Activité antagoniste des composés diffusibles envers les isolats du FOC

Les meilleurs souches bactériennes apparentant aux deux genres étudiés ayant une activité antifongique supérieure à 40% dans les tests de confrontation directe contre le FOC1en dual culture on été retenues pour les tests futures. Il s’avère que 35 souches de

Bacillus et 31 souches de Pseudomonas correspondent aux critères d’efficacité retenus.

D’emblé, on signale la confirmation des résultats obtenus dans les tests préliminaires, ou l’inhibition de la croissance mycélienne du FOC a été réobtenue dans l’actuel test de comparaison du comportement des souches bactériennes envers les isolats du FOC.

En ce qui concerne l’efficacité des souches bactériennes dans le contrôle de la croissance mycélienne des isolats fongiques nous donnent une grande variabilité, d’une part entre les souches bactériennes et à l’intérieur du même isolat fongique et d’autre part entre l’efficacité de chaque souche bactérienne et le développement mycélien des trois isolats fongiques étudiés (Figure 11, Tableau E, annexe1).

En effet, les souches de Bacillus étaient très efficaces contre le FOC1 avec une moyenne d’inhibition de l’ordre de 54,63%, suivie par inhibition moyenne de l’ordre de 42,44% contre le FOC3 et seulement moyenne d’inhibition de 28% le FOC2.

A titre individuel, la souche bactérienne codée B61 s’est avéré la plus efficace contre le FOC1, FOC2 avec des taux d’inhibition de l’ordre 77% et 66,71%, respectivement. Alors que dans le cas du FOC3 la souche bactérienne B73 s’est montré la plus efficace du moment qu’elle a donné un taux d’inhibition de l’ordre 72,97% (Tableau C, annexe 1).

Comme synthèse des résultats, il en ressort que 48.5% des souches de Bacillus testées sont efficaces ont un pourcentage d’inhibition de la croissance mycélienne du FOC1 supérieur à 50%, et le même pourcentage de souches (48.5%) ont un taux d’inhibition copris entre 25 et 50%. Deux souches de Bacillus se sont avérées très efficaces contre le FOC1 soit 2,85% du total des souches testées.

En ce qui concerne l’activité anti fongique contre le FOC2, la majorité des souches de Bacillus ont une activité comprise entre 25 – 50% d’efficacité soit un taux de 60% du total des souches testées. Ceci est semblable aux résultats obtenus contre le FOC3, où la majorité des souches soit 65,71% avaient une efficacité comprise entre 25 – 50%. On également que contre ces deux isolats fongiques, on n’avait trouvé aucune souche avec un pouvoir inhibiteur dépassant les 75% d’efficacité (Tableau 13).

Chapitre II Etude du pouvoir antagoniste antifongique des rhizobactéries in Vitro

54 Tableau 13: Classement des souches de Bacillus selon l’action par les produits diffusibles

Isolats FOC Groupe 1

Sup à 75% Groupe 2 Entre 50 - 75% Groupe 3 Entre 25 – 50% FOC1 2.85% 48.57% 48.57% FOC2 0% 31.43% 60% FOC3 0% 28.57% 65.71%

Les résultats de comparaison de l’inhibition de la croissance mycélienne par les souches de Bacillus montrent un effet significatif au seuil 5% avec les quatre isolats du Foc et avec le Fusarium solani. Ceci confirme aussi bien la variabilité entre les FOC et les souches de Bacillus (Tableau 14).

Tableau 14 : Analyse de la variance de l’effet antagoniste des souches de Bacillus contre trois isolats de FOC et contre le FS.

Somme des carrés ddl Moyenne des carrés F Signification Inhibition_FOC1 Inter-groupes 7998,62 34 235,25 7,10 0,000 Intra-groupes 1159,75 35 33,13 Total 9158,37 69 Inhibition_FOC2 Inter-groupes 23101,80 34 679,46 132,75 0,000 Intra-groupes 179,13 35 5,11 Total 23280,93 69 Inhibition_FOC3 Inter-groupes 7022,12 34 206,53 45,28 0,000 Intra-groupes 159,62 35 4,56 Total 7181,75 69 Inhibition_FS Inter-groupes 17388,33 34 511,42 43,05 0,000 Intra-groupes 415,72 35 11,87 Total 17804,05 69

II.3.3.1.2. Le cas des souches bactériennes Pseudomonas

Comme dans le cas des Bacillus, les souches de Pseudomonas ont donné des résultats similaires aux résultats des tests préliminaires, ou l’inhibition de la croissance mycélienne du FOC a été réobtenue dans l’actuel test de comparaison du comportement des souches bactériennes envers les isolats du FOC. (Figure 9).

En ce qui concerne l’efficacité des souches bactériennes dans le contrôle de la croissance mycélienne des isolats fongiques nous donnent une grande variabilité, d’une part entre les souches bactériennes et à l’intérieur du même isolat fongique et d’autre part entre l’efficacité de chaque souche bactérienne et le développement mycélien des trois isolats fongiques étudiés.

Chapitre II Etude du pouvoir antagoniste antifongique des rhizobactéries in Vitro

55 En effet, les souches de Pseudomonas étaient très efficaces contre le FOC1 et le FOC2 avec la même moyenne d’inhibition de l’ordre de 47,26%, très loin de la moyenne d’inhibition de l’ordre de 25,40% obtenue dans le cas du FOC3. A titre individuel, la souche bactérienne codée P53 s’est montrée la plus efficace pour le contrôle du FOC1 avec un taux de 71% mais totalement inactive contre le FOC2 (0%), qui était beaucoup plus sensible à la souche P25 avec un taux d’inhibition de l’ordre de 71,42%. Alors que dans le cas du FOC3, c’est la souche bactérienne P37 qui s’est montré la plus efficace puisqu’elle a donné un taux d’inhibition de l’ordre 56,75% (Tableau D, annexe 1).

Comme synthèse des résultats, il en ressort que globalement, il n’existe aucune différence dans le nombre de souches de Pseudomonas agissant conte les trois isolats du FOC. Primo aucune n’a donné un pouvoir inhibiteur supérieur à 75% d’inhibition quelque soit l’isolat fongique, secundo, on a obtenu le même nombre de souches bactériens ayant une inhibition comprise entre 25 et 50% de réduction de la croissance mycélienne. Un nombre plus ou moins réduit (25,80) de souches ayant une activité comprise entre 50 et 75% anti FOC2 est à signaler (Tableau 16).

Tableau 16: Classement des souches de Pseudomonas selon l’action par les produits diffusibles

Souche

bactériennes Groupe 1 Groupe 2 Groupe 3

FOC1 0% 29.03% 70.97%

FOC2 0% 25.80% 70.97%

FOC3 0% 29.03% 70.97%

L’analyse de la variance au seuil de 5% a montré un effet significatif de l’activité antagoniste des 31 souches de Pseudomonas contre les trois isolats de FOC et contre le FS (Tableau 17). Tableau 17 : Analyse de variance de l’effet antagoniste de souches de Pseudomonas contre les isolats fongiques.

Source Somme des carrés

de type III ddl Moyenne des carrés D Sig. Souches_Pseudomonas 18251,47 30 608,38 12,03 0,000 Isolats_FOC 9426,29 3 3142,09 62,15 0,000 Souches_Pseudomonas * Isolats_FOC 38978,66 90 433,09 8,56 0,000 Erreur 6268,67 124 50,55 Total 513575,53 248 Total corrigé 72925,10 247

Chapitre II Etude du pouvoir antagoniste antifongique des rhizobactéries in Vitro

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II.3.3.1.3. Activité antagoniste des Bacillus et Pseudomonas envers le Fusarium solani

Afin d’étudier l’effet des souches bactériennes sur d’autres espèces de Fusarium, nous avons confronté les souches bactériennes sélectionnées dans des tests In Vitro contre le F.

solani. Les résultats, nous donnent que les souches bactériennes (Bacillus et Pseudomonas)

exercent une activité antagoniste envers cette espèce de Fusarium.

En effet, les souches de Bacillus ont donné une moyenne d’inhibition de l’ordre 43,129. Elle est parfois plus sensible par rapport au FOC2 à l’activité antifongique des souches bactériennes du groupe de Bacillus. Il se trouve que la souche B61 qui était la meilleure contre le FOC1 et FOC2, s’est montré la plus efficace dans l’inhibition de la croissance mycélienne du Fusarium solani.

Dans le cas des souches de Pseudomonas, elles ont donné une moyenne d’inhibition de l’ordre 39,5, ce taux se trouve plus supérieur qu’au taux enregistré avec le FOC3, qui est égale à 25,4. Individuellement, la souche P29 s’est montré la plus efficace dans l’inhibition de la croissance mycélienne du Fusarium solani avec un taux d’inhibition de la croissance mycélienne de l’ordre de 67,5.

II.3.3.2 Activité antagoniste des composés volatiles envers les isolats du FOC