2. Préconisation : le VDIP et son matériel
2.2. La détection, l’identification et le prélèvement : définition et challenges pour les
2.2.1. Le prélèvement
2.2.1.2. Procédures et matériels
Le prélèvement est une étape critique indispensable à la qualité de l’analyse. En effet,
comme celui-ci est souvent naturellement contaminé par d’autres micro-organismes, il faut
donc que l’intervention humaine soit minime afin de limiter la sur-contamination. C’est pourquoi des recommandations ont été émises concernant le type de matériel à utiliser
(30,37,38) et les procédures (taille de l’échantillon et nombre). Les règles de base
concernant l’échantillonnage sont en premier lieu de bien identifier l’échantillon (lieu, date, heure..). En second lieu, il convient d’effectuer le prélèvement en trois exemplaires, l’un destiné pour l’analyse proprement dite ou expertise, l’autre conservé pour une éventuelle contre-expertise, et un troisième au titre de la conservation de la preuve (30).
Les quantités prélevées devront être suffisantes pour l’ensemble des analyses nécessaires.
Pour les prélèvements environnementaux, l’échantillonnage doit être réalisé préalablement à toute autre manipulation de l’objet suspect et nécessite l’utilisation d’outils de prélèvement stériles à usage unique selon des procédures adéquates réalisées par du
personnel formé. De plus, les analyses par des méthodes de terrains doivent être entreprises
seulement après la collecte en quantité suffisante d’échantillons réservés aux laboratoires de référence en évitant toute contamination extérieure. Si l’objet ne peut être conditionné
(volumineux), il est conservé sur le site.
Le matériel de prélèvement et les quantités à prélever en fonction du type de matrice sont
référencés dans le Tableau 3. Des exemples de kits de prélèvement commerciaux et les
matrices sur lesquelles ils peuvent être utilisés sont recensés et associés à des sites internets
60
Tableau 3 : Recommandation pour le prélèvement des différentes matrices environnementales (adapté de (38))
Types d'échantillon Matériels(1) Quantités à
prélever Détails
Gazeux (aérosols et particules)
Unités de prélèvement stériles d’aérosols, filtres,
milieux de croissance,
éponges, lingettes, Minimum 100L
Seulement si une détection positive est retrouvée ou
sur ordre
Si possible, éviter la récupération des poudres
ayant été directement en contact avec le sol Colleteur d’air (cyclone, sur
filtre, électrostatique)
Liquides et eaux Pipettes, seringues, flacons à seller avec téflon, éponge
100mL (eau) Prélever indépendamment eaux de surface, sédiments, eau de profondeurs. Penser à prélever les eaux post-
décontamination 10mL
(liquides)
Solides
Sols, poudres
Sacs plastiques à seller, truelle, pelle, cuillère, spatules, flacons à seller
avec téflon, filtres
Surface de 10x10x2cm
(sols)
Prélever les débris séparément
Neige Cuillères, pelle, truelle, flacons à seller avec téflon
Surface de 10x10x2cm
Ne prélever que la (les) couche(s) touchée(s)
Pierres Sacs plastiques à seller
Taille: de 0,5 à 2cm pour un volume maximum de 200mL Végétaux
Sacs plastiques à seller, ciseaux, sécateurs, pinces de
prélèvement
2L Ne pas toucher les plantes avec les gants
Solides non transportables
Cotons secs, cotons imprégnés de tampon, écouvillons dans milieu
adapté
Pas de quantité minimum
Peut-être de type bâtiments, tables, murs…
Vêtements Sacs plastiques de 5L à seller, pinces
Pas de quantité minimum
Découper les parties contaminées
Echantillons de contrôle
Tous les échantillons de contrôles doivent être réalisés dans les mêmes conditions que l’échantillon contenant l’agent à analyser. Il permet d’évaluer le bruit de fond présent dans la matrice.
(1)
61
Tableau 4 : Liste non exhaustives de kits de prélèvements commerciaux disponibles
Instruments/kits Fabricants Sites internet (au 27/04/14) Types de matrices Commentaires
Alexeter Collection Swab®
Alexeter http://www.alexeter.com/biow/index.a sp
- Poudre, surfaces.
- Remise en milieu liquide - Pré-traitement par filtration
- Compatible avec les tests immunologiques
BioDetect test strip et avec la détection par PCR
- 75 dollars américains (USD) / boîte de 25 - Décontamination par immersion possible
Sample collection and recovery device
(SCRD)
ASD biosystem http://www.asdbiosystems.com/p1.htm - Poudre, surface
- Remise en milieu liquide
- Compatible avec les tests immunologiques et avec la détection par PCR
- 12 USD chacun
- Décontamination par immersion possible
Kits SWIPE™ New Horizons
Diagnostics
http://www.nhdiag.com/profile_one.sh tml
- Solides, liquides, poudres, particules
- Pré-traitement par filtration pour le kit
SWIPE™ Sample Processing Kit
- Compatible avec les tests immunologiques et avec la détection par PCR
- 13,20-23,10 USD selon le kit
B2C™ Bulk sample collection kit
QuickSilver Analytics, Inc.
http://www.chembiokits.com/ Poudres 26,71 USD chacun
ULTRA-TURRAX® Tube Drive control
IKA® http://www.ika.com Liquides, poudres, surfaces, solides (végétaux,
écorces..)
- 968 USD la malette contenant différents tubes (disperseurs, broyeurs, agitareurs)
- Recharge: en moyenne 10 US USD/tube
BiSKit™ Large Area Sampling Kit (LAS
Kit)
QuickSilver Analytics, Inc.
http://www.chembiokits.com/ Surfaces - 51,65 USD chacun
- Compatible avec les PCR et immuno-essais
QSA model 102™ QuickSilver
Analytics, Inc.
http://www.chembiokits.com/ -Surfaces, liquides et solides
- Agents RBC-E
3050,65 USD le kit complet
Mini Push Pack™ QuickSilver
Analytics, Inc.
http://www.chembiokits.com/ Liquides, surfaces et solides
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Kit SAS™ Small area sampling
QuickSilver Analytics, Inc.
http://www.chembiokits.com/ Poudres et liquides 22,68 USD chacun
S3™ Bio sampler QuickSilver
Analytics, Inc.
http://www.chembiokits.com/ Surfaces - Compatible avec les tests immunologiques et avec la détection par PCR
- 32,46 USD chacun
Coriolis® FR ou RECON
Bertin technology http://www.bertin.fr/en/coriolis-fr- first-response-bio-aerosol-
sampler.aspx
Bio-collecteur d’air (cyclone)
32250 USD
SASS® technology Research
international™
http://www.resrchintl.com/ Bio-collecteur d’air (cyclone)
IMASS™ et SASS® BBI detection http://www.bbidetection.com Poudre, liquide, surface et aérosols
Pour les poudres : couplé à une détection immunologique
Air Corona™ Leti™ et le
Commissariat à l'énergie atomique
et aux énergies alternatives
(CEA)
http://www.leti.fr/ Bio-collecteur d’air (électrostatique)
BioBadge® 100 FLIR® http://www.southernscientific.co.uk/ca
talog/products/icx-biobadge
Bio-collecteur d’air (filtre)
ACD-200 INNOVAPREP http://innovaprep.com/products/acd-
200-bobcat-aerosol-collector/
Bio-collecteur d’air (filtre)
XMX/2AL-MIL Dycor http://www.dycor.com/Products/Defen
seSecurity/AerosolCollectors/XMX2L MIL.aspx
Bio-collecteur d’air
TED Evaluation Kit BioTX http://biotx.net/products/ted Poudres, fibres, liquides et
surfaces
559,59 USD
M-Vac portable SEC MSI M-Vac®
system
http://www.m-
vac.com/products/overview/portable- sec
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