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Calendrier du cours IFT6291/BIN6000 Semaine 1:

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Academic year: 2022

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UNIVERSIT ´E DE MONTR ´EAL Automne 2014

D´epartement IRO Nadia El-Mabrouk

Calendrier du cours IFT6291/BIN6000 Semaine 1:

• Mardi 2 Septembre

– Cours: Introduction au cours.

Semaine 2:

Lecture de deux chapitres de livre:

• Molecular Biology Primer: Chapitre 3 du livre An introduction to Bioinformatics Al- gorithms, par Neil C. Jones et Pavel A. Pezner, 2004.

• Duplication, rearrangement and reconciliation: a follow-up 13 years later: DansModels and algorithms for genome evolution, Computational Biology series, par C. Chauve, N.

El-Mabrouk, L. Gueguen, M. Semeria and E. Tannier, Springer , pp. 47-62, 2013.

Semaine 3:

• Lundi 15 Septembre

– Cours: Recherche et alignement de s´equences par programmation dynamique.

– S´eminaire: Pr´esentation: “Arbres de g`enes et r´econciliation”

• Mardi 16 Septembre – Cours: Suite

Semaine 4:

• Lundi 22 Septembre

– Cours: Heuristiques: M´ethodes de filtrage pour la recherche dans les banques de donn´ees biologiques.

– S´eminaire: Discussion.

• Mardi 23 Septembre – Cours: Suite

(2)

Semaine 5:

• Lundi 29 Septembre

– Cours: Alignement multiple par programmation dynamique

– S´eminaire: Pr´esentation courte de chaque ´etudiant (r´esum´e, plan de travail, bib- liographie)

• Mardi 30 Septembre – Cours: Suite

Semaine 6:

• Lundi 6 Octobre

– Cours: Alignement multiple: Heuristiques – S´eminaire: Virginie Calderone.

• Mardi 7 Octobre

– Cours: Recherche exacte; Arbres des suffixes

Semaine 7:

• Lundi 13 Octobre – Jour f´eri´e

• Mardi 14 Octobre:

– Intra

– S´eminaire: Bilell Benzaid

Mardi 21 et Mercredi 22 Octobre: Semaine de relˆache.

Semaine 8:

• Lundi 27 Octobre

– Cours: Recherche exacte; Arbres des suffixes – S´eminaire: Manuel Lafond

• Mardi 28 Octobre – Cours: Suite

(3)

Semaine 9:

• Lundi 3 Novembre

– Cours: Arbres des suffixes – S´eminaire: Emmanuel Noutahi.

• Mardi 4 Novembre

– Cours: Phylog´enie: Mod`eles ´evolutifs, inf´erence

Semaine 10:

• Lundi 10 Novembre

– Cours: Phylog´enie: Mod`eles ´evolutifs, inf´erence – S´eminaire: Amar Boudaa.

• Mardi 11 Novembre

– Cours: Phylog´enie: Mod`eles ´evolutifs, inf´erence

Semaine 11:

• Lundi 17 Novembre

– Cours: Phylog´enie: Consensus d’arbres – S´eminaire:

∗ Pr´esentation ´etudiant.

∗ Remise des rapports pr´eliminaires de projets

• Mardi 18 Novembre

– Cours: Phylog´enie: Consensus d’arbres

Semaine 12:

• Lundi 24 Novembre

– Cours: R´earrangements g´enomiques – S´eminaire: Marc Andr´e Legault.

• Mardi 25 Novembre – Cours: Suite

(4)

Semaine 13:

• Lundi 1 D´ecembre

– Cours: Familles de g`enes et r´econciliation – S´eminaire: Pam´ela Mehanna.

• Mardi 2 D´ecembre – Cours: Suite

Semaine 14:

• Lundi 8 D´ecembre

– Cours: R´evision.

– S´eminaire: Pr´esentation des projets.

Semaine 15:

• Mardi 16 D´ecembre – Examen final

Références

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