Nom et Pr´enom ...
N. Carte ´Etudiant ...
Module ASB. Examen Janvier 2007. Dur´ee 1h.
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T´el´ephones portables ´eteints et rang´es dans vos sacs
Exercice 1 (5 points)
Expliquer comment les matrices de substitution ont ´et´e construite. Par exemple les matrices de la famille BLOSUM, utilis´ees dans les programmes d’alignement des s´equences prot´eiques.
1
Exercise 2. (5 points) D´ecrire l’algorithme FASTA.
2
Exercise 3. (5 points)
Donner un algorithme Brute-force pour la d´etection d’un motif inconnu dansns´equences et sugg`erer une approche branch-and-bound pour am´eliorer sa performance.
3
Exercise 4 (5 points)
D´ecrire l’algorithme de Gibbs sampling pour la d´etection d’un motif dans n s´equences.
4
