LES PROBIOTIQUES ET LEUR PLACE DANS LA PRATIQUE OFFICINALE : ENQUETE AUPRES DES PHARMACIENS OFFICINAUX

UNIVERSITE MOHAMMED V DE RABAT

FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT

DOYENS HONORAIRES :

1962 – 1969 : Professeur Abdelmalek FARAJ 1969 – 1974 : Professeur Abdellatif BERBICH 1974 – 1981 : Professeur Bachir LAZRAK 1981 – 1989 : Professeur Taieb CHKILI

1989 – 1997 : Professeur Mohamed Tahar ALAOUI 1997 – 2003 : Professeur Abdelmajid BELMAHI 2003 - 2013 : Professeur Najia HAJJAJ – HASSOUNI

ADMINISTRATION: Doyen

Professeur Mohamed ADNAOUI

Vice-Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines Professeur Brahim LEKEHAL

Vice-Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération Professeur Toufiq DAKKA

Vice-Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie Professeur Younes RAHALI

1. ENSEIGNANTS.·CHERCHEURS MEDECINS ET PHARMACIENS

PROFESSEURS DE L'ENSEIGNEMENT SUP2RIEUR:

Décembre 1984

Pr. MMOUNI Abdelaziz Médecine Interne - Cl i nique Rovale

Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi Anesthésie -Réanimation Pr. SETTAF Abdellatif Pathologie Chirurgicale

Janvier, Février et Décembre 1987

Pr. LA..CHKAR Hassan Médecine Interne

Décembre 1988

Pr. DAFIRI Rachida Radiologie

Décembre 1989

Pr. ADNAOUI Mohamed Médecine Interne -Doyen de l a FMPR

Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda Neurologie Janvier et Novembre 1 990

Pr. KHARBACH Aîcha Gynécologie .Obstétrique

Pr. TAZI Saoud Anas Anesthésie Réanimation

Février Avril Juillet et Décembre 1991

Pr. AZZOUZI Abderrahim Anesthésie Réanimation- Doven de FMPQ

Pr. BAYAHIA Rabéa Néphrologie

Pr. BELKOUCHI Abdelkader Chirurgie Générale Pr. BENCHEKROUN Belabbes Abdellatif Chirurgie Générale

Pr. BENSOUDA Yahia Pharmacie galénique

Pr.BERRAHO Amina Ophtalmologie

Pr.BEZAD Rachid Gynécologie Obstétrique Méd. C hef M;1ternité des O rangers

Pr. CHERRAH Yahia Pharmacologie

Pr. CHOKAIRI Omar Histologie Embryologie

Pr. KHATTAB Mohamed Pédiatrie

Pr. SOUIAYMANI Rachida Pharmacologie ·Di r. du Centre Nati o mil PV Rabat

Pr. TAOUFIK Jamal Chimie thérapeutique

Décembre 1992

Pr. AHALIAT Mohamed Chirurgie Générale Doyen de FMPT

Pr. BENSOUDA Adil Anesthésie Réanimation

Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza Gastro·Entérologie

Pr. CHRAIBI Chafiq Gynécologie Obstétrique

Pr.EL OUAHABI Abdessamad Neurochirurgie

Pr.FELIAT Rokaya Cardiologie

Pr. JIDDANE Mohamed Anatomie

Pr. TAGHY Ahmed Chirurgie Générale

Pr. ZOUHDI Mimoun Microbiologie

Mars 1994

Pr. BENJAAFAR Noureddine Radiothérapie

Pr. BEN RAIS Nozha Biophysique

Pr. CAOUI Malika Biophysique

Pr. EL AMRANI Sabah Gynécologie Obstétrique Pr. EL BARDOUNI Ahmed Traumato-Orthopédie Pr. EL HASSANI My Rachid Radiologie

Pr. ERROUGANI Abdelkader Chirurgie Générale - Di recteur du C HIS

Pr. ESSAKALI Malika Immunologie

Pr. ETTAYEBI Fouad Chirurgie Pédiatrique Pr. IFRINE Lahssan Chirurgie Générale

Pr. MAHFOUD Mustapha Traumatologie - Orthopédie Pr. RHRAB Brahim Gynécologie -Obstétrique

Pr. SENOUCI Karima Dermatologie

Mars 1994

Pr. ABBAR Mohamed* Urologie Inspect eur du SSM Pr. BENTAHIIA Abdelali Pédiatrie

Pr. BERRADA Mohamed Saleh Traumatologie - Orthopédie Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae Ophtalmologie

Pr. IAKHDAR Amina Gynécologie Obstétrique

Pr. MOUANE Nezha Pédiatrie

Mars 1995

Pr. ABOUQUAL Redouane Réanimation Médicale Pr. AMRAOUI Mohamed Chirurgie Générale Pr. BAIDADA Abdelaziz Gynécologie Obstétrique Pr. BARGACH Samir Gynécologie Obstétrique Pr. EL MESNAOUI Abbes Chirurgie Générale Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila Oto-Rhino-Laryngologie Pr. IBEN ATIYA ANDALOUSSI Ahmed Urologie

Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia Ophtalmologie Pr. SEFIANI Abdelaziz Génétique

Pr. ZEGGWAGH Amine Ali Réanimation Médicale

Décembre 1996

Pr. BELKACEM Rachid Chirurgie Pédiatrie Pr. BOUIANOUAR Abdelkrim Ophtalmologie Pr. EL AIAMI EL FARICHA EL Hassan Chirurgie Générale

Pr. GAOUZI Ahmed Pédiatrie

Pr. OUZEDDOUN Naima Néphrologie

Pr. ZBIR EL Mehdi* Cardiologie Di rect eur HMI Mohammed V

Novembre 1997

Pr. ALAMI Mohamed Hassan Gynécologie-Obstétrique Pr. BEN SLIMANE Lounis Urologie

Pr. BIROUK Nazha Neurologie

Pr. ERREIMI Naima Pédiatrie

Pr. FELIAT Nadia Cardiologie

Pr. KADDOURI Noureddine Chirurgie Pédiatrique Pr. KOUTANI Abdellatif Urologie

Pr. I.AHLOU Mohamed Khalid Chirurgie Générale Pr. MAHRAOUI CHAFIQ Pédiatrie

Pr. TOUFIQ Jallal Psychiatrie Di recteur Hôp•.Ar.-razi Salé Pr. YOUSFI MALKI Mounia Gynécologie Obstétrique

Novembre 1998

Pr. BENOMAR ALI Neurologie Doyen de l a FMP Abu/cassis

Pr.BOUGTAB Ahdesslam Chirurgie Générale

Pr. ER RIHANI Hassan Oncologie Médicale

Pr. BENKIRANE Majid* Hématologie

Janvier 2000

Pr. ABID Ahmed* Pneumo-phtisiologie

Pr. AIT OUAMAR Hassan Pédiatrie

Pr. BENJELLOUN Dakhama Badr .Sououd Pédiatrie

Pr. BOURKADI Jamal-Eddine Pneumo-phtisiologie Directeur Hôp. My Youssef

Pr.CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer

Chirurgie Générale Pr. ECHARRAB El Mahjoub Chirurgie Générale Pr. EL FTOUH Mustapha Pneumo-phtisiologie Pr. EL MOSTARCHID Brahim* Neurochirurgie

Pr. TACHINANTE Rajae Anesthésie-Réanimation Pr. TAZI MEZALEK Zoub_ida Médecine Interne Novembre 2000

Pr. AIDI Saadia Neurologie

Pr. AJANA Fatima Zohra Gastro·Entérologie

Pr.BENAMR Said Chirurgie Générale

Pr.CHERTI Mohammed Cardiologie

Pr. ECH.CHERIF EL KETTANI Selma Anesthésie-Réanimation

Pr. EL HASSANI Amine Pédiatrie • Di rect eur Hôp. Chei kh Zaid

Pr. EL KHADER Khalid Urologie

Pr. GHARBI Mohamed El Hassan Endocrinologie et Maladies Métaboliques Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae Pédiatrie

Décembre 2001

Pr. BALKHI Hicham* Anesthésie Réanimation

Pr. BENABDELJLIL Maria Neurologie

Pr. BENAMAR Loubna Néphrologie

Pr. BENAMOR Jouda Pneumo-phtisiologi e

Pr. BENELBARHDADI lmane Gastro-Entérologie

Pr.BENNANI Rajae Cardiologie

Pr. BENOUACHANE Thami Pédiatrie

Pr. BEZZA Ahmed* Rhumatologie

Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi Anatomie Pr. BOUMDIN El Hassane* Radiologie

Pr. CHAT Latifa Radiologie

Pr. DAALI Mustapha* Chirurgie Générale

Pr. EL HIJRI Ahmed Anesthésie Réanimation

Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid Neuro-Chirurgie

Pr. EL MADHI Tarik Chirurgie-Pédiatrique

Pr. EL OUNANI Mohamed Chirurgie Générale

Pr. ETTAIR Said Pédiatrie • Directeur Hôp. d1Enlants Rabat

Pr.GAZZAZ Miloudi* Neuro-Chirurgie

Pr. HRORA Abdelmalek Chirurgie Générale Directeur Hôpital Ibn Sina Pr. KABIRI EL Hassane* Chirurgie Thoracique

Pr. lAMRANI Moulay Omar Traumatologie Orthopédie

Pr.LEKEHAL Brahim Chirurgie Vasculaire Périphérique V-D chargéAH Acad Est.

Pr. MEDARHRI Jalil Chirurgie Générale

Pr. MIKDAME Mohammed* Hématologie Clinique

Pr. MOHSINE Raouf Chirurgie Générale

Pr. NOUINI Yassine Urologie

Pr. SABBAH Farid Chirurgie Générale

Pr. SEFIANI Yasser Chirurgie Vasculaire Périphérique Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Sournia Pédiatrie

Décembre 2002

Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane* Anatomie Pathologique

Pr. AMEUR Ahmed * Urologie

Pr.AMRI Rachida Cardiologie

Pr. AOURARH Aziz* Gastro-Entérologie

Pr. BAMOU Youssef * Biochimie-Chimie

Pr. BELMEJDOUB Ghizlene* Endocrinologie et Maladies Métaboliques

Pr.BENZEKRI Laila Dermatologie

Pr. BENZZOUBEIR Nadia Gastro-Entérologie

Pr. BERNOUSSI Zakiya Anatomie Pathologique

Pr. CHOHO Abdelkrim * Chirurgie Générale

Pr. CHKIRATE Bouchra Pédiatrie

Pr. EL AlAMI EL Fellous Sidi Zouhair Chirurgie Pédiatrique Pr. EL HAOURI Mohamed * Dermatologie

Pr.·FILALIADIB Abdelhai Gynécologie Obstétrique

Pr. HAJJI Zakia Ophtalmologie

Pr. JAAFAR Abdeloihab* Traumatologie Orthopédie

Pr. KRIOUILE Yamina Pédiatrie

Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss* Gynécologie Obstétrique Pr. OUJILAL Abdelilah Oto-Rhino-Laryngologie

Pr. RAISS Mohamed Chirurgie Générale

Pr. SIAH Samir * Anesthésie Réanimation

Pr. THIMOU Amal Pédiatrie

Pr. ZENTAR Aziz* Chirurgie Générale

Janvier 2004

Pr.ABDELIAH El Hassan Ophtalmologie

Pr. AMRANI Mariam Anatomie Pathologique

Pr. BENBOUZID Mohammed Anas Ota-Rhine-Laryngologie Pr. BENKIRANE Ahmed* Gastro-Entérologie

Pr.BOUI.AADAS Malik Stomatologie et Chirurgie Maxille-faciale Pr. BOURAZZA Ahmed* Neurologie

Pr. CHAGAR Belkacem* Traumatologie Orthopédie Pr. CHERRADI Nadia Anatomie Pathologique Pr. EL FENNI Jamal* Radiologie

Pr. EL HANCHI ZAKI Gynécologie Obstétrique Pr. EL KHORASSANI Mohamed Pédiatrie

Pr. HACH!Hafid Chirurgie Générale

Pr. JABOUIRIK Fatima Pédiatrie

Pr. MOUGHIL Said Chirurgie Cardia-Vasculaire

Pr. OUBAAZ Abdelbarre * Ophtalmologie

Pr. TARIB Abdelilah* Pharmacie Clinique

Pr. TIJAMI Fouad Chirurgie Générale

Pr. ZARZUR Jamila Cardiologie

Janvier 2005

Pr. ABBASSI Abdellah Chirurgie Réparatrice et Plastique Pr. AL KANDRY Sif Eddine* Chirurgie Générale

Pr. ALLALI Fadoua Rhumatologie

Pr. AMAZOUZI Abdellah Ophtalmologie

Pr. BAHIRI Rachid Rhumatologie Di rect eur Hôp. Al Avachi Salé

Pr. BARKA.T Amina Pédiatrie

Pr. BENYASS Aatif Cardiologie

Pr. DOUDOUH Abderrahim * Biophysique

Pr. HAJJI Leila Cardiologie (mise en disponibilité)

Pr. HESSISSEN Leila Pédiatrie

Pr. JIDAL Mohamed* Radiologie

Pr. LAAROUSSI Mohamed Chirurgie Cardio-vasculaire Pr. LYAGOUBI Mohammed Parasitologie

Pr. SBIHI Souad Histo-Embryologie Cytogénétique

Pr. ZERAIDI Najia Gynécologie Obstétrique

AVRIL 2006

Pr. ACHEMLAL Lahsen* Rhumatologie

Pr. BELMEKKI Abdelkader* Hématologie

Pr. BENCHEIKH Razika O.R.L

Pr. BIYI Abdelhamid* Biophysique

Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine Chirurgie ·Pédiatrique

Pr. BOULAHYA Abdellatif* Chirurgie Cardio-Vasculaire. Di rect eur Hôpi t al Ibn Si na M

Pr. CHENGUETI ANSARI Anas Gynécologie Obstétrique

Pr. DOGHMI Nawal Cardiologie

Pr. FELIAT Ibtissam Cardiologie

Pr. FAROUDY Mamoun Anesthésie Réanimation Pr. HARMOUCHE Hicham Médecine Interne Pr. IDRISS LAHLOU Amine* Microbiologie

Pr. JROUNDI Laila Radiologie

Pr. KARMOUNI Tariq Urologie

Pr. KILI Amina Pédiatrie

Pr. KISRA Hassan Psychiatrie

Pr. KISRA Mounir Chirurgie - Pédiatrique Pr. LAATIRIS Abdelkader* Pharmacie Galénique

Pr. LMIMOUNI Badreddine* Parasitologie

Pr. MANSOURI Hamid* Radiothérapie

Pr. OUANASS Abderrazzak Psychiatrie

Pr. SAFI Soumaya* Endocrinologie

Pr. SEKKAT Fatima Zahra Psychiatrie

Pr.SOUALHI Mouna Pneumo - Phtisiologie

Pr.TELLAL Saida* Biochimie

Pr. ABIDI Khalid Réanimation médicale

Pr. ACHACHI Leila Pneumo phtisiologie

Pr. ACHOUR Abdessamad* Chirurgie générale

Pr. AIT HOUSSA Mahdi * Chirurgie cardia vasculaire

Pr. AMHAJJI Larbi * Traumatologie orthopédie

Pr. AOUFI Sarra Parasitologie

Pr. BAITE Abdelouahed * Anesthésie réanimation Pr. BALOUCH Lhousaine * Biochimie-chimie

Pr. BENZIANE Hamid * Pharmacie clinique

Pr. BOUTIMZINE Nourdine Ophtalmologie

Pr. CHERKAOUI Naoual * Pharmacie galénique

Pr. EHIRCHIOU Abdelkader * Chirurgie générale

Pr. EL BEKKALI Youssef * Chirurgie cardio-vasculaire

Pr. EL ABSI Mohamed Chirurgie générale

Pr. EL MOUSSAOUI Rachid Anesthésie réanimation

Pr. EL OMARI Fatima Psychiatrie

Pr. GHARIB Noureddine Chirurgie plastique et réparatrice

Pr. HADADI Khalid * Radiothérapie

Pr. ICHOU Mohamed * Oncologie médicale

Pr. ISMAILI Nadia Dermatologie

Pr. KEBDANI Tayeb Radiothérapie

Pr. LOUZI Lhoussain * Microbiologie

Pr. MADANI Naoufel Réanimation médicale

Pr. MAHI Mohamed * Radiologie

Pr. MARC Karima Pneumo phtisiologie

Pr. MASRAR Azlarab Hématologie biologique

Pr. MRANI Saad * Virologie

Pr. OUZZIF Ez zohra Biochimie-chimie

Pr. RABHI Monsef * Médecine interne

Pr. RADOUANE Bouchaib* Radiologie

Pr. SEFFAR Myriame Microbiologie

Pr. SEKHSOKH Yessine * Microbiologie

Pr. SIFAT Hassan * Radiothérapie

Pr. TABERKANET Mustafa "* Chirurgie vasculaire périphérique

Pr. TACHFOUTI Samira Ophtalmologie

Pr. TAJDINE Mohammed Tariq* Chirurgie générale

Pr. TANANE Mansour * Traumatologie-orthopédie

Pr. TLIGUI Houssain Parasitologie

Pr. TOUATI Zakia Cardiologie

Mars 2009

Pr. ABOUZAHIR Ali * Médecine interne

Pr.AGADR Aomar * Pédiatrie

Pr. AIT AIJAbdelmounaim * Chirurgie Générale Pr. AIT BENHADDOU El Hachmia Neurologie

Pr. AKHADDAR Ali * Neuro-chirurgie

Pr. ALLALI Nazik Radiologie

Pr. AMINE Bouchra Rhumatologie

Pr. BELYAMANI Lahcen • Anesthésie Réanimation

Pr. BJIJOU Younes Anatomie

Pr. BOUHSAIN Sanae * Biochimie-chimie

Pr.BOUI Mohammed * Dermatologie

Pr. BOUNAIM Ahmed * Chirurgie Générale Pr. BOUSSOUGA Mostapha * Traumatologie-orthopédie Pr. CHTATA Hassan Toufù.< * Chirurgie Vasculaire Périphérique

Pr. DOGHMI Kamal * Hématologie clinique

Pr. EL MALKI Hadj Omar Chirurgie Générale Pr.EL OUENNASS Mostapha* Microbiologie

Pr. ENNIBI Khalid * Médecine interne

Pr. FATHI Khalid Gynécologie obstétrique

Pr. HASSIKOU Hasna * Rhumatologie

Pr. KABBAJ Nawa Gastro-entérologie

Pr. KABIRI Meryem Pédiatrie

Pr. KARBOUBI Lamya Pédiatrie

Pr. IAMSAOURI Jamal * Chimie Thérapeutique Pr. MARMADE Lahcen Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. MESKINI Toufik Pédiatrie

Pr. MESSAOUDI Nezha * Hématologie biologique

Pr. MSSROURI Rahal Chirurgie Générale

Pr.NASSAR lttimade Radiologie

Pr. OUKERRAJ Latifa Cardiologie

Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani * Pneumo-Phtisiologie Octobre 2010

Pr. ALILOU Mustapha Anesthésie réanimation

Pr. AMEZIANE Taoufiq* Médecine Interne Directeur ERSSM

Pr. BEIAGUID Abdelaziz Physiologie

Pr.CHADLI Mariama* Microbiologie

Pr. CHEMSI Mohamed* Médecine Aéronautique

Pr. DAMI Abdellah* Biochimie, Chimie

P r. DARBI Abdellatif* Radiologie

Pr. DENDANE Mohammed Anouar Chirurgie Pédiatrique

Pr.EL HAFIDI Naima Pédiatrie

Pr.EL KHARRAS Abdennasser* Radiologie

Pr.EL MAZOUZ Samir Chirurgie Plastique et Réparatrice

Pr. EL SAYEGH Hachem Urologie

Pr. ERRABIH lkram Gastro-Entérologie

Pr. LAMALMI Najat Anatomie Pathologique

Pr. MOSADIK Ahlam Anesthésie Réanimation

Pr. MOUJAHID Mountassir* Chirurgie Générale

Pr. NAZIH Mouna* Hématologie

Decembre 2010

Pr.ZNATI Kaoutar Anatomie Pathologique

Mai 2012

Pr. AMRANI Abdelouahed Chirurgie pédiatrique Pr. ABOUEWAA Khalil * Anesthésie Réanimation Pr.BENCHEBBA Driss * Traumatologie-orthopédie Pr. DRISSI Mohamed * Anesthésie Réanimation Pr. EL AIAOUI MHAMDI Mouna Chirurgie Générale Pr. EL KHATIABI Abdessadek * Médecine Interne Pr. EL OUAZZANI Hanane * Pneumophtisiologie Pr.ER-RAJI Mounir Chirurgie Pédiatrique

Pr. JAHID Ahmed Anatomie Pathologique

Pr.RAISSOUNI Maha * Cardiologie

* Enseignants Militaires Février 2013

Pr.AHID Samir Pharmacologie

Pr.AIT EL CADI Mina Toxicologie

Pr.AMRANI HANCHI Laila Gastro-Entérologie

Pr.AMOR Mourad Anesthésie Réanimation

PrAWAB Almahdi Anesthésie Réanimation

Pr.BEIAYACHI Jihane Réanimation Médicale

Pr.BELKHADIR Zakaria Houssain Anesthésie Réanimation Pr.BENCHEKROUN Laila Biochimie-Chimie

Pr.BENKIRANE Souad Hématologie

Pr.BENNANA Ahmed* Informatique Pharmaceutique Pr.BENSGHIR Mustapha * Anesthésie Réanimation

Pr.BENYAHIA Mohammed * Néphrologie

Pr.BOUATIA Mustapha Chimie Analytique et Bromatologie Pr.BOUABID Ahmed Salim* Traumatologie orthopédie

Pr BOUTARBOUCH Mahjouba Anatomie

Pr. CHAIB Ali * Cardiologie

Pr. DENDANE Tarek Réanimation Médicale

Pr.DINI Nouzha * Pédiatrie

Pr.ECH-CHERIF EL KEITANI Mohamed Ali

Anesthésie Réanimation Pr.ECH-CHERIF EL KEITANI Najwa Radiologie

Pr.ELFATEMI NIZARE Neure-chirurgie

Pr.EL GUERROUJ Hasnae Médecine Nucléaire Pr.EL HARTI Jaouad Chimie Thérapeutique Pr.EL JAOUDI Rachid * Toxicologie

Pr.EL KABABRI Maria Pédiatrie

Pr. EL KHANNOUSSI Basma Anatomie Pathologique

Pr.EL KHLOUFI Samir Anatomie

Pr.EL KORAICHI Alae Anesthésie Réanimation

Pr.EN-NOUAL! Hassane * Radiologie

Pr.ERRGUIG Laila Physiologie

Pr.GHFIR lmade Médecine Nucléaire

Pr.IMANE Zineb Pédiatrie

Pr.IRAQ!Hind Endocrinologie et maladies métaboliques

Pr.KABBAJ Hakima Microbiologie

Pr.KADIRI Mohamed * Psychiatrie

Pr.LATIB Rachida Radiologie

Pr.MAAMAR Mouna Fatima Zahra Médecine Interne

Pr.MEDDAH Bouchra Pharmacologie

Pr.MELHAOUI Adyl Neuro-chirurgie

Pr.MRABTI Hind Oncologie Médicale

Pr.NEJJARI Rachid Pharmacognosie

Pr.OUBEJJA Houda Chirugie Pédiatrique

Pr.OUKABLI Mohamed * Anatomie Pathologique

Pr. RAHALI Younes Pharmacie Galénique Vice-Doyen à la Pharmacie

Pr.RATBI Ilham Génétique

Pr.RAHMAN! Mounia Neurologie

Pr.REDA Karim * Ophtalmologie

Pr.REGRAGUI 'X'afa Neurologie

Pr.RKAIN Hanan Physiologie

Pr.ROSTOM Samira Rhumatologie

Pr.ROUAS Lamiaa Anatomie Pathologique

Pr.ROUIBAA Fedoua * Gastro-Entérologie

Pr SALIHOUN Mouna Gastro-Entérologie

Pr.SAYAH Rochde Chirurgie Cardio-Vasculaire

Pr.SEDDIK Hassan * Gastro-Entérologie

Pr.ZERHOUNI Hicham Chirurgie Pédiatrique

Pr.ZINE Ali * Traumatologie Orthopédie

• Enseignants Militaires

AVRIL 2013

Pr.EL KHATIB MOHAMED KARIM * Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale MARS 2014

Pr.ACHIR Abdellah Chirurgie Thoracique

Pr.BENCHAKROUN Mohammed T Traumatologie- Orthopédie Pr.BOUCHIKH Mohammed Chirurgie Thoracique

Pr. EL KABBAJ Driss * Néphrologie

Pr. EL MACHTANI IDRISSI Samira " Biochimie-Chimie

Pr.HARDIZI Houyam Histologie·Embryologie.Cytogénétique

Pr. HASSAN! Amale * Pédiatrie

Pr. HERRAK Laila Pneumologie

Pr. JANANE Abdellah • Urologie

Pr. JEA.IDI Anass * Hématologie Biologique

Pr. KOUACH Jaouad* Génycologie-Obstétrique

Pr. LEMNOUER Abdelhay* Microbiologie

Pr. MAKRAM Sanaa * Pharmacologie

Pr. OUIAHYANE Rachid* Chirurgie Pédiatrique Pr. RHISSASSI Mohamed Jaafar CCV

Pr. SEKKACH Youssef* Médecine Interne Pr. TAZI MOUKHA Zakia Génécologie-Obstétriq DECEMBRE 2014

Pr.ABILKACEM Rachid* Pédiatrie

Pr.AIT BOUGHIMA Fadila Médecine Légale

Pr. BEKKALI Hicham * Anesthésie-Réanimation

Pr. BENAZZOU Salma Chirurgie Maxillo-Faciale

Pr. BOUABDELIAH Mounya Biochimie-Chimie

Pr. BOUCHRIK Mourad* Parasitologie

Pr. DERRAJI Soufiane* Pharmacie Clinique

Pr. DOBLALI Taoufik Microbiologie

Pr. EL AYOUB! EL IDRISSI Ali Anatomie

Pr. EL GHADBANE Abdedaim Hatim* Anesthésie-Réanimation

Pr. EL MARJANY Mohammed* Radiothérapie

Pr. FEJJAL Nawfal Chirurgie Réparatrice et Plastique

Pr. JAHIDI Mohamed* O.R.L

Pr. lAKHAL Zouhair* Cardiologie

Pr. OUDGHIRI NEZHA Anesthésie-Réanimation

Pr. RAMI Mohamed Chirurgie Pédiatrique

Pr. SABIR Maria Psychiatrie

Pr. SBAI IDRISSI Karim* Médecine préventive, santé publique et Hyg. AOUT 2015

Pr. MEZIANE Meryem Dermatologie

Pr. TAHIRI Latifa Rhumatologie

PROFESSEURSAGREGES 1

JANVIER 2016

Pr. BENKABBOU Amine Chirurgie Générale

Pr. EL ASRI Fouad* Ophtalmologie

Pr. ERRAMI Noureddine* O.R.L

Pr. NITASSI Sophia O.R.L JUIN 2017

Pr. ABI Rachid* Microbiologie

Pr. ASFALOU Ilyasse* Cardiologie

Pr.BOUAYTI El Arbi* Médecine préventive, santé publique et Hyg.

Pr. BOUTAYEB Saber Oncologie Médicale

Pr. EL GHISSASSI Ibrahim Oncologie Médicale

Pr. HAFIDI Jawad Anatomie

Pr. OURAINI Saloua* 0. R.L

Pr. RAZINE Rachid Médecine préventive, santé publique et Hyg.

Pr. ZRARA Abdelhamid* Immunologie NOVEMBRE 2018

Pr. AMELLAL Mina Anatomie

Pr. SOULY Karim Microbiologie

Pr. TAHRI Rjae Histologie-Embryologie-Cytogénétique "' Enseignants Militaires"

2. ENSEIGNANTS-CHERCHEURS SCIENTIFIQUES

PROFEURS/Prs. HABILITES

Pr. ABOUDRAR Saadia Physiologie

Pr. AlAMI OUHABI Naima Biochimie-chimie

Pr. AIAOUI KATIM Pharmacologie

Pr. AIAOUI SLIMANI Lalla Naïma Histologie-Embryologie

Pr. ANSAR M'hammed Chimie Organique et Pharmacie Chimique

Pr .BARKIYOU Malika Histologie-Embryologie

Pr. BOUHOUCHE Ahmed Génétique Humaine

Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz Applications Pharmaceutiques Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia Biochimie-chimie

Pr. DAKKA Taoufiq Physiologie

Pr. FAOUZI Moulay El Abbes Pharmacologie

Pr. IBRAHIMI Azeddine Biologie moléculaire/Biotechnologie

Pr. KHANFRI Jamal Eddine Biologie

Pr. OUIAD BOUYAHYA IDRISSI Med Chimie Organique

Pr. REDHA Ahlam Chimie

Pr. TOUATI Driss Pharmacognosie

Pr. ZAHIDI Ahmed Pharmacologie

Mise à jour le 04/02/2020 Khaled Abdellah

Chef du Service des Ressources Humaines FMPR

À mon très cher père Abderrahim FARAHE

Tous les mots du monde ne sauraient exprimer l’immense amour que je vous porte,

ni la profonde gratitude que je vous témoigne pour tous les efforts et les sacrifices

que vous n’avez jamais cessé de consentir pour mon instruction et mon bien-être.

C’est à travers vos encouragements que j’ai opté pour cette noble

profession, et c’est à travers vos critiques que je me suis réalisée.

J’espère avoir répondu aux espoirs que vous avez fondés en moi.

Je vous rends hommage par ce modeste travail en guise de ma reconnaissance

éternelle et de mon infini amour.

Que Dieu tout puissant vous garde et vous procure santé, bonheur et longue vie

pour que vous demeuriez le flambeau illuminant mon chemin. Vos prières et votre

bénédiction m’ont été d’un grand secours pour mener à bien mes études.

À Allah

Tout puissant

Qui m’a inspiré

Qui m’a guidé dans le bon chemin

Je vous dois ce que je suis

devenue

Louanges et remerciements

Pour votre clémence et miséricorde

Aucune dédicace ne saurait être assez éloquente pour exprimer ce que vous

méritez pour tous les sacrifices que vous n’avez cessé de me donner depuis ma

naissance, durant mon enfance et même à l’âge adulte.

À ma très chère mère Fatima ZIDOUH

Tous les mots ne sauraient exprimer mon amour éternel, ma gratitude et le respect

que j’ai pour toi, meilleure maman au monde. Tu m’as donné vie et Tu as toujours

été là à mes côtés dans les moments de joies et encore plus lors des moments les

plus sombres de ma vie. Tu n'as jamais cessé de me soutenir et de m'encourager

durant toutes ces années d'études.

Merci de m’avoir aidé à arriver là où je suis aujourd’hui malgré toutes les

difficultés et embûches, merci pour tes prières, pour tes encouragements et ta

patience. J'aimerais pouvoir te rendre tout l'amour et la dévotion que tu nous as

offerts, mais une vie entière n'y suffirait pas. Sans toi, je ne suis rien, mais grâce

à toi je deviens Pharmacien.

Ce travail et là où je suis actuellement sont le fruit de tes sacrifices et ton

éducation. Je ne pourrai jamais te remercier assez.

Je te rends hommage par ce modeste travail en guise de ma reconnaissance

éternelle et de mon amour infini. En ce jour, j'espère réaliser l'un de tes rêves.

Puisse Dieu, tout puissant, te prêter longue vie, santé et bonheur.

J’espère que tu es fière de moi.

À mon très cher frère Aimad,

à mes très chères soeurs Doâa et Maryam

Je ne peux exprimer à travers ces lignes tous mes sentiments d’amour et de

tendresse envers vous.

Je vous dédie ce travail en témoignage de l’amour et des liens de sang qui nous

unissent.

Puissions-nous rester unis dans la tendresse et fidèles à l’éducation que nous

avons reçue.

Que Dieu vous apporte bonheur et vous aide à réaliser tous vos voeux.

À Ma tante Touria, Son époux Ghazouani et ses fils ;

Yahya et Mehdi

Vous avez toujours fait preuve d’attachement, de sincérité, et de considération

envers ma personne. Je voudrais pouvoir vous apporter ici la chaleur de mon

affection et de mon amour.

Votre aide, votre générosité extrême, votre soutien, étaient pour moi une source

de courage, de conscience et de patience. Puisse Dieu, le tout puissant, vous

combler de santé, de bonheur et vous procurer longue vie.

À toute personne qui m’est chère et que j’ai involontairement omis de citer qu’elle

me pardonne.

À notre maître et Président du jury

Monsieur EL HARTI Jaouad

Professeur de chimie thérapeutique,

Faculté de médecine et de pharmacie de Rabat

Nous vous remercions de l’honneur que vous nous avez fait en acceptant de

présider notre jury.

Nous vous sommes très reconnaissants de la simplicité, la gentillesse et

l’amabilité avec laquelle vous nous avez reçus et de bien vouloir

À notre maître et Directeur de thèse :

Monsieur BOUSLIMAN Yassir

Professeur d’Enseignement Supérieur en Toxicologie

Faculté de médecine et de pharmacie de Rabat

Vous nous avez fait un grand honneur en acceptant de nous confier ce travail.

Nous sommes très touchés par le réconfort que vous nous

avez apporté lors de l’élaboration de ce travail. Vos conseils, vos

orientations mais plus encore votre sympathie n’ont cessé de susciter

notre grande admiration. Vos qualités professionnelles et humaines

nous servent d’exemple.

Veuillez trouver ici, Professeur, l’expression

À Notre maître et juge de thèse :

Madame CHERKAOUI Naoual,

Professeur de Pharmacie Galénique

Faculté de médecine et de pharmacie de Rabat

Nous sommes très sensibles à l'honneur que vous nous faites

en acceptant de juger ce travail. Votre culture scientifique, votre

compétence et vos qualités humaines ont suscité en nous une grande

admiration, et sont pour vos élèves un exemple à suivre.

Veuillez accepter, cher Maître, l'assurance de notre estime et notre profond

respect

À Notre maître et juge de thèse :

Monsieur NAJJARI Rachid

Professeur de Pharmacognosie

Faculté de médecine et de pharmacie de Rabat

Vous nous avez fait l’honneur de faire partie de notre jury.

Nous avons pu apprécier l’étendue de vos connaissances et vos grandes

qualités humaines. Votre sérieux et votre rigueur au travail ainsi que

votre dévouement professionnel sont pour nous un objet

d’admiration.

Veuillez accepter, Professeur, nos sincères remerciements et notre profonde

reconnaissance.

À notre Membre du jury :

Madame SENTISSI Sarra

Hépato gastro-entérologue

Hopital Militaire d’Instruction Mohammed V

C’est pour nous un honneur et un grand privilège de vous avoir dans notre jury

de thèse.

Merci pour la simplicité que vous avez témoigné en acceptant de siéger parmi

notre jury de thèse.

Veuillez trouver dans ce travail, l’expression de notre gratitude et de notre

grande estime.

Liste des

ADN : acide désoxyribonucléique

AMM : autorisation de mise sur le marché ARN : acide ribonucléique

ARNr : acide ribonucléique ribosomique CI : contre-indication

DAA : diarrhée associée aux antibiotiques

DHPLC : denaturing high performance liquid chromatography

ESPGHAN : société européenne de gastroentérologie, hépatologie et nutrition pédiatrique FAO : food and agriculture organization

FOS : fructo-oligosaccharides GABA : gamma-aminobutyric acid GALT : gut associated lymphoid tissue GC : guanine et cytosine

Hp : Helicobacter pylori IgA : immunoglobulines A IL : interleukine

MICI : maladies inflammatoires chroniques de l’intestin OMS : organisation mondiale de la santé

ORL : otorhinolaryngologie

RCP : résumé des caractéristiques du produit RCUH : rectocolite ulcéro-hémorragique RT-PCR : reverse transcriptase PCR SII : syndrome de l’intestin irritable TGI : tractus gastro-intestinal

Liste des

Liste des figures

Figure 1 : Le système digestif chez l’Homme ... 4 Figure 2 : Les cinq couches tissulaires du tube digestif. ... 6 Figure 3 : Le gros intestin ... 9 Figure 4 : le microbiote intestinal ... 13 Figure 5 : Arbre phylogénétique du microbiote intestinal représentant les principaux phyla bactériens. ... 15 Figure 6 : Représentation des différents phyla et genres retrouvés au niveau du microbiote fécal dans une large étude chez des individus adultes ... 16 Figure 7 : Variations de l’abondance et de la composition microbienne le long du tractus gastro-intestinal humain. ... 17 Figure 8 : Influence du mode d’alimentation sur la flore fécale de nourrissons en bonne santé ... 20 Figure 9 : Synthèse des facteurs développementaux et environnementaux modifiant l’implantation du microbiote et impliqués dans la survenue de morbi-mortalité : combinaison des hypothèses hygiénistes et de programmation ... 21 Figure 10 : Rôle du microbiote intestinal ... 22 Figure 11 : Les composantes de la digestion colique ... 24 Figure 12 : l’appareil génital féminin ... 27 Figure 13 : Mécanismes mis en jeu par les lactobacilles vaginaux pour inhiber les pathogènes ... 33 Figure 14 : Résumé des mécanismes d’action possible des probiotiques ... 44 Figure 15 : Recommandation pour l’évaluation d’un probiotique dans le cadre d’une utilisation alimentaire ... 48 Figure 16 : Répartition des pharmaciens interrogés selon la situation géographique de l’officine. ... 75 Figure 17 : Réponses obtenues à la question n°1 : connaissez- vous les probiotiques ? ... 76 Figure 18 : Nom de spécialités citées selon nombre de réponses ... 77

Figure 19 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 2 : « Qu’est-ce qu’un probiotique ?» ... 78 Figure 20 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 3 : « L’usage des probiotiques ?» ... 79 Figure 21 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 4 : « A qui s’adressent les probiotiques ?» ... 80 Figure 22 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 5 : « Parmi ces microorganismes, lesquels sont des probiotiques ?» ... 81 Figure 23 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 6 : « Quelle(s) souche(s) est / sont utilisée(s), dans quelle(s) indication(s) ?» ... 82 Figure 24 : Récapitulatif des scores obtenus par les pharmaciens interrogés quant aux questions de la 2ème à la 6ème visant à évaluer leurs connaissances. ... 83 Figure 25 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 7 : « Avez-vous des probiotiques dans votre officine ?» ... 84 Figure 26 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 8 : « Recevez-vous des ordonnances prescrivant les probiotiques ?» ... 85 Figure 27 : Fréquence de réception des ordonnances prescrivant des probiotiques en fonction du nombre de réponses. ... 86 Figure 28 : Indications pour lesquelles sont prescrits les probiotiques en fonction du nombre de réponses ... 87 Figure 29 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 9 : « Recevez-vous un retour positif sur la prescription des probiotiques ?» ... 88 Figure 30 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 10 : « Les patients déclarent-t-ils des effets indésirables suite aux probiotiques ?» ... 89 Figure 31 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 11 : « Si vous conseillez les probiotiques, quelle(s) est /sont la /les indications(s) habituelle(s) ?» ... 90 Figure 32 : Analyse des réponses obtenues à la question n° 12 : « Si vous ne conseillez pas de probiotiques, précisez votre (vos) raison(s) ?» ... 91 Figure 33 : Situations amenant à conseiller des probiotiques ... 93 Figure 34 : Satisfaction des sujets vis-à-vis de Bion® Restore ... 99

Liste des tableaux

Tableau I : Présentation des avantages et des limites des techniques d’étude du microbiote intestinal ... 14 Tableau II : Différentes flores vaginales normales ... 30 Tableau III : Nom, composition et indications des probiotiques ayant une AMM. ... 54 Tableau IV : Nom, composition et indications des médicaments de la sphère ORL contenant une souche probiotique ... 56 Tableau V : Nom, composition et indications des médicaments indiqués en cas de vulvovaginite. ... 57 Tableau VI : Nom, composition et indication du médicament local pour les affections respiratoires hautes. ... 58 Tableau VII : Tableau regroupant les résultats de plusieurs études sur l’action de souches bactériennes sur des symptômes précis ... 62 Tableau VIII : Liste non exhaustive des produits à base de probiotiques disponibles sur le marché officinal marocain avec leur composition, posologie et principales indications. (À l’exception des laits infantiles) ... 67 Tableau IX : Exemple de spécialités probiotiques à visée urogénitale ... 95 Tableau X : Principales bactéries utilisées comme probiotiques dans les pathologies digestives ... 96

INTRODUCTION ... 1 CHAPITRE 1 : GENERALITES... 3 I. Système digestif ... 4

1. Cavité buccale ... 5 2. Pharynx ... 5 3. Tube digestif proprement dit ... 5 3.1. Œsophage ... 7 3.2. Estomac ... 7 3.3. Intestin grêle ... 8 3.4. Gros intestin ... 8 3.5. Foie ... 11 3.6. Pancréas ... 11 II. Le microbiote ... 11 1. Le microbiote intestinal ... 11 1.1. Outil d’étude ... 14 1.2. La composition du microbiote intestinal ... 15 1.3. Distribution des bactéries dans le tractus gastro-intestinal humain ... 17 1.4. Etablissement et évolution du microbiote intestinal au cours du temps ... 18 1.5. Les facteurs influençant la mise en place du microbiote... 18 1.5.1. Facteurs propres à l’individu ... 18 1.5.2. Le mode d’accouchement ... 18 1.5.3. Terme de la naissance ... 19 1.5.4. L’environnement ... 19 1.5.5. Mode d’alimentation ... 19 1.5.6. L’antibiothérapie ... 20 1.6. Les fonctions du microbiote intestinal ... 21 1.6.1. Effet barrière et fonctions immunitaires ... 22 1.6.2. Fonctions métaboliques ... 23 1.6.2.1. Métabolisme des glucides ... 24

1.6.2.2. Métabolisme des gaz ... 24 1.6.2.3. Métabolisme protéines ... 25 1.6.2.4. Métabolisme lipides ... 25 1.6.3. Effets trophiques et sur la motricité ... 25 1.7. La dysbiose du microbiote intestinal ... 26 2. La flore vaginale ... 27 2.1. Physiologie vaginale ... 27 2.2. Définition ... 28 2.3. Composition de la flore vaginale d'une femme adulte normale ... 28 2.4. Évolution de la flore génitale normale ... 30 2.5. Actions des lactobacilles vis-à-vis des microorganismes potentiellement

pathogènes ... 32 2.6. Facteurs modifiant la flore vaginale ... 34 CHAPITRE 2 : LES PROBIOTIQUES ... 35

I. Généralités ... 36 1. Historique ... 36 2. Définitions... 37 2.1. Les probiotique ... 37 2.2. Les prébiotiques ... 37 2.3. Les symbiotiques ... 38 II. Classification des probiotiques ... 38 1. Bactéries lactiques ... 38 1.1. Lactobacilles ... 39 1.2. Coques ... 40 1.3. Bifidobactéries ... 41 2. Bactéries non lactiques ... 41 3. Levures ... 42 III. Mécanismes d’action des probiotiques ... 43 IV. Survie des probiotiques dans le tube digestif ... 44 V. Méthodes d’étude de la survie des probiotiques chez l’homme ... 46

VI. Modes de production industriels ... 47 1. Critères de sélection des souches probiotiques ... 47 2. Production à l’échelle industrielle [98] ... 50 2.1. Conservation des souches ... 50 2.2. Pré-cultures ... 50 2.3. Cultures ... 50 2.4. Récolte et conditionnement ... 50 2.5. Séchage ... 50 2.6. Cultures pures ... 51 2.7. Formulation ... 51 2.8. Conditionnement ... 51 VII. Statut juridique des probiotiques... 51 1. Généralités ... 51 2. Réglementation marocaine des compléments alimentaires ... 51 VIII. Indications... 53 1. Spécialités bénéficiant d’une AMM ... 53 1.1. Voie orale ... 53 1.1.1. Diarrhée ... 53 1.1.2. Affections respiratoires hautes ... 56 1.2. Voie locale ... 57 1.2.1. Vulvovaginites ... 57 1.2.2. Affections respiratoires hautes ... 58 2. Indications hors AMM ... 58 2.1. Diarrhée associée aux antibiotiques et diarrhée à Clostridium difficile ... 58 2.2. Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin ... 60 2.3. Syndrome de l’intestin irritable ... 61 2.4. Infection à Helicobacter Pylori... 62 2.5. Pathologies vaginales ... 63 2.6. Allergie ... 64 3. Perspectives thérapeutiques ... 66

IX. Les produits commercialisés au Maroc ... 67 X. Effets indésirables et contre-indication ... 71 1. Effets indésirables ... 71 1.1. Les troubles gastro-intestinaux ... 71 1.2. Le risque infectieux ... 71 1.3. Transfert de gènes ... 71 2. Contres indications... 72 CHAPITRE 3 : PARTIE PRATIQUE ... 73

I. Introduction ... 74 II. Matériels et méthodes ... 74 III. Résultats... 75 1. Généralités ... 75 2. Les questions ... 76 IV. Discussion ... 92 1. Prescription des probiotiques ... 92 1.1. La diarrhée ... 92 1.2. Coliques du nourrisson ... 92 1.3. Colopathie fonctionnelle ... 93 2. Conseil pharmaceutique ... 93 2.1. Troubles gastro-intestinaux et urogénitaux ... 93 2.2. Maladie de Crohn ... 96 2.3. Rectocolite hémorragique (RCH) et Pouchite ... 96 2.4. Constipation ... 97 2.5. Modulation du système immunitaire ... 97 2.6. Allergie ... 97 3. Usage des probiotiques ... 98 4. Effets indésirables ... 98 5. Retour positif suite à la prise de probiotiques ... 98 6. Contre-indications ... 99 7. Quelles sources de probiotiques utiliser ? ... 100

8. Obstacles au conseil pharmaceutique des probiotique : ... 100 CONCLUSION ... 101 RESUMES ... 103 ANNEXE ... 107 REFERENCES ... 110

1

2

L’organisme humain héberge de nombreuses bactéries qui constituent « le microbiote normal». Ces bactéries sont souvent dotées d’un effet bénéfique. Parmi ces flores, la flore intestinale caractérisée souvent comme « deuxième cerveau ». Elle est particulièrement importante par sa dimension, sa diversité et ses multiples rôles.

La flore vaginale protège la muqueuse de l’appareil génital de l’infection et préserve son équilibre physiologique.

Le déséquilibre de ces flores est appelé dysbiose et peut engendrer de nombreux problèmes de santé.

L’Homme connaît les probiotiques depuis longtemps, ces bactéries ou levures sont dotées d’un pouvoir de fermentation utilisé dans les domaines de production de bières et de Yaourts. Mais depuis quelques années, ils ont pour prétention de pouvoir moduler le microbiote.

Ce travail a pour objectif de faire le point sur l’intérêt des probiotiques sur le plan préventif et curatif. Il sera articulé en trois chapitres :

 Le premier, décrira en premier lieu l’appareil digestif humain et abordera en deuxième lieu le microbiote intestinal ainsi la flore vaginale.

 Le second, traitera les probiotiques et s’attardera sur leur classification, indications et spécialités présentes sur le marché.

 Enfin le troisième, correspondra à la partie pratique : il s’agit d’une enquête réalisée auprès des pharmaciens d’officine en vue d’évaluer leurs connaissances sur les probiotiques et déterminer la place de cette nouvelle thérapeutique dans la pratique officinale.

3

CHAPITRE 1 :

GENERALITES

4

La plupart des nutriments présents dans l’alimentation sont de grandes molécules qui ne peuvent pas être absorbées dans l’intestin du fait de leur taille ou de leur caractère hydrophobe.

Le système digestif réduit la taille de ces molécules en unités plus petites et directement absorbables et convertit les molécules hydrophobes en complexes hydrophiles.

I. Système digestif

Le tube digestif s’étend de la bouche à l’anus. Il comprend le canal alimentaire proprement dit et ses glandes accessoires : le foie et la vésicule biliaire d’une part, le pancréas d’autre part. (Figure1)

5

1. Cavité buccale

Délimitée en avant par les lèvres, par les joues sur le côté, en bas par la langue et en haut par le palais. C'est une cavité tapissée par une muqueuse comprenant un épithélium pavimenteux stratifié non kératinisé et un chorion vascularisé qui abrite des glandes salivaires disséminées.

Les rôles de la cavité buccale sont multiples : préhension des aliments, transformations mécaniques (dent, langue, sécrétions provenant des glandes salivaires), chimique (salive), perception du goût (appareil gustatif, bourgeons du goût), défense de l'organisme (amygdale, salive) et résonateurs (dents, langue, lèvres, palais) [2].

2. Pharynx

Est un carrefour aéro-digestif. Il fait communiquer la cavité buccale avec l'œsophages, mais aussi les fosses nasales avec le larynx. À partir de la bouche, les aliments passent dans l'oropharynx puis dans le laryngo-pharynx.

 La muqueuse de l'oropharynx et du laryngo-pharynx est de type buccal (épithélium pavimenteux stratifié).

 La sous-muqueuse contient des follicules lymphoïdes et des glandes muqueuses pures.

 La musculeuse est formée de muscles striés squelettiques répartis en deux couches : -Une couche longitudinale interne.

-Une couche externe formant les muscles constricteurs du pharynx.

Ces muscles volontaires propulsent les aliments vers l'œsophage alors que l'épiglotte ferme l'entrée du larynx [2].

3. Tube digestif proprement dit

Commence au niveau de l'œsophage et se termine au niveau de l'anus. Il comprend quatre segments : l'œsophage, l'estomac, l'intestin grêle et le gros intestin.

6

Structure de base

Le tube digestif a une structure de base caractérisée par la présence, de la lumière à l'extérieur, de cinq couches successives : une muqueuse formée d'un épithélium et d'un chorion, une musculaire muqueuse, une sous-muqueuse, une musculeuse et une séreuse ou adventice selon la position de l'organe (Figure 2).

Figure 2 : Les cinq couches tissulaires du tube digestif.

Musculature

Le tube digestif se caractérise par la présence d'une musculature lisse sauf au niveau du sphincter œsophagien supérieur, au niveau du tiers supérieur de l'œsophage et au niveau du sphincter anal externe où les fibres musculaires sont striées. Les cellules musculaires lisses sont rassemblées au sein de la musculaire muqueuse et de la musculeuse, plus épaisse. La musculeuse est constituée d'au moins deux couches à orientations différentes des fibres musculaires. Cette musculature est adaptée à ce double rôle de brassage et de propulsion du bol alimentaire (péristaltisme intestinal). Il existe des particularités selon le niveau du tube digestif.

Innervation

Trois acteurs principaux sont impliqués dans la motricité du tube digestif : les cellules musculaires lisses, le système nerveux entérique et les cellules interstitielles de Cajal. Le tube digestif a son propre système nerveux. Des regroupements de neurones forment, avec des

7

ganglions, des plexus : le plexus de Meissner situé dans la sous-muqueuse et le plexus d'Auerbach situé dans la musculeuse. Cette innervation entérique est responsable de la coordination de la motilité intestinale et du réflexe péristaltique.

Certains neurones de ces plexus sont des neurones sensoriels qui reçoivent des informations provenant des cellules épithéliales et musculaires (chimiorécepteurs et mécanorécepteurs) ; les autres neurones sont des neurones effecteurs assurant l'innervation des cellules musculaires et endocrines. Les cellules interstitielles de Cajal jouent le rôle de pacemaker en contrôlant le rythme du péristaltisme. Le système nerveux est relié au système nerveux central (système sympathique et parasympathique).

Vascularisation

La vascularisation comporte principalement les ramifications de l'aorte dorsale (artères hépatiques, spléniques, gastriques et mésentériques supérieure et inférieure). Les artères pénètrent dans la séreuse, traversent la musculeuse. Elles forment des plexus dans la sous-muqueuse et dans la sous-muqueuse. Dans la sous-muqueuse, des artérioles se terminent en un réseau capillaire. Des veinules partent de ce réseau capillaire, fusionnent pour former des veines dans la sous muqueuse et parcourent le chemin inverse. Le chylifère central, capillaire lymphatique en cul-de-sac, est spécifique aux villosités intestinales. Le système porte hépatique recueille le sang veineux chargé de nutriments pour le conduire au foie.

Le foie traite ces nutriments puis les libère dans la circulation sanguine générale [2]. 3.1. Œsophage

L'œsophage a une longueur de 25 cm. Il est situé entre le pharynx et l'estomac.

Son rôle est de transporter le bol alimentaire de la cavité buccale à l'estomac. Il est subdivisé en quatre segments : cervical, thoracique, diaphragmatique et abdominal [2].

3.2. Estomac

L'estomac est situé entre l'œsophage et le duodénum. L'estomac comprend le cardia, le fundus, le corps, l'antre et le canal pylorique qui s'ouvre vers l'intestin.

8

L'estomac stocke provisoirement les aliments, les brasse et les transforme de façon chimique. C'est le lieu de transformation des aliments en chyme [2].

3.3. Intestin grêle

L'intestin grêle est un tube de 7 à 8 mètres de long qui s'étend depuis la région pylorique de l'estomac jusqu'à la valve iléo-cæcale au niveau du gros intestin.

Il comprend trois parties : le duodénum, le jéjunum et l'iléon. L'intestin grêle transforme le chyme en chyle. Il intervient dans l'absorption et la défense immunitaire [2].

 Duodénum

Le duodénum est la portion initiale de l'intestin grêle qui s'incurve autour de la tête du pancréas. À son niveau se raccordent les conduits provenant de la vésicule biliaire (bile) et du pancréas (suc pancréatique). La libération de ces sécrétions étant sous le contrôle du sphincter d'Oddi.

Le duodénum a un rôle essentiel dans l'absorption des éléments nutritifs et la protection contre les sécrétions gastriques. Ces rôles sont facilités par le développement d'une motilité particulière, le péristaltisme intestinal [2].

 Jéjunum

Le jéjunum est un lieu d'absorption majeur du tube digestif. Il présente un système de villosités complexes.

 Iléon

L'iléon est caractérisé par le développement des formations lymphoïdes. C'est à son niveau que l'on rencontre la plus grande concentration de plaques de Peyer au niveau du chorion et de la sous-muqueuse.

3.4. Gros intestin

Le gros intestin s'étend de la jonction iléo-cæcale jusqu'à l'anus. Il comprend l'appendice et le cæcum, les côlons ascendant, transverse, descendant et sigmoïde. Il se termine par le rectum et l'anus [2] (Figure 3).

9

Figure 3 : Le gros intestin [3]

Il possède des fonctions importantes de motricité. Il stocke et brasse les nutriments pour une transformation finale puis il les propulse vers le rectum. Sa fonction d'absorption est différente de celle de l'intestin grêle. Elle concerne principalement la réabsorption d'eau qui se fait au niveau des microvillosités des entérocytes. Il n'y a pas de valvules conniventes ni de villosités au niveau du gros intestin.

Il produit une grande quantité de mucus qui protège le gros intestin des matières fécales et facilite le transport de celles-ci. De plus, il participe à la défense de l'organisme. Enfin c'est l'organe du tube digestif qui contient la plus importante flore intestinale [2].

 Appendice et cæcum

L'appendice est un diverticule du cæcum. Il a la même structure que le côlon mais possède peu de glandes de Lieberkühn. Il se caractérise par la présence de nombreux îlots lymphoïdes et de lymphocytes dans le chorion. Les îlots lymphoïdes peuvent s'étendre dans la sous-muqueuse en traversant la musculaire muqueuse [2].

10

 Côlon

L'épithélium du côlon est dépourvu de villosités. Il contient des entérocytes et une majorité de cellules caliciformes. Les glandes de Lieberkühn, longues et rectilignes, contiennent principalement des cellules caliciformes, quelques entérocytes et des cellules du système endocrine diffus. En coupe histologique transversale, la richesse des glandes en cellules caliciformes se traduit par un aspect de « champ de marguerites ». Le chorion contient de nombreux follicules lymphoïdes.

La musculaire muqueuse et la sous-muqueuse ne présentent pas de particularités. La musculeuse est formée d'une couche circulaire interne et d'une couche longitudinale externe. Cette couche longitudinale est irrégulière et contient des faisceaux de fibres musculaires qui fusionnent entre elles pour former le tænia coli, permettant une contraction particulière au niveau du côlon.

La séreuse contient des amas de tissu adipeux [2].

La masse bactérienne du microbiote colique, par son abondance et sa diversité, fait du côlon un lieu important de métabolisme et de fermentation. Ce métabolisme bactérien permet de récupérer de l’énergie, notamment à partir des glucides non absorbés dans le grêle [3].

 Rectum

Le rectum est la partie courte, terminale et dilatée du côlon. Il fait suite au côlon sigmoïde. Il a une structure analogue à celle du côlon. Son rôle est l'accumulation des fèces avant la défécation [2].

 Canal anal

Le canal anal est le dernier segment du gros intestin. Il comprend trois parties, la zone ano-rectale, la zone ano-cutanée et la zone cutanée.

Le canal anal est sous le contrôle de sphincters. Il existe à ce niveau du corps deux sphincters : un sphincter interne dont le fonctionnement est automatique et qui est constitué de fibres musculaires lisses, et un sphincter externe sous le contrôle de la volonté comportant des cellules musculaires striées [2].

11 3.5. Foie

Le foie est situé dans la cavité abdominale sous le diaphragme.

e foie est considéré comme une glande digestive par sa sécrétion biliaire mais c'est également une interface entre le système digestif et le sang et, à ce titre, il a une fonction métabolique essentielle [2].

3.6. Pancréas

Le pancréas est une glande amphicrine.

La fonction exocrine se traduit par la présence d'acinus et de ses conduits excréteurs. Le suc pancréatique est formé d'eau, d'enzymes excrétés sous forme inactive pour protéger le pancréas, d'électrolytes et de bicarbonates. Ces produits sont acheminés par les conduits excréteurs et déversés dans le duodénum où ils sont activés.

La partie endocrine du pancréas se présente sous forme d'îlots de Langerhans richement vascularisés. Elle contient les cellules B qui sécrètent l'insuline et l'amyline, les cellules A qui sécrètent le glucagon, les cellules D qui sécrètent la somatostatine, et les cellules PP qui sécrètent le polypeptide pancréatique [2].

II. Le microbiote

Qu’est-ce que le microbiote ?

Les microbes présents dans l’environnement interagissent étroitement avec tous les organismes. Les humains peuvent ainsi être considérés comme des supra-organismes composés, d’une part, de leurs cellules humaines et, d’autre part, d’une grande diversité de micro-organismes qui colonisent tous les organes du corps en contact avec le compartiment extérieur. Cette collection de micro-organismes est appelée le microbiote [4].

1. Le microbiote intestinal

Le microbiote intestinal humain est composé d’environ 100 000 milliards de microorganismes, est-à-dire dix fois plus de cellules que n’en contient l’organisme humain et plus de 3 millions de gènes, soit 100 fois plus que de gènes présents dans le génome humain

12

[5], avec un nombre total moyen d’espèces bactériennes commensales différentes estimé à plus de 500 par individu. Le microbiote intestinal humain peut être considéré comme un organe au sein d'un organe, vivant en symbiose conduisant à l'homéostasie physiologique [6] (Figure 4). C’est un écosystème complexe composé essentiellement de bactéries et dans une moindre mesure, d’archées, d’eucaryotes et de virus [7].

Trois types de flore caractérisent le microbiote : [8]

 Les bactéries symbiotiques : exerçant un effet bénéfique sur la santé.  Les bactéries commensales : n'exerçant aucun effet sur l'hôte

 Les bactéries opportunistes : pouvant selon les conditions environnementales se multiplier et devenir pathogènes pour l'hôte.

Elle évolue de la naissance jusqu’à sa stabilisation vers l’âge de 2 ans [9]. Propre à chaque individu, elle peut être modifiée principalement par les substances qui sont au contact du microbiote, à savoir les aliments et les xénobiotiques ainsi que leurs produits de métabolisation (médicaments, les pesticides et contaminants chimiques présents sur et dans les aliments et dans les boissons) [11]. Elle assure des fonctions quasi identiques pour chaque individu [9].

De nombreuses espèces composent donc notre microbiote : un tiers sont communes à tous et les 2/3 restant sont propres à un individu.

La diversité bactérienne d'un individu à l'autre peut dépendre de plusieurs facteurs : [10]  Génétique

 Géographique  Alimentaire  Age

On peut donc parler d'une véritable ≪ empreinte digitale bactérienne ≫ concernant la spécificité du microbiote d'un sujet à l'autre.

13

On retrouve aussi des populations bactériennes au niveau cutané, vaginal, buccal et respiratoire (Figure 4).

Figure 4 : le microbiote intestinal [12]

Cependant, certaines zones de l’organisme restent stériles chez un hôte sain : le sang, les voies respiratoires basses, les sinus, l’oreille moyenne, la plèvre, le péritoine, le foie, la vésicule biliaire, les os les muscles, l’utérus, les voies génitales hautes et le tractus urinaire [13].

14 1.1. Outil d’étude

Les bactéries du microbiote intestinale sont essentiellement anaérobies strictes c'est-à-dire qu'elles ne peuvent survivre dans un environnement compose d'oxygène, c'est pourquoi il était difficile autrefois de les étudier [14]. À peine 20 à 30 % d'entre elles sont cultivables en milieu d'étude classique [11].

Techniques d’analyse du microbiote intestinal : synthèse

Nous avons rapporté une synthèse des différentes techniques utilisées pour l’analyse du microbiote intestinal dans le tableau ci-dessous (Tableau I), à partir d’un travail réalisé par Sekirov et al. [15]. Il y est fait état des avantages et des limites de chaque technique d’analyse du microbiote.

Tableau I : Présentation des avantages et des limites des techniques d’étude du microbiote intestinal [15].

Techniques Objectif Avantages Limites

Culture in vitro - Dénombrement de micro-organismes

- Peu coûteux - Micro-organismes pas tous cultivables - Milieux sélectifs Techniques d’empreinte -Identification taxonomique - Rapide - Peu coûteux - Phénomènes de co- migration Hybridation in situ couplée à la cytométrie en flux (FISH) - Identification taxonomique

- Utilisation in situ - Design des sondes - Sélectivité PCR quantitative - Identification taxonomique - Sensible et spécifique - Rapide - Peu coûteux

- Design des amorces et des sondes - Sélectivité Séquençage haut-débit - Identification taxonomique - Analyse de la diversité - Sensible et spécifique - Analyse de plusieurs échantillons en même temps. - Coûteux Métagénomique - Identification taxonomique

- Fonctions des gènes

- Sensible et spécifique

- Prix - Volume des données à analyser

15 1.2. La composition du microbiote intestinal

Les travaux basés sur le séquençage du gène codant l’ARNr 16S gène ont rapporté que plus de 95% des séquences sont assignées à 4 groupes phylogénétiques (ou phyla) : Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria et Proteobacteria sur les 55 existants [16,17] (Figure 5). Globalement, au sein de ces phyla, 6 genres bactériens prédominent :

Eubacterium, Lactobacillus, Enterococcus, Clostridium, Bacteroides, Bifidobacterium [16].

Figure 5 : Arbre phylogénétique du microbiote intestinal représentant les principaux phyla bactériens.

La surface des zones indique l’abondance des phyla [18] (adaptée).

Le phylum des Firmicutes est actuellement le plus grand phylum bactérien, avec plus de 200 genres. Il est divisé en trois classes de bactéries Gram positif : les Clostridia (anaérobie), les Bacilli (aérobie stricte ou facultatif) et les Mollicutes. La majorité des Firmicutes dans le tractus gastro-intestinal (TGI) proviennent principalement de deux grands groupes appartenant à la classe Clostridia : le groupe Clostridium coccoides (également appelé

Clostridium cluster XIVa (cluster ‘’un agrégat de bactéries sur la base de la similarité des

séquences de gènes’’ [22]) et le groupe Clostridium leptum (également appelé Clostridium cluster IV) [26]. Le groupe C. coccoides, représenté par 20 à 30 % des bactéries totales, est

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constitué d’espèces appartenant aux genres Eubacterium, Clostridium, Ruminococcus,

Roseburia, Blautia et Butyrivibrio [19]. Le groupe C. leptum, représentant 16 à 25 % du

microbiote intestinal, comprend le genre Faecalibacterium, et certains membres des genres

Eubacterium et Ruminococcus [20]. En outre, les genres Lactobacillus, Lactococcus et Streptococcus, appartenant à la classe Bacilli, ont été également étudiés [21].

Le second phylum majoritaire est celui des Bacteroidetes composé de quatre classes : Bacteroidia, Flavobacteria, Sphingobacteria, et Cytophagia (bactéries Gram négatif). Parmi ces classes, la classe Bacteroidia, contenant les genres bien connus Bacteroides et Prevotella, est probablement la plus étudiée [26].

Actinobacteria constitue le troisième phylum majoritaire, retrouvé en faible quantité dans le microbiote intestinal d’individus adultes sains. Il représente moins de 1% des bactéries totales. On y recense principalement le genre Bifidobacterium [16,24].

Le phylum Proteobacteria, retrouvé en très faible quantité dans le microbiote intestinal d’individus adultes sains, est représenté principalement par le genre Escherichia [16,24] (Figure 6).

Figure 6 : Représentation des différents phyla et genres retrouvés au niveau du microbiote fécal dans une large étude chez des individus adultes [24]

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1.3. Distribution des bactéries dans le tractus gastro-intestinal humain

Le tractus gastro-intestinal (TGI) est un organe qui revêt une importance cruciale, dans les processus impliqués dans la conversion et l'absorption des aliments. Chaque région anatomique du tractus digestif se caractérise par ses propres conditions physico-chimiques, et ces conditions déterminent l’abondance et la diversité de l’écosystème microbien le colonisant [23]. Les conditions physico-chimiques influant sur la composition du microbiote intestinal incluent le pH, la motilité intestinale, le potentiel redox, l'apport nutritionnel, les sécrétions d'hôte (l'acide chlorhydrique, les enzymes digestives, la bile et le mucus, par exemple [25]. Le nombre de cellules bactériennes et la diversité de la flore augmentent le long du tube digestif. Par gramme de contenu frais, la densité microbienne varie de 103 à 104 cellules bactériennes dans l'estomac et le duodénum, de 105 à 109 bactéries au niveau du jéjunum et de l'iléon et atteint 1011 à 1012 cellules dans le côlon et les matières fécales [26] (Figure 7).

En raison de son environnement acide (pH 1,5-3,5) qui ne tolère que certaines bactéries résistantes aux acides, l’estomac possède donc très peu de bactéries endogènes (103-104 bactéries par gramme de contenu). En effet, des études in vivo et in vitro ont démontré que la majorité des bactéries étaient incapables de survivre quand le pH est inférieur à 4 [27,28]. La plupart des bactéries qui se trouvent dans l’estomac appartiennent aux genres Helicobacter et

Streptococcus [29,30].

Figure 7 : Variations de l’abondance et de la composition microbienne le long du tractus gastro-intestinal humain.

Des chiffes représentent les nombres de cellules bactériennes par gramme de contenu frais pour chaque partie anatomique du TGI [26].

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1.4. Etablissement et évolution du microbiote intestinal au cours du temps Pendant la grossesse, le fœtus se trouve dans un environnement stérile et, à la naissance, le tube digestif du nouveau-né constitue un milieu non contaminé. La contamination microbienne commence à partir des premiers moments de vie extra-utérine. Peu de temps après la naissance, des microorganismes « pionniers » colonisent le côlon. Il s’agit de bactéries anaérobies facultatives comme des entérobactéries (principalement Escherichia coli) et des streptocoques qui s’installent dans les 24 à 48 heures suivant la naissance. Plus tard, des bactéries appartenant aux genres Staphylococcus, Enterococcus et Lactobacillus peuvent prendre leur place. Ces microorganismes qui colonisent le tube digestif contribuent activement à son évolution physicochimique créant un environnement anoxique en épuisant l’oxygène. C’est à partir de ce moment que des bactéries anaérobies telles que

Bifidobactérium, Bactéroides et Clostridium peuvent apparaître dans les selles. Dès la

première semaine de vie, le niveau total de la population bactérienne fécale croit rapidement pour atteindre 109-10 bactéries par gramme de selles [31].

1.5. Les facteurs influençant la mise en place du microbiote 1.5.1. Facteurs propres à l’individu

La génétique est un facteur qui contribue en partie à la détermination de la composition de notre microbiote [34].

1.5.2. Le mode d’accouchement

L'implantation de la flore est différente entre les nouveau-nés nés par césarienne et ceux nés par voie basse [32].

Les enfants nés par césarienne rencontrent majoritairement en premier lieu les bactéries de leur environnement : air et personnel soignant., Les premières bactéries implantées sont toujours les anaérobies facultatifs (entérobactéries, entérocoques, staphylocoques), mais la flore anaérobie stricte s’implante beaucoup plus tardivement, ce retard portant principalement sur les genres Bifidobacterium et Bacteroides, bactéries d’origine entérique. Le suivi sur 6 mois d’une cohorte a montré que ce retard de colonisation était toujours significatif à 1 mois

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pour le genre Bifidobacterium et à 6 mois pour le genre Bacteroides [33]. 1.5.3. Terme de la naissance

L’implantation du microbiote intestinal diffère entre les nouveau-nés prématurés et à terme [35].

On observe chez les prématurés un retard de colonisation important avec un nombre plus réduit d’espèces bactériennes par rapport aux enfants nés à terme. Les causes les plus fréquentes de ce retard sont dues à la naissance par césarienne, la séparation avec la mère, la mise en place dans un environnement de soins intensifs très aseptisé avec une antibiothérapie à large spectre. On observe chez les prématurés hospitalisés une décroissance de la diversité de la flore d’un enfant à un autre au cours de leur hospitalisation [33].

1.5.4. L’environnement

L’environnement joue un rôle important dans la colonisation intestinale. Certaines études ont mis en évidence la colonisation à plus haut niveau et plus fréquente chez les enfants nés dans les pays en voie développement par les bifidobactéries. Ces différences de flore sont vraisemblablement liées aux conditions plus strictes d’hygiène entourant les accouchements dans les pays industrialisés, réduisant l’exposition de l’enfant aux flores fécale et vaginale de sa mère [33].

1.5.5. Mode d’alimentation

La flore d’un né allaité par sa mère est riche en Bifidobacterium. Les nouveau-nés nourris au lait de vache adapté développent une flore significativement moins riche en bactéries de type Bifidobacterium, mais plutôt caractérisée par une richesse en bactéries de type Clostridium [36] (Figure 8).