RESUME
Ce travail s'inscrit dans le cadre d'une étude visant à identifier des gènes de prédisposition mineure au cancer mammaire en recourant au rat comme modèle.
Vingt locus de trait quantitatif ou QTLs ont été associés au cancer mammaire induit chimiquement chez le rat (Cotroneo et al., 2006; Haag et al., 2003; Hsu et al., 2007; Lan et al., 2001; Quan et al., 2006; Samuelson et al., 2005; Samuelson et al., 2007; Shepel et al., 1998).Sept d'entre eux ont été identifiés au laboratoire suite à une analyse de liaison génétique du croisement impliquant la lignée sensible SPRD-Cu3 et la lignée résistante WKY/E56. Chacun des 7 locus identifiés a été associé à l’un des trois phénotypes tumoraux (la multiplicité, la latence et la vitesse de croissance tumorale) (Quan et al., 2006). Le présent travail a pour objectif de tester et de préciser les observations. A cet effet plusieurs approches ont été suivies.
La première approche a consisté à s'interroger sur la nature des gènes de prédisposition; nous nous sommes demandés si ces gènes étaient des gènes suppresseurs de tumeurs. Pour cela nous avons caractérisé des tumeurs d'animaux F1 issus du croisement (SPRD-Cu3 X WKY) pour des éventuelles pertes d'hétérozygotie, indice essentiel de la présence de gènes suppresseurs de tumeurs, au niveau de chacun des 7 QTLs identifiés au laboratoire. A l’issue de cette étude, nous n’avons pas pu mettre en évidence des indices de présence de gènes suppresseurs de tumeurs dans les QTLs.
La deuxième approche a consisté dans un premier temps à réaliser et étudier des lignées congéniques SPRD-Cu3.WKY pour plusieurs des sept locus identifiés statistiquement, ceci dans le but d'assurer l'existence des QTLs et de mesurer plus précisément l'implication de chacun d'entre eux dans le contrôle de la sensibilité au cancer mammaire. L’existence de 5 QTLs a ainsi pu être confirmée : trois QTLs situés sur les chromosomes 1p.tel, 5 et 18 sont associés à la multiplicité tumorale, un QTL situé sur le chromosome 9 est associé à la latence tumorale et un QTL situé sur le chromosome 10 est associé à la vitesse de croissance tumorale. Dans un deuxième temps, nous avons créé et analysé une lignée dite multicongénique afin de tester les relations d'épistasie éventuelles entre les QTLs situés sur les chromosomes 5 et 18. Nous avons ainsi démontré que le QTL situé sur le chromosome 18, contrôle à la fois la multiplicité tumorale et la vitesse de croissance tumorale. Cependant les deux traits sont indépendamment modulés par le QTL situé sur le chromosome 5.
La troisième approche a consisté à appliquer la méthode du gène candidat à notre modèle. Les gènes candidats ont été sélectionnés sur base d'analyses de profils d'expression génique réalisées préalablement. Les gènes différentiellement exprimés entre les souches parentales et localisés dans les régions d'intérêt ont été considérés comme des candidats de choix. Nous avons évalué la candidature de quelques-uns de ces gènes dontPla2g2aetPfn1.
