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Détection de mutations conférant la résistance aux strobilurines et aux benzimidazoles chez Mycosphaerella fijiensis à partir de l'observation de phénotypes de germination

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Academic year: 2021

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Session Posters Methodes de lutte et gestion des r ´esistances: nouveaux d ´efis dans l ´e gestion des

risques P9

D ´etection de mutations conf ´erant la r ´esistance aux strobilurines et aux benzimi-dazoles chez Mycosphaerella fijiensis `a partir de l’observation de ph ´enotypes de germination

J. Ngando,a, A. Rieuxb, A. Mehlc, J. Carlierbet L. De Lapeyre De Bellaired

aCarbap, rue dinde, 842 Douala, Cameroun; bCIRAD-Bios, UMR BGPI, Campus international de Baillarg, 34398 Montpellier, France;cBayer CropScience, Aktiengesellschaft BCS AG-R-F-BF, 6240 Monheim, Allemagne;dCIRAD-Persyst, UPR Syst`emes bananes et ananas, TA B-26 / PS4, Blvd. de la Liron, 34398 Montpellier, France

Des campagnes d’analyse du statut de la r´esistance au sein des populations fongiques de

Mycosphaerella fijiensis sont r´eguli`erement mises en œuvre dans les plantations industrielles de

banane dessert afin d’orienter les strat´egies de lutte chimique contre la Maladie des Raies Noires, une grave maladie foliaire du bananier. Dans la pratique, des tests de germination in vitro sont r´ealis´es en routine pour d´etecter et quantifier les souches r´esistantes aux diff´erents fongicides syst´emiques. Toutefois, l’observation des ph´enotypes de germination ne permet pas toujours une interpr´etation facile du statut des souches. L’objectif de la pr´esente ´etude est de relier la pr´esence des mutations qui conf`erent la r´esistance aux benzimidazoles et aux strobilurines aux ph´enotypes de germination in

vitro. Deux populations de 52 et 75 souches ont respectivement ´et´e g´enotyp´ees par pyros´equenc¸age

pour la d´etection d’une part de la mutation G143A qui conf`ere la r´esistance aux strobilurines et d’autre part de la mutation au point 198 du g`ene de la beta tubuline qui conf`ere la r´esistance aux benzimidazoles. Chaque souche a ´et´e soumise `a des tests de germination in vitro avec une s´erie de fongicides `a diff´erentes concentrations dont le m´ethyl- thiophanate et le thiabendazole `a des concentrations de 5 et 10 µg/mL pour les benzimidazoles et l’azoxystrobine et la trifloxystrobine `a 10 et 30 µg/mL. La longueur des tubes germinatifs de chaque souche a ´et´e mesur´ee et diff´erentes classes ph´enotypiques ont ´et´e ´etablies tenant compte du mode d’action du fongicide. En pr´esence de benzimidazoles on observe les ph´enotypes suivants : (i) absence de germination (NG), (ii) tubes germinatifs d´eform´es (T), (iii) tubes germinatifs non d´eform´es mais `a croissance plus faible que celle du t´emoin (C) et (iv) tubes germinatifs semblables au t´emoin (N). Pour les strobilurines, la longueur du tube germinatif (L) et le pourcentage d’inhibition de croissance par rapport au t´emoin (GI) ont ´et´e mesur´es. Les r´esultats ont montr´e que pour les benzimidazoles, les souches r´esistantes portant la mutation au codon 198 ont les ph´enotypes N, C ou N+C et dans quelques cas ne germaient pas. Les souches sensibles ne portant pas la mutation ont des tubes germinatifs d´eform´es ou ne germent pas. Pour les strobilurines, le crit`ere de la longueur absolue du tube germinatif (L>150µm) recommand´e arbitrairement par certains auteurs (Frac), ne permet pas de d´etecter toutes les souches portant la mutation G143A. Il est ´egalement difficile de fixer une limite de pourcentage d’inhibition de croissance (GI<50% par exemple) pour d´etecter toutes les souches portant cette mutation. Ainsi, pour cette classe de fongicides seul un test mol´eculaire permet de discriminer sans ambig¨uit´e les souches portant ou non la mutation G143A.

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