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Avantages et limites dans le domaine médical

TROISIEME PARTIE : PHAGOPROPHYLAXIE

V. Avantages et limites dans le domaine médical

1. Avantages

L’administration de phages prophylactiques dans le domaine médical offre certains avantages.

En prophylaxie, les densités bactériennes sont souvent moindres. Les produits de la dégradation bactérienne par les phages seront, par conséquent, quantitativement moins importants. La sécurité phagique est donc renforcée.

De plus, l’association des bactériophages à certains antibiotiques pourrait permettre de réduire les doses d’antibiotiques administrées et ainsi réduire certains effets indésirables.

Enfin, les phages n’interfèrent pas avec la cicatrisation [110]. Ceci est un élément important à prendre en compte dans le cadre de certaines chirurgies.

2. Limites

Dans la mesure où les bactéries sont présentes à de faibles densités, un traitement actif pourrait ne pas être possible. En effet, le seuil de densités bactériennes nécessaires à une autoréplication phagique peut ne pas être atteint. Un traitement passif devrait donc être envisagé.

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De plus, les traitements prophylactiques sont souvent des traitements empiriques, puisque le pathogène auquel l’individu pourrait être exposé n’est, dans la majorité des cas, pas connu par avance. L’utilisation de cocktails phagiques, permettant d’élargir le spectre d’activité, pourrait donc être préférée en prophylaxie.

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CONCLUSION

La phagothérapie a été découverte il y a plus de quatre-vingt-dix ans. Après des débuts prometteurs, elle est progressivement tombée dans l’oubli dans les pays Occidentaux.

Actuellement, elle suscite de nouveau l’intérêt de scientifiques et de quelques industriels et hommes politiques. Les avantages qu’offre la phagothérapie n’y sont probablement pas étrangers. En effet, les bactériophages peuvent être considérés comme des « médicaments (car ils répondent effectivement à la définition du médicament) intelligents », puisqu’ils sont autorépliquant (capable de multiplication in situ) et auto-limitant. De plus, le pouvoir bactéricide des phages virulents, la possibilité d’éliminer la bactérie pathogène sans altération de la floreendogène et le faible nombre d’effets indésirables observés justifient indéniablement lepositionnement de la phagothérapie comme une alternative crédible à l’antibiothérapie ou enassociation avec les antibiotiques. L’utilisation de phages en prophylaxie offre également despossibilités intéressantes dans des domaines variées.

A ce jour, toutes les propriétés des bactériophages ne sont pas connues. Les éventuelles applications que pourraient offrir ces virus ne se limitent pas à la seule phagothérapie. En effet, les phages sont étudiés dans d’autres domaines parmi lesquels on retrouve la biologie moléculaire, la génétique, les transplantations cutanées ou le traitement de tumeurs.

L’état ou la multirésistance de bactéries aux antibiotiques est-elle que toute les solutions sont les bienvenue, parce qu’on a atteint un niveau de multirésistance qui a des conséquences claire sur la morbidité et sur la mortalité, d’où l’intérêt de surveiller de prés les bactériophages.

Il est trop tôt pour dire s’il s’agit de la potion miracle ou une simple ruse qui nous permettra de gagner du temps, on ne sait pas assez encore aujourd’hui pour connaitre les résultats, c’est le même problème que les organismes génétiquement modifiés, il semble que c’est que se soit une bonne chose mais est-ce le cas vraiment !? Il faut garder en tête qu’une fois le génie est sortie de la bouteille, il est très difficile de le faire rentrer.

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Résumé

Titre : Rôle de la phagoterapie dans le traitement des infections bacteriennes Auteur : Abdessamad ERRAFYG

Mots clés : Phagothérapie – Bactériophage – Infection lytique – résistance bactérienne s

Devant l‘évolution inexorable des bactéries résistantes aux antibiotiques, il est devenu urgent de trouver des solutions viables. Le traitement par les bactériophages, ancienne thérapeutique antibactérienne, semblerait pouvoir apporter sa contribution dans la recherche de nouveaux moyens pour combattre les infections en échec.

Les bactériophages disposent d‘un matériel génétique (ADN ou ARN), ce qui commande la machinerie de la cellule hôte, et par le biais de mutations sont capables d‘attaquer et tuer les bactéries multi-résistantes par le simple principe lytique, présentant donc un grand avantage.

Des faits récents apportent des arguments nouveaux qui devraient pousser à mettre en valeur la phagothérapie et donc la revoir comme complément à l‘antibiothérapie Ce n‘est pas une découverte mais aujourd‘hui et plus que jamais, cette association doit être envisagée, et pas seulement si les bactéries sont résistantes aux antibiobiques.

La potentialisation des antibiotiques par les phages, la dégradation des biofilms qui protègent les bactéries persistantes, un éventuel blocage du système SOS des bactéries soumis à l‘action des antibiotiques, sont autant de pistes qui méritent un intérêt.

Aujourd‘hui, le contexte de la recherche médicale est bien différent de celui des débuts de la phagothérapie car elle est envisagée dans plusieurs applications, notamment la prophylaxie et Le traitement des maladies infectieuses, en plus de la génétique et la biologie moléculaire, et donc constitue un outil de recherche à réévaluer.

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Summary

Title: Role of phage therapy in the treatment of bacterial infections Author: Abdessamad ERRAFYG

Key words: Phage therapy – bacteriophage – lytic infection – bacterial resistance.

Faced with the inexorable evolution of antibiotic resistant bacteria, it became urgent to find workable solutions. Treatment with bacteriophages, former antibacterial therapy, seem to contribute in the search for new ways to fight infections in check.

Bacteriophages have genetic material (DNA or RNA), which controls the machinery of the host cell, and through mutations are able to attack and kill multi-resistant bacteria simply by lytic principle, thus presenting a great advantage.

Recent developments provide new arguments that should push to enhance the review and therefore the phage therapy as an adjunct to antibiotic therapy This is not a discovery but now more than ever, this association should be considered, not only if the bacteria are resistant to antibiotics.

The potentiating of antibiotics by phages, degradation of biofilms that protect bacteria are persistent, a possible system crash SOS bacteria subjected to the action of antibiotics are all tracks that are worth a visit.

Today, the context of medical research is very different from the early days of phage therapy because it is considered in many applications, including prophylaxis and treatment of infectious diseases, in addition to genetics and molecular biology and thus constituted a research tool to reassess.

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BIBLIOGRAPHI ET WEBOGRAPHIE

1. Jończyk e, the influence of external factors on bacteriophages—review. folia microbiologica 2011, 56(3) : 191-200.

2. Sulakvelidze a, bacteriophages: biology and applications 2005: crc press.

3. Barrette g, évaluation de l’utilisation des bactériophages anti-staphylococcus aureus pour l’assainissement de surfaces. école polytechnique de montréal 2015.

4. Dublanchet a., des virus pour combattre les infections. favre ed 2009: 115-21.

5. Inal j, phage therapy: a reappraisal of bacteriophages as antibiotics. archivum immunologiae et therapiae experimentalis-english edition 2003, 51(4) : 237-44. 6. Ictv, virus taxonomy : 2012 release in: international committee on taxonomy of

viruses [en ligne]. [http://www.ictvonline.org/virustaxonomy.asp?version=2012] (consultation le 24/7/16) 2012.

7. Ackermann h, bacteriophage observations and evolution. research in microbiology 2003, 154(4) : 245-51.

8. Gilmore b, bacteriophages as anti-infective agents: recent developments and regulatory challenges. expert review of anti-infective therapy 2012, 10(5): 533-35. 9. Calendar r, the bacteriophages. oxford university press on demand 2006.

10. Dublanchet a, Patey o, la phagothérapie: passé et avenir (faits nouveaux et procédure [s] pour une réhabilitation). immuno-analyse & biologie spécialisée 2011, 26(4): 165-75.

11. Skurnik m, Strauch e. phage therapy: facts and fiction. international journal of medical microbiology 2006, 296(1) : 5-14.

12. Jacquet s, viruses : conductors of aquatic ecosystems ? presented at the infectiologie bactérienne : quelle place pour la phagothérapie?, i.p.d.p., france., des virus pour combattre les infections. favre ed 2007: 115-21.

13. Personnic s, les virus planctoniques: un compartiment biologique clé des milieux aquatiques. le courrier de l'environnement de l'inra 2006, 53(53): 19-34.

15. Souza v, an endangered oasis of aquatic microbial biodiversity in the chihuahuan desert. proceedings of the national academy of sciences 2006, 103(17): 6565-70. 16. Viruses : conductors of aquatic ecosystems ? presented at the infectiologie bactérienne

: quelle place pour la phagothérapie? institut pasteur de paris, france 2007.

17. Grossi o, évaluation de l’efficacité d’une suspension de bactériophages anti-staphylococciques: corrélation in vitro-in vivo 2006.

18. Lysogenic cycle - phage lambda in: biology 1151, principles of biological science [en ligne]. [http://bio1151b.nicerweb.net/] (consultation le 01/08/16).

19. Sulakvelidze a, alavidze z., morris g., bacteriophage therapy. antimicrobial agents and chemotherapy 2001, 45(3): 649-659.

20. Miller e, bacteriophage t4 genome. microbiology and molecular biology reviews 2003,

67(1): 86-156.

21. Poincare h, intérêtdu génotypage des phages arnf-spécifiques pour estimer la pollution fécale et virale des eaux.

22. Marine b, bactériophage in: biologie marine.com [en ligne].

[http://www.biologiemarine.com/micro/bacphage.htm] (consultation le 01/08/16).

23. Zinder n, forty years ago: the discovery of bacterial transduction. genetics 1992,

132(2): 291.

24. Sulakvelidze a, safety by nature: potential bacteriophage applications-bacteriophages offer opportunities for safely managing bacterial infections. microbe 2011, 6(3): 122. 25. Loc-carrillo c, Abedon s, pros and cons of phage therapy. bacteriophage 1: 111–14,

2011.

26. Kuhl s, Mazure h, d’Hérelle. preparation of therapeutic bacteriophages, appendix 1 from: le phénomène de la guérison dans les maladies infectieuses: masson et cie 1938, paris—oclc 5784382. bacteriophage 2011, 1(2): 55-65.

27. Abedon s, phage treatment of human infections. bacteriophage 1: 66–85. 2011. 28. D'hérelle f., le bactériophage et son comportement 1926: masson.

29. Ruffat m, 175 ans d'industrie pharmaceutique française: histoire de synthélabo 1996: ed. la découverte.

30. Fruciano d, Bourne s, phage as an antimicrobial agent: d’Herelle’s heretical theories and their role in the decline of phage prophylaxis in the west. canadian journal of infectious diseases and medical microbiology 2007, 18(1): 19-26.

31. Sauvé l., le bactériophage in chirurgie. la médecine 1936, 17: 49-54.

32. El moukhlis A, m.a, phagothérapie passe et avenir 2012, universite mohammed v. 33. Drouji s, mise au point des bactériophages: caractéristiques et applications 2009. 34. Carlet j, Rambaud c, pulcini c, alliance contre les bactéries multirésistantes : sauvons

les antibiotiques ! annales françaises d'anesthésie et de réanimation 2012, 31(9): 704-08.

35. The bacterial challenge : time to react. ecdc/emea joint technical report, september 2009.

36. Charles d, 1809-1882. citation evolution. www.atheisme.free.fr.

37. Godin c, evaluation de l’utilisation de l’outil e-sin dans la gestion du signalement externe des infections nosocomiales.

38. Gorski a, 2 phage as a modulator of immune responses: practical implications for phage therapy. advances in virus research 2012, 83: 41.

39. Chups, pharmacologie - dcem1 in: faculté de médecine pierre et marie curie.

[http://www.chups.jussieu.fr/polys/pharmaco/poly/cinetique.html] (consultation le

8/08/16).

40. Górski a, bacteriophage translocation. fems immunology & medical microbiology 2006, 46(3): 313-19.

41. Weber d, effect of phage therapy on the turnover and function of peripheral neutrophils. fems immunology & medical microbiology 2002, 34(2): 135-38.

42. Appelmans r, le bacteriophage dans l’organisme. cr seances soc biol fil 1921, 85: 722-24.

43. Dubos r, straus j, pierce c, the multiplication of bacteriophage in vivo and its protective effect against an experimental infection with shigella dysenteriae. the journal of experimental medicine 1943, 78(3): 161.

44. Evans a, inactivation of antistreptococcus bacteriophage by animal fluids. public health rep 1933, 48: 411-26.

45. Smith h, huggins m, shaw k, the control of experimental escherichia coli diarrhoea in calves by means of bacteriophages. microbiology 1987, 133(5): 1111-26.

46. Krueger a, scribner e, the bacteriophage: its nature and its therapeutic use. journal of the american medical association 1941, 116(20): 2269-77.

47. Bruttin a, brüssow h, human volunteers receiving escherichia coli phage t4 orally: a safety test of phage therapy. antimicrobial agents and chemotherapy 2005; 49(7), 2874-78.

48. Merril c, long-circulating bacteriophage as antibacterial agents. proceedings of the national academy of sciences 1996, 93(8): 3188-92.

49. Bull j., dynamics of success and failure in phage and antibiotic therapy in experimental infections. bmc microbiology 2002, 2(1): 1.

50. Levin b, Bull j, population and evolutionary dynamics of phage therapy. nature reviews microbiology 2004, 2(2): 166-73.

51. Payne r, Jansen v, understanding bacteriophage therapy as a density-dependent kinetic process. journal of theoretical biology 2001, 208(1): 37-48.

52. Kasman l.m, overcoming the phage replication threshold: a mathematical model with implications for phage therapy. journal of virology 2002, 76(11): 5557-64.

53. Weld r, Butts c, Heinemann j, models of phage growth and their applicability to phage therapy. journal of theoretical biology 2004, 227(1): 1-11.

54. Wiggins b, Alexander m, minimum bacterial density for bacteriophage replication: implications for significance of bacteriophages in natural ecosystems. applied and environmental microbiology 1985, 49(1): 19-23.

55. Sharp r, bacteriophages: biology and history. journal of chemical technology and biotechnology 2001,76(7): 667-72.

56. Kabéshima t, sur un ferment d’immunité bactériolysant, du mécanisme d’immunité infectieuse intestinale, de la nature du dit “microbe filtrant bactériophage” de d’herelle. compt rend soc biol paris 1920, 83: 219-21.

57. Kniotek m, bacteriophage interactions with t cells and platelets. immunology 2004: 189-93.

58. Przerwa a, effects of bacteriophages on free radical production and phagocytic functions. medical microbiology and immunology 2006, 195(3): 143-50.

59. Mankiewicz e, Kurti v, Adomonis h, the effect of mycobacteriophage particles on cell-mediated immune reactions. canadian journal of microbiology 1974 20(9):1209-18. 60. Zimecki m, bacteriophages provide regulatory signals in mitogen-induced murine

splenocyte proliferation. cellular and molecular biology letters 2003, 8(3): 699-712. 61. Kniotek m, phages as immunomodulators of antibody production. immunology 2004:

33-37.

62. Kumari s, Harjai k, Chhibber s, vidence to support the therapeutic potential of bacteriophage kpn5 in burn wound infection caused by klebsiella pneumoniae in balb/c mice. j microbiol biotechnol 2010, 20(5): 935-41.

63. Debarbieux l, bacteriophages can treat and prevent pseudomonas aeruginosa lung infections. journal of infectious diseases 2010, 201(7): 1096-1104.

64. Weber d, Mulczyk m, Górski a, bacteriophage therapy of bacterial infections: an update of our institute’s experience, in inflammation 2001, springer: 201-09.

65. Miedzybrodzki r, 3 clinical aspects of phage therapy. advances in virus research 2012:

83, 73.

66. Comeau a.m, la «synergie phages-antibiotiques». médecine/sciences 2008, 24: 449-74. 67. Balog j, Donoghue a, 27 bacteriophage: potential role in food safety. preharvest and

postharvest food safety: contemporary issues and future directions 2008, 16: 365. 68. Hyman p.,abedon s, bacteriophage host range and bacterial resistance. advances in

applied microbiology 2010, 70: 217-48.

69. Abedon s, Thomas-abedon c, phage therapy pharmacology. current pharmaceutical biotechnology 2010, 11(1): 28-47.

70. Abedon s, phage treatment of human infections. bacteriophage 2011, 1(2): 66-85. 71. Abedon s, lysis and the interaction between free phages and infected cells. molecular

72. Chan b, abedon s, bacteriophage adaptation, with particular attention to issues of phage host range 2012, nova science publishers, ny, usa, 25-52.

73. Cairns b, Payne r, bacteriophage therapy and the mutant selection window. antimicrobial agents and chemotherapy 2008,52(12): 4344-50.

74. Alisky j, bacteriophages show promise as antimicrobial agents. journal of infection 1998, 36(1): 5-15.

75. Pirisi a, phage therapy—advantages over antibiotics? the lancet 2000, 356(9239): 1418.

76. Van helvoort t, bacteriological and physiological research styles in the early controversy on the nature of the bacteriophage phenomenon. medical history 1992,

36(03): 243-70.

77. Carlton r, phage therapy: past history and future prospects. archivum immunologiae et therapiae experimentalis-english edition 1999, 47: 267-74.

78. Magali c, Elisabeth b, la phagothérapie : historique et potentielle utilisation contre les infections à bactéries multirésistantes. thèse pour le doctorat vétérinaire présentée et soutenue publiquement devant la faculté de médecine de créteil le 30 janvier 2014. 79. Les bactéries résistantes aux antibiotiques : note d’analyse 299 in: centre d’analyse

stratégique du premier ministre français [en ligne]. centre d’analyse stratégique du premier ministre français. [

http://www.strategie.gouv.fr/content/bacteries-resistantes-antibiotiques-na299], 2012.(consultation le 11/08/16).

80. Hervey t, Mchale j, health law and the european union 2004: cambridge university press.

81. Scott l, Simpson d, voriconazole. drugs 2007, 67(2): 269-98.

82. D’helsinki d, principes éthiques applicables à la recherche médicale impliquant des êtres humains». world medical association 1964.

83. Kutter e, phage therapy, in biotherapy-history, principles and practice 2013, springer: 191-231.

84. Biofutur et geephage (2013). le renouveau de la phagothérapie. pourquoi ? comment ? . institut mutualiste montsouris-paris in: supbiotech, 2013. [en ligne].

[http://blogs.supbiotech.fr/2013/01/forum-phagotherapie-2013.html] (consultation le11/08/16).

85. Fineran p, the phage abortive infection system, toxin, functions as a protein–rna toxin– antitoxin pair. proceedings of the national academy of sciences 2009, 106(3): 894-99. 86. Labrie s, Samson j, Moineau s, bacteriophage resistance mechanisms. nature reviews

microbiology 2010, 8(5): 317-27.

87. Kutateladze m, Adamia r, bacteriophages as potential new therapeutics to replace or supplement antibiotics. trends in biotechnology 2010, 28(12): 591-95.

88. Capparelli r, experimental phage therapy against staphylococcus aureus in mice. antimicrobial agents and chemotherapy 2007, 51(8): 2765-73.

89. Lammertyn e, evidence for the presence of legionella bacteriophages in environmental water samples. microbial ecology 2008, 56(1): 191-97.

90. Danelishvili l, Young l, Bermudez l, in vivo efficacy of phage therapy for mycobacterium avium infection as delivered by a nonvirulent mycobacterium. microbial drug resistance 2006, 12(1): 1-6.

91. Faruque s, self-limiting nature of seasonal cholera epidemics: role of host-mediated amplification of phage. proceedings of the national academy of sciences 2005,102(17): 6119-6124.

92. Maliki a, fièvre typhoïde: renforcer la vaccination par l’hygiène 2013.

93. Goodridge l, Bisha b, phage-based biocontrol strategies to reduce foodborne pathogens in foods. bacteriophage 2011, 1(3): 130-37.

94. Garcia p , bacteriophages and their application in food safety. letters in applied microbiology 2008, 47(6): 479-85.

95. Connerton p , Timms a, Connerton i, campylobacter bacteriophages and bacteriophage therapy. journal of applied microbiology 2011, 111(2): 255-65.

96. Wall s, phage therapy to reduce preprocessing salmonella infections in market-weight swine. applied and environmental microbiology 2010, 76(1): 48-53.

97. Park s, isolation of bacteriophages specific to a fish pathogen, pseudomonas plecoglossicida, as a candidate for disease control. applied and environmental microbiology 2000, 66(4): 1416-22.

98. Nakai t., park s., bacteriophage therapy of infectious diseases in aquaculture. research in microbiology 2002, 153(1): 13-18.

99. Karunasagar i, biocontrol of pathogens in shrimp hatcheries using bacteriophages. aquaculture 2007, 268(1): 288-92.

100. Holck A , Berg J, Soni k, Inhibition of Listeria monocytogenes in cooked ham by virulent bacteriophages and protective cultures.Applied and environmental microbiology 2009. 75(21): 6944-46.

101. Boubendir a , incidence de listeria spp. et autres bactéries psychrotrophes dans le lait cru bovin dans le nord est algérien. revue de medecine veterinaire 2011, 162(5): 265. 102. Carlet j , ready for a world without antibiotics? the pensières antibiotic resistance call

to action. antimicrobial resistance and infection control 2012, 1(1): 1.

103. Callejón r, reported foodborne outbreaks due to fresh produce in the united states and european union: trends and causes. foodborne pathogens and disease 2015, 12(1): 32-38.

104. Guenther s, virulent bacteriophage for efficient biocontrol of listeria monocytogenes in ready-to-eat foods. applied and environmental microbiology 2009, 75(1): 93-100. 105. Holck a. berg j., inhibition of listeria monocytogenes in cooked ham by virulent

bacteriophages and protective cultures. applied and environmental microbiology 2009,

75(21): 6944-46.

106. Soni k, Nannapaneni r, hagens s, reduction of listeria monocytogenes on the surface of fresh channel catfish fillets by bacteriophage listex p100. foodborne pathogens and disease 2010, 7(4): 427-34.

107. Dewaal c, foods associated with foodborne illness outbreaks from 1990 through 2003. food protection trends 2006, 26(7): 466-73.

108. Question sur la phagothérapie in: question orale sans débat n° 0350s publiée dans le jo sénat du 21/02/2013 - page 543 ; réponse du ministère chargé des personnes âgées et

de l’autonomie publiée dans le jo sénat du22/05/2013 -page 4294 [en ligne].

[http://www.senat.fr/questions/base/2013/qseq13020350s.html](consultation le

14/08/16).

109. Siringan p, bacteriophage-mediated dispersal of campylobacter jejuni biofilms. applied and environmental microbiology 2011, 77(10): 3320-26.

110. Carson l., gorman, gilmore b., the use of lytic bacteriophages in the prevention and eradication of biofilms of proteus mirabilis and escherichia coli. fems immunology & medical microbiology 2010, 59(3): 447-55.