• Aucun résultat trouvé

Des relations temporelles Des relations temporelles

2. Relations entre propositions Relations entre propositions Relations entre propositions

2.1. Des relations temporelles Des relations temporelles

Na caracterização funcional foi observado que a Hsp110 de sorgo apresenta atividade chaperona, pois, protege substratos modelo contra a agregação induzida por aquecimento e por agente redutor, e mostrou ser específica, uma vez que a proteção ocorreu em diferentes graus dependendo do substrato modelo testado. Como controle negativo, observou-se que ao usar BSA ou aldolase, proteínas sem função chaperona, não ocorreu proteção. Na literatura já foram realizados experimentos com proteínas Hsp110s de mamíferos avaliando a prevenção da agregação induzida por aquecimento a 43 ºC por 30 minutos, no caso dos substratos modelo luciferase e citrato sintase, também medindo o espalhamento de luz a 320 nm (Oh et al., 1997). Nestes testes, com ambos os substratos, foi observada máxima eficiência de proteção utilizando a proporção de 1:1 (Hsp110:luciferase e Hsp110:citrato sintase), mostrando inclusive que a Hsp110 foi mais eficiente que a Hsc70, também testada na ocasião (Oh et al., 1997). Para a Hsp110 de sorgo, a máxima eficiência de proteção foi obtida na proporção 2:1 (Hsp110:citrato sintase) e

na proporção 10:1 (Hsp110:luciferase), o que mostra que há diferenças nas ações destas proteínas dependendo do organismo testado.

Nos testes de recuperação da atividade enzimática da luciferase desenovelada/agregada observou-se que nas condições testadas o sistema formado pelas proteínas Hsp110 de sorgo, Hsc70 e Hsp40 humanas foi capaz de recuperar parcialmente a atividade da proteína-cliente testada. Nos experimentos de reenovelamento houve recuperação de metade da atividade após 1 hora de incubação, enquanto que nos experimentos de desagregação houve recuperação de um terço da atividade após 3 horas de incubação. Na literatura já foram utilizados sistemas de reenovelamento/desagregação da luciferase usando diferentes combinações de chaperonas/co-chaperonas. Em Dragovic et al. (2006), foram realizados experimentos envolvendo Hsps de mamíferos e luciferase desenovelada com cloreto de guanidina e também com aquecimento, no caso aquecendo a luciferase a 42 °C por 12 minutos já na presença de Hsc70, de modo a se evitar a agregação. Em ambos os casos o reenovelamento foi realizado a 30 °C na presença de ATP, e a incubação por 1 hora contendo a mistura Hsc70/Hsp40/Hsp110 mostrou recuperação de cerca de 50 % da atividade enzimática da proteína-cliente luciferase. Já em Shorter (2011) foram realizados experimentos envolvendo luciferase previamente agregada com ureia e incubada de 0 - 6 horas a 25 °C na presença da proteína Apg-2, dos complexos Hsc70:Hdj1 / Hsp70:Hdj1, e de ATP, de modo a promover a desagregação proteica. Foi mostrado que a adição da proteína Apg-2 aumentou a atividade de desagregase e que ela não é capaz de promover a desagregação sozinha ou em combinação com a Hsc70, a Hsp70 ou a Hdj1 também sozinhas. Observou-se, no caso, maior eficiência de desagregação quando a incubação foi feita com a mistura Apg-2/Hsc70/Hdj1, na qual obteve-se cerca de 20 % de recuperação da luciferase. Também foi observado que a habilidade da Hsp110 em interagir com a Hsp70 e a Hsp40 para promover a desagregação proteica e reativação da luciferase é conservada em homólogos de levedura, como na Sse1 (Shorter, 2011). Em todos esses testes a recuperação enzimática foi medida através da luminescência gerada pela reação entre a luciferase e a luciferina.

Em Svetlov et al. (2006) foi realizado estudo com chaperonas moleculares do sistema Hsp70 (DnaK, DnaJ e GrpE) em extrato de E. coli no reenovelamento da luciferase. Neste caso a luciferase foi desenovelada com ureia a 20 °C por 5 minutos e nas condições testadas chegou a ser observada recuperação de cerca de 80 % da

atividade da luciferase dentro de 60 minutos de incubação a 25 °C. Em Sharma et al. (2010) foi também mostrado que o sistema em bactéria (Hsp70-Hsp40-NEF) pode eficientemente reenovelar espécies mal enoveladas da luciferase.

Por fim, este trabalho mostra que apesar de possuírem uma chaperona desagregase muito eficiente, a Hsp100, plantas podem se utilizar de um outro sistema na recuperação de proteínas, aquele formado por Hsc70/Hsp40/Hsp110. Animais perderam o gene da Hsp100 mas mantiveram o sistema Hsc70/Hsp40/Hsp110, que parece ser suficiente para lidar com os casos de agregação mais básicos, mas talvez não aqueles mais complexos causados por envelhecimento ou mutações. Plantas mantiveram os dois sistemas, provavelmente para lidarem de maneira mais eficiente com o maior número de condições estressantes a que estão continuamente expostas.

6. Conclusão

- O gene para hsp110 de sorgo foi clonado em vetor para expressão em bactéria. - A proteína foi expressa solúvel e purificada com alto teor de pureza (> 90 %) em duas etapas de cromatografia (afinidade em coluna de níquel e exclusão molecular). - Os experimentos de dicroísmo circular e fluorescência do triptofano mostraram que a proteína recombinante foi produzida enovelada, apresentando estrutura secundária do tipo hélice e evidenciando a presença de um ou mais resíduos de triptofano se encontrando, pelo menos parcialmente, enterrados no interior da proteína.

- Os experimentos de desenovelamento mostraram que a proteína é estável nas condições de estudo.

- A proteína produzida apresentou-se como um monômero em solução com formato alongado.

- A Hsp110 de sorgo apresentou atividade chaperona em diferentes proporções dependendo da especificidade do substrato modelo testado ao realizar experimentos de prevenção da agregação induzida tanto por aquecimento quanto por agente redutor.

- A Hsp110 tem papel essencial em um complexo chaperona que foi capaz de recuperar parcialmente a atividade enzimática da proteína-cliente luciferase testada tanto desenovelada quanto agregada, conservando a função desagregase inicialmente observada nas Hsp110s de mamíferos.

7. Referências

1. Andréasson, C., Fiaux, J., Rampelt, H., Mayer, M. P., Bukau, B. (2008). Hsp110 Is a Nucleotide-activated Exchanged Factor for Hsp70. The Journal of Biological Chemistry. Vol. 283 (14), pp. 8877-8884.

2. Anfinsen, C. B. (1973). Principles That Govern Folding of Protein Chains. Science. Vol. 181 (4096), pp. 223-230.

3. Atkins, P., Jones, L. Princípios de Química: Questionando a Vida Moderna e o Meio Ambiente. 3ª edição. São Paulo: Bookman, 2007.

4. Baaklini, I., Wong, M. J. H., Hantouche, C., Patel, Y., Shrier, A., Young, J. C. (2012). The DNAJA2 Substrate Release Mechanism Is Essential for Chaperone- mediated Folding. The Journal of Biological Chemistry. Vol. 287 (50), pp. 41939- 41954.

5. Barth, H. G., Jackson, C., Boyes, B. E. (1994). Size Exclusion Chromatography. Analytical Chemistry. Vol. 66 (12), pp. 595–620.

6. Batista, F. A. H., Gava, L. M., Pinheiro, G. M. S., Ramos, C. H. I., Borges, J. C. (2015). From Conformation to Interaction: Techniques to Explore the Hsp70/Hsp90 Network. Current Protein & Peptide Science. Vol. 16 (8), pp. 735-753.

7. Borges, J. C., Hannes, F., Craievich, A. F., Ramos, C. H. I. (2005). Low Resolution Structural Study of Two Human Hsp40 Chaperones in Solution: DJA1 from subfamily A and DJB4 from subfamily B have different quaternary structures. Journal of Molecular Biology. Vol. 280 (14), pp. 13671-13681.

8. Borges, J. C., Ramos, C. H. I. (2011). Analysis of Molecular Targets of Mycobacterium tuberculosis by Analytical Ultracentrifugation. Current Medicinal Chemistry. Vol. 18 (9), pp. 1276-1285.

9. Borges, J. C., Ramos, C. H. I. (2005). Protein Folding Assisted by Chaperones. Protein and Peptide Letters. Vol. 12 (3), pp. 257-261.

10. Bracher, A., Verghese, J. (2015). GrpE, Hsp110/Grp170, HspBP1/Sil1 and BAG Domain Proteins: Nucleotide Exchange Factors for Hsp70 Molecular Chaperones. Subcellular Biochemistry. Vol. 78, pp. 1-33.

11. Correa, D. H. A., Ramos, C. H. I. (2009). The use of circular dichroism spectroscopy to study protein folding, form and function. African Journal of Biochemistry Research. Vol. 3 (5), pp. 164-173.

12. da Silva, V. C. H., Cagliari, T. C., Lima, T. B., Gozzo, F. C., Ramos, C. H. I. (2013). Conformational and functional studies of a cytosolic 90 kDa heat shock protein Hsp90 from sugarcane. Plant Physiology and Biochemistry. Vol. 68, pp. 16- 22.

13. Dragovic, Z., Broadley, S. A., Shomura, Y., Bracher, A., Hartl, F. U. (2006). Molecular chaperones of the Hsp110 family act as nucleotide exchange factors of Hsp70s. The EMBO Journal. Vol. 25 (11), pp. 2519-2528.

14. Edelhoch, H. (1967). Spectroscopic determination of tryptophan and tyrosine in proteins. Biochemistry. Vol. 6 (7), pp. 1948–1954.

15. Edward, J. T. (1970). Molecular Volumes and the Stokes-Einstein Equation. Journal of Chemical Education. Vol. 47 (4), pp. 261-270.

16. Gao, X., Carroni, M., Nussbaum-Krammer, C., Mogk, A., Nillegoda, N. B., Szlachcic, A., Guilbride, D. L., Saibil, H. R., Mayer, M. P., Bukau, B. (2015). Human Hsp70 Disaggregase Reverses Parkinson's-Linked -Synuclein Amyloid Fibrils. Molecular cell. Vol. 59 (5), pp. 781-793.

17. Gava, L. M., Gonçalves, D. C., Borges, J. C., Ramos, C. H. I. (2011). Stoichiometry and thermodynamics of the interaction between the C-terminus of human 90 kDa heat shock protein Hsp90 and the mitochondrial translocase of outer

membrane Tom70. Archives of Biochemistry and Biophysics. Vol. 513 (2), pp. 119- 125.

18. Grimsley, G. R., Pace, N. (2004). Spectrophotometric Determination of Protein Concentration. Current Protocols in Protein Science. Chapter 3, Unit 3.1.

19. Hanahan, D. (1983). Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids. Journal of Molecular Biology. Vol. 166 (4), pp. 557-580.

20. Hengen, P. (1995). Purification of His-Tag fusion proteins from Escherichia coli. Trends in Biochemical Sciences. Vol. 20 (7), pp. 285–286.

21. Jachimska, B., Wasilewska, M., Adamczyk, Z. (2008). Characterization of Globular Protein Solutions by Dynamic Light Scattering, Electrophoretic Mobility, and Viscosity Measurements. Langmuir. Vol. 24 (13), pp. 6866-6872.

22. Laemmli, U. K. (1970). Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. Vol. 227 (5259), pp. 680-685.

23. Lakowicz, J. R. Principles of fluorescence spectroscopy. 2ª edição. Nova York: Springer, 1999.

24. Lakowicz, J. R. Principles of fluorescence spectroscopy. 3ª edição. Nova York: Springer, 2006.

25. Lee, G. J., Roseman, A. M., Saibil, H. R., Vierling, E. (1997). A small heat shock protein stably binds heat-denatured model substrates and can maintain a substrate in a folding-competent state. The EMBO Journal. Vol. 16 (3), pp. 659–671.

26. Lee-Yoon, D., Easton, D., Murawski, M., Burd, R., Subjeck, J. R. (1995). Identification of a Major Subfamily of Large hsp70-like Proteins through the Cloning of the Mammalian 110-kDa Heat Shock Protein. The Journal of Biological Chemistry. Vol. 270 (26), pp. 15725-15733.

27. Lehninger, A. L., Nelson, D. L., Cox, M. M. Principles of Biochemistry. 4ª edição. Nova York: W. H. Freeman & Company, 2004.

28. Lindquist, S., Craig, E. A. (1988). The heat-shock proteins. Annual Review of Genetics. Vol. 22, pp. 631-677.

29. Liu, Q., Hendrickson, W. A. (2007). Insights into Hsp70 Chaperone Activity from a Crystal Structure of the Yeast Hsp110 Sse1. Cell. Vol. 131 (1), pp. 106–120.

30. Mattoo, R. U. H., Sharma, S. K., Priya, S., Finka, A., Goloubinoff, P. (2013). Hsp110 Is a Bona Fide Chaperone Using ATP to Unfold Stable Misfolded Polypeptides and Reciprocally Collaborate with Hsp70 to Solubilize Protein Aggregates. The Journal of Biological Chemistry. Vol. 288 (29), pp. 21399–21411.

31. Mokry, D. Z., Abrahão, J., Ramos, C. H. I. (2015). Disaggregases, molecular chaperones that resolubilize protein aggregates. Anais da Academia Brasileira de Ciências. Vol. 87 (2), pp. 1273-1292.

32. Nelson, D. L., Cox, M. M. Lehninger – Princípios de Bioquímica. 3ª edição. São Paulo: Sarvier, 2002.

33. Nillegoda, N. B., Bukau, B. (2015). Metazoan Hsp70-based protein disaggregases: emergence and mechanisms. Frontiers in molecular biosciences. Vol. 2 (57), pp. 1-12.

34. Nillegoda, N. B., Kirstein, J., Szlachcic, A., Berynskyy, M., Stank, A., Stengel, F., Arnsburg, K., Gao, X., Scior, A., Aebersold, R., Guilbride, D. L., Wade, R. C., Morimoto, R. I., Mayer, M. P., Bukau, B. (2015). Crucial HSP70 co-chaperone complex unlocks metazoan protein disaggregation. Nature. Vol. 524 (7564), pp. 247- 251.

35. Nogueira, M. L. C., Franco, J. C., Gandelini, G. M., Ramos, C. H. I. The 70 KDA Heat Shock Protein Hsp70 as Part of a Protein Disaggregase System. In: Alexzander A. A. Asea; Punit Kaur; Stuart Calderwood. (Org.). Regulation of Heat

Shock Protein Responses. 1ed.: Springer International Publishing, 2018, v. 13, p. 155-180. Homepage: http://www.springer.com/br/book/9783319747149; Número da revisão: 1; ISBN: 9783319747149.

36. Oh, H. J., Chen, X., Subjeck, J. R. (1997). hsp110 Protects Heat-denatured Proteins and Confers Cellular Thermoresistance. The Journal of Biological Chemistry. Vol. 272 (50), pp. 31636–31640.

37. Pace, C. N., Vajdos, F., Fee, L., Grimsley, G., Gray, T. (1995). How to measure and predict the molar absorption coefficient of a protein. Protein Science. Vol. 4, pp. 2411-2423.

38. Petsko, G. A., Ringe, D. Protein Structure and Function. Londres: New Science Press Ltd., 2004.

39. Ramos, C. H. I. (2004). A Spectroscopic-based Laboratory Course for Protein Conformational Studies. Biochemistry and Molecular Biology Education. Vol. 32 (1), pp. 31-34.

40. Ramos, C. H. I. Dicroísmo circular para a análise da conformação de proteínas: uma visão prática. In: Salvatore Giovanni De Simone. (Org.). A arte da caracterização e separação de proteínas. Fortaleza: RDS gráfica e editora Ltda, 2008, v. 1.

41. Ramos, C. H. I., Ferreira, S. T. (2005). Protein folding, misfolding and aggregation: evolving concepts and conformational diseases. Protein and Peptide Letters. Vol. 12 (3), pp. 213-222.

42. Rampelt, H., Kirstein-Miles, J., Nillegoda, N. B., Chi, K., Scholz, S. R., Morimoto, R. I., Bukau, B. (2012). Metazoan Hsp70 machines use Hsp110 to power protein disaggregation. The EMBO Journal. Vol. 31 (21), pp. 4221-4235.

43. Raviol, H., Bukau, B., Mayer, M. P. (2006). Human and yeast Hsp110 chaperones exhibit functional differences. FEBS Letters. Vol. 580 (1), pp. 168–174.

44. Ribeiro-Jr, E. A., Ramos, C. H. I. (2004). Origin of the anomalous circular dichroism spectra of many apomyoglobin mutants. Analytical Biochemistry. Vol. 329, pp. 300-306.

45. Rosenzweig, R., Moradi, S., Zarrine-Afsar, A., Glover, J. R., Kay, L. E. (2013). Unraveling the mechanism of protein disaggregation through a ClpB-DnaK interaction. Science. Vol. 339 (6123), pp. 1080-1083.

46. Sambrook, J., Fritsch, E. F., Maniatis, T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2ª edição. Nova York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.

47. Sambrook, J., Russell, D. W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 3ª edição. Nova York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.

48. Sharma, S. K.; Rios, P. De Los; Christen, P.; Lusting, A.; Goloubinoff, P. (2010). The kinetic parameters and energy cost of the Hsp70 chaperone as a polypeptide unfoldase. Nature Chemical Biology. Vol. 6 (12), pp. 914–920.

49. Shiber, A., Ravid, T. (2014). Chaperoning Proteins for Destruction: Diverse Roles of Hsp70 Chaperones and their Co-Chaperones in Targeting Misfolded Proteins to the Proteasome. Biomolecules. Vol. 4 (3), pp. 704-724.

50. Shorter, J. (2011). The Mammalian Disaggregase Machinery: Hsp110 Synergizes with Hsp70 and Hsp40 to Catalyze Protein Disaggregation and Reactivation in a Cell-Free System. PLoS ONE. Vol. 6 (10), pp. 1-12.

51. Stryer, L. Bioquímica. 5ª edição. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2004.

52. Studier, F. W., Moffatt, B. A. (1986). Use of bacteriophage T7 RNA polymerase to direct selective highlevel expression of cloned genes. Journal of Molecular Biology. Vol. 189 (1), pp. 113-130.

53. Studier, F. W., Rosenberg, A. H., Dunn, J. J., Dubendorff, J. W. (1990). Use of T7 RNA polymerase to direct expression of cloned genes. Methods in Enzymology. Vol. 185, pp. 60-89.

54. Svetlov, M. S., Kommer, A., Kolb, V. A., Spirin, A. S. (2006). Effective cotranslational folding of firefly luciferase without chaperones of the Hsp70 family. Protein Science. Vol. 15 (2), pp. 242–247.

55. Tiroli, A. O., Ramos, C. H. I. (2007). Biochemical and biophysical characterization of small heat shock proteins from sugarcane. Involvement of a specific region located at the N-terminus with substrate specificity. International Journal of Biochemistry & Cell Biology. Vol. 39 (4), pp. 818-831.

56. Tiroli-Cepeda, A., Ramos, C. H. I. (2011). An overview of the role of molecular chaperones in protein homeostasis. Protein and Peptide Letters. Vol. 18 (2), pp. 101- 109.

57. Torrente, M., Shorter, J. (2013). The metazoan protein disaggregase and amyloid depolymerase system. Prion. Vol. 7 (6), pp. 457-463.

58. Tzankov, S., Wong, M. J. H., Shi, K., Nassif, C., Young, J. C. (2008). Functional Divergence between Co-chaperones of Hsc70. Journal of Molecular Biology. Vol. 283 (40), pp. 27100–27109.

59. Woody, R. W. (1995). Circular dichroism. Methods in Enzymology. Vol. 246, pp. 34-71.

60. Wyatt, P. (1993). Light scattering and the absolute characterization of macromolecules. Analytica Chimica Acta. Vol. 272 (1), pp. 1-40.

61. Zanphorlin, L. M., Alves, F. R., Ramos, C. H. I. (2014). The effect of celastrol, a triterpene with antitumorogenic activity, on conformational and functional aspects of human 90 kDa heat shock protein Hsp90, a chaperone implicated in the stabilization of the tumor phenotype. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects. Vol. 1840 (10), pp. 3145-3152.

8. Anexos