WKY 1 SPRD-Cu3 1605 WKY 61 SPRD-Cu3 1545 WKY 121 SPRD-Cu3 1485 WKY 181 SPRD-Cu3 1425 WKY 241 SPRD-Cu3 1365 WKY 301 SPRD-Cu3 1305 WKY 361 SPRD-Cu3 1245 WKY 421 SPRD-Cu3 1185 WKY 481 SPRD-Cu3 1125 WKY 541 SPRD-Cu3 1065 WKY 601 SPRD-Cu3 1005 WKY 661 SPRD-Cu3 945 WKY 721 SPRD-Cu3 885 WKY 781 SPRD-Cu3 825 WKY 841 SPRD-Cu3 765 WKY 901 SPRD-Cu3 705 WKY 961 SPRD-Cu3 645
ggaaagcagagaacgcgtgtacgccagtgctccacttgctctcttagctccgctgcaggc ggaaagcagagaacgcgtgtacgccagtgctncacttgctctcttagctccgctgcaggc caggactaggggatggtgccgcccactaggagaaggtcttccaacctcactgtaatcgag caggactaggggatggtgccgcccactaggagaaggtcttccaacctcactgtaatcgag acagtcctctggggctcagaggcccacctcccaagtggttttaggttttgtcaagttgat acagtcctctggggctcagaggcccacctcccaagtggttttaggttttgtcaagttgat aactagcaccatcatgagaactcctttacaaggtcattgtgagcattgaatgaatccgta aactagcaccatcatgagaactcctttacaaggtcattgtgagcattgaatgaatccgta aagaactctgaatagtacgcagcccatcactcctcctctataagtggttgctaaatgcca aagaactctgaagagtacgcagcccatcactcctcctctataagtggttgctaaatgcca tattaataaagtaaaatgggaaggcaatcttgtttgctgtcatttgttaaaacagtcgtc tattaataaagtaaaatgggaaggcaatcttgtttgctgtcatttgttaaaacagtcgtc acagggccagcatgaaaatagatctgtggcagcaaggcccgagcagggagcctttcaaaa acagggccagcatgaaaatagatctgtggcagcaaggcccgagcagggagcctttcaaaa tgactacattctttgttttgcgtttgtatatgtgcaggtctgcatgtgcttcttttcctg tgactacattctttgttttgcgtttgtatatgtgcaggtctgcatgtgcttcctttcctg tcaaactgtggttatttcacagatactagatccaactgtttaaataggcttataaaatag tcaaactgtggttatttcacagatactagatccaactgtttaaataggcttataaaatag attatacttatgaggtctgcatactataatggtaaaagtgtttatgatataacattgaag attatacttatgaggtctgcatactataatggtaaaagtgtttatgatataacattgaag ataaagagaaacatgttcaggagagtctcaagaatattaaacaagcgtgtgaccaaatga ataaagagaaacatgttcaggagagtctcaagaatattaaacaagcgtgtgaccaaatga gccgcgttccataggaggcagacaggaaggaaagcccagagacagcggccacgctgctgc gccgcgttccataggaggcagacaggaaggaaagcccagagacagcggccacgctgctgc aatgcagaaagagtgatctttacctcgtgcgtgttgatgttctgtgtacactgtttctgg aatgcggaaagagtgatctttacctcgtgcgtattgatgttctgtgtacactgtctctgg aggagcttggtcttttatggccagtatggaaaaagaacccacaggtgtccatcgggtgtg aggagcttggtcttttatggccagtatggaaaaagaacccacaggtgtccatcgggtgtg gtgaaccacagaaatcacccaaagtcagaactagtgtgtgggagacaacagtgcgcaaaa gtgaaccacagaaatcacccaaagtcagaactagtgtgtgggagacaacagtgcgcaaaa gagctgactgggtgtatcctgaggaaggtgtgactgggatgtacctatttccaggagaaa gagctgactgggtgtatcctgaggaaggtgtgactgggatgtacctatttccaggagaaa aatcatattgtcatgagtcagacatgaagtctcatgtttactctcattgtctcgtttttt aatcatattgtcatgagtcagacatgaagtctcatgtttactctcattgtctcgtttttt
Annexe 3.B: Alignement des séquences consensus des lignées SPRD-Cu3 et WKY dans la région du marqueur microsatellite D5Rat190. Toute la séquence n’est pas représentée. Le « n » en position 36 de la séquence WKY indique que la base est indéterminée. En gris les polymorphismes de séquence (Single Nucleotide polymorphisme ou SNP) entre les lignées SPRD-Cu3 et WKY. Le SNP en gras (position dans la séquence WKY : 473) est celui qui a servi lors des analyses de perte d’hétérozygotie. Les positions des amorces du produit PCR utilisé pour réaliser la pyroséquence sont soulignées. L’amorce de pyroséquence est indiquée en gras souligné.
