Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Biologie et Mod´ elisation
Mod` eles continus :
Analyse des syst` emes dynamiques dans R
M. Bailly-Bechet, tr` es largement inspir´ e de S. Mousset
Universit´ e Claude Bernard Lyon I – France
Document disponible ` a :
http://pbil.univ-lyon1.fr/members/mbailly
1 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . .
Conclusions
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . . Conclusions
3 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Qu’est-ce qu’une EDO ?
D´ efinition
Une EDO dans R , dite EDO du premier ordre d´ ecrit l’´ evolution (ou la variation) dans le temps (ou l’espace) d’une variable de R .
Exemples
I une variable quelconque x(t ),
I l’effectif d’une population N(t),
I la concentration d’une
substance chimique c(t). . .
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Notation des EDO
Pour une variable x(t) ∈ R, une EDO d’ordre 1 s’´ ecrit : dx
dt = f (x, t ) dx
dt peut aussi ˆ etre not´ e x 0 (t ) ou ˙ x et d´ ecrit la variation de x par rapport au temps.
dx
dt = x 0 (t) = ˙ x
5 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Les EDO autonomes / non autonomes
Une EDO est dite autonome si ˙ x ne d´ epend pas directement de t.
EDO autonome
˙
x = f (x)
EDO non autonome
˙
x = f (x, t)
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Les EDO autonomes lin´ eaires / non lin´ eaires
Une EDO autonome est dite lin´ eaire si ˙ x = f (x ) est une expression lin´ eaire de x.
EDO autonome lin´ eaire
˙
x = f (x) = ax + b o` u (a, b) ∈ R 2
EDO autonome non lin´ eaire Le mod` ele de Monod
˙
x = a(b − x)x K − x
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Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . .
Conclusions
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Malthus
Application `a des donn´ees de dynamique des populations
Les mod` eles lin´ eaires
I Mod` eles les plus simples
I Une analyse quantitative compl` ete est possible
I Une analyse qualitative permet de d´ ecrire le comportement du mod` ele.
9 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Le mod` ele de Malthus (ou mod` ele exponentiel) en 1800
Le mod` ele de Malthus est l’un des premiers mod` eles de dynamique des populations. Les hypoth` eses de ce mod` ele sont les suivantes :
I On consid` ere une population de taille N(t).
I L’accroissement individuel de la population est constant quel que soit N(t).
Comment la taille de la population ´ evolue-t-elle au cours du
temps ?
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Malthus
Application `a des donn´ees de dynamique des populations
Les variables et les param` etres du mod` ele
Les variables
N(t) est la taille de la population.
Les param` etres
r est le “taux de croissance” intrins` eque de la population.
11 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Malthus
Application `a des donn´ees de dynamique des populations
Les ´ equations du mod` ele
L’´ evolution la taille de la population v´ erifie : dN = rNdt ⇐⇒ dN
dt = rN On r´ esoud l’´ equation diff´ erentielle dN
dt = rN . On obtient :
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Malthus
Application `a des donn´ees de dynamique des populations
Les ´ equations du mod` ele
L’´ evolution la taille de la population v´ erifie : dN = rNdt ⇐⇒ dN
dt = rN On r´ esoud l’´ equation diff´ erentielle dN
dt = rN . On obtient : N(t) = N 0 e rt
12 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Repr´ esentation graphique des solutions : Chroniques
L’allure des solutions N(t) varie selon le signe de r.
N ˙ = rN
0 2 4 6 8 10
050100150200
temps
N
r>0
r=0
r<0 N=0
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Le mod`ele de Malthus
Application `a des donn´ees de dynamique des populations
Ajustement des donn´ ees ` a un mod` ele
Le nombre d’habitants aux USA (donn´ ees publi´ ees en 1925)
● ● ● ● ● ● ● ●● ● ● ●
●
1750 1800 1850 1900 1950 2000
050150250
Temps [Années]
Nombre d'habitants [millions]
14 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Ajustement des donn´ ees ` a un mod` ele
Le nombre d’habitants en France (donn´ ees publi´ ees en 1925)
●
●
● ●● ●●●●●● ● ●
1650 1700 1750 1800 1850 1900 1950 2000
01020304050
Temps [Années]
Nombre d'habitants [millions]
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Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . . Conclusions
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Le mod` ele de Verhulst ou mod` ele logistique
Le mod` ele de dynamique des populations de Malthus est insatisfaisant car :
I le taux de croissance de la population ne d´ epend pas de sa taille
I il fait l’hypoth` ese de ressources illimit´ ees
I il m` ene ` a l’extinction de la population ou ` a une explosion d´ emographique.
Dans le mod` ele de Malthus, on a r = b − d o` u b est le taux de
f´ econdit´ e et d le taux de mortalit´ e par individu.
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Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
Les ´ equations du mod` ele
Les hypoth` eses du mod` ele :
I Le taux de f´ econdit´ e par individu est constant : b = b 0 .
I Le taux de mortalit´ e par individu croˆıt avec l’effectif : d = d 0 + δN.
Le taux de croissance intrins` eque de la population est
r = b − d = b 0 − d 0 − δN. La variation de l’effectif dN durant la
diff´ erentielle de temps dt est donc :
dN = (b 0 − d 0 − δN)Ndt
dN dt = rN
1 − N
K
, (1)
avec r = b 0 − d 0 et K = r δ .
18 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Les ´ equations du mod` ele
Les hypoth` eses du mod` ele :
I Le taux de f´ econdit´ e par individu est constant : b = b 0 .
I Le taux de mortalit´ e par individu croˆıt avec l’effectif : d = d 0 + δN.
Le taux de croissance intrins` eque de la population est
r = b − d = b 0 − d 0 − δN. La variation de l’effectif dN durant la
diff´ erentielle de temps dt est donc :
dN = (b 0 − d 0 − δN)Ndt
dN dt = rN
1 − N
K
, (1)
avec r = b 0 − d 0 et K = r
δ .
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
Analyse quantitative du mod` ele logistique
Les solutions de l’´ equation 1 sont donc du type :
N(t) = N 0 K
N 0 + (K − N 0 )e −rt . (2) Quatre cas possibles :
I Si N 0 = 0, alors ∀t, N(t) = 0.
I Si K > N 0 > 0, alors ∀t, N ˙ > 0 et lim
t→∞ N(t) = K .
I Si N 0 = K , alors ∀t, N(t) = N 0 .
I Si N 0 > K , alors ∀t, N ˙ < 0 et lim
t→∞ N(t) = K .
19 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Analyse quantitative du mod` ele logistique
Les solutions de l’´ equation 1 sont donc du type : N(t) = N 0 K
N 0 + (K − N 0 )e −rt . (2) Quatre cas possibles :
I Si N 0 = 0, alors ∀t, N(t) = 0.
I Si K > N 0 > 0, alors ∀t, N ˙ > 0 et lim
t→∞ N(t) = K .
I Si N 0 = K , alors ∀t, N(t) = N 0 .
I Si N 0 > K , alors ∀t, N ˙ < 0 et lim
t→∞ N(t) = K .
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Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
Repr´ esentation graphique des solutions (chroniques)
0 2 4 6 8 10
050100150200
temps
effectif
N0<K N0>K
N0=K
N0=0
20 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Ajustement ` a un jeu de donn´ ees
Le nombre d’habitants en France (donn´ ees publi´ ees en 1925)
●
●
● ●● ●●●●●● ● ●
1650 1700 1750 1800 1850 1900 1950 2000
01020304050
temps
Nombre d'habitants
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Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
Propri´ et´ es du syst` eme
Plutˆ ot que l’´ etude quantitative d´ etaill´ ee du syst` eme, il serait int´ eressant d’´ etudier simplement ses propri´ et´ es :
I Existe-t-il des points invariants ?
I Comment le syst` eme ´ evolue-t-il ailleurs qu’en ces points invariants ?
I Quelle est la forme des chroniques ?
22 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Les points singuliers ou points d’´ equilibre
Le cas du mod` ele logistique
Un point d’´ equilibre N ? du mod` ele est tel qu’` a ce point N n’´ evolue plus, c’est ` a dire dN
dt N=N
?= 0.
dN dt
N=N
?= 0 ⇐⇒ rN ?
1 − N ? K
= 0 Il existe deux points d’´ equilibre, N 0 ? = 0 et N 1 ? = K .
N va-t-il tendre ` a se rapprocher de ces points d’´ equilibre ou bien ` a
s’en ´ eloigner ?
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Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
L’´ evolution du syst` eme entre les points singuliers
Le cas du mod` ele logistique
Pour savoir si N croˆıt ou d´ ecroˆıt, on ´ etudie le signe de ˙ N
0 50 100 150
−40−2002040
N
dNdt
24 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
L’´ evolution du syst` eme entre les points singuliers
Le cas du mod` ele logistique
Aux points d’´ equilibre N 0 ? et N 1 ? , dN dt = 0.
0 50 100 150
−40−2002040
N
dNdt
N0 N1
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
L’´ evolution du syst` eme entre les points singuliers
Le cas du mod` ele logistique
Ailleurs, le signe de dN dt indique le sens d’´ evolution de N.
0 50 100 150
−40−2002040
N
dNdt
N0 dN dt>0 N1 dN dt<0
26 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Portrait de phase du syst` eme
Le cas du mod` ele logistique
Le portrait de phase d’un syst` eme dynamique indique les points singuliers du syst` eme et le sens de variation de la variable ´ etudi´ ee de part et d’autre des points d’´ equilibre.
N0 N1
instable stable
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Verhulst ou mod`ele logistique Analyse quantitative du mod`ele logistique Ajustement `a un jeu de donn´ees Analyse qualitative
Les chroniques
Le cas du mod` ele logistique
Les chroniques d’un syst` emes sont la repr´ esentation graphique des solutions. Elles ont les propri´ et´ es suivantes :
I Les chroniques ne sont jamais s´ ecantes (par un point (N, t) il ne passe qu’une seule chronique).
I Au voisinage des points d’´ equilibre, les pentes des chroniques tendent ` a devenir nulles (horizontales).
I La chronique passant par le point (N, t + λ) s’obtient par translation de la chronique passant par le point (N, t) : on parle d’invariance temporelle, et ce ph´ enom` ene vient du fait que l’´ equation de d´ epart est autonome.
28 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Les chroniques
Le cas du mod` ele logistique
0 2 4 6 8 10
050100150200
temps
effectif
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Les points singuliers ou points d’´equilibre Stabilit´e des points d’´equilibre et lin´earisation Les points d’inflexion
Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . . Conclusions
30 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Analyse qualitative d’un mod` ele quelconque dans R
Comme nous l’avons vu pour le mod` ele logistique, il est possible d’effectuer une analyse qualitative d’un mod` ele lorsque celui-ci est trop complexe.
Analyse quantitative
I Recherche de solutions exactes.
I Etude des fonctions ´ solutions.
Analyse qualitative
I Etude des propri´ ´ et´ es des solutions.
I Etude des tendances (points ´
d’´ equilibre, stabilit´ e. . . )
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Les points singuliers ou points d’´equilibre Stabilit´e des points d’´equilibre et lin´earisation Les points d’inflexion
Points singuliers
Les points singuliers (ou points d’´ equilibre) not´ es x ? d’un syst` eme quelconque du type ˙ x = f (x) satisfont :
dx dt x=x
?= 0 ⇐⇒ f (x ? ) = 0.
Rechercher les points d’´ equilibre d’un syst` eme ˙ x = f (x) revient donc ` a trouver les solutions de l’´ equation f (x) = 0.
Un syst` eme peut n’avoir aucun point d’´ equilibre, un nombre fini ou un nombre infini de points d’´ equilibres.
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Stabilit´ e des points d’´ equilibre
Si dans un syst` eme quelconque ˙ x = f (x), la fonction f est continue, alors il suffit d’´ etudier le signe de f au voisinage des points d’´ equilibre pour connaˆıtre leur stabilit´ e.
Il existe 4 cas possibles.
x ? stable
Xx dx dt
dx dt>0 dx dt<0
stable
x ? instable
Xx
dx dt
dx dt<0 dx dt>0
instable
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Les points singuliers ou points d’´equilibre Stabilit´e des points d’´equilibre et lin´earisation Les points d’inflexion
Stabilit´ e des points d’´ equilibre
x ? shunt positif
Xx dx dt
dx dt>0 dx dt>0
shunt positif
x ? shunt n´ egatif
Xx
dx dt
dx dt<0 dx dt<0
shunt négatif
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Stabilit´ e des points d’´ equilibre
Lin´ earisation de
dxdtau voisinage des points d’´ equilibre
On utilise un d´ eveloppement de Taylor d’ordre 1 pour lin´ eariser dx dt au voisinage des points d’´ equilibre x ? .
dx
dt = f (x − x ? ) ≈ f (x ? )
| {z }
+ (x − x ? )f 0 (x ? )
| {z }
≈ 0 + (x − x ? ) d x ˙ dx x=x
?La stabilit´ e de x ? d´ epend du signe de λ = d x ˙
dx
x=x
?Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Les points singuliers ou points d’´equilibre Stabilit´e des points d’´equilibre et lin´earisation Les points d’inflexion
Stabilit´ e des points d’´ equilibre
Lin´ earisation de
dxdtau voisinage des points d’´ equilibre
λ = d x ˙ dx x=x
?est la pente de la tangente ` a la courbe repr´ esentative de dx dt = f (x ) au point x = x ? .
λ < 0 ⇒ x ? stable
Xx λ <0 dx dt
stable
λ > 0 ⇒ x ? instable
Xx λ >0
dx dt
instable
36 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Stabilit´ e des points d’´ equilibre
Lin´ earisation de
dxdtau voisinage des points d’´ equilibre
λ = 0 ⇒ on ne peut pas conclure
Xx λ =0 dx dt
stable
Xx dx dt
λ =0
Xx λ =0
dx dt
instable
Xx
dx dt
λ =0
shunt négatif
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Les points singuliers ou points d’´equilibre Stabilit´e des points d’´equilibre et lin´earisation Les points d’inflexion
Points d’inflexion
Les points d’inflexion des chroniques d’un syst` eme dynamique de type ˙ x = f (x) sont les points pour lesquels.
dx
dt = ˙ x 6= 0 d 2 x
dt 2 = d x ˙
dt = 0 ⇔ d x ˙ dx
dx dt = 0
⇒ d x ˙
dx = f 0 (x) = 0
38 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Points d’inflexion
Les points d’inflexion des chroniques d’un syst` eme dynamique de type ˙ x = f (x) sont les points diff´ erents des points singuliers qui s’obtiennent en r´ esolvant l’´ equation
d x ˙ dx x=x
infl= f 0 (x infl ) = 0.
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Les points singuliers ou points d’´equilibre Stabilit´e des points d’´equilibre et lin´earisation Les points d’inflexion
Points d’inflexion
Exemple du mod` ele logistique
L’´ equation (1) du mod` ele de Verhulst vu pr´ ec´ edemment est : N ˙ = dN
dt = rN(1 − N
K ) = rN − rN 2 K Il existe deux points d’´ equilibre, N 0 ? = 0 et N 1 ? = K . Les points d’inflexion des chroniques v´ erifient d N ˙
dN = 0 ⇐⇒ r − 2rN
K = 0 ⇐⇒ N = K 2
40 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Points d’inflexion
Exemple du mod` ele logistique
Les chroniques du mod` ele logistique pr´ esentent donc un point d’inflexion pour N = K
2 .
0 2 4 6 8 10
04080120
temps
effectif N=K 2
N=K
N=0
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . . Conclusions
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Le mod` ele de Gompertz
Un concurrent du mod` ele logistique
Le mod` ele de Gompertz est un mod` ele de dynamique des populations. Son ´ equation est la suivante :
dN
dt = rN ln 1
N
,
o` u r > 0.
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Le mod` ele de Gompertz
Caract´ eristiques du mod` ele
Quelles sont les caract´ eristiques de ce mod` ele ?
I Points d’´ equilibre :
N = N 0 ? = 0 N = N 1 ? = 1
I Stabilit´ e : N 0 ? = 0 est instable et N 1 ? = 1 est stable.
I Points d’inflexion : N = e −1
44 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Le mod` ele de Gompertz
Caract´ eristiques du mod` ele
Quelles sont les caract´ eristiques de ce mod` ele ?
I Points d’´ equilibre :
N = N 0 ? = 0 N = N 1 ? = 1
I Stabilit´ e : N 0 ? = 0 est instable et N 1 ? = 1 est stable.
I Points d’inflexion : N = e −1
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Le mod` ele de Gompertz
Chroniques
Un changement d’´ echelle peut permettre d’adapter le mod` ele de Gompertz pour obtenir une capacit´ e limite de K individus et un point d’inflexion pour N = K
e .
0 2 4 6 8 10
04080120
temps
effectif
N=K e N=K
N=0
45 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Les mod` eles de populations exploit´ ees
Les mod` eles de populations exploit´ ees sont utilis´ es pour leur int´ erˆ et commercial ou ´ ecologique. De nombreux mod` eles ont ´ et´ e propos´ es, ils sont toujours compos´ es :
I d’un type de croissance (Logistique, Gompertz. . . )
I d’un type de pr´ edation (constant, lin´ eaire, non lin´ eaire. . . ) Dans le cadre de ce cours nous verrons deux mod` eles de populations exploit´ ees. Pour chaque mod` ele, la croissance de la population sera de type logistique.
dN dt = rN
1 − N
K
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
La croissance logistique
On s’int´ eresse ` a la fonction ˙ N = rN 1 − N K
= rN − r N K
2.
I Racines (points d’´ equilibre du mod` ele logistique)
I Tangentes aux points d’´ equilibre
I Extremums (points d’inflexion des chroniques)
47 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
La croissance logistique
Points d’´ equilibre
N ˙ = 0 ⇐⇒ rN
1 − N K
= rN − r N 2 K = 0 Deux points d’´ equilibre :
I N 0 ? = 0
I N 1 ? = K
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
La croissance logistique
Extremum
d N ˙
dN = 0 ⇐⇒ r − 2r N
K = 0 ⇐⇒ N = K 2 dN
dt admet un maximum local pour N = K
2 , qui vaut : dN
dt N=
K2= r K 2
1 − K
2K
= rK 4
49 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
La croissance logistique
Tangentes aux points d’´ equilibre
dN dt
N=0 = r
dN dt
N=K = r − 2r K K = −r
Les pentes des tangentes aux points d’´ equilibre sont
respectivement r et −r.
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
La croissance logistique
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
dNdt
K 0
λ =r λ = −r
K 2 rK 4
51 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
L’exploitation d’une population
L’exploitation d’une population consiste ` a pr´ elever des individus dans cette population. Ce pr´ el` evement peut-ˆ etre
I Constant
I Proportionnel ` a la taille de la population
I non lin´ eaire et croissant avec la taille de la population
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota
Equation du mod` ele
Il s’agit du mod` ele le plus simple d’exploitation, o` u la quantit´ e d’individus pr´ elev´ es par unit´ e de temps est constante Q (quota).
dN dt = rN
1 − N
K
− Q
53 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota
Points d’´ equilibre
On r´ esoud dN dt = 0.
K
I r − 4Q
K > 0 ⇐⇒ Q < rK
4 ⇒ ∆ > 0 ⇒ il existe 2 points d’´ equilibre.
I r − 4Q
K = 0 ⇐⇒ Q = rK
4 ⇒ ∆ = 0 ⇒ il existe 1 point d’´ equilibre.
I r − 4Q
K < 0 ⇐⇒ Q > rK
4 ⇒ ∆ < 0 ⇒ il n’existe pas de
point d’´ equilibre.
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota
Points d’´ equilibre
On r´ esoud dN dt = 0.
− r
K N 2 + rN − Q = 0
Il existe 3 cas possibles selon le signe de ∆ = r 2 − 4 rQ K
I r − 4Q
K > 0 ⇐⇒ Q < rK
4 ⇒ ∆ > 0 ⇒ il existe 2 points d’´ equilibre.
I r − 4Q
K = 0 ⇐⇒ Q = rK
4 ⇒ ∆ = 0 ⇒ il existe 1 point d’´ equilibre.
I r − 4Q
K < 0 ⇐⇒ Q > rK
4 ⇒ ∆ < 0 ⇒ il n’existe pas de point d’´ equilibre.
54 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche avec quota
Points d’´ equilibre, Q < rK 4
Dans le cas ∆ > 0, les points d’´ equilibre sont :
I N 0 ? = K r −
q
r 2 − 4 rQ K 2r > 0
I N 1 ? = K r +
q
r 2 − 4 rQ K 2r > 0 Avec 0 < N 0 ? < K
2 < N 1 ? < K .
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota
Points d’´ equilibre, Q = rK 4
Dans le cas ∆ = 0, le seul point d’´ equilibre est : N ? = K
2
56 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche avec quota
Q > rK 4
Dans le cas ∆ > 0, il n’y a pas de point d’´ equilibre et dN
dt = rN
1 − N K
− Q < 0.
Le mod` ele pr´ edit que la taille de la population d´ ecroˆıt sans cesse.
Peut-on trouver une m´ ethode simple expliquant ces r´ esultats ?
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota, Q < rK 4
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4
Q
58 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche avec quota, Q < rK 4
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4
Q N1 N2
instable stable
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota,Q = rK 4
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4 Q
60 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche avec quota,Q = rK 4
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4 Q
shunt négatif
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota,Q > rK 4
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4 Q
62 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche avec quota, Q > rK 4
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4 Q
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche avec quota
Conclusions
I Dans le meilleur des cas, 2
´
etats d’´ equilibre.
I 1 ´ etat instable / 1 ´ etat stable.
I L’augmentation du quota rapproche les deux ´ etats.
I On ne peut pas pˆ echer avec Q ≥ rK 4 .
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K
0 K 2
rK 4
Q N1 N2
instable stable
64 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche ` a effort constant
Equation du mod` ele
Ici, l’effort de pˆ eche E est constant, c’est ` a dire que la quantit´ e d’individus pr´ elev´ es par unit´ e de temps est proportionnelle ` a la taille de la population EN.
dN dt = rN
1 − N
K
− EN
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche ` a effort constant
Points d’´ equilibre
On r´ esoud dN dt = 0.
Il existe deux points d’´ equilibre : N 0 ? = 0 et N 1 ? = K r − E
N 1 ? n’a de sens biologique que si r N 1 ? > 0, c’est ` a dire r > E
66 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche ` a effort constant
Points d’´ equilibre
On r´ esoud dN
dt = 0. Il existe deux points d’´ equilibre : N 0 ? = 0 et N 1 ? = K r − E
N 1 ? n’a de sens biologique que si r N 1 ? > 0, c’est ` a dire r > E
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche ` a effort constant
Optimum de l’effort de pˆ eche, E < r
Dans le cas o` u N 1 ? existe, on peut chercher un optimum de l’effort de pˆ eche permettant d’obtenir le pr´ el` evement le plus ´ elev´ e possible.
La quantit´ e pˆ ech´ ee au point d’´ equilibre N 1 ? est : EN 1 ? = EK r − E
r = KE − K E 2 r
67 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche ` a effort constant
L’optimum de l’effort de pˆ eche E ? est tel que EN 1 ? est maximum pour E = E ? , soit :
taille N opt ? = K r −E r = K 2 , et la quantit´ e d’individus pr´ elev´ es est N opt ? E ? = rK
4
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche ` a effort constant
L’optimum de l’effort de pˆ eche E ? est tel que EN 1 ? est maximum pour E = E ? , soit :
E ? = r 2
A l’effort de pˆ ` eche optimum, la population est maintenue ` a une taille N opt ? = K r −E r
?= K 2 , et la quantit´ e d’individus pr´ elev´ es est N opt ? E ? = rK
4
68 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche ` a effort constant, E < 2 r
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K 0
λ =r
K 2 rK 4
E<r 2
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Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche ` a effort constant, E < 2 r
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K 0
λ =r
K 2 rK 4
E<r 2 N1
stable N0
instable
70 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche ` a effort constant, E = 2 r
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K 0
λ =r
K 2 rK 4
E=r 2 N1
stable
N0 instable
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Le mod`ele de Gompertz
Les mod`eles de populations exploit´ees
Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche avec quota Un mod`ele de population exploit´ee : pˆeche `a effort constant
Pˆ eche ` a effort constant, E > r
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K 0
λ =r
K 2 rK 4
E>r
N0 stable
72 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR
Pˆ eche ` a effort constant
Conclusions
I 2 ´ etats d’´ equilibre tant que E < r.
I 1 ´ etat instable / 1 ´ etat stable.
I La population ne s’´ eteint que lorsque E > r
0 20 40 60 80 100
−200204060
N
K 0
λ =r
K 2 rK 4
E<r 2 N1 stable N0
instable
Introduction L’analyse des mod`eles lin´eaires Un mod`ele non lin´eaire : le mod`ele logistique Principes de l’analyse qualitative Quelques exemples classiques. . . Conclusions
Table des mati` eres
Introduction
L’analyse des mod` eles lin´ eaires
Un mod` ele non lin´ eaire : le mod` ele logistique Principes de l’analyse qualitative
Quelques exemples classiques. . . Conclusions
74 marc.baillybechet@univ-lyon1.fr Syst`emes dynamiques dansR