Après screening et criblage des colonies, beaucoup d’isolats ont été éliminés par simple observation visuelle, soit par non-conformité à la couleur ou à l’aspect des colonies d’Erwinia sur milieu KingB ou bien à cause de croissance réduite. Selon Hélias (1999), les colonies de couleur blanche crémeuse donnant une suspension homogène.
*Identification biochimique des colonies purifiées Identification préliminaire
Après caractérisation morphologique et culturale,les tests préliminaires d’identification sont indispensables, ces examens comportent, l’observation de la mobilité, la coloration de Gram et le test de la catalase. (Tableau I)
Tableau I : Résultats des tests d’identificaton préliminaire Test results of preliminary identification.
Souche Test Coloration de Gram Catalase Mobilité
Ech 99.21
_ + + S1/ S2 /S3 /S4 / S5 _ + +
-Mise en évidence des Erwinia pectinolytiques
Trois souches de référence (Eca 86.20, Ecc 98.1 et Ech 99.21) sont utilisées pour la caractérisation biochimique. Ces souches type répondent de manière positive aux tests biochimiques d’indentification ;elles possèdent une activité pectinolytique, réduisent les nitrates en nitrites (Tableau II). Ces tests constituent des critères clefs de détérmination des Erwinia pectinolytiques
Tableau II : Mise en évidence des Erwinia pectinolytiques/ Discovery of pectinolytic Erwinia
-Distinction entre Erwinia carotovora et Erwinia chrysanthemi
Après détermination et mise en évidence des souches d’Erwinia pectinolytiques, la deuxième étape est la distinction entre les Ec et Ech. Le tableau III résume les résultats des tests de discrimination entre ces deux espèces
Les souches isolées localement (S1, S2, S3, S4 et S5) se comportent de la même façon et ont les mêmes réponses que la souche type Ech 99.21. Elles synthétisent de l’indole à partir du tryptophane par l’action d’une enzyme, la tryptophanase, ceci est conforme à la bibliographie (Cother et Blakeney 1987).
Par ailleurs, ces mêmes souches produisent une lécithinase et sont incapables de croître en présence d’une grande concentration de NaCl. D’après Gouesbet et al.(1995) et Touzé et
al.(2001), la croissance et les activités métaboliques des Erwinia chrysantemi sont
complètement inhibées dans les milieux hypersalins.
Ces propriétés sont considérées par de nombreux auteurs comme étant spécifiques aux souches d’Erwinia chrysanthemi.
En tenant compte de l’ensemble de ces tests, les 5 souches isolées localement semblent appartenir à l’espèce Erwinia chrysanthemi. Ce résultat permet d’integrer ces souches qui étaient absentes dans la collection effectuées antérieuement par Yahiaoui-Zaidi et al. (2003). Cependant, il reste encore prématuré de conclure sur la classification des espèces pectinolytiques d’Erwinia qui nécessite davantage de tests de confirmation
Souche Test Activité pectinolytique (CVP) Nitrate réductase Eca 86.20 Ecc 91.8 Ech 99.21 + + S1/ S2 /S3 /S4 / S5 + +
Tableau III : Différenciation entre les espèces Ec et Ech Differentiation between two species Ec and Ech
CONCLUSION
L’objectif de notre travail était de mettre en collection différentes souches appartenant au genre Erwinia pectinolytiques (Pectobacterium), isolées à partir des tubercules de pomme de terre en ALGERIE/BEJAIA
Les résultats obtenus, après une identification biochimique approximative, s’accordent pour confirmer la présence de cinq souches d’Erwinia chrysanthemi.
La pomme de terre, de par sa valeur nutritionnelle et son côut abordable, incite à l’élaboration d’un programme intégrant sa protection et sa conservation. La lutte contre les agents pathogènes passe en priorité par un ensemble de mesures prophylactiques permettant de limiter les risques d’apparition de la maladie et de ralentir sa propagation dans les parcelles et dans les chambres de conservation.
REMERCIEMENT
Il n’ya pas de travail sans succès comme il n’ya pas de succès sans travail. Merci Papa de me l’avoir si souvent répété.
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Souches Tests Eca 86.20 Ecc 91.8 Ech 99.21 S1/ S2/S3/S4/S5 Lactose + + _ _ Malonate _ _ + + Indole _ _ + + Lécithinase _ _ + + Lipoprotéinase _ _ + + Tolérance au NaCl% + + _ _
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QUANTITATIVE ANALYSIS OF SOLANAPYRONE A