L’échelle spatiale considérée

Dans notre étude, nous avons réalisé des comparaisons inter-parcellaires. C’est-à-dire que les intensités des attaques de bioagresseurs ont été comparées entre parcelles de 1000 ou 2500 m2. Cependant, les mécanismes qui lient la structure de la végétation aux bio-agresseurs surviennent à différentes échelles spatiales et varient en fonction de ces échelles (Condeso and Meentemeyer, 2007; Nesme et al., 2010).

De l’échelle intra-parcellaire...

Au cours de ce travail de thèse, nous avons exploré l’effet de la composition et de la structure spatiale de la végétation d’une parcelle sur l’intensité moyenne d’une mala-die et la densité moyenne en ravageurs. Or, à l’intérieur d’une parcelle, donc à l’échelle intra-parcellaire, les individus hôtes subissent des dégâts plus ou moins importants. Une perspective à la suite de ce travail est l’étude des processus intra-parcellaires qui lient la structure de la végétation aux bioagresseurs des agroforêts. Il serait intéressant d’étu-dier les variations intra-parcellaires des dégâts liés aux bioagresseurs en fonction de la composition et de la structure spatiale des voisins directs. Cette étude permettrait par exemple d’identifier si dans une parcelle à structure agrégée des arbres d’ombrage, les plantes hôtes les plus endommagées sont situées sous les agrégats d’arbres d’ombrage ou entre les agrégats. Il s’agirait d’étudier les effets de la composition et de la structure spatiale des plus proches voisins d’un individu sur le taux d’infestation de cet individu par un bioagresseur. Des indices existent pour caractériser la composition végétale ou la structure spatiale au voisinage d’un individu, comme par exemple les indices de mélange ou d’angle uniforme (Figure 5, tirée de Li et al. 2012). Au cours d’une première analyse nous avions testé l’influence de l’interaction spatiale entre cacaoyers et arbres forestiers sur l’intensité de la moniliose à l’échelle de la parcelle (Annexe D). Cette analyse avait montré une tendance à la réduction de l’intensité de la maladie dans les parcelles où la

Figure 5 – Illustrations des valeurs de l’indice d’angle uniforme et de l’indice de mélange. A) Schéma illustrant des valeurs de l’indice d’angle uniforme en fonction des valeurs α et l’angle standard α₀ = 72 degrés. De gauche à droite les schémas illustrent les motifs de voisinage autour d’un individu i : très régulier, régulier, aléatoire, irrégulier et très irrégulier. B) De gauche à droite les schémas illustrent cinq valeurs de l’indice de mélange d’un voisinage. Les ronds gris sont d’une espèce différente de celle des ronds noirs. La valeur de mélange = 0 indique que tous les voisins de l’individu i sont de la même espèce que l’individu i alors que la valeur de mélange = 1 indique que tous les voisins de l’individu i sont d’une espèce différente. Figure tirée de Li et al. 2012.

position des cacaoyers et les arbres forestiers était du type attraction. La caractérisation du voisinage direct des cacaoyers et l’analyse de l’effet de la composition et de la structure spatiale de ce voisinage sur l’incidence de la maladie à l’échelle du cacaoyer permettraient de mieux comprendre les processus de régulation des bioagresseurs intra-parcellaires qui aboutissent à l’intensité observée à l’échelle de la parcelle.

Au sein de l’analyse des mécanismes intra-parcellaires, il serait intéressant de consi-dérer également l’effet du mélange de variétés de cacaoyers sur l’intensité d’attaque des bioagresseurs. En effet, nous avons considéré dans notre étude l’effet de la diminution de la ressource seulement par des caractéristiques descriptives de la composition de la popu-lation de cacaoyer d’une parcelle (abondance relative et densité en cacaoyers). Or, on sait que la diminution de la ressource peut également avoir lieu lors du mélange de variétés plus ou moins sensibles aux bioagresseurs dans un même agroécosystème (Garrett and Mundt, 1999). L’introduction d’une variété résistante joue alors le rôle de l’introduction de l’individu non-hôte dans notre étude et peut ainsi réduire l’intensité de la maladie par diminution de l’abondance et/ou de la densité de l’hôte le plus compétent pour le bioagresseur étudié. A Talamanca au Costa Rica, les variétés de cacaoyers cultivées sont issues de mélanges qui trouvent leurs origines dans les nombreuses introductions de plants

“améliorés" réalisées par de grandes compagnies agro-industrielles (United Fruit) ou des projets de développement agricole (Deheuvels, 2011). Le patchwork génétique en résultant rend extrêmement délicat l’identification d’une variété dans cette région. Pour cette rai-son, nous n’avions pas étudié l’effet de la composition variétale en cacaoyers sur l’intensité de la moniliose. Au Cameroun, près de la ville d’Obala, la variété dominante (plus des 3/4 des cacaoyers) est l’Amelonado (Forastero bas-amazoniens) ou “cacao allemand". Ces cacaoyers sont les descendants des premiers cacaoyers introduits par les Allemands au Cameroun à la fin du XIX`eme siècle (Babin, 2009). Les autres cacaoyers sont des hybrides issus des programmes de sélection de la recherche camerounaise et distribués par la So-ciété de Développement du Cacao (SODECAO) dans les années 1960 et 1970. La variété Amelonado serait plus résistante aux mirides que les hybrides (Babin, 2009). La prise en compte de la variabilité génétique des cacaoyers dans le mécanisme de “diminution de la ressource" dans les agroforêts est une piste de recherche intéressante à exploiter dans le cadre de la gestion agroéocologique de ces systèmes.

... à l’échelle du paysage

Un paysage peut être caractérisé par sa structure. La structure d’un paysage com-prend la composition des différents patchs constitutifs du paysage et la structure spatiale de ces patchs, c’est-à-dire leur agencement dans l’espace (Day and Possingham, 1995; Plantegenest et al., 2007). On sait que la structure du paysage est susceptible d’influencer l’intensité d’attaque de bioagresseurs dans une parcelle (Burel and Baudry, 1999).

La structure du paysage (composition et structure spatiale) dans lequel sont situées nos deux réseaux de parcelles au Costa Rica et au Cameroun est certainement un facteur influençant les intensités d’attaque au sein des parcelles. Par exemple, au Costa Rica, nos données ont permis d’observer un gradient croissant d’intensité de la moniliose du sud vers le nord. En effet, les intensités de la moniliose sont en moyenne inférieure dans les parcelles situées à Soki et Namu Woki que dans les parcelles situées à Amubri et Watsi. Ce gradient peut s’expliquer par deux aspects paysagers. Le paysage de la réserve Bribri dans la région de Talamanca peut être décrit comme une plaine alluviale où se croisent sept principaux cours d’eau et leurs affluents. Par conséquent, les déplacements dans cette région ne sont pas toujours faciles. Les villages de Watsi et Amubri sont plus accessibles que les villages de Namu Woki et Soki. En effet, Watsi est accessible en bus en partant de la ville de Bribri, et Amubri est accessible à partir de Watsi et après avoir traversé en bateau le fleuve Télire. Puis, à partir d’Amubri, Namu Woki et Soki sont accessibles à pieds. Une maladie plus tardivement installée dans les zones reculées et une dispersion des spores par l’homme plus faible entre les parcelles pourraient expliquer l’intensité de moniliose inférieure dans la zone sud de la région de Talamanca que dans la zone nord. De plus, la présence d’arbres forestiers dans les parcelles crée des conditions microclimatiques moins favorables au développement et à la dissémination de la moniliose (Chapitre III et

IV). Le paysage devient de plus en plus forestier dans le sud de la réserve (Deheuvels et al., 2012). La proximité des parcelles avec la forêt naturelle pourrait permettre une réduction de l’intensité de la moniliose en diminuant la vitesse des vents et par effet barrière sur le déplacement des spores.

Au Cameroun, l’absence de données de géo-localisation précises des parcelles a empêché l’étude de l’effet de l’auto-corrélation spatiale sur la distribution des bioagresseurs et celle de l’influence du positionnement des parcelles dans le paysage sur les intensités observées. En général, et malgré l’intérêt d’une étude de l’influence de la structure du paysage sur l’intensité des bioagresseurs d’agroécosystèmes, une difficulté majeure réside dans l’obtention de cartes du paysage exploitables. En effet, la distinction entre le couvert d’une agroforêt et celui d’une forêt est actuellement encore difficilement réalisable sur des cartes satellitaires, dans des zones tropicales de plus à forte couverture nuageuse. Le développement de nouvelles techniques de télédétection pourront probablement rendre possible ce type d’étude sur l’influence du contexte paysager sur l’intensité d’attaque des bioagresseurs dans les agroforêts.