Xylella fastidiosa – Plan de surveillance 2018
DRAAF Auvergne-Rhône-Alpes Service régional de l'alimentation
06 juin 2018
GENERALITES
✔ Maladie de Pierce (USA)
✔ Chlorose variéguée des agrumes (Brésil)
✔ Complexe de dessèchement rapide des oliviers (Italie)
●
Bactérie polyphage, organisme de quarantaine réglementé au niveau UE
●
Plus de 359 espèces sensibles recensées dans le monde (EFSA, liste mise à jour en février 2016) : liste en augmentation (prochaine mise à jour par l'EFSA)
●
Véhiculé par des insectes vecteurs de l'infra-ordre des Cicadomorpha qui se nourrissent de la sève brute (xylème)
●
Bactérie du xylème, Xylella fastidiosa empêche la plante de s'alimenter
en gênant la circulation de la sève brute.
GENERALITES
● Plusieurs sous-espèces : pauca, fastidiosa, multiplex, sandyi, morus, (tashke)
● Spécificité d'hôte à l'échelle de la souche
● Des situations très contrastées selon la
souche/ la plante hôte/ le vecteur/ l'environnement
Source : Rodrigo Almeida
« Il n'y a pas une mais plusieurs Xylella fastidiosa »
MALADIE DE PIERCE
● Décrite pour la première fois à la fin du XIXe siècle
> Dépérissement des vignobles californiens
> Divers épisodes catastrophiques à plusieurs années d’intervalles (fin XIXe, années 30-40, années 90-2000)
> nouveau regain dans les années 1990 avec l'arrivée d'un vecteur invasif très efficace dans la région : Homalodisca vitripennis → 100 %
d'infection en un an et 40 % de pertes dans le Temecula
● Coût annuel aux États Unis aujourd'hui :
> manque à gagner pour l'industrie du vin et raisin de tale : 100 million $/an
> coût de la gestion dans les vignobles : 100 million $/an
Source : Rodrigo Almeida
X. fastidiosa subsp. fastidiosa, ST1
MOYENS DE LUTTE
●
Il n'existe pas de moyen de lutte curatif
●
Gestion de la maladie :
➔ Assainissement des foyers par l'arrachage des plantes contaminées
➔ Gestion des populations d'insectes vecteurs par des traitements phytosanitaires
●
Prévention
➔ Bonnes pratiques agricoles : utilisation de variétés moins sensibles, élimination de végétaux sensibles dans l'environnement d'une zone cultivée,
protection matérielle, PGRP…
➔ Sensibilisation du public aux risques liées aux maladies des végétaux
VECTEURS
Source : INRA- CBGP
Aphrophoridae
Cicadellidae Cicadidae
Cercopidae
- Liste de 51 espèces suceurs de sève brute
- Espèces sans intérêt agronomique ni patrimonial - Des espèces très communes et très « polyphages »
- Pas de clé d’identification pour l’Europe ou la France (sauf Allemagne)
- Répartition très mal connue
- Données biologiques très fragmentaires : - ne passent pas l’hiver
- pas de transmission par l’œuf et purge bactérienne à chaque mue
- Impossible de transposer les connaissances US en Europe :
- espèces et biologies différentes,
- comportement différents des mêmes espèces
Surveillance
● Méthodes d'analyse listées dans une base de données en ligne
✗ Zones indemnes : validation par deux méthodes moléculaires
✗ Zones délimitées : validation par une méthode moléculaire OU une méthode sérologique (ex. ELISA) et une méthode moléculaire
Éradication
● Évolution du rayon des zones délimitées : de 10 km à 5 km (jusqu'à 1km sous certaines conditions)
Enrayement
● Corse et Iles Baleares en stratégie d'enrayement
● Possibilité de planter des végétaux hôtes, en privilégiant les espèces les moins sensibles lorsqu'elles sont connues
PRINCIPALES ÉVOLUTIONS DE LA DECISION
Dispositions en zones infectées
● Possibilité de déroger à l'obligation d'arrachage de sujets 'patrimoniaux', sous certaines conditions
Dispositions en zones tampons
● Surveillance de la zone tampon dans des quadrats de 100 x 100 m dans le 1er km puis 1km x 1 km dans le reste de la zone
Circulation des végétaux sur le territoire européen
● Évolution des dispositions de la dérogation 9.2 pour la sortie des végétaux spécifiés des zones délimitées
● Dispositions spécifiques pour les espèces 'à risque' intra-UE : Olea europaea,
Polygala myrtifolia, Lavandula dentata, Nerium oleander, Prunus dulcis, Coffea sp.
→ inspections et prélèvements pour analyse dans le site de production
● Dispositions spécifiques pour les espèces 'à risque' à l'import : même exigences
PERSPECTIVES : ÉVOLUTIONS DE LA DECISION
SITUATION PHYTOSANITAIRE
SITUATION DANS LE MONDE
https://gd.eppo.int/taxon/XYLEFA/distribut ion
SITUATION EN EUROPE
4 États membres ont identifié Xf sur leur territoire
2016
2016
2017
2013
2015
2015
● Identifiée en 2013, Sous-espèce pauca, souche CoDiRO
● Trois nouveaux échantillons d'olivier ont été détectés positifs dans la zone d'enrayement en septembre 2017
● Surveillance renforcée de la zone tampon et la zone d'enrayement : identification régulière d'oliviers
contaminés, qui sont alors arrachés
SITUATION EN EUROPE
ITALIE
● En juin 2016, la bactérie (sous espèce fastidiosa) a été détectée sur un plant de Laurier-rose dans une petite pépinière produisant de jeunes
végétaux et des plantes ornementales, et
accueillant les plantes de particuliers pendant l’hiver dans une petite serre.
● 4 plants contaminés des espèces : laurier rose (Nerium oleander), romarin (Rosmarinus),
hybrides de Streptocarpus et hybrides de Erysimum.
● A ce jour, il n’existe pas d’élément qui indiquerait que la contamination se soit répandue au-delà de l’établissement
SITUATION EN EUROPE
ALLEMAGNE
SITUATION EN EUROPE
ESPAGNE – ILES BALEARES - MAJORQUE
Majorque ● À ce jour, 360 échantillons positifs
● Sous-espèces multiplex et fastidiosa
➔ Xf fastidiosa : Cistus monspeliensis, Polygala myrtifolia, Prunus avium, Prunus dulcis, Vitis vinifera,
➔ Xf multiplex : Ficus carica, Fraxinus angustifolius, Olea europaea, Polygala myrtifolia, Acacia saligna, Lavandula dentata, Prunus domestica
➔ Sous espèce non identifiée : Nerium oleander, Rosmarinus officinalis, Juglans regia
SITUATION EN EUROPE
ESPAGNE – ILES BALEARES - MAJORQUE
●
Une trentaine de Vitis contaminés à Majorque
●
Vignes de production de vin et raisin de table
●
Sous-espèce fastidiosa,
sequence type 'ST1' : même
ST que la maladie de Pierce
SITUATION EN EUROPE
ESPAGNE – ILES BALEARES - MAJORQUE
SITUATION EN EUROPE
ESPAGNE – ILES BALEARES - IBIZA
Ibiza
●
À ce jour, 103 échantillons positifs
●
Sous-espèce pauca
➔ Xf pauca : Acacia saligna, Lavandula dentata, Olea europaea, Polygala myrtifolia
➔Sous-espèce non identifiée : Nerium
oleander, Prunus dulcis, Rosmarinus officinalis
SITUATION EN EUROPE
ESPAGNE – ILES BALEARES - MINORQUE
Minorque
●
84 échantillons contaminés
●
Sous-espèce multiplex
➔ Xf multiplex : Olea europaea, Rosmarinus officinalis
➔ Sous-espèce non identifiée : Ficus carica, Polygala myrtifolia, Rhamnus alaternus
●
Première détection de Xf dans la province d'Alicante
●
Signalement : observation d'une baisse de rendement dans un verger d'amandiers âgés de +30 ans (majoritairement variétés 'Marcona' et 'Guara')
●
Espèce touchée : Prunus dulcis (amandier)
●
Sous-espèce : multiplex (ST6)
SITUATION EN EUROPE
ESPAGNE – ALICANTE
SITUATION EN FRANCE
NATIONAL
●
Depuis 2015, près de 25 000 échantillons analysés pour la recherche de Xylella sur l'ensemble du territoire
●
À ce jour, deux régions concernées : Corse et PACA (Var et Alpes-Maritime)
●
Très polyphage, Xf identifiée sur 40
espèces différentes en France
SITUATION EN FRANCE
CORSE
●
Foyers situés essentiellement en milieux urbains et zones naturels (maquis, foret) : pas de zone cultivée touchée
●
Sous-espèce multiplex (ST6 et ST7)
●
Éradication non réalisable : adoption d'une stratégie d'enrayement
> Près de 16 000
échantillons analysés depuis 2015
> 918 (5,8%) échantillons positifs
SITUATION EN FRANCE
CORSE
P. myrtifolia, C. villosa, H. italicum, C.
monspeliensis
représentent 80 % des échantillons contaminés
rôle de P. myrtifolia : indicateur de présence de X. fastidiosa ?
rôle de C.
monspeliensis : vivier d'insectes vecteurs ? Compartiment caché ?
SITUATION EN FRANCE
PACA
●
Foyers urbains et péri-urbains : Var et Alpes-Maritimes
●
Stratégie d'éradication
●
Deux sous-espèces identifiées :
➔
multiplex
➔
pauca (1 foyer)
> Près de 5 600 échantillons analysés depuis 2015
> 123 (2%) échantillons positifs
SITUATION EN FRANCE
PACA
SITUATION EN FRANCE
●
Faible progression de la limite des zones délimitées depuis 2016
●
Stabilisation des zones de foyers
Janvier
2016 Décembre
2017
RÉUNION DE HAUT NIVEAU – 30/11 et 01/12
● Réunion des Etats membres concernés par Xf en Europe à l'Académie Diplomatique
Internationale :
➔ Territoires touchés : Italie, Espagne, Allemagne, France
➔ Territoires indemnes mais à risque : Portugal, Slovénie, Croatie, Grèce, Malte, Chypre
+ Commission européenne
● Interventions : EFSA, OEPP, INRA
● Programme :
➔ Jeudi 30/11 : réunion technique avec les COPHS
➔ Vendredi 1 décembre : réunion en présence des Ministres et des COPHS
●
Feuille de route ambitieuse pour renforcer la prévention et de la lutte contre Xf
✔ Améliorer les connaissances au sujet de Xf
✔ Renforcer la surveillance et améliorer les mesures de gestion
✔ Renforcer les actions de sensibilisation et de partage d'information
➔
Présentation à la prochaine réunion des COPHS par Alain Tridon
➔
Présentation au prochain conseil de l'UE en janvier 2018
RÉUNION DE HAUT NIVEAU – 30/11 et 01/12
SURVEILLANCE NATIONALE
ORGANISATION DE LA LUTTE CONTRE X. FASTIDIOSA
●
205 agents de l’État participent à temps plein ou partiel aux activités en relation avec Xylella fastidiosa
●
La planification et l'organisation des contrôles sont encadrées par la
DGAl
●
Mise en œuvre de la
réglementation au sein des DRAAF-
SRAl (ou leur délégataire FREDON)
et par les délégataires nationaux
FranceAgriMer, GNIS-SOC, CTIFL
ORGANISATION DE LA SURVEILLANCE XYLELLA
Objectifs de la surveillance :
- vérifier le caractère indemne du territoire
- détecter la présence de Xf le plus précisément possible
ORGANISATION DE LA SURVEILLANCE XYLELLA
Lieux de surveillance prioritaire :
Entrée dans le territoire : Points d'Entrée Communautaires (PEC), pépiniéristes revendeurs de plants (grossistes), marchés d'intérêt national (MIN) ;
Circuits de distribution : Jardineries et autres points de vente au détail, marchés locaux ;
Cultures de végétaux hôtes et spécifiés dont les pépiniéristes producteurs.
Zones prioritaires après analyse de risque : les
départements des côtes méditerranéenne et atlantique et dans
les autres zones à conditions climatiques équivalentes.
ORGANISATION DE LA SURVEILLANCE XYLELLA
La surveillance officielle des végétaux spécifiés
→ Priorité : végétaux hôtes de multiplex, pauca et fastidiosa
Suivi des filières à risque en Auvergne-Rhône-Alpes:
Arboricole
Oliviers : 80 parcelles
Pêchers et abricotiers : 30 parcelles chacun Cerisiers : 20 parcelles
Pruniers : 10 parcelles
PPAMC (plantes à parfum aromatique, médicinale et condimentaire)
Lavandes, Lavandin et Romarin : 5 parcelles chacun
Immortelle d’Italie : 2 parcelles
ORGANISATION DE LA SURVEILLANCE XYLELLA
Viticole
1 % des parcelles prospectées pour la flavescence dorée (945 parcelles sur 70 communes en 2017)
Ornementale
Tous les établissements soumis à passeport phytosanitaire (272 établissements en 2017 dont 232 pépiniéristes)
5 marchés dont bourses d’échanges
SURVEILLANCE RENFORCÉE DE LA FILIÈRE VITIS
PRÉLÈVEMENTS
●
Que prélever ? :
➔ Répartition très hétérogène de la bactérie dans la plante
➔ Zones les plus chargées en bactéries : pétiole et nervure centrale
➔ Choix du prélèvement : tissus sains, idéalement à proximité de tissus symptomatiques, éviter les jeunes pousses
➔ Prélèvements asymptomatiques : représentatif de l'ensemble du végétal, éviter les jeunes pousses
●
A quelle période prélever ? :
➔ Surveillance pendant les périodes les plus favorables à l'expression des symptômes : été-automne
➔ Les prélèvements après les périodes chaudes augmentent la probabilité de détection de la bactérie quand elle est présente
●
Taille de l'échantillon : au moins 5 feuilles pour Vitis
● Mesures prophylactiques : désinfecter le sécateur et tout autre matériel de prélèvement
● Marquage et identification des pieds prélevés (étiquette, bombe, ruban…)
● Conservation :
➔ échantillons maintenus dans du papier journal ou papier absorbant puis placés dans un contenant fermé (sachet plastique...)
➔ Conservation à basse température
● Envoi au laboratoire dans les meilleurs délais après le prélèvement
➔ L'échantillon doit être réceptionné au plus tard le vendredi matin de chaque semaine
➔ Pas d'envoi au laboratoire les vendredis après-midi
PRÉLÈVEMENTS
●
Saisie des données dans une base de données pour transmission à la DGAl
●
Quelles données saisir ?
➔
Numéro d'échantillon harmonisé tel que transmis au LDA
➔
Coordonnées de l'établissement
➔
Coordonnées GPS au format degrés décimaux projection UTM/WGS 84
➔
Date de prélèvement
➔
Nom du végétal prélevé en latin (genre, espèce)
➔
Nom du LDA qui réalise l'analyse
●
1 échantillon par ligne
SAISIE DES DONNÉES DE SURVEILLANCE
LDA 67
LDA 71 LABOCEA
LDA31 LDA13
LDA AGRÉES POUR XYLELLA
●
Envoi des échantillons à l'un des 5 LDA
●
En cas de résultat positif ou
indeterminé, transmission au LNR (Anses-LSV Angers)
●
Analyses réalisées suivant la
norme OEPP PM7/24
COMPILATION DES DONNÉES DE SURVEILLANCE
Source : UCAS
VALORISATION DES DONNÉES DE SURVEILLANCE
INRA Avignon
Modélisation de la dynamique d'expansion spatio-tempotelle de la maladie
Datation de l'introduction de Xf en France
INRA Montpellier
Cartes à risque de répartition de Xf en France
ANSES-UCAS
Évaluation de la qualité des données et des
saisies
Analyse de l'évolution épidémiologique
Valorisation des données via des applications web Direction générale de
l'alimentation
Amélioration des stratégies de
surveillance suivant les analyses de données et résultats de la recherche
Groupe de travail Xylella fastidiosa
Évaluation des modalités de surveillance
Communication et sensibilisation des parties prenantes
COMMUNICATION NATIONALE
http://agriculture.gouv.fr/xylella-fastidiosa-une-bacte rie-nuisible-pour-les-vegetaux
https://shiny-public.anses.fr/Xylella_fastidiosa/
http://www.inra.fr/Grand-public/Sante-des-plantes/Tous-les- dossiers/Xylella-fastidiosa-identifiee-en-Corse
●
Se renseigner → dossier Xylella fastidiosa sur le site du Ministère :
http://agriculture.gouv.fr/xylella-fastidiosa-une-bacterie-nuisible-pour-les-veget auxhttp://draaf.auvergne-rhone-alpes.agriculture.gouv.fr/Xylella-fastidiosa
●
Alerter → contacter les services de la DRAAF/SRAl sral.draaf-auvergne-rhone-alpes@agriculture.gouv.fr 04 78 63 34 09
●
Ne pas tailler, ne pas déplacer la plante : vous risquez de propager la maladie vers des zones indemnes !
●
