Le 31 décembre 2019, l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a été informée par les autorités chinoises d’un épisode de cas groupés de pneumonies dont tous les cas initialement confirmés semblaient liés avec un marché d’animaux vivants dans la ville de Wuhan (région du Hubei), en Chine.
Le 9 janvier 2020, un nouveau virus émergent a été identifié par l’OMS comme étant responsable de ces cas groupés de pneumopathies en Chine. Il s’agit d’un coronavirus, temporairement désigné par l’OMS virus 2019-nCoV (novel coronavirus), puis le 11 février 2020 officiellement désigné par l’OMS SARS-CoV-2, responsable de la maladie Covid-19 (Coronavirus disease).
L’importation de cas de Covid-19 depuis la Chine dans d’autres pays a été observée dès le mois de janvier 2020. L’ensemble des continents a été progressivement touché, conduisant l’OMS à déclarer l’état d’urgence de santé publique internationale (USPPI) le 30 janvier 2020, puis la pandémie de Covid-19 le 11 mars 2020 [1]. Le continent américain et l’Europe ont été particulièrement touchés et comptabilisaient à eux deux près de 80% de la totalité des cas de Covid-19 rapportés dans le monde en date du 28 juin 2020 [2].
Au 20 juillet 2020, la France comptabilisait 176 754 cas confirmés dont 30 177 décès liés au Covid-19 depuis le début de l’épidémie de Covid-19 ; 6 589 personnes étaient hospitalisées dont 467 en réanimation.
Un dispositif de surveillance du Covid-19 a été mis en place dès le 10 janvier 2020 en France par Santé publique France (SpF), avec pour objectifs de détecter précocement tout cas importé sur le territoire national et de prévenir toute transmission secondaire [3]. Au cours du mois de mars 2020, une surveillance en population a été mise en place à partir de plusieurs sources de données (en médecine de ville, à l’hôpital, dans les établissements sociaux et médico-sociaux, etc.) permettant de documenter la dynamique de l’épidémie et d’en mesurer l’impact en termes de morbidité et de mortalité [4].
La définition de cas de Covid-19 de SpF évolue régulièrement en fonction de la situation épidémiologique et des connaissances disponibles sur les manifestions cliniques de la maladie. D’après celle en vigueur le 07 mai 2020 [3] :
Un cas possible est une personne présentant des signes cliniques évocateurs de Covid-19 : infection respiratoire aiguë avec une fièvre ou une sensation de fièvre, ou toute autre manifestation clinique suivante de survenue brutale, selon l’avis du HCSP relatif aux signes cliniques d’orientation diagnostique du Covid-19 [5] :
- En population générale : asthénie inexpliquée ; myalgies inexpliquées ; céphalées en dehors d’une pathologie migraineuse connue ; anosmie ou hyposmie sans rhinite associée ; agueusie ou dysgueusie.
- Chez les personnes âgées de 80 ans ou plus : altération de l’état général ; chutes répétées ; apparition ou aggravation de troubles cognitifs ; syndrome confusionnel ; diarrhée ; décompensation d’une pathologie antérieure.
- Chez les enfants : tous les signes sus-cités en population générale ; altération de l’état général ; diarrhée ; fièvre isolée chez l’enfant de moins de 3 mois.
- Chez les patients en situation d’urgence ou de réanimation : troubles du rythme cardiaque récents ; atteintes myocardiques aigües ; évènement thromboembolique grave.
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Un cas probable est une personne présentant des signes cliniques et des signes visibles en tomodensitométrie thoracique évocateurs de Covid-19.
Un cas confirmé est une personne, symptomatique ou non, avec un résultat biologique confirmant l’infection par le SARS-CoV-2, par RT-PCR (ou par sérologie dans le cadre d’un diagnostic de rattrapage, conformément aux recommandations de la HAS [6].
En France, les premiers cas importés de Covid-19 ont été détectés le 24 janvier 2020 [3, 7].
Au cours du mois de février 2020, différentes chaînes de transmission autochtones du SARS-CoV-2 ont été identifiées dans plusieurs régions métropolitaines [8, 9]. Certaines d’entre elles ont conduit à l’installation progressive d’une circulation communautaire [10]. La diffusion du virus en France métropolitaine s’est rapidement intensifiée à la fin du mois de février, pour atteindre un pic épidémique du nombre de cas confirmés au cours de la dernière semaine de mars (S13-2020), soit une semaine après la mise en œuvre des mesures de confinement de la population générale, le 17 mars 2020. Un pic d’hospitalisations pour Covid-19 et d’excès de mortalité toutes causes a été observé au cours de la première semaine d’avril (S14). A partir de la 2e semaine d’avril (S15), les différents indicateurs épidémiologiques ont suivi une évolution à la baisse, pour atteindre de faibles niveaux d’intensité au moment de la levée progressive des mesures de confinement au cours de la 2e semaine de mai (S20) [11]. En date du 9 juillet 2020, en France métropolitaine, la circulation du virus tend à progresser comme en témoignent l’augmentation de l’incidence des cas de Covid-19, l’augmentation du nombre de cas ainsi que le R0 effectif qui est significativement supérieur à 1. Cette tendance, si elle est concomitante d’une augmentation du nombre de tests RT-PCR réalisés, n’en indique pas moins une transmission qui permet au virus de se maintenir voire de progresser. Dans certains départements, la circulation virale progresse, ainsi en Mayenne la situation épidémiologique a rapidement évolué avec une incidence et un taux de positivité élevés en lien avec des clusters critiques témoignant du fort potentiel évolutif qui demeure quand le virus continue de circuler et que les conditions de transmission sont favorables [12].
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Références bibliographiques
1. Covid-19 : chronologie de l’action de l’OMS : https://www.who.int/fr/news-room/detail/27-04-2020-who-timeline---covid-19
2. European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC) Covid-19 pandemic : https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19-pandemic
3. Bernard-Stoecklin et al., 2020, Eurosurveillance et renvoyer vers le site de SpF (https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections- respiratoires/infection-a-coronavirus/articles/infection-au-nouveau-coronavirus-sars-cov-2-covid-19-france-et-monde
4. Site de Santé publique France : https://www.santepubliquefrance.fr/dossiers/coronavirus-covid-19/covid-19-notre-action
5. Avis du HCSP du 20 avril 2020 relatif aux signes cliniques d’orientation diagnostique du Covid-19.
Accessible sur :
https://www.hcsp.fr/Explore.cgi/Telecharger?NomFichier=hcspa20200420_signeclinidor iendiagnducovid.pdf
6. Haute autorité de santé. Place des tests sérologiques dans la stratégie de prise en charge de la maladie COVID-19. Accessible sur : https://www.has-
sante.fr/upload/docs/application/pdf/2020-05/rapport_indications_tests_serologiques_covid-19.pdf [consulté le 18/07/2020]
7. Lescure et al, 2020, Lancet Infect Dis :
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32224310/?from_term=lescure+covid-19&from_pos=3
8. Danis et al, Clin Infect Dis, 2020 :
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32277759/?from_single_result=kostas+danis+covid-19&expanded_search_query=kostas+danis+covid-19
9. Fontanet A et al. Cluster of COVID-19 in northern France: A retrospective closed cohort study
MedRxiv, 2020. accessible sur
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.18.20071134v1
10. Gambaro F et al. Introductions and early spread of SARS-CoV-2 in France , 2020, BioRixiv : https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.24.059576v2
11. Santé publique France, point épidémiologique du 14 mai 2020 : https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections- respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/bulletin-national/covid-19-point-epidemiologique-du-14-mai-2020
12. Santé publique France, point épidémiologique du 9 juillet 2020 : https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections- respiratoires/infection-a-coronavirus/documents/bulletin-national/covid-19-point-epidemiologique-du-9-juillet-2020
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