• Aucun résultat trouvé

l’état   fondamental   précédemment   décrit   est   obtenu   tel   que   ρ(x,y,z)   minimise

,   et   le   terme  d’interaction  électron-­‐électron  est  noté  

V

^e-e:  

H^ ^ ^ ^

!"

!

!"

= T+V

N-e

+V

e-e

!

!"

= E

!"

!

!"

De  nombreuses  méthodes  proposent  une  résolution  mathématique  approchée  de  cette  équation,   en  travaillant  directement  avec  Ψél   comme   inconnue,   a]in  d’en  déduire  la   valeur  de  l’observable   énergie  électronique  Eél.  

Le  principe  de  base  de  la  technique  DFT  est  de  considérer  l’énergie  Eél  comme  une  fonctionnelle   de  la   densité  électronique:  ce  principe,  connu  sous  le  nom  de  principe  de  Bright  Wilson,  énonce   que   la   seule   connaissance   de   la   densité   électronique   permet   d’avoir   accès   à   toutes   les   observables  hamiltoniennes  du  système,  donc  aux  niveaux  d’énergie  associés.34  35

Pour  alléger  l’écriture,  Ψél  et  Eél  seront  dans  la  suite  notées  respectivement    Ψ  et  E.

Deux  théorèmes  fondamentaux,  dus  à  Kohn  et  Hohenberg,  découlent  de  cette  constatation:36

Théorème   1:   un   système   à   l’état   fondamental,   avec   toutes   ses   propriétés   observables,   est  

entièrement   déterminé   par   la   seule   donnée   de   sa   densité   électronique   ρ(x,y,z)   en   tout   point.   Il   apparaît  donc,  en  particulier,  que  l’énergie  de  ce  système  est  une  fonctionnelle  de  la  densité:  

E = F[ρ]

Théorème   2:   l’état   fondamental   précédemment   décrit   est   obtenu   tel   que   ρ(x,y,z)   minimise  

l’énergie  E  .

L’énergie   E   se   décompose   ainsi   en  une   somme   de   trois  fonctionnelles  de   la   densité:   un   terme   cinétique   (T),   un   terme   d’interaction   coulombienne   noyau-­‐électron   (VN-e)   et   un   terme   d’interaction  coulombienne  électron-­‐électron  (Ve-e)  :  

E[ρ] = T[ρ] + V

N-e

[ρ] + V

e-e

[ρ]

Seul  le  deuxième  terme  se  calcule  aisément;  il  s’agit  de  la  somme  des  interactions  coulombiennes   de  chaque  électron  i  avec  chacun  des  noyaux  I;  la  charge  d’un  volume  élémentaire  dV1  centré  au   point  de  coordonnée  r1  étant  égale  à  ρ(r1)dV1  ,  on  obtient:  

VN-e[!] = "# Z

I

!(r

1

)dV

1

|r

i

-R

I

|

i,I

Une   partie  de   l’énergie   d’interaction  électron-­‐électron  peut  être   modélisée   par  l’énergie  J[ρ]  de   répulsion  de  deux  charges  ρdV,  placées  en  deux  points  distants  de  |r1-r2|,  soit:  

J[!] = "" !(r

1

)!(r

2

)dV

1

dV

2

|r

1

-r

2

|

Le  terme J[ρ]  n’est  qu’une  approximation  de  l’énergie  d’interaction  électron-­‐électron,  pour  deux   raisons:  

-­‐ il   ne   prend   pas   en   compte   la   corrélation,   c’est-­‐à-­‐dire   le   fait   que   les   mouvements   des   deux   électrons  sont  liés:  en  effet,  si  la   densité   ρ(r1)  varie,   la  densité   ρ(r2)  doit  elle   aussi  varier.37   Or,   ces  deux  quantités  apparaissent  comme   indépendantes  dans  l’expression  de  J[ρ].   De   surcroît,   un   électron   i   ayant   une   densité   de   présence   dé]inie   en   tout   point   de   l’espace,   donc   en   particulier  aux  points  r1 et  r2 ,  cette  expression  de  J[ρ]  fait  interagir  tout  électron  avec  lui-­‐même   (self-­interaction).  

-­‐ il   ne   prend  pas  en   compte   l’interaction   d’échange   électronique  (interaction   de   Fermi),   qui   est   une   propriété  purement  quantique  liée  au  spin   de  l’électron  et  qui   stipule  que   deux  électrons     (deux  fermions  dans  le   cas  général)  possédant  un  spin   identique   ne   peuvent  se  trouver  en  un   même  point  de  l’espace.38

La  méthode  proposée  par  Kohn  et  Sham  repose  sur  une  expression  de  la  densité  électronique  en   fonction   d’une   combinaison   linéaire   de   produits   d’orbitales   atomiques,   appelées   «orbitales   de   Kohn-­‐Sham»   et   notées   φKS.   Elles   ont   pour   propriété   de   correspondre   à   la   description   d’un   système  ]ictif  d’électrons  sans  interaction,   mais  qui  possèderait  la   même  répartition  de   densité   que   le   système   réel.   Ceci   permet   d’exprimer  de   manière   exacte   les  termes  TS,  VN-e,S,  et  J39  (où   l’indice  «S»  rappelle  que  ces  expressions  concernent  le  système  ]ictif  de  Kohn-­‐Sham):  

PARTIE I - CHAPITRE I

37   Ceci  est   dû  au  fait   que,  puisque  l’électron  i  est   une  particule  chargée,   un  changement  de  sa  position  spatiale   (donc   de  sa  densité  ρ(ri))  induit   une  variation  locale  du  champ  électrostatique  ressenti  par  les  autres  particules   chargées;  l’électron  j  étant  lui-­‐même  chargé,  il  sera  sensible   à   cette  variation  de  champ  et   sa  position  spatiale,   donc  la  densité  ρ(rj)  qui  lui  est  associée,  changera.  

38  On  retrouve  ici  le  principe  d’exclusion  de  Pauli.  

39  Dans   ces   expressions,   la  densité   intervient   implicitement  via   les   orbitales   de   Kohn-­‐Sham:  en  effet,   on  a  par   dé]inition:

! = " # |$

KS

(i)(r

1

)|

2

dV

1

T

!

= - 12 !

i <"

KS

(i)|#

i2

|"

KS

(i)>

VN-e,! = ! $ !Z

I

|"

KS

(i)(r

1

)|

2

dV

1

|r

i

-R

I

|

i i,I

Ve-e,! = ! $$ |"

KS

(i)(r

1

)|

2

|"

KS

(j)(r

2

)|

2

dV

1

dV

2

= J

i,j>i

1

|r

1

-r

2

|

Evidemment,   les   termes   exprimés   ci-­‐dessus   ne   correspondent   pas   aux   énergies   cinétique   et   potentielle   réelles   puisque   toute   la   partie   «interaction»   entre   les   électrons   a   été   omise   dans   l’expression  des  orbitales  φKS(i).  Toute  cette  contribution  est  regroupée  dans  un  nouveau  terme,   appelé   énergie   d’échange-­corrélation,   et   noté   Exc.   Elle   est   elle   aussi   une   fonctionnelle   de   la   densité  électronique  ρ;  ainsi,  l’énergie  du  système  réel  est  égale  à:  

E = T

S

+ V

N-e,S

+ J + E

xc

L’énergie  d’échange-­‐corrélation  est  quant  à  elle  décomposée  en  un  terme  d’échange,  et  un  terme   de  corrélation:  

E

xc

= E

x

+ E

c

Il  n’existe  pas  de  forme  analytique  universelle  de  cette  fonctionnelle  d’échange-­‐corrélation:  ainsi,   des  systèmes  où  les  termes  de  corrélation  sont  plutôt  forts  et  des  systèmes  où  domine   le  terme   d’échange  seront-­‐ils  décrits  différemment.  

La  technique  la  plus  simple  permettant  d’évaluer  l’énergie  d’échange-­‐corrélation  est  la  méthode   de  la  densité  locale  (LDA  pour  Local  Density  Approximation),  qui  considère  localement  la  densité   électronique  comme  un  gaz  uniforme  d’électrons.  L’avantage  est  que  le  gaz  uniforme  d’électrons   est  le  seul  système  pour  lequel  on  dispose  d’excellentes  interpolations  des  énergies  d’échange  et   de   corrélation.  L’inconvénient  est  que,   dans  la  plupart  des  systèmes,   la  répartition  électronique   est  loin   d’être  localement  uniforme,   ce   qui  conduit  notamment  à  une   très  mauvaise   estimation   des  énergies  de   liaison.  Une  méthode  palliant  les  lacunes  de   la  description  LDA  est  la  méthode   des  gradients  généralisés  (ou  GGA,   pour  Generalized  Gradient  Approximation):  là   où  la  méthode   LDA  considère   comme  localement  homogène   la  densité   électronique,  la  méthode   GGA  prend   en   compte   les   variations   spatiales   de   cette   dernière   en   faisant   intervenir   la   dérivée   spatiale   première  de  la  densité  dans  sa  fonctionnelle  d’échange-­‐corrélation.

Un   inconvénient  majeur   des  méthodes   LDA   et   GGA   est   qu’elle   ne   prennent  pas   en   compte   le   phénomène   de  self-­interaction,  ainsi  que   les  effets  de  corrélation  à  grande  distance   (corrélation   non-­‐locale).   A   l’heure   actuelle,   la   théorie   Hartree-­‐Fock,   antérieure   au   développement   de   la   méthode  DFT,  permet  d’af]iner  ces  modèles.  

Une   nouvelle   classe   de   fonctionnelles   d’échange-­‐corrélation   est   ainsi   apparue:   il   s’agit   de   la   famille   des   fonctionnelles   hybrides,   introduite   par   A.Becke   en   1993.40   Ces   fonctionnelles   décrivent  une   fraction   du   terme   d’échange   par  l’énergie   d’échange  issue   de   la   théorie   Hartree-­‐ Fock,  l’énergie  de  corrélation  étant  obtenue  via  des  fonctions  de  la  densité.  

De   nombreuses  fonctionnelles   hybrides   existent  dans   la   littérature   et  possèdent  chacune   leur   spéci]icité.   En  ce   qui  concerne  la  modélisation   de  systèmes  organiques  et  organométalliques,   la   fonctionnelle   hybride  de  Perdew,   Burkhe,   et  Ernzerhof  (notée  PBE),41  initialement  de   type   GGA   et   rendue   hybride   par   Adamo   et   Barone,42   a   montré   de   bons   résultats   en   accord   avec   l’expérience.  C’est  la  fonctionnelle  qui  sera  utilisée  dans  ce  travail.

Le   caractère   hybride   introduit   par   Adamo   et   Barone   a   abouti   à   l’obtention   d’une   nouvelle   fonctionnelle  notée  PBE0:  

E

xc

(PBE0) = E

xcPBE

+ 0,25(E

xHF

-E

xPBE

)

où ExcPBE et ExPBE correspondent   aux   énergies   d’échange-­‐corrélation   et   d’échange   de   la   fonctionnelle   GGA   originelle   (ici  PBE),   et  où   ExHF   correspond  à   la   part   d’énergie   d’échange   de   type  Hartree-­‐Fock  introduite  dans  l’hybridation.      

II.3.a.4)  Bases  d’orbitales  atomiques    

Les  orbitales  de  Kohn-­‐Sham  précédemment  décrites  sont  des  orbitales  moléculaires:  il  est  donc   nécessaire  de  les  exprimer  en  fonction  des  orbitales  atomiques  du  système.  

On  se  place  pour  ce  faire  dans  l’approximation  LCAO  (Linear  Combination  of  Atomic  Orbitals)  qui   consiste   à   exprimer  chaque   orbitale   moléculaire   comme   une   combinaison   linéaire   d’orbitales   atomiques.   Il   est   ainsi   nécessaire   d’obtenir   une   bonne   description   des   fonctions   d’onde   atomiques  avant  de  pouvoir  obtenir  les  orbitales  de  Kohn  et  Sham.    

L’idée  la   plus  simple  est  de  partir  des  seules  orbitales  connues  sans  approximation,   à  savoir  les   orbitales   de   l’atome   d’hydrogène   et   des   atomes   hydrogénoïdes.   Cette   base   est   entièrement   décrite  par  le  triplet  de  nombres  quantiques  {n,l,ml}  et  a  pour  forme:  

|n,l,m

l

> = N.Y

l,m

.r

l

.P

n,l

(r).exp(-2r/na

0

)

l

où  r  est  la  distance  noyau-­‐électron,  Pn,l(r)  le  polynôme  de  Laguerre  de  degré  n-­‐l-­‐1,  Yl,ml  la  fonction  

angulaire  (harmonique  sphérique),  a0  le  rayon  de  l’atome  d’hydrogène  de  Bohr  (52,9  pm)43  et  N   une  constante  de  normalisation.  

PARTIE I - CHAPITRE I

40  Becke,  A.D.  J.  Chem.  Phys.,  1993,  98,  1372

41  Perdew,  J.P.;  Burke,  K.;  Ernzerhof,  M.  Phys.  Rev.  Lett.,  1996,  77,  3865-­‐3868;  et  Phys.  Rev.  Lett.,  1997,  78,  1396

42  Adamo,  C.;  Barone,  V.  J.  Chem.  Phys.,  1999,  110,  6158

43   a0  =  h2ε0/πm(e)q2   ~52,9  pm   (où  h  est   la   constante  de  Planck,  ε0   la  permittivité  diélectrique  du  vide,   m(e)  la   masse  de  l’électron  et  q  sa  charge).  

Slater  a  ainsi  proposé  par  extension   pour  un  atome   quelconque   des  fonctions  orbitales  (notées   «STO»  pour  Slater-­Type  Orbitals)  de  la  forme:  

!(STO) = N.Y

l,m l

.r

n-1

.exp(-"r)

où   ζ   est   un   paramètre   lié   à   la   charge   du   noyau,   le   plus   souvent   déterminé   par   des   règles   empiriques.44  

Cependant,  la   présence   du  terme   exponentiel  rend   les  calculs  relativement  lourds  à   partir  d’un   système   contenant   plus   de   deux   atomes.   Elles   sont   donc   remplacées   par   une   combinaison   linéaires   de   fonctions   gaussiennes   (où   le   terme   exponentiel   est   quadratique   et   de   la   forme                                

exp(-­a/r2),  avec  a>0).  

Dans   le   cas   le   plus   général   où   trois   gaussiennes   sont   combinées,   ce   qui   permet   d’avoir   une   interpolation   acceptable   de   la   partie   radiale   de   la   fonction   d’onde,   on   obtient   ainsi   la   base   d’orbitales  atomiques  nommée  STO-­‐3G45  la  plus  simple  incluse  dans  le  logiciel  Gaussian09.   La  description  de  la   fonction  d’onde   d’un   atome   est  d’autant  plus  précise   qu’elle  est  interpolée   par  le  maximum  de  fonctions  gaussiennes;  la  contrepartie  est  évidemment  un  temps  de  calcul  de   plus  en  plus  lourd.  Il  convient  donc  de  déterminer  quelles  seront  les  propriétés  importantes  des   systèmes  étudiés  dans  le  choix  des  fonctions  de  modélisation.  

On  distingue  habituellement  trois  zones  spatiales  dans  la  description  d’un  atome  qui  requièrent   des  modélisations  assez  différentes:  

-­‐ la  zone  de  cœur,  où  les  électrons  sont  très  fortement  liés  au  noyau,

-­‐ la  zone  de  valence,  qui  est  la  zone  la  plus  délicate  à  traiter  puisqu’elle  concerne  les  électrons  qui   participent  à  la  réactivité  de  l’atome  étudié.  Ceci  implique  deux  conséquences  pratiques:  

-­‐ la   prise   en   compte   de   multiples   gaussiennes   décrivant  les   orbitales  de   valence   (split  

valence):  par  exemple,   une   orbitale   s  pourra   être   décrite  par  une  combinaison   linéaire  

de   deux   orbitales   s   de   rayons   différents.   Ceci   pourra   permettre   de   modéliser   la   contraction  ou  l’extension  du  nuage  électronique  porté  par  cette  orbitale.46

-­‐ la  prise   en   compte   de   fonctions  de  polarisation:  ceci  consiste,   pour  un  atome   donné,  à   ajouter  à  sa  description  des  gaussiennes  de  nombre  quantique  l  supérieur.  Pour  décrire   PARTIE I - CHAPITRE I

par  exemple  un  atome  d’hydrogène,  cela  revient  à  lui  ajouter  des  orbitales  p,  d,  etc.  Ceci   permet  de  prendre  en  compte  le  caractère  directionnel  du  nuage  électronique.47

-­‐ la  zone  de  diffusion,  où  priment  les  interactions  faibles  de  type  Van  der  Waals  (essentiellement   les  interactions  dipolaires,  les  liaisons  hydrogène  ou  les  liaisons  halogène).  Il  convient  alors  de   prendre  en  compte  des  orbitales  dites  diffuses,  c’est-­‐à-­‐dire  qui  s’étendent  relativement  loin  des   noyaux  et  qui  permettent  de   modéliser  ces  interactions  qui  sont  de  plus  longue  portée  que  les   interactions  aboutissant  à  la  formation  de  liaisons  covalentes.  En  pratique,  on  décrit  un  atome   diffus  de  nombres  quantiques  {n,l}  en  lui  ajoutant  un  ensemble  d’orbitales  {(n+1)s  ;(n+1)p}. Une   base  d’orbitales  B  se  nomme   comme  suit  dans  le   formalisme  de   Pople,   couramment  utilisé   dans  les  logiciels  de  calculs  comme  Gaussian09:  

B  =  n-­‐n’n’’...(++)G(**)  

Où,   pour  un   atome   donné,   n   désigne   le   nombre   de   gaussiennes   de   la   couche   interne,   n’,   n’’,   ...   désignent  le  nombre  de  gaussiennes  utilisées  dans  chaque  couche  de  valence,  (++)  désigne  s’il  y   a   lieu   l’emploi   d’un  (+)  ou   deux   (++)   ensemble   d’orbitales  diffuses,   et  (**)  désigne   s’il  y  a   lieu   l’utilisation  d’orbitales  d  sur  les  atomes  de  la  deuxième  période  (utilisation  d’un  seul  astérisque   «*»)  et  d’orbitales  p  sur  les  atomes  d’hydrogène  (utilisation  de  deux  astérisques  «**»).  On  utilise   parfois  la  notation  «G(d,p)»  au  lieu  de  «**».  

Dans  ce   travail,   tous  les  atomes  ont  été   modélisés   dans  la   base   6-­‐31(+)G(*),   ce   qui   permet   de   prendre  en  compte  d’éventuelles  interactions  de  Van  der  Waals.  

II.3.a.5)  Notion  de  pseudo-­‐potentiels  

Il   est   courant  d’introduire   une   approximation   supplémentaire   visant   à   séparer   la   description   quantique  des  électrons  de  cœur,  fortement  liés  aux  noyaux,  et  celle  des  électrons  de  valence.  En   effet,  avec  une  très  bonne  approximation,  ces  derniers  peuvent  être  considérés  comme  les  seuls   responsables  de  la   réactivité  des  molécules  et  des  complexes  étudiés:48  49  ainsi,  il  est  commode   de  considérer  que  les  électrons  de  cœur  n’interagissent  pas  avec  les  électrons  de  valence  comme   PARTIE I - CHAPITRE I

47   Par   exemple,   la  modélisation   d’une   liaison  H-­‐X   (où  X  est   un  atome   électronégatif)   sans   la   prise   en  compte   d’orbitales  p  de  polarisation  donnerait  la  géométrie  suivante  pour  le  niveau  LUMO:  

H =

s

X = ns + np

LUMO (X-H) =

X H

Cette  modélisation  est  erronée  car  la  zone  électrophile  d’une  telle  molécule  est  essentiellement   développée  sur   l’atome  d’hydrogène  et  dans   le   prolongement  de  la   liaison  X-­‐H  à  l’extérieur  de  la   molécule.   Prendre  en  compte   une  contribution  de  polarisation  p  sur  l’atome  d’hydrogène  permet  de  retranscrire  de  ce  phénomène:  

H = +

s p

X = ns + np

LUMO (X-H) =

X H

48  Cette  approximation  a  pour  extrême  limite  la  théorie  de  Fukui  des  orbitales   frontières,  où  l’on  considère  que   seules   la   plus   haute   orbitale   occupée   et   la   plus   basse   orbitale   vacante   suf]isent   à   décrire   la   réactivité   des   molécules  étudiées.  

49   Cette  approximation  n’est  évidemment   plus  valable  dès   lors  que  les   niveaux  de  cœur   interviennent  dans   les   processus  sondés  (comme  par  exemple  l’étude  de  l’effet  Auger,  la  spectroscopie  photoélectronique,  ...).  Ce  ne  sera   pas  le  cas  des  résultats  présentés  dans  ce  manuscrit.  

des  particules  indépendantes  à  part  entière,  mais  que  les  électrons  de   valence  évoluent  dans  un  

potentiel  électrostatique  moyen  créé  par  les  électrons  de  cœur.  

On  distingue  deux  types  de  pseudopotentiels,  selon  qu’ils  prennent  en  compte   ou  non  les  effets   relativistes  des  atomes  décrits.  Ces  effets  étant  relativement  importants  dans  le   cas  des  métaux   de   transition,   les   électrons  de   cœur   des   métaux   modélisés   dans   ce   travail   (Fe   et   Cu)   ont   été   traités  par  le  potentiel  SDD,50  qui  permet  de  prendre  en  compte  ces  effets  relativistes.  

II.3.b)  Modélisation  d’une  surface  d’énergie  potentielle

Le   travail   théorique   présenté   ici   se   focalise   uniquement   sur   l’étude   et   la   détermination   de   chemins   réactionnels,   qui   consiste   en   la   détermination,   pour   un   système   réactif   donné,   des   extrema   locaux   de   la   surface   d’énergie   potentielle   associée.   En   pratique,   pour   modéliser  une   réaction   élémentaire   quelconque,   seuls   les   points   stationnaires   sont   déterminés:   il   s’agit   des   minima  locaux  (états  stables:  réactifs,  intermédiaires  réactionnels),  et  des  maxima  locaux  à  point   de  selle(états  instables  qui  correspondent  aux  états  de  transition).

Cette   sous-­‐partie   constitue   en   quelque   sorte   la   «boîte   à   outils»   où   sont   regroupées   les   descriptions  des  différentes  démarches  à   prendre   en  compte   lorsque   l’on   met  en   pratique  une   modélisation   d’un   système   par   DFT.   Y   sont  présentés  les  différents   algorithmes  utilisés,   leurs   limites,   les   éventuelles   corrections   à   amener  aux   résultats   numériques  obtenus,   ainsi   que   les   choix  de  modélisation  qui  ont  été  faits  en  fonction  des  systèmes  étudiés  dans  ce  travail.  

II.3.b.1)  Logiciel  utilisé  

Tous  les  calculs  présentés  dans  ce  manuscrit  ont  été  réalisés  avec  le  logiciel  Gaussian09.51

 

II.3.b.2)  Recherche  des  extrema  locaux

Deux   catégories   de   structures   sont   modélisées   lors   de   l’étude   du   mécanisme   d’une   transformation:   les   structures  qui   correspondent   à   des  minima   d’énergie   potentielle   (réactifs,   produits,   ou   intermédiaires   réactionnels),   et   les   structures   qui   correspondent   aux   maxima   d’énergie  potentielle  (états  de  transition).  

Dans  les  deux  cas  (minimum  ou  maximum  d’énergie  potentielle),  ces  structures  correspondent  à   un   point   du   chemin   réactionnel   où   la   dérivée   première   de   l’énergie   potentielle   est   nulle   par   rapport  à  toute  variation  de  coordonnée  réactionnelle  (coordonnée  notée  «q»  dans  le  cas  le  plus   général).  Les  algorithmes  de  modélisation  DFT  modélisent  donc  pas  à  pas  une  structure  dont  le   gradient  de  l’énergie  tend  à  se  minimiser  pour  devenir  nul.  Ces  algorithmes  dits  de  minimisation   peuvent   interpoler   les   extrema   locaux   des   courbes   par   des   fonctions   polynomiales   (développements   de   Taylor)   d’ordre   plus   ou   moins   élevé   selon   la   ]inesse   requise   par   la   modélisation.

Le  critère  permettant  de  s’assurer  de  la  bonne  modélisation  d’un  minimum  ou  d’un  maximum  de   la   courbe   d’énergie   potentielle   est   l’étude   vibrationnelle,   à   savoir  le   calcul   des   fréquences   de   PARTIE I - CHAPITRE I

Ceci   s’interprète   de   la   manière   qui   suit:   pour  chaque   mode   de   vibration   correspondant  à   une   coordonnée   réactionnelle   «q»,   l’énergie   potentielle   de   vibration   selon   cette   coordonnée   s’écrit   dans  l’approximation  harmonique,  au  voisinage  de  la  position  d’équilibre:  

 

 

E = k(q-q1

0

)

2

2

où  k  est  la  constante  de  vibration  associée  au  mode  de  vibration  considéré,  et  q0 correspond  à  la   valeur  de  la  coordonnée  q  à  l’équilibre.  

L’équation  précédente  ainsi  que  la  loi  de  Hooke,  reliant  la  constante  de  vibration  k  à  la  fréquence   de  vibration  associée   f  et  à  la   masse  réduite  µ  du  système  vibrant,52  impliquent  immédiatement   l’équation  suivante:  

!

2

E

!q

2

= k = 4"

2

f

2

!

Ainsi,   un   minimum   d’énergie,   correspondant   à   une   dérivée   seconde   positive   de   l’énergie   potentielle,   est   caractérisé   par  un   ensemble   de   constantes  de   vibration   k   positives,   et   par  les   fréquences  vibrationnelles  f  correspondantes,  elles  aussi  toutes  réelles  et  positives.  

En   revanche,  un   état  de  transition,  qui  correspond  à  une  dérivée   seconde   négative  de  l’énergie   potentielle  par  rapport  à  une  des  coordonnées  de  vibration  q,  sera  caractérisé  par  une  constante   de   vibration   k   négative   associée   à   ce   mode   de   vibration,   la   fréquence   de   vibration   correspondante  étant  quant  à  elle  imaginaire  pure.  

En   pratique,   l’abus   de   langage   consistant   à   dire   que   c’est   la   fréquence   de   vibration   et   non   la  

constante  de  vibration  qui  est  négative  est  couramment  fait,  notamment  dans  les  listes  d’analyse  

vibrationnelle  données  par  le  logiciel  Gaussian09.  

En]in,  lorsqu’un  état  de  transition  a   été  modélisé  (i.e.  une  structure  possédant  une  fréquence  de   vibration  négative),  il  est  nécessaire   de   s’assurer  que  cette  fréquence   de  vibration  corresponde   bien  au  mode  de  vibration  de  l’acte  élémentaire  que  l’on  souhaite  modéliser.  En  d’autres  termes,   il  convient  de  s’assurer  que  ce  mode  de  vibration  permet  bien  de  passer  des  réactifs  aux  produits   de   la   réaction   étudiée   et   donc   que   l’état   de   transition   modélisé   corrèle   bien   les   réactifs   aux   produits.  

On   utilise   pour  cela   l’algorithme   IRC   (pour  Intrinsic   Reaction   Coordinate),53   implémenté   dans   Gaussian09  et  qui  permet,  à  partir  de  la  structure  d’un  état  de  transition,  de  recalculer  différents   points  de  la  courbe  d’énergie  potentielle  situés  «avant»  l’état  de  transition  (système  pré-­‐réactif),   et   différents   points   situés   «après»   l’état   de   transition   (formation   des   produits):   ainsi,   il   est   possible   d’obtenir   l’intégralité   du   chemin   réactionnel   correspondant   à   la   réaction   modélisée   (voir  schéma  1.29)  et  donc  de  s’assurer  que  l’état  de  transition  modélisé  est  correct.  

PARTIE I - CHAPITRE I

52  Pour  une  vibration  correspondant  à  l’élongation  d’une  liaison  A-­‐B,  la  masse  réduite  du  système  est  

µ  =  m(A)m(B)/(m(A)+m(B))   où  m(i)  est  la  masse  de  l’atome  i.  

X X X X X X X

obtention de points à droite qui corrèlent aux produits obtention de points

à gauche qui corrèlent aux réactifs ET P R Energie potentielle Coordonée réactionnelle

Schéma  1.29:  Principe  du  calcul  IRC:  à  partir  d’un  état  de  transition  ET,  on  obtient  différents  points   de  la  courbe  d’énergie  («x»)  qui  permettent  de  connaître  les  réactifs  (R)  et  les  produits  (P)  reliés  à  

cet  état  de  transition.  

II.3.b.3)  Contamination  de  spin  

L’un  des  problèmes  majeurs  de  la  description  des  systèmes  possédant  un  ou  plusieurs  électrons   célibataires  est  qu’elle  fait  la  plupart  du  temps  intervenir  une   technique  «non-­‐restreinte»,  c’est-­‐ à-­‐dire  une  technique  dans  laquelle  les  électrons  de  spin  1/2  et  de  spin  -­‐1/2  sont  décrits  par  des   répartitions  spatiales  a  priori  différentes.    

La   principale   conséquence   est   que   la   fonction   d’onde   optimisée   n’est   plus   valeur   propre   de   l’opérateur  de  spin  S2.  Or,  cet  opérateur  commutant  avec  l’opérateur  hamiltonien  du  système,  la   fonction  d’onde  exacte  décrivant  le  système   doit  donc  en   théorie   être   à   la  fois  valeur  propre   de   l’opérateur  hamiltonien  et  de  l’opérateur  S2  .  

On  peut  montrer  que  le  spin  total  associé  à  une  fonction  d’onde  non-­‐restreinte  qui  décrit  un  état   paramagnétique   est   systématiquement   surévalué:   concrètement,   cela   veut   dire   que   la   fonction   d’onde  optimisée  pour  un   système   de   spin  S   est  contaminée   par  les  fonctions  d’onde  des  états   excités  de  spin  supérieur:  

ΨNON-­‐RESTREINTE(S)  =    Ψexacte(S)  +  λ1.Ψ(S+1)  +  λ2.Ψ(S+2)  +  ...

Plusieurs  algorithmes  de  correction  de  la  fonction  d’onde  non-­‐restreinte  «polluée»  existent;  celui   qui   est   utilisé   ici   est   implémenté   dans   le   code   Gaussian09,   et   consiste   en   la   suppression   du   premier  contaminant  de   spin  («Ψ(S+1)»  dans  la  formule  ci-­‐dessus,  qui  est  supposé   apporter  la   «pollution»  la  plus  importante)  à   chaque  pas  du  calcul:  il  s’agit  de  l'algorithme  d’annihilation  de   Löwdin.54   Cette   méthode   est   relativement   indiquée   lorsque   la   contamination   de   la   fonction   d’onde  de  base  par  des  états  de  multiplicité  de  spin  élevée  est  faible.  

L’énergie  des  deux  réactifs  séparés  est  aisément  calculable  et  vaut   E{A+A’}  =  EB{A}  +  EB’{A’}

Le   problème   se   pose   lorsque   l’on   calcule   l’énergie   d’un   système   où   interagissent  A   et  A’   (par   exemple,  l’énergie  d’un  état  de  transition  de  réaction  entre  A  et  A’):  en  effet,   ces  deux  réactifs  se   retrouveront  modélisés  dans  le  même  calcul,  ce  qui  va  permettre  au  réactif  A  «d’emprunter»  à  A’   des  fonctions  de  la  base  B’,  de  même  que  cela  permettra  à  A’  «d’emprunter»  à  A  des  fonctions  de