MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
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UNIVERSITE D’ABOMEY-CALAVI
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ECOLE POLYTECHNIQUE D’ABOMEY-CALAVI
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DEPARTEMENT DE GENIE DE BIOLOGIE HUMAINE
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OPTION : ANALYSES BIOMEDICALES
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RAPPORT DE STAGE DE FIN DE FORMATION POUR L’OBTENTION DU DIPLÔME DE LICENCE PROFESSIONNELLE
Fèmi Estelle Alexandra OMORE
Devant le jury :
Membre 1 : Prof Honoré BANKOLE Membre 2 : Dr Victorien DOUGNON Membre 3 : Dr Pascal ATCHADE
Sous la direction de :
Tuteur : Superviseur : Mr Michel AGBLA Pr Honoré BANKOLE Master en Biologie Cellulaire et Microbiologiste
Immunologie Maitre de Conférences des Universités Laboratoire National de Santé EPAC/ UAC
9eme Promotion
Présenté et soutenu le 14 janvier 2017 par :
Année académique 2015-2016
Prévalence de l’infection à rotavirus chez 36
enfants à Sèmè-Kpodji au Bénin
REPUBLIQUE DU BENIN
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MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
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UNIVERSITE D’ABOMEY-CALAVI
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ECOLE POLYTECHNIQUE D’ABOMEY-CALAVI ***************
DEPARTEMENT DE GENIE DE BIOLOGIE HUMAINE
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DIRECTEUR : Professeur Mohamed SOUMANOU
DIRECTEUR ADJOINT : Professeur Clément AHOUANNOU CHEF DE DEPARTEMENT : Docteur Pascal ATCHADE
Résumé
Dans les pays sous-développés, la diarrhée représente une cause majeure de mortalité et de morbidité chez les enfants âgés de moins de 5ans. Une forte proportion de cette diarrhée est due au virus dont principalement le rotavirus. Dans le but de contribuer au diagnostic des diarrhées infantiles à rotavirus à l’hôpital de Sèmè-Kpodji au sud du Bénin, 36 échantillons de selles d’enfants âgés de 0 à 5ans, ont été recueillis, de juin à septembre 2016.
La technique ELISA a été utilisée pour rechercher les rotavirus dans les échantillons de selles. Le taux de positivité de la diarrhée due au rotavirus a été évalué à 55,6%. Les enfants âgés de 7 à 12 mois ont été les plus atteints (55,5%) suivis des enfants âgés de moins de 6 mois (38,8%).
Abstract
In developing countries, diarrhea represents the second cause of mortality and morbidity within children under five years old. A high proportion of this diarrhea is due to viruses which mainly rotavirus. In order to contribute to the diagnosis of rotavirus diarrhea in childhood at Sèmè-Kpodji hospital, located in the southern of Benin,36 stool samples were collected from under five years old children, from june to september 2016. ELISA test was performed to select positive samples.
The positive rate of diarrhea due to rotavirus was estimated to 55,6%.
Children between the ages of 7 to 12 months were the most affected (55,5%), followed by those under 6 months (38,8%).
Key words: Diarrhea, rotavirus, Sèmè-Kpodji, Benin.
Mots clés : Diarrhée, rotavirus, Sèmè-Kpodji, Bénin
Liste des enseignants Nom et prénom Matières enseignées ABLEY Sylvestre Déontologie médicale
ADOMOU Alain Physique
AGBANGLA Clément Génétique Moléculaire
AGOUA Jean Informatique
AHOYO Théodora Angèle Microbiologie / Santé publique et Hygiène hospitalière
AKAKPO B. Huguette Education physique et sportive AKOGBETO Martin Entomologie médicale
AKPOVI D. Casimir Biologie cellulaire/ Physiologie Humaine/ Biologie métabolique
ALITONOU Alain Guy Chimie Générale/ Chimie organique
ANAGO Eugénie Biochimie Structurale/Biochimie clinique/Biochimie Moléculaire
ANAGONOU Silvère Education Physique et Sportive ATCHADE Pascal Parasitologie/Mycologie
AVLESSI Félicien Chimie Générale/ Chimie Organique BANKOLE Honoré Bactériologie / Virologie
DARBOUX Raphael Histologie Appliquée
DESSOUANSSI Noel Biophysique
DOSSEVI Lordson Techniques Instrumentales
DOSSOU Cyriaque Technique d’Expression et Méthode de la Communication
DOUGNON T. Victorien Microbiologie/Méthodologie de la Recherche HOUNNON Hyppolite Mathématiques
HOUNSOSSOU Hubert Biostatistique et Epidémiologie LALLY Armel Législation et Droit du Travail
LOKO Frédéric Biochimie Clinique
LOKOSSOU Gatien Immunologie/ Immunologie Pathologie
LOZES Evelyne Immunologie/Immunologie Pathologie/Equipements Biomédicaux
MASSOULOKONON Vincent Histologie Générale OGOUDIKPE Nicarette Informatique médicale SECLONDE Hospice Transfusion Sanguine
SEGBO Julien Biochimie/Biologie Moléculaire
SENOU Maximin Histologie Appliquée
TOPANOU Adolphe Hématologie/ Hémostase et Pharmacologie
SOEDE Casimir Anglais
YOVO K. S. Paulin Pharmacologie/ Toxicologie
TOHOYESSOU Zoe Soins Infirmiers
Dédicace
A tous ces scientifiques qui œuvrent sans cesse pour le bien-être de la population mondiale !
Remerciements
A Dieu le Miséricordieux et le Tout Puissant, c’est par ta grâce que j’ai pu y parvenir, merci infiniment.
A mon père Alphonse OMORE qui a toujours été là pour m’assurer une meilleure éducation. Reçois par ce travail toute ma reconnaissance. Que Dieu te prête longue vie pour bénéficier des fruits de tes efforts.
A ma mère Bibiane GANDONOU pour ton affection maternelle, tes conseils avisés et l’éducation que j’ai reçue de toi. Ton souhait a toujours été de voir tes enfants prospérer. Que Dieu te bénisse et te comble de grâce.
A mes sœurs Alida, Eve-Régina, Gloria merci pour vos conseils et votre soutien. Puisse Dieu renforcer nos liens fraternels.
A Monsieur ADECHOUBOU Mankarimi et son épouse qui ont été d’un soutien indéfectible. Puisse Dieu vous combler de ses bienfaits et vous prêter longue vie.
A mon superviseur, Professeur Honoré BANKOLE, qui malgré ses multiples occupations, a toujours été disponible. Puisse l'Eternel vous accorder longévité et prospérité.
A mon tuteur de stage, Monsieur Michel AGBLA, pour votre encadrement et votre compréhension. Soyez béni.
A tout le personnel du laboratoire national de santé, recevez mes sincères gratitudes pour l’ambiance de famille qui a régné durant mon séjour et vos multiples conseils.
Aux autorités et enseignants de l’EPAC, en particulier ceux du département de Génie de Biologie Humaine. Recevez ici le témoignage de ma profonde gratitude.
Aux camarades de ma promotion, merci pour l’amitié.
A tous ceux qui de près ou de loin ont participé à la réalisation de ce travail.
Hommages
Au Président de Jury
En acceptant de présider le jury de soutenance de rapport de fin de formation, vous me faites un grand honneur.
Aux membres de jury
Je suis très heureuse de vous avoir dans mon jury. Vos critiques et suggestions sont vivement attendues pour l’amélioration de ce travail.
Hommages respectueux.
Liste des sigles et abréviations
Sigles et abréviations Définitions
OMS Organisation Mondiale de la Santé
WHO World Health Organisation
ELISA Enzyme Linked Immunosorbent Assay
VP Viral Protein
ARN Acide Ribonucléique
NSP Non Structural Protein
RT-PCR Reverse Transcription- Polymerase Chain Reaction
PEV Programme Elargi de Vaccination
VIH / SIDA Virus de l’Immunodéficience Humaine/ Syndrome d’immunodéficience Acquise
Liste des tableaux
Numéro Titre des tableaux Page
Tableau I Répartition de la population d’étude selon l’âge et le sexe
30 Tableau II Répartition de la population d’étude selon
l’hospitalisation
31 Tableau III Répartition de la population d’étude selon l’état de
déshydratation
32 Tableau IV Répartition de la population d’étude selon la présence
de fièvre
33 Tableau V Répartition de la population d’étude la présence de
vomissement
33 Tableau VI Répartition de la population en fonction de la diarrhée à
rotavirus et le sexe
35 Tableau VII Répartition de la population en fonction de la diarrhée à
rotavirus et selon l’hospitalisation
37 Tableau VIII Répartition de la population en fonction de la diarrhée à
rotavirus et selon l’état de déshydratation
37 Tableau IX Répartition de la population en fonction de la diarrhée à
rotavirus et selon la présence de vomissement
38 Tableau X Répartition de la population en fonction de la diarrhée à
rotavirus et selon la présence de la fièvre
38 Tableau XI Répartition des enfants en fonction de l’état de
déshydratation associé au vomissement
39 Tableau XII Répartition des enfants en fonction de l’état de
déshydratation associé à la fièvre
39 Tableau XIII Répartition des enfants en fonction de la présence de
vomissement associé à la fièvre
40 Tableau XIV Répartition des enfants en fonction de l’état de
déshydration associé au vomissement à la fièvre
40
Liste des figures
Numéro Titre des figures Page
Figure 1 Structure moléculaire des rotavirus (Greenberg et al., 2009) 15 Figure 2 Organigramme du laboratoire national de santé 22 Figure 3 Prévalence de l’infection à rotavirus au sein de la population
d’étude
34 Figure 4 Répartition de la diarrhée à rotavirus dans la population
d’étude
36
Sommaire
Introduction……….12
Chapitre1 : Synthèse bibliographique………...14
1 Rotavirus……….15
2 Diarrhée à rotavirus………....17
3 Prévention et traitement ……….19
Chapitre II : Matériel et méthodes………20
1 Cadres………...………..………21
2 Matériel……… .25
3 Méthodes………. . 25
Chapitre III : Résultats et commentaire……… 29
1 Résultats……….30
2 Commentaire………..41
Conclusion………45
Recommandations...………46
INTRODUCTION
La diarrhée est l’une des maladies infantiles les plus meurtrières en Afrique (Liu et al., 2012). Elle est majoritairement causée par les agents microbiens d’origine bactérienne, parasitaire et virale (Liu et al., 2012). Les virus principalement les rotavirus viennent en tête avec plus de 80% des cas (Tate et al., 2012 ; WHO, 2008). Les rotavirus entrainent très rapidement chez l’enfant un état de déshydratation qui, en l’absence d’une prise en charge adaptée peut mettre en jeu le pronostic vital (Haffaf et al., 2014).
En Afrique, plusieurs facteurs concourent à la fréquence et à la gravité des diarrhées. Nous pouvons citer les difficultés d’accès à l’eau potable, la malnutrition, les co-infections avec les maladies à potentiel épidémique et l'infection au VIH/SIDA (Pothier et Agnello, 2012 ; WHO, 2013). Les interventions faisant preuve de leur efficacité dans le traitement des gastro- entérites virales sont tant curatives que préventives. Elles sont surtout basées sur l’administration des solutés à osmolarité réduite, la supplémentation en zinc, la promotion de l'allaitement maternel, l’antibiothérapie, la vaccination… (Pothier et Agnello, 2012).
Dans le monde, le rotavirus, principale cause de diarrhée sévère chez les enfants, entraine chaque année plus de 450 000 décès d’enfants de moins de 5ans. Il est approximativement responsable de 11 millions d’épisodes de diarrhées enregistrées dues aux rotavirus, 25 millions de consultations et 2 millions d’hospitalisations chez les enfants de moins de cinq ans à travers le monde (Enyonam et al., 2014 ; Parashar et al., 2006).
En Afrique, le rotavirus tue chaque année 232000 enfants de moins de 5 ans soit plus de 50% du total mondial des décès (Tate et al., 2012).La diarrhée à rotavirus est responsable d’environ 12% des décès d’enfants de moins de 5 ans dans la région africaine de l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS AFRO, 2010)(Liu et al., 2012).La grande majorité des pays ayant les taux les plus élevés de mortalité infantile se situent en Afrique sub-saharienne avec plus 300 décès sur 100 000 décès (WHO,2014 ; Tate et al., 2012).
Au Bénin, malgré la forte prévalence des diarrhées infantiles, il existe très peu de données sur les diarrhées d’origine virale en général et à rotavirus en particulier.
Le présent travail s’est donné comme objectif général est d’établir la prévalence des diarrhées infantiles à rotavirus.
Spécifiquement il s’est agi de :
Déterminer la protéine VP6 des rotavirus par la technique ELISA ; Répertorier la place des rotavirus dans les diarrhées infantiles.
La présente étude a été rédigée en trois chapitres essentiels en dehors de l’introduction et de la conclusion. Le premier chapitre a permis de faire la synthèse de littérature sur les rotavirus. La méthodologie adoptée a été décrite dans le deuxième chapitre. Les résultats suivis du commentaire ont fait l’ossature du dernier chapitre.
CHAPITRE I
:
SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
1. ROTAVIRUS
1.1 Taxonomie et structure
Les rotavirus appartiennent à la famille des Reoviridae et au genre Rotavirus. Ce sont de petits virus nus, de 60 à 80 nm de diamètre, composés d’une double capside de symétrie icosaédrique et d’un ARN bicarténaire segmenté. Le génome viral comprend 11 segments portant chacun une séquence codante unique encadrée par des séquences conservées non codantes (Poeury et al., 2007 ; Schnepf et al., 2005).
Leur capside est formée de trois couches de protéines (figure 1 page 14) à savoir :
Une couche interne formée par la protéine VP2 et les protéines VP1 et VP3 qui sont associées au génome ;
Une protéine VP6 qui forme la couche intermédiaire de la capside et détermine sept sérogroupes numérotés d’A à G ;
Des protéines de la couche externe constituées des protéines VP4 et VP7 qui induisent la production d’anticorps neutralisants. Les déterminants antigéniques de VP4 permettent de définir les sérotypes P et ceux portés par VP7 déterminent les sérotypes G (Pothier et al., 2007).
Figure 1 : Structure moléculaire des rotavirus (Greenberg et al., 2009).
1.2 Protéines et caractéristiques antigéniques
Les rotavirus sont classés d’A à G et ceci, basé sur leurs propriétés antigéniques. Les groupes A, B et C infectent les hommes et les animaux, alors que les autres groupes n’ont été observés jusqu’à présent que chez les animaux.
Les rotavirus du groupe A sont les plus importants en pathologie humaine (Baert et al., 2009). Leur génome est constitué de 11 segments d’ARN codant pour 6 protéines non structurales NSP1 à NSP6 et 6 protéines structurales VP1 à VP4, VP6 et VP7. Les protéines structurales sont organisées en trois couches. La couche la plus interne ou le core est constituée des protéines VP1, VP2, VP3 qui interviennent dans la transcription et la réplication virale. La couche intermédiaire est faite de la protéine VP6. Elle est la protéine majeure du virus, soit environ 50% de la masse protéique totale. C’est le déterminant antigénique de groupe. Elle représente la protéine que reconnaissent la plupart des réactifs immunologiques utilisés au laboratoire pour le diagnostic biologique. Les protéines structurales VP7 et VP4 forment la couche externe de la capside. Elles supportent les caractères antigéniques dénommés respectivement sérotypes G et P (Pothier et al., 2007). Ces protéines VP7 et VP4, induisent la production d’anticorps neutralisants, qui sont à l’origine de la classification binaire des rotavirus établie par séro-neutralisation. Actuellement, on distingue 19 sérotypes G et 31 sérotypes P (Baert et al., 2009). Il existe une autre classification basée sur le génotypage des rotavirus par analyse des gènes codant pour les protéines VP7 et VP4. Par convention, les sérotypes sont écrits entre parenthèses et les génotypes entre crochets (Cugnet et al., 2015).
1.3. Physiopathologie de la diarrhée
Les rotavirus infectent les entérocytes et provoquent une diarrhée selon un mécanisme complexe et multifactoriel (Ramig et al., 2004). L’infection de ces entérocytes entraine des anomalies structurales et fonctionnelles de l’épithélium, à l’origine de la diarrhée. En effet, l’infection diminue les fonctions de digestion et d’absorption des nutriments.
Dans la détermination de la diarrhée à rotavirus, une entérotoxine virale joue un rôle important ; il s’agit de la glycoprotéine non structurale NSP4. Elle serait impliquée dans l’hypersécrétion modérée du chlore dans la lumière intestinale suite à une augmentation du calcium intracellulaire par la stimulation du système nerveux entérique (Lorrot et al., 2007 ; Dong.et al., 1997). La présence des récepteurs spécifiques de NSP4 serait dépendante de l’âge et expliquerait en partie la sévérité de la diarrhée chez les jeunes enfants (Lorrot et al., 2007 ; Greenberg et al., 2009).
2. DIARRHEE A ROTAVIRUS 2.1 Aspects cliniques
Le mode de contamination des rotavirus est essentiellement oro-fécal. Sa transmission est favorisée par l’excrétion élevée du rotavirus dans les diarrhées, sa résistance dans l’environnement et sa faible dose infectante (Lundgren et al., 2000 ; Dennehy et al., 2000). Le rotavirus a une période d’incubation de deux à quatre jours, souvent marquée au début par un épisode d’otite ou de rhinopharyngite. La maladie débute brutalement par des vomissements et de la fièvre. L’atteinte de l’état général est fréquente et peut être marquée. Le maximum de diarrhée est atteint entre vingt-quatre à quarante-huit heures. Les selles sont liquides et abondantes. En raison de l’intensité des vomissements et de la fièvre élevée, la survenue d’une déshydratation aiguë sévère est significativement plus fréquente qu’au cours des autres infections intestinales virales.
2.2. Répartition géographique
Les rotavirus sont la première cause de diarrhée aigüe sévère du jeune enfant dans le monde. Presque tous les enfants sont infectés par le rotavirus au cours des cinq premières années de leur vie. Environ 500000 enfants âgés de moins de 5 ans meurent de diarrhée à rotavirus chaque année. 85% de ces décès surviennent dans les pays à faible revenu d’Afrique et d’Asie. (Cugnet et al., 2015). Dans les pays industrialisés, les infections à rotavirus représentent 15 à 50% des cas des gastro-entérites ; la mortalité associée à celles–ci reste faible.
2.3. Diagnostic biologique
Plusieurs méthodes sont utilisées dans le diagnostic biologique des diarrhées à rotavirus.
2.3.1. Les méthodes immunologiques
Elles comprennent les techniques d’ELISA, d'agglutination latex et d'immunochromatographie. Ces techniques sont basées sur la liaison spécifique entre l’antigène et l’anticorps. Cette liaison peut être révélée par agglutination, par coloration enzymatique ou par fluorescence. L’utilisation d’anticorps monoclonaux a permis d’augmenter leur spécificité et leur reproductibilité.
Cependant, contrairement à la biologie moléculaire, ces techniques ne permettent pas de distinguer les sérotypes viraux. Le test d’agglutination repose essentiellement sur la détection rapide d’antigène de rotavirus (Cugnet et al., 2015). Il consiste à mettre en contact l’échantillon avec des microbilles de latex recouvertes d’anticorps spécifiques. Ces anticorps sont dirigés contre la protéine VP6 de rotavirus de groupe A. La liaison de l’antigène viral cible à l’anticorps entraine une agglutination visible à l’œil nu (Cugnet et al., 2015). Les Tests d’agglutination au latex sont de plus en plus délaissés au profit des tests d’immunochromatographie qui présentent une meilleure sensibilité. Les tests immunochromatographiques sont sous la forme de bandelette. Ils font intervenir deux anticorps spécifiques de l’antigène recherché.
2.3.2. Autres méthodes
D’autres méthodes sont également utilisées pour le diagnostic de rotavirus. Il s’agit de :
La microscopie électronique qui est la technique de référence car permet la mise en évidence et la visualisation directe du virus.
La RT- PCR multiplex qui permet de réaliser le génotypage des souches.
3. PREVENTION ET TRAITEMENT 3.1. Prévention
Le meilleur moyen de protéger les enfants est de prévenir l’infection par la vaccination. Deux vaccins anti-rotavirus à administrer par voie orale sont disponibles (WHO, 2013 ; Ruiz-Palacios et al., 2006).
3.2. Traitement
Il n’existe actuellement aucun traitement spécifique. Comme pour d’autres diarrhées de l’enfance, la thérapie se fonde sur le remplacement des liquides pour éviter la déshydratation et l’administration de zinc, qui diminue la gravité et la durée de la diarrhée. Les solutions de sels de réhydratation orale à osmolarité réduite sont plus efficaces pour remplacer les liquides perdus.
CHAPITRE II
:
MATERIEL ET METHODES
1. CADRES
1.1. Cadre institutionnel
L’Ecole Polytechnique d’Abomey-Calavi (EPAC), constitue notre cadre institutionnel. Elle comporte plusieurs départements dont le département de Génie de Biologie Humaine (GBH), notre département d’origine. Le département de Génie de Biologie Humaine forme en trois ans, des techniciens en analyses biomédicales.
1.2. Cadre technique
Notre stage s’est déroulé au laboratoire national de santé de Cotonou.
1.2.1. Situation
Le laboratoire national de santé de Cotonou est situé dans l’enceinte du Ministère de la Santé.
1.2.2. Attributions
Le laboratoire national de santé est chargé de :
Développer et pratiquer les méthodes d’analyses biologiques dans un but de diagnostic et de recherche ;
Organiser et mettre en œuvre toutes les enquêtes de surveillance épidémiologique des maladies en général et des maladies transmissibles en particulier ;
Pratiquer toutes les analyses de santé publique en collaboration avec les structures concernées ;
Assurer l’organisation des stages pratiques des élèves et étudiants en provenance des structures agréées de formation, ainsi que le recyclage et la formation en cours d’emploi des techniciens de laboratoire d’analyses biomédicales ;
Etudier et faire appliquer la règlementation sur les conditions d’ouverture et de fonctionnement des laboratoires d’analyses biomédicales publics et privés ;
Organiser et participer aux analyses de santé publique et aux investigations toxicologiques diverses.
La figure N°2 ci-dessous indique l’organigramme du laboratoire national de santé.
Figure 2 : Organigramme du laboratoire national de santé 1.2.3. Différentes sections
Le laboratoire national de santé de Cotonou comprend les sections suivantes : Bactériologie, Biochimie, Hématologie, Parasitologie et Sérologie.
Section de bactériologie
Elle a pour rôle d’assurer le contrôle et la surveillance des maladies à potentiel épidémique. Outre cette activité, les examens suivants y sont réalisés :
Examen cytobactériologique des urines ;
Examen cytobactériologique des sécrétions cervico-vaginales ;
Section : Hygiène, Eaux et Aliments
Service National des Laboratoires de Santé Secrétariat
Division : Laboratoire Central
Division : Accueil Comptabilité
Division : Assurance, qualité, Coordination, Contrôle technique et Formation continue
Division : Evaluation, Statistique et Approvisionnement Section : Caisse
Section : Matériel et consommables Section : Bactériologie
Section : Hématologie
Section : Biochimie
Section : Sérologie
Section : Parasitologie
Examen cytobactériologique des sécrétions urétrales ; Examen bactériologique des pus et sérosités ;
Spermogramme ; Spermoculture ; Coproculture.
Section de parasitologie Les examens suivants y sont pratiqués : Coprologie parasitaire complète ;
Recherche d’amibes, kystes, œufs et parasites ;
Analyse de la goutte épaisse et réalisation de la densité parasitaire ; Recherche des œufs de bilharzie vésicale ;
Recherche de filaires ;
Test biologique de grossesse.
Section de sérologie
Elle s’occupe, comme la section de bactériologie, du contrôle et de la surveillance des maladies à potentiel épidémique. Néanmoins les examens suivants y sont réalisés :
Sérodiagnostic de Widal ; Sérodiagnostic de la syphilis ; Sérodiagnostic de la rubéole ; Sérodiagnostic de la chlamydiae ; Sérodiagnostic de la toxoplasmose ;
Dosage de l’anticorps antistreptolysine o ;
Recherche de l’antigène du virus de l’hépatite B ; Recherche de l’anticorps du virus de l’hépatite C
Section de biochimie
Les paramètres suivants y sont doses : Glycémie ;
Urémie ;
Créatininémie ; Uricémie ; Transaminases ; Cholestérols ; Bilirubines ; Calcémie ; Magnesémie ; Triglycérides ; Gamma-gt ;
Phosphatase alcaline ; Alpha amylase ; Protidémie.
On y pratique également :
L’électrophorèse de l’hémoglobine L’ionogramme sanguin.
Section d’hématologie
Les examens ci-après sont pratiques dans cette section : Numération et formule sanguine ;
Vitesse de sédimentation ; Numération des réticulocytes ; Temps de saignement ;
Temps de coagulation ;
Groupage sanguin ABO et facteur rhésus ; Test d’Emmel.
2. MATERIEL
2.1. Echantillons de selles
Le matériel biologique est constitué d’échantillons de selles d’enfants âgés de moins de cinq ans.
2.2. Kits de prélèvements de selles
Le kit de prélèvement de selles est composé de pots propres pour le recueil de selles, de sachets pour l’emballage et d’une glacière pour le transport.
2.3. Matériel pour ELISA
Il est constitué de tubes Eppendorf, de portoirs, de micropipettes, de minuterie, de centrifugeuse de paillasse, d’agitateur vortex, de microplaques, de l’eau distillée, de glycérol, de laveur ELISA, de papier hygiénique, de lecteur ELISA et de kits ProSpecT Rotavirus. Tous les réactifs ont été conservés à +4°C.
3. METHODES
3.1. Population d’étude
Elle a été constituée de 36 enfants de moins de cinq ans sans distinction de sexe.
3.1.1. Critère d’inclusion
Tout enfant âgé de moins de cinq ans admis à l’hôpital de Sèmè-Kpodji pour raison de gastroentérites faites de diarrhées, avec ou sans vomissements comme premier motif de consultations.
3.1.2. Critère de non inclusion
Tout enfant âgé de moins de cinq ans présentant des selles sanguinolentes.
3.2. Prélèvement
Les échantillons de selles ont été prélevés 48 heures au plus tard après l’admission à l’hôpital des enfants pour éviter les infections nosocomiales, dans des pots propres en plastique de 25ml. Ces échantillons ont ensuite été transportés au laboratoire national de santé pour analyses dans une glacière contenant des accumulateurs de froid (Annexe 1).
3.3. Recherche de l’antigène VP6
La détermination de la protéine VP6 a été réalisée par la technique ELISA, selon la méthode décrite dans le kit ProSpecT Rotavirus commercialisé par Oxoid.
Les différents réactifs du kit ProSpecT rotavirus et les échantillons de selles à tester ont été sortis du réfrigérateur 30 minutes avant la manipulation ;
Une suspension à 10% a été préparée en ajoutant 100µL de selles liquides ou 0,1g de selles solides soit environ la taille d’un petit pois à 900µL du diluant fourni avec le kit ;
La suspension a été mélangée à l’agitateur vortex pendant 30 secondes, puis centrifugée à 5000 tours/min pendant 3 min ;
Un volume de 100µL de surnageant de chaque échantillon dilué a été ajouté aux différents micropuits suivant une feuille de paillasse pré établie. Un contrôle positif et un contrôle négatif ont toujours été inclus dans chaque série de tests ;
Ensuite, 100µL soit deux gouttes du conjugué ont été ajoutés dans chaque micropuits. Le conjugué contient des anticorps polyclonaux spécifiques à la protéine VP6 et conjugués à de la peroxydase ;
La plaque a été recouverte et incubée à 22°C pendant 60 +/- 5minutes.
Après incubation, le contenu des micropuits a été déversé où chaque
micropuits a été lavé avec une solution tampon de lavage préalablement dilué au 1/10 ;
Ce processus de lavage a été réalisé 5 fois au total. Après le lavage final, la plaque a été renversée et tapotée sur du papier absorbant pour retirer les dernières traces de tampon de lavage ;
Après ce lavage, 100µL de substrat ont été ajoutés dans chaque micropuits. Le substrat est un chromogène qui permet de révéler la réaction ;
Les micropuits ont été ensuite incubés à 22°C pendant 10 minutes, et reçoivent 100µL de solution d’arrêt. La lecture au spectrophotomètre a été effectuée dans les 30 minutes qui ont suivi l’ajout de la solution d’arrêt ; La lecture a été faite à partir d’un lecteur ELISA en double longueurs d’onde 450 et 650 nm. La propreté du fond des micropuits a été soigneusement vérifiée avant la lecture ;
Le calcul de la valeur seuil ou le « Cut-off value » a été fait en ajoutant 0,200 unités d’absorbance à la valeur du contrôle négatif, selon les recommandations du fabricant et approuvées par les laboratoires de références de l’OMS ;
Le test a été validé si la valeur du contrôle négatif est strictement inférieure à 0,150 unités d’absorbance et celle du contrôle positif, strictement supérieure à 0,500 unités d’absorbance.
A l’issu de la lecture, tout échantillon de selles dont la valeur d’unité d’absorbance est supérieure à la valeur seuil est positif, et tout échantillon de selles dont la valeur d’unité d’absorbance est inférieure à la valeur seuil est déclaré négatif. Les échantillons dont les résultats ont donné des valeurs d’unités d’absorbance se situant à moins de 0,010 unités d’absorbance de la valeur seuil ont été considérés comme équivoque. Ces échantillons ont été à nouveau testés, ou le patient a été soumis à de nouveaux prélèvements.
3.4. Analyses des données
Les données ont été analysées par le logiciel SPSS version 21. L’analyse a été faite au seuil de 5% afin de déceler les éventuelles comparaisons.
CHAPITRE III :
RESULTATS ET COMMENTAIRE
1. RESULTATS
1.1. Caractéristiques démographiques de la population d’étude Tableau I : Répartition de la population d’étude selon l’âge et le sexe
Tranches d’âges
Sexe
Effectif
M F
≤ 6 mois 08
(22,2%)
06 (16,6%)
14 (38,8%)
7-12 mois 08
(22,2%)
12 (33,3%)
20 (55,5%)
≥ 13 mois 02
(5,5%)
02 (00%)
04 (5,5%)
Total 18
(50%)
18 (50%)
36 (100%)
M : Masculin F : Féminin
Les enfants âgés de 7 à 12 mois sont les plus représentés (55,5%) suivis des enfants âgés de moins de 6 mois (38,8%). Dans la population d’étude, on note une répartition égale entre les deux sexes.
1.2. Répartition de la population d’étude en fonction de l’hospitalisation, de l’état de déshydratation, de la fièvre et du vomissement.
Tableau II : Répartition de la population d’étude selon l’hospitalisation.
Hospitalisation Sexe
Effectif
M F
Oui 14
(38,8%)
18 (50%)
32 (88,8%)
Non 04
(11,2%)
00 (00%)
04 (11,2%)
Total 18
(50%)
18 (50%)
36 (100%)
M : Masculin F : Féminin
Les enfants hospitalisés constituent 88,8% (32/36) de l’effectif total de la population d’étude.
Tableau III : Répartition de la population d’étude selon l’état de déshydratation.
Déshydratation Sexe
Effectif
M F
Sévère 04
(11,1%)
06 (16,6%)
10 (27,7%)
Modérée 08
(22,2%)
06 (16,6%)
14 (38,8%)
Aucune 06
(16,6%)
06 (16,6%)
12 (33,3%)
Total 18
(50%)
18 (50%)
(36) (100%)
M : Masculin F : Féminin
L’état de déshydratation sévère, a été observé chez 27,7% (10/36) enfants admis à l’hôpital.
Tableau IV : Répartition de la population d’étude selon la présence de fièvre.
Fièvre Sexe
Effectif
M F
Oui 10
(27,8%)
14 (38,8%)
24 (66,6%)
Non 08
(22,3%)
04 (11,1%)
12 (33,4%)
Total 18
(50%)
18 (50%)
36 (100%)
M : Masculin F : Féminin
Plus de la moitié des enfants (66,6%) avaient de la fièvre c’est-à-dire une température corporelle supérieure à 37,5°C.
Tableau V : Répartition de la population d’étude selon la présence de vomissement.
Vomissement Sexe
Effectif
M F
Oui 12
(33,3%)
14 (38,9%)
26 (72,2%)
Non 06
(16,6%)
04 (11,2%)
10 (27,8%)
Total 18 18 36
(50%) (50%) (100%)
M : Masculin F : Féminin
Le vomissement a été observé chez 72,2%des enfants.
1.3. Prévalence de l’infection à rotavirus
Figure3 : Prévalence de l’infection à rotavirus au sein de la population d’étude.
Des 36 échantillons de selles testés, 20 ont été positifs au rotavirus soit un taux de positivité de 55,6%.
Positif Négatif
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
Résultat du test ELISA
Frequence en %
1.4. Répartition de la population en fonction de la diarrhée à rotavirus
1.4.1. Répartition de la population en fonction de la diarrhée à rotavirus et le sexe.
Tableau VI : Répartition de la population en fonction de la diarrhée à rotavirus et le sexe.
Sexe
Positifs N %
Négatifs N %
Total Masculin 06 33,3 12 66,8 18
Féminin 14 77,7 04 22,2 18
Total 20 55,6 16 44,4 36
N : Nombre
Les enfants de sexe féminin, ont été plus touchés (77,7%) que ceux du sexe masculin (33,3%). Toutefois aucune différence statistiquement significative n’a été observée (p˃0,05).
Figure 4 : Répartition de la diarrhée à rotavirus dans la population d’étude Les enfants âgés de 0 à 3 mois et de 15 à 18 mois ont été les moins touchés par la diarrhée à rotavirus dans cette étude. Ce qui n’a pas été le cas pour ceux de la tranche d’âge de 3 à 12 mois.
0
4
18
10
4
0
0 0
12
6
2
0
0-2m 3-5m 6-8m 9-11m 12-15m 16-18m
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20
Tranche d'âges en mois
Nombre de cas
Nombre total de cas Nombre total de cas positif
1.4.2. Répartition de la population en fonction de la diarrhée à rotavirus et selon le statut d’hospitalisation et l’état de déshydratation.
Tableau VII : Répartition de la population en fonction de la diarrhée à rotavirus et selon l’hospitalisation.
Hospitalisation
Positifs N %
Négatifs N %
Total Oui 18 90 14 87,5 32
Non 02 10 02 12,5 04
Total 20 100 16 100 36
N : Nombre
La diarrhée à rotavirus a été détectée chez 90% (18/32) des enfants hospitalisés contre 10% (02/04) des enfants non hospitalisés.
Tableau VIII : Répartition de la population en fonction de la diarrhée à rotavirus et selon l’état de déshydratation.
Déshydratation
Positifs N %
Négatifs N % Présence 14 70 10 62,5 Sévère 06 30 04 25,0 Modérée 08 40 06 37,5 Absence 06 30 06 37,5 Total 20 100 16 100
N : Nombre
La diarrhée à rotavirus a entrainé un état de déshydratation sévère chez 30% (06/20) des enfants malades.
1.4. 3. Répartition des enfants en fonction de la présence de vomissement, de la fièvre et de l’état de déshydratation.
Tableau IX : Répartition des enfants en fonction de la présence de vomissement.
Vomissement
Positifs N %
Négatifs N % Présence 18 90 08 50
Absence 02 10 08 50
Total 20 100 20 100
N : Nombre
Le vomissement a été observé chez 90% (18/20) des enfants malades.
Tableau X : Répartition des enfants en fonction de la présence de la fièvre.
Fièvre
Positifs N %
Négatifs N % Présence 16 80 08 50
Absence 04 20 08 50
Total 20 100 16 100
N : Nombre
La diarrhée à rotavirus était présente chez 80% (16/20) des enfants ayant une température corporelle supérieure à 37,5°C.
Tableau XI : Répartition des enfants en fonction de l’état de déshydratation associé au vomissement
Déshydratation et
vomissement
Positifs N %
Négatifs N % Présence 18 90 08 50
Absence 02 10 08 50
Total 20 100 16 100
N : Nombre
La diarrhée à rotavirus a entrainé un état de déshydratation associée au vomissement chez 90% (18/20) des enfants malades.
Tableau XII : Répartition des enfants en fonction de l’état de déshydratation associé à la fièvre
Déshydratation et
Fièvre
Positifs N %
Négatifs N % Présence 10 50 02 12,5
Absence 10 50 14 87,5
Total 20 100 16 100
N : Nombre
L’association fièvre et état de déshydratation, a été enregistrée chez la moitié des enfants malades.
Tableau XIII : Répartition des enfants en fonction de la présence de vomissement associé à la fièvre
Vomissement et
Fièvre
Positifs N %
Négatifs N % Présence 14 70 02 12,5
Absence 06 30 14 87,5
Total 20 100 16 100
N : Nombre
Plus de la moitié 70% (14/20) enfants malades ont présenté simultanément de vomissement et de fièvre.
Tableau XIV : Répartition des enfants en fonction de l’état de déshydration associé au vomissement à la fièvre
Déshydratation et vomissement
et Fièvre
Positifs N %
Négatifs N % Présence 12 60 00 00
Absence 08 40 16 100
Total 20 100 16 100
N : Nombre
L’état de déshydratation associé au vomissement et à la fièvre a été observé chez 60% (12/20) des enfants malades.
2. COMMENTAIRE
La présente étude a montré la présence de rotavirus au sein des enfants âgés de 0 à 5ans admis à l’hôpital de Sèmè-Kpodji.
Les résultats de cette étude ont montré que l’infection à rotavirus a été plus notée chez les filles. Toutefois, aucune différence statistique n’a été observée (p˃ 0,05). Ces résultats sont similaires à ceux de Abebe et al., en 2014 en Ethiopie et de Mukaratirwa et al., en 2014 au Zimbabwé.
Aucun enfant âgé de moins de 2 mois n’a développé la maladie. Les enfants appartenant à la tranche d’âges de 0 à 12 mois ont été les plus touchés avec un pic entre 6 et 8 mois (figure N°4). Les mêmes observations ont été rapportées au Nigéria (Uzoma et al., 2016, Tagbo et al., 2014), au Ghana (Enweronu et al., 2014), au Togo (Tsolenyanu et al., 2014) et en Ethiopie (Abebe et al., 2014). Par contre, en Mauritanie (Pursem et al., 2014) et au Zimbabwé (Mukaratirwa et al., 2014), les enfants de la tranche d’âges de 12 à 24 mois ont été les plus touchés suivis de ceux de 0 à 12 mois. Dans ces deux pays, la majorité des cas positifs a été isolée avant 24 mois. Ces différents résultats de la répartition de la diarrhée à rotavirus en fonction de l’âge, pourraient s’expliquer par le fait que les enfants, notamment les nouveaux nés, sont protégés par le fort taux d’anticorps transplacentaires acquis de leur mère.
Il pourrait aussi s’agir des propriétés immuno-protectrices contenues dans certaines substances du lait maternel ou la grande quantité d’acide gastrique présent dans le tractus digestif des jeunes enfants. En effet, les anticorps maternels protègent l’enfant efficacement les premiers mois. Cette protection régresse avec l’âge et est perdue lorsque l’enfant avoisine 6 mois (Wandéra, 2012). Ceci pourrait expliquer la recrudescence des cas à 6 mois (classe médiane 6-8 mois) et l’absence de cas aux premières semaines de vie de l’enfant. Aussi, le lait maternel contiendrait des immunoglobulines IgA capables de neutraliser les rotavirus, des récepteurs analogues pouvant s’adhérer aux virus et inhiber leurs attachements aux récepteurs cellulaires et d’autres
facteurs pouvant prévenir l’attachement des virus aux cellules ou être impliqués dans d’autres mécanismes de protection de l’enfant. (Newburg et al., 1998).
Ces substances, comme les anticorps maternels, sont élevées aux premières semaines de vie de l’enfant et régressent avec l’âge et le processus d’allaitement. Selon Clemens en 1993, l’allaitement exclusif des enfants au sein, les protégeaient des infections aigues à rotavirus surtout pendant leurs premières années de vie. La grande quantité d’acide gastrique contenue dans le tube digestif de l’enfant pourrait aussi prévenir les infections à rotavirus. La baisse du pH induite, pourrait détruire les virus (Wandéra, 2012).
Le taux de positivité obtenu a été de 55,6%. Ce fort taux enregistré pourrait s’expliquer par la probable défaillance des conditions d’hygiène de vie et alimentaires de nos populations. En effet, le mode de transmission du rotavirus est essentiellement oro-fécal. Aussi, faudrait-il noter que le rotavirus est extrêmement infectieux. Le taux de positivité obtenu au cours de cette étude est voisin de celui enregistré en République Démocratique du Congo (Sangaji et al., 2015), au Togo (Tsolenyanu et al., 2014) et au Ghana (Enweronu et al., 2014). Il est supérieur aux taux trouvés au Nigéria (Imade et al., 2015, Junaid et al., 2011), au Gabon (Lekana-Douki et al., 2015), au Kenya (Khagayi et al., 2014 ; Breiman et al., 2014), en Ethiopie (Abebe et al., 2014), en Gambie (Kwambana et al., 2014) et en Uganda (Odiit et al., 2014). Par contre, il reste inférieur à ceux obtenus au Nigéria (Uzoma et al., 2016), au Soudan (Mustafa et al., 2014) et en Mauritanie (Pursem et al., 2014) chez les enfants de mêmes âges.
La diarrhée à rotavirus a majoritairement entrainé chez les enfants de la déshydratation, du vomissement et de la fièvre. Pris isolément, ces signes n’ont pas été significativement associés à cette infection (p>0,05). Ces observations concordent avec celles enregistrées au Nigéria (Uzoma et al., 2016, Junaid et al., 2011) et en République Démocratique du Congo (Sangaji en 2015).
Par contre, Abebe en 2014 en Ethiopie, a trouvé que le vomissement a varié
significativement avec l’infection à rotavirus. Les répartitions des enfants selon l’association de ces signes ont été statistiquement significatives (p< 0,05). Les mêmes résultats ont été obtenus au Nigéria (Junaid et al., 2011). Ceci pourrait s’expliquer par le fait que le rotavirus entrainerait par épisode, simultanément, au moins deux de ces signes cliniques associés à la présence de la diarrhée (Junaid et al., 2011). Ces faits justifient le fort taux d’admission et surtout d’hospitalisation observée.
CONCLUSION
Au terme de cette étude, le taux de positivité des diarrhées infantiles à rotavirus à Sèmè-Kpodji a été évalué à 55,6%. Les enfants de la tranche d’âges de 7 à 12 mois ont été les plus touchés. Aucun cas de diarrhée à rotavirus n’a été observé avant le premier trimestre de vie chez ces enfants.
La présente étude devra être complétée par des études moléculaires afin de rechercher les profils de la protéine VP6 en électrophorèse et les génotypes de rotavirus circulants au Bénin.
Recommandations
A l’issue de cette étude, nous formulons les recommandations suivantes : A l’endroit du Ministère de la Santé, nous recommandons,
L’installation et la formalisation des sites de surveillance des rotavirus sur toute l’étendue du territoire en vue d’avoir des feedbacks permanents et donc une maitrise des souches circulant dans chaque localité ;
L’institution du vaccin contre les rotavirus dans le PEV.
A l’endroit de l’OMS, nous souhaitons,
L’appui technique et matériel pour aider le Ministère de la Santé à intégrer les suggestions décrites ci-dessus ;
Le soutien des projets de recherches sur la thématique « Rotavirus » en l’occurrence les activités de recherche sur les différents génotypes circulant dans notre pays.
Références bibliographiques
1. Abebe A, Teka T, Kassa T, Seheri M, Beyene B, Teshome B, Kebede F, Habtamu A, Maake L, Kassahun A, Getahun M, Mitiku K. and Mwenda JM Hospital-based surveillance for rotavirus gastroenteritis in children younger than 5 years of age in Ethiopia: 2007–2011. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S28–S33.
2. Baert L and Debevere J. The efficacy of preservation methods to inactivate foodborne viruses. Intern Journ of Food Microbiol. 2009; 131: 83 – 94.
3. Breiman RF, Cosmas L, Audi A, Mwiti W, Njuguna H, Bigogo GM, Olack B, Ochieng JB, Wamola N, Montgomery JM, Williamson J, Parashar UD, Burton DC, Tate JE, and Feikin DR. Use of population-based surveillance to determine the incidence of rotavirus gastroenteritis in an urban slum and a rural setting Kenya. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S54–S61.
4. Clemens J, Rao M, Ahmed F, Ward R, Huda S, Chakraborty J, Yunus M, Khan MR, Ali M, Kay B, van Loon F and Sack D. Breast-feeding and the risk of life threatening rotavirus diarrhea. Pediatr. 1993; 92(5): 680-685.
5. Cugnet Aurélie, 2015 Diagnostic Moléculaire des Entérites Virales à Rotavirus, Norovirus et Adénovirus : Thèse de Doctorat présenté à la faculté de Pharmacie, Université Claude-Bernard-LYON. 100p.
6. Dennehy PH. Transmission of rotavirus and other enteric pathogens in the home. Pediatr. Infect. Dis. J. 2000; 19 (Suppl 10): S103-105.
7. Dong Y, Zeng, CQ, Ball JM, Estes MK, and Morris AP. The rotavirus enterotoxin NSP4 mobilizes intracellular calcium in human intestinal cells by stimulating phospholipase C-mediated inositol 1,4,5-trisphosphate production. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1997; 94: 3960-3965.
8. Enweronu-Laryea CC, Sagoe KWC, Mwenda JM, and Armah G. Severe acute rotavirus gastroenteritis in children less than 5 years in southern Ghana:
2006–2011. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S9–S13.
9. Enyonam T, Mapaseka S, Anoumou D, Edem D, Segla T, Martin N, Edotse A, Georges A, Jason M, and Yawo A. Surveillance for Rotavirus Gastroenteritis in Children Less than 5 Years of Age in Togo. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S14–S18.
10. Greenberg HB and Estes MK. Rotaviruses from pathogenesis to vaccination.
Gastr. 2009; 136 (Suppl 6):1939‑1951.
11. Junaid SA Umeh C, Olabode AO, and Banda JM. Incidence of rotavirus infection in children with gastroenteritis attending Jos University Teaching Hospital. Virol J. 2011; (Suppl 8): 233.
12. Khagayi S, Burton DC, Onkoba R, Ochieng B, Ismail A, Mutonga D, Muthoni J, Feikin RD, Breiman FR, Mwenda JM, Odhiambo F, and Laserson FK. High burden of rotavirus gastroenteritis in young children in rural Western Kenya, 2010–2011. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S34–
S40.
13. Kwambana BA, Ikumapayi UN, Sallah N, Dione M, Jarju S, Panchalingham S, Jafali J, Lamin M, Betts M, Adeyemi M, Akinsola A, Bittaye O, Jasseh M, Kotloff LK, Levine MM, Nataro PJ, CorrahT, Hossain MH, Saha D, and Antonio M. High genotypic diversity among rotavirus strains infecting Gambian children. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S69–S76.
14. Lekana-douki SE, Kombila-koumavor C, Nkoghe D, Drosten C, Drexler JF, Leroy EM. Molecular epidemiology of enteric viruses and genotyping of rotavirus A, adenovirus and astrovirus among children under 5 years old in Gabon. Int J Infect Dis. 2015; (Suppl 34): 90-95.
15. Liu L, Johnson HL, Cousens S, Perin J, Scott S, Lawn JE, Rudan I, Campbell H, Cibulskis R, Li M, Mathers C, Black RE. Global, regional, and national causes of child mortality: an updated systematic analysis for 2010 with time trends since 2000. Lancet. 2012; 379 (9832): 2151-2161.
16. Lorrot M, Vasseur M. Physiopathologie de la diarrhée à rotavirus. Arch Pediatr. 2007; 14(Suppl 3): S145 ‑ 151.
17. Lundgren O, Peregrin AT, Persson K, Kordasti S, Uhnoo I, Svens-Son L.
Role of the enteric nervous system in the fluid and electrolyte secretion of rotavirus diarrhea. Science. 2000 ; 287 : 491- 495.
18. Maria Hemming. Rotavirus Infections in Children Clinical features and effects of large scale prevention. Rotavirus vaccination. 2014 ;1 : 21-28.
19. Mukaratirwa A, Berejena C, Nziramasanga P, Shonhai A, Mamvura TS, Chibukira P, Mucheuki I, Mangwanya D, Kamupota M, Manangazira P, Tapfumaneyi C, Gerede R, Munyoro M, Mwenda JM, Mphahlele JM, Mapaseka L, Seheri ML, Peenze I, Gonah AN, Maruta A, and Tengende MB.
Epidemiologic and Genotypic characteristics of rotavirus strains detected in children less than 5years of age with gastroenteritis treated at 3 pediatric hospitals in Zimbabwe during 2008–2011. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S45–S48.
20. Mustafa A, Makki A, Siddig O, Haithami S, Teleb N, Trivedi T, Parashar U and Patel M. Baseline burden of rotavirus disease in Sudan to monitor the impact of vaccination. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S23–S27.
21. Newburg DS, Peterson JA and Ruiz-Palacios GM. Role of human milk lactadherin in protection against symptomatic rotavirus infection. Lancet.
1998; 351: 1160-1164.
22. Odiit A, Mulindwa A, Nalumansi E, Mphahlele MJ, Seheri LM, Mwenda JM, and Kisakye A. Rotavirus prevalence and genotypes among children younger than 5 years with acute diarrhea at Mulago National Referral Hospital, Kampala, Uganda. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S41–
S44.
23. Organisation Mondiale de la santé : les maladies diarrhéiques. Aide mémoire N° 330, 2013 Accessible à http://www.who.int/mediacentre /factsheets/fs 24. Parashar UD, Givson CJ, Bresee JS, Glass RI. Rotavirus and severe
childhood diarrhea. Emerg Infect Dis. 2006 ; 12 : 304-306.
25. Poeury AL, Dehée A, Garbarg-Chenon A. Rotavirus : aspects clinique et biologique. Feuillets Biol. 2007 ; 48 (274) : 31- 44.
26. Pothier P, Kohli E and Fromentin C. Infections à rotavirus. Médecine thérapeutique/pédiatrie. 1998 ; 1 (Suppl 1) : 31-36.
27. Pothier P et Agnello Davide. Les rotavirus et leur prévention. Médecine thérapeutique/pédiatrie. 2012 ; 150 : 23-27.
28. Pursem VN, Peeroo C, Mangar T, Sohawon LMF, Seheri LM, Mphahlele JM, Mwenda JM and Manraj S. Epidemiology of rotavirus diarrhea and diversity of rotavirus strains among children less than 5 years of age with acute gastroenteritis in Mauritius: June 2008 to December 2010. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S49–S53.
29. Ramig RF. Pathogenesis of intestinal and systemic rotavirus infection. J.
Virol. 2004, 78:10213-10220.
30. Ruiz-Palacios GM, Pérez-Schael I, Velázquez FR, Abate H, Breuer T, Clemens SC and al. Safety and efficacy of an attenuated vaccine against severe rotavirus gastroenteritis. N Engl J Med. 2006 ; 354 :11–22.
31. Sangaji MK, Mukuku O and Mutombo AM. Etude épidémio-clinique des diarrhées à rotavirus chez les nourrissons à l’hôpital Jason Sendwe de Lubumbashi, République Démocratique du Congo. Pan African Med J. 2015
; 21 : 113-115.
32. Schnepf N, Garbarg-Chenon A. Infection à rotavirus : Aspects épidémiologique, clinique, thérapeutique, immunologique, biologique et physiopathologique. Feuillets Biol. 2005 ; 46 (264) : 13-23.
33. Tagbo BN, Mwenda JM, Armah G, Obidike EO, Okafor UH, Oguonu T, Ozumba UC, Eke CB, Chukwubuike C, Edelu BO, Ezeonwu BU, Amadi O, Okeke IB, Nnani OR, Ani OS, Ugwuezeonu I, Benjamin-Pujah C, Umezinne N, Ude N, Nwodo C, Ezeonyebuchi MC, Umesie E, Okafor V, Ogude N, Osarogborum OV, Ezebilo SK, Goitom WG, Abanida EA, Elemuwa C and Nwagbo DF. Epidemiology of rotavirus diarrhea among younger than 5 years in Enugu, South East, Nigeria. Pediatr Infect Dis J. 2014; 33 (Suppl 1): S19–
S22.
34. Tate JE, Burton AH and Boschi‐Pinto C, et al. 2008 estimate of worldwide rotavirus‐associated mortality in children younger than 5 years before the introduction of universal rotavirus vaccination programmes: a systematic review and meta‐analysis. The Lancet Infect Dis. 2012; 12(2) :136–141.
35. Tsolenyanu E, Seheri M, Dagnra A, Djadou E, Tigossou S, Nyaga M, Adjeoda E, Armah G, Mwenda JM and Atakouma Y. Surveillance for rotavirus gastroenteritisin children less than 5 years of age in Togo. Pediatr Infect Dis J. 2014 ; 33 (Suppl 1) : S14–S18.
36. Uzoma EB, Chukwubuikem C, Omoyibo E and Tagbo O. Rotavirus genotypes and the clinical severity of diarrhea among under 5 years of age.
Nigeria Postgrad Med J. 2016; 23: 1-5.
37. Wandera EA. Detection and molecular characterization of rotavirus strains isolated from children attending selected health facilities in Kiambu district, Kenya. Octobre 2012, 84 pages.
38. WHO position paper: Rotavirus vaccines: Weekly Epidemiological Record.
2013; 88 (5) : 49-64.www.who.int/entity/wer/2013/wer8805.pdf.
39. WHO. Rotavirus deaths in under 5 years of age, as of endocytosis dependent and involves sequential VP4 conformational changes. J Virol. 2011; 85 (6) : 2492-2503.
Annexe1: Formulaire de notification
Dossier médical N° : ---
Date d’hospitalisation : ---/---/---/ Date d’admission : ---/---/---/ (Jour/Mois/ Année) Information sur le patient :
Nom du Père/Mère : --- Prénoms de l’enfant : --- Commune de résidence : --- Ville : --- Quartier : --- Tél : --- Age (Mois) : --- Date de naissance : ---/---/---/ Poids (kg) : --- Sexe : M F Traitement reçu : SRO seul ( ) ; IVF ( ) ; SRO +IVF ( ) ; Autre (préciser) --- Information clinique :
L’enfant a-t-il vomi : --- (Oui/Non) No d’épisodes/24h : --- Durée (Jours) : --- L’enfant fait-il la diarrhée : --- (Oui/Non) No d’épisodes/24h : --- Durée (Jours) : --- Date de début de la diarrhée : ---/---/---/ (Jour/Mois/ Année) Température : ---°C
Léthargie/inconscient : --- (Oui/Non) Yeux creux : --- (Oui/Non) Difficultés à boire : --- (Oui/Non) Pli cutané : --- (Oui/Non) Etat de déshydratation : Sévère ( ) Evident ( ) Aucun ( ) Statut vaccinal :
Vaccin contre Rota reçu : ---- (Oui/Non) Type de vaccin : Rotateq ( ) Rotarix ( ) Autre : --- Source de l’information : Carte vaccination ( ) Registre médical ( ) Rapport verbal ( ) Inconnue ( ) Issue : Améliorée ( ) ; Transférée ( ) ; Décédée ( ) ; Contre avis médical ( ) ; Inconnue ( ) Date de sortie ou de décès : ---/---/---/ (Jour/Mois/ Année)
Information de Laboratoire :
Date de prélèvement des selles : ---/---/---/ (Jour/Mois/ Année) Heure de prélèvement : --- Etat de l’échantillon : Adéquat ( ) Non adéquat ( )
Moyen de conservation des selles : ( ) Glacière ( ) Réfrigérateur ( ) Congélateur ( ) Aucun Date d’envoi au Laboratoire : ---/---/---/ (Jour/Mois/ Année)
Date de réception au Laboratoire : ---/---/---/(Jour/Mois/ Année)
Rotavirus dépisté dans les selles : --- (Oui/Non) Si <<Oui>> Méthode utilisée : --- Personne ne remplissant le formulaire :
Nom/Prénoms : --- Signature : ---
