SPRD-Cu3 1 WKY 1319 SPRD-Cu3 61
WKY 1259 SPRD-Cu3 121
WKY 1199 SPRD-Cu3 181
WKY 1139 SPRD-Cu3 241
WKY 1079 SPRD-Cu3 301
WKY 1019 SPRD-Cu3 361
WKY 959 SPRD-Cu3 421 WKY 899 SPRD-Cu3 481 WKY 839 SPRD-Cu3 541 WKY 779 SPRD-Cu3 601 WKY 719
caatattgtgctacccatatcgatccaggaccggttttaatgcatcaatcttcttaactc caatattgtgctacccatatcgatccaggaccggttttaatgcatcaatcttcttaactc caggacctttctagattattttgttgttgttctattttgcttctgagagatttcctaggc caggacctttctagattattttgttgttgttctattttgcttctgagagatttcctaggc tatgttaatcccactactagataaagatgattcagttgcacatgcctgtaattttaacag tatgttaatcccactactagataaagatgattcagttgcacatgcctgtaattttaacag ttgcaagataaaagtagatgagctgagaagttggaggccagcatgagctataagaaaaca ttgcaagataaaagtagatgagctgagaagttggaggccagcatgagctataagaaaaca gagaggaaagtttgttttagagatatctaagcctatcacagtgtccagggaagctgtagc gagaggaaagtttgttttagagatatctaagcctatcacagtgtccagggaagctgtagc tgtataatcttccaatatttgaggccattctagactatagtaaattcagaccagttgatt tatataatcttccaatatttgaggccattctagactatagtaaattcagaccagttgatt tgcacaataagaccttccttgtctcaaaatatgaacagggttgagaagatgttccagctt tgcacaataagaccttccttgtctcaaaatatgaacagggttgagaagatgttccagctt ctaaaattcttgctgctcaagtgtaaggaccggcattcagactctcaaggactccgatat ctaaaattcttgctgctcaagtgtaaggaccggcattcagactctcaaggactccgatat aaatctgggtgtagtcgctcaggtcactaactgtgcctcaattatatcctcagattaaat aaatctgggtgtagtcgctcaggtcactaactgtgcctcaattatatcctcagattaaat gatgatataagagccaaacccaagttgttggaatatacagcttggcctgaacccagagca gatgatataagagccaaacccaagttgttggaatatacagcttggcctgaacccagagca tttccttctgtttgaacttcttttgctgtagacattaaagactctaccctccacacaatc tttccttctgtttgaacttcttttgctgtagacattaaagactctaccctccacacaatc
Annexe 3.A:Alignement des séquences consensus des lignées SPRD-Cu3 et WKY dans la région du marqueur microsatellite D1Rat1. Toute la séquence n’est pas représentée. En gris, le polymorphisme de séquence (Single Nucleotide polymorphisme ou SNP) entre les lignées SPRD- Cu3 et WKY qui a servi lors des analyses de perte d’hétérozygotie. Les positions des amorces du produit PCR utilisé pour réaliser la pyroséquence sont soulignées. L’amorce de pyroséquence est indiquée en gras souligné.