Liste des abréviations
ADN : Acide Désoxyribonucléique
AMC : Amoxicilline + Acide clavulanique AMX : Amoxicilline
ATB : Antibiotique
BGN : Bacille à Gram négatif
BLSE : Bêtalactamases à Spectre Etendu BMR : Bactéries Multirésistantes
C : Chloramphénicol CF : Céfalotine CFM : Céfixime
CGN : Cocci à Gram négatif CGP : Cocci à Gram positif
CHU : Centre Hospitalier Universitaire CIP : Ciprofloxacine
CMI : Concentrations Minimales Inhibitrices CN : Céfalexine
CXM : Céfuroxime
C2G : Céphalosporines de deuxième Génération C3G : Céphalosporines de troisième Génération E : Érythromycine
EARS-Net : European Antimicrobial Resistance Surveillance Network
ECBU : Examen cytobactériologique des urines FOX : Céfoxitine
FT : Nitrofurantoine GM : Gentamicine
NNIS : National Nosocomial Infections Surveillance ITU : Infection du tractus urinaire
IU : Infection urinaire
OMS : Organisation Mondiale de la Santé PLP : Protéines Liant les Pénicillines PT : Pristinamycine
PV : Prélèvement vaginal PU : Prélèvement urétral
SARM : Staphylococcus Aureus Résistant aux Méthicillines SASM : Staphylococcus Aureus Sensible aux Méthicillines SPC : Spermoculture
SXT : Sulfaméthoxazole + Triméthoprime TE : Tétracycline
TOB : Tobramycine
Liste des figures
Figure 1 : Provinces et préfectures de la région Rabat-Salé-Kénitra ...5 Figure 2 : Monuments de la ville de Salé au Maroc ...5 Figure 3 : Exemple du laboratoire d’analyses médicales Le Caducée Salé ... 16 Figure 4 : Fiche de renseignement. ... 17 Figure 5 : Exemple d’une souche bactérienne (bacille à Gram négatif) d’origine urinaire sur le milieu MacConkey. ... 20 Figure 6 : Exemples de Disques d’Antibiotiques (Photo prise au laboratoire Le Caducée) ... 20 Figure 7 : Exemple d’antibiogramme avant l’incubation (Photo prise au laboratoire Le Caducée). ... 21 Figure 8 : Exemples d’antibiogrammes (photo prise au laboratoire El Hayat). ... 22 Figure 9 : Concentrations critiques inférieures et supérieures ... 23 Figure 10 : les types de résistance bactérienne ... 27 Figure 11 : Répartition globale par groupes de germes. ... 30 Figure 12 : Répartition globale des bactéries selon le sexe ... 31 Figure 13 : Répartition des bactéries selon la nature du prélèvement. ... 33 Figure 14 : Répartition des BGN selon le sexe. ... 34 Figure 15 : Répartition des BGN selon l’âge. ... 35 Figure 16 : Répartition des BGN selon la nature du prélèvement ... 36 Figure 17 : Répartition des BGN selon l’espèce. ... 37 Figure 18 : Profil de résistance d’E.coli aux antibiotiques. ... 39 Figure 19 : Profil de résistance de Klebsiella sp aux antibiotiques... 39
Figure 20 : Profil de résistance de Proteus sp aux antibiotiques. ... 40 Figure 21 : Répartition des cocci selon le sexe. ... 41 Figure 22 : Répartition des cocci selon l’âge ... 42 Figure 23 : Répartition des cocci selon la nature du prélèvement ... 43 Figure 24 : Répartition des cocci selon l’espèce. ... 44 Figure 25 : Profil de résistance des Streptocoque sp aux antibiotiques. ... 46 Figure 26 : Profil de résistance des Staphylocoque sp aux antibiotiques. ... 46 Figure 27 : Profil de résistance des Neisseria gonorrhoeae aux antibiotiques. ... 47 Figure 28 : Principaux mécanismes biochimiques de la résistance bactérienne aux antibiotiques ... 53 Figure 29 : Publicité présentée dans le magazine LIFE du 14/08/1944 (issue du livre: Le paradoxe de antibiotiques de Stuart B. Levy). ... 55 Figure 30 : Sources et méthodes utilisées en paléomicrobiologie pour la détection des microorganismes dans les échantillons anciens ... 58 Figure 31 : Source géographique des échantillons anciens de l’environnement et humains dans lesquels des gènes codant des résistances aux antibiotiques, ont été détectés ... 59 Figure 32 : Destins possibles d’un gène de résistance aux antibiotiques. Tra : transférable ... 62 Figure 33 : Exemple de l’évolution de la résistance aux bêtalactamines entre 1940 et 2005 ... 63 Figure 34 : Proportion de souches de Klebsiella pneumoniae résistantes aux carbapénèmes en 2012 ... 69 Figure 35 : Proportion de souches d’Enterococcus faecium résistant à la vancomycine en 2012 ... 70
Figure 36: Utilité de la comparaison entre le niveau de résistance et le niveau de consommation des antibiotiques : diagramme d’aide à la décision. D’après Monnet et al. DDJ : dose définie journalière ... 72 Figure 37 : Causes de l’antibiorésistance d’après l’OMS ... 76 Figure 38 : Propagation de la résistance bactérienne aux antibiotiques d’après
Liste des tableaux
Tableau I : Profil de la Démographie au niveau de Salé (Urbain) ...7 Tableau II : Profil de la Démographie au niveau de Salé (Rural) ...9 Tableau III : Profil de l’éducation et l’alphabétisation au niveau de Salé ... 11 Tableau IV : Profil d’activité et d’emploi au niveau de Salé ... 14 Tableau V : Répartition globale par groupes de germes. ... 29 Tableau VI : Répartition globale des bactéries selon le sexe ... 31 TableauVII : Répartition des bactéries selon le type de prélèvement. ... 32 TableauVIII : Répartition des BGN selon le sexe ... 34 Tableau IX : Répartition des BGN selon l’âge. ... 35 Tableau X : Répartition des BGN selon la nature du prélèvement. ... 36 Tableau XI : Répartition des BGN selon l’espèce ... 37 Tableau XII : Profil de résistance des bacilles à Gram négatif les plus fréquents. ... 38 TableauXIII : Répartition des cocci selon le sexe. ... 41 Tableau XIV : Répartition des cocci selon l’âge. ... 42 Tableau XV : Répartition des cocci selon la nature du prélèvement ... 43 Tableau XVI : Répartition des cocci selon l’espèce... 44 Tableau XVII : Profil de résistance des cocci les plus fréquents. ... 45 Tableau XVIII : Cible d’action des principaux antibiotiques ... 49 Tableau XIX : Profil de résistance des SASM et SARM ... 68 Tableau XX : comparaison de la répartition globale des souches isolées avec d’autres études ... 85
Introduction ...1 Matériel et méthodes d’étude ...3
I.Présentation de la ville d’étude ...4 Potentialité de la ville Salé ...6 1.1. Cadre démographique ...6 1.2. Cadre naturel ... 11 1.3. Cadre économique ... 12 1.4. Cadre sanitaire ... 14 II.Cadre de l’étude ... 15 III.Méthodologie ... 16 1.Type et période d’étude ... 16 2.Population d’étude ... 16 3.Critères d’inclusion ... 16 4.Critères d’exclusion ... 17 5.Recueil de données ... 17 6.Saisie et analyse des données ... 18 7.Types de prélèvements ... 18 8.Antibiogramme ... 18 8.1 Définition ... 18 8.2 Indications ... 19 8.3 Réalisation d’un antibiogramme ... 19 8.3.1 Matériel ... 19
8.3.2 Etapes ... 21 9.Contraintes et limites du travail ... 24 IV.Résistance bactérienne aux antibiotiques ... 24 1.Définition de la résistance bactérienne ... 24 2.Types de résistance bactérienne ... 25
Résultats ... 28
I.Fréquence générale des bactéries ... 29 1.Répartition globale des bactéries ... 29 2.Répartition globale des bactéries selon le sexe ... 31 3.Répartition globale des bactéries selon le type de prélèvement ... 32 II.Fréquence des bacilles à Gram négatif ... 34 1.Répartition des bacilles à Gram négatif selon le sexe ... 34 2.Répartition des bacilles à Gram négatif selon l’âge ... 35 3.Répartition des bacilles à Gram négatif selon la nature du prélèvement ... 36 4.Répartition des bacilles à Gram négatif selon l’espèce ... 37 5.Profil de résistance des bacilles à Gram négatif les plus fréquentes ... 38 III.Fréquences des cocci ... 41 1.Répartition des cocci selon le sexe ... 41 2.Répartition des cocci selon l’âge ... 42 3.Répartition des cocci selon la nature du prélèvement ... 43 4.Répartition des cocci selon l’espèce ... 44 5.Profil de résistance des cocci les plus fréquents ... 45
Discussion... 48
I.Rappels ... 49 1.Définitions ... 49 2.la multirésistance et son évolution ... 50 3.Mécanismes biochimique de la résistance bactérienne ... 51 3.1 Résistance à médiation enzymatique ... 51 3.2 Altération de la cible ... 52 3.3 Expulsion des antibiotiques ... 52 3.4 Diminution de la perméabilité membranaire ... 53 II.L’historique ... 54 1.Histoire des antibiotiques ... 54 2.Antiquité de la résistance des bactéries aux antibiotiques ... 56 3.Histoire de la résistance bactérienne ... 60 III.Epidémiologie de la résistance bactérienne ... 64 1.A l’échelle nationale ... 64 2.A l’échelle internationale ... 66 IV.Relation entre l’utilisation des antibiotiques et la résistance bactérienne ... 70 V.Causes de la résistance aux antibiotiques ... 73 1.Automédication antibiotiques ... 73 2.Prescription inappropriée des antibiotiques ... 74 3.Usage en médecine vétérinaire ... 75 VI.Le sursaut de l’industrie pharmaceutique ... 78 VII.Discussion des résultats ... 79
1.Répartition des prélèvements selon le sexe ... 79 2.Répartition des prélèvements selon l’âge ... 80 3.Répartition des prélèvements selon leur nature ... 81 4.Répartition globale des souches bactériennes isolées ... 83 5.Profil de résistance des bactéries aux antibiotiques ... 85 5.1 Profil de résistance aux antibiotiques des BGN les plus fréquentes ... 85 5.1.1 Profil de résistance des souches d’E.coli ... 87 5.1.1.1. Résistance à l’AMX/AMC... 87 5.1.1.2. Résistance aux C3G... 87 5.1.1.3. Résistance à la gentamycine ... 88 5.1.1.4. Résistance aux fluoroquinolones... 88 5.1.1.5. Résistance au cotrimoxazole ... 88 5.1.2 Profil de résistance des souches de Klebsiella sp ... 88 5.1.2.1. Résistance à l’AMC... 89 5.1.2.2. Résistance aux C3G... 89 5.1.2.3. Résistance aux fluoroquionolones ... 89 5.1.2.4. Résistance au cotrimoxazole ... 89 5.2 Profil de résistance des cocci à Gram positif ... 90 5.2.1 Profil de résistance du Staphylococcus sp ... 90 VIII.Recommandation et surveillance ... 91 1.Problématique de données et réseau de surveillance au Maroc ... 91 2.Stratégie de prévention ... 93 IX.Rôle du pharmacien d’officine dans la lutte contre la résistance bactérienne ... 94
1.Juste usage des antibiotiques ... 94 2.Prévention des infections et maîtrise des transmissions croisées ... 95 3.Communication, éducation et formation ... 95
Conclusion ... 96 Résumé
Profil de résistance des bactéries aux antibiotiques en milieu extra-hospitalier dans la ville de Salé
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Profil de résistance des bactéries aux antibiotiques en milieu extra-hospitalier dans la ville de Salé
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D’après l’Organisation Mondiale de la Santé, « la résistance aux antibiotiques menace la prévention et le traitement efficace d’un nombre de plus en plus grand d’infections bactériennes. C’est une menace grandissante pour la santé publique mondiale, qui nécessite une action de la part de tous les secteurs ministériels et de la société en entier. La résistance aux antibiotiques est présente dans toutes les parties du monde, et de nouveaux mécanismes de résistance voient le jour et diffusent dans le monde entier ».
Au Maroc, le problème de la résistance aux antimicrobiens est resté un problème connu des seuls spécialistes. En 2015, le ministère de la santé a célébré, à l’instar des autres états membres de l’organisation mondiale de la santé, la première semaine mondiale pour un bon usage des antibiotiques qui a eu lieu du 16 au 22 novembre 2015 avec comme thème « Antibiotiques à manipuler avec précaution ». L’objectif de cette célébration est de « faire connaitre le phénomène de résistance aux antibiotiques, dû à l’usage abusif et sans prescription médicale ».
Les laboratoires d’analyses médicales jouent un rôle important dans l’identification des germes impliqués et l’étude de leur sensibilité aux antibiotiques constituent la base de toute thérapeutique efficace et donc le choix d’une antibiothérapie adaptée.
Salé est une ville située sur le littoral atlantique et limitée au Nord par Kénitra, au Sud par la Préfecture de Rabat et à l’Ouest par la province de Khemisset. Elle est d’une superficie de 688.5km², soit 4 % du territoire de la Région de Rabat-Salé-Kénitra (18 194 km²).
Dans notre travail, nous rapportons les résultats d’une étude descriptive portante sur 400 cas ayant des infections différentes d’origine bactérienne, parvenues aux différents laboratoires d’analyses médicales au niveau de Salé.
L’objectif de ce travail est d’apprécier la fréquence, la répartition et la résistance des bactéries aux antibiotiques en milieu extra-hospitalier au niveau de la ville de Salé, afin de faire le point sur l’épidémiologie locale et l’évolution de cette résistance, et aider l’orientation thérapeutique des médecins du secteur libéral dans le traitement de certaines infections bactériennes.
Profil de résistance des bactéries aux antibiotiques en milieu extra-hospitalier dans la ville de Salé
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