HAL Id: tel-02918065
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02918065
Submitted on 20 Aug 2020
HAL is a multi-disciplinary open access
archive for the deposit and dissemination of sci-entific research documents, whether they are pub-lished or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers.
L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d’enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés.
Federica Evangelista
To cite this version:
Federica Evangelista. Study of the role of the human TREX-2 complex in the DNA Damage Re-sponse. Genomics [q-bio.GN]. Université de Strasbourg, 2017. English. �NNT : 2017STRAJ122�. �tel-02918065�
������������������������
�
���������������������������������������������������������
�����������
��������������������������������������
� ������
��
����������������
���������������������
� ������������������������������� � � � �����������������������������������������������������������������
����������������������������������������������������������������������������
�
�����������������������������������������������������
��������������������
�
���������������������������������������������������
�����������������������������
� � � �������������������� � ���������������� ������������������������������������ � �������������� � �������������������� ��������������������������������������������������� ������������������������������� ������������������������������������������������������ � � ������������������������� � ���������������������� � ������������������������������������������������������ �������������������� � ������������������������������������������������������� ������������������ � ���������������������������������������������������� � ������������������������������������������������������������������������������������������� ����������� � �� � ���� ����� ������� ��� ����� � ��� ��� ����� ���� �� ���������� ��� �������������������������������������������������������������������������������������������� ���� ������� ��� ���� ������������ ��� ������������� ����� ������ ��� ����������� ���� ��� ���������� ���� ��� ��� ������� ��� ���� ��� ���� �� ��� ����� ��������������� ���������� ��� �������� ���� ������� ����������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������� �������� ������� ����� �� ������ ������� ����� ��� ������ ��� ���� ���� ���� ���� ����� ����� ���� ����� ��� ������ ��������������������������������������������������������������������������������� ����� ���� ���� ������ ���� ������� ��� ���� ��� ���� ���� ��� ���� �� ����������� ��������� ����� ���������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� �������� ���������� �������� ���� ���������� ������ ����� ������� ��� ��������� ��� �������� ���� ���������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ������� �������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ���� ����� ��������� �� �� ������� ���� ���� ��� ��� �� �������� ������ ��� ���� ������� �������� ��� ����� ������� ������ ����� ����� ����� ������ ��� ������ ���� ������ ���� ���� ������ �������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ������� ������������������������������������������� �� ������ ����� ��� ������ ���� �������� ������� ����� �������� ����� ��� ���� ���������� ��� ���� ����� ���������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� �����������������������������������������������������������������������������������������
��������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������� ���� ���� ���� ������ �� ������ ����� ��� ������ ��� �������� ������� ����� ���� ������� �������� ����� ������� � ����� ���� ��� ������������ �� ��������� ������� ��� ������ � �� �� ������������ ����������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������� �
� ������������������� ��������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������ � �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������� ����������� ��������� �������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������� ������������������������� ������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������
����������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ������ ����� ��� ����������� ����� ���������� ����� ���� ������� ���������� ��� ��� ������������� ���������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���� ������� ���� ����� ���������� ��� ��������� ����������� �������� ���������� ���� ���� ���������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ���� ������� ���� ����� ���������� ��� ��������� ����������� �������� ���������� ���� ���� ���������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���� ����� ��������� ������� �������� ������� ������� ���� ������� ���������� ����������� ������ �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ �������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� � �������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������
��������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������ �������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������ �� ������������������������ �� ��� ������������ ������� ���������������������������� �� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������������������� � ������������� �������� ������������������������������������������������������������������������������������������������������� �������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� �������� ���������������������������������������������������������������������������������������� �
List of Abbreviations
������ ���������������������� ��� ���������� ������� �������� ��������� ������� ������������������������ ���� � ������������������������������ ���� � ��������������������������������������� ������ ��������� �������� ���������������� ������ ������������������������������� ���� � �������������������������� ���� � ������ ������ ���������������� ������ ���������������� ������ ����������������� ���� � ������������������������� ����� � ������������������������������ ���� � ������������������������� ��� � ���������� ���� � ��������������������������� ����� � ������������������������� ���� � �������������������� ���� � ������������������������� ������ ������������� ������� ������ ��������� ������������������������������������� � ���� � �������������������� ������ �������������������� ���� � ��������������� ������ ��������������������� ������ �������������� ���� � ���������������������� ������ ������������������������������������������� ������ ������������������������������������������� ��� � ���������������������� �������������������������������������������������� ���� � ��������������������������� ��� � ������������������ �� ������������������������ ��� � ��������������� ��� � ������������������� ����� � ������������������������� ��� � ����������� ��� � ���������� ������ ������������������������� ������ ��������������������������������������������� ������� ������������������������������������������������ ������ ���������������������������� ������ ��������������������� ������ ���������������������������������� ���� � ����������������� ���� � ����������������� ��� � ������������������ ������ ����������������������������� ���� � �������������� ��� � ����������������� ������ ��������������������������� ���� � ��������������������� ����� ����������� ������������ ����� ������ ���������������������������� ������ ��������������������������������� ������ ������������������������������� ����� � ���������������������������� ������ ����������������������� ������ ����������������������� ���� � ���������������������� ������ ������������������������������� ������ �������������������� ������� ����������������������������
���� � ������������������������������ ������� ����������������������������������� ���� � �������������������������������������� � � ��� ��������� ����������� ����� ���� � ����������������������������� ��� � ���������� ���� � ������������������ ������ ��������������������������������� �
Thesis summary in French
��������������������������������������������������������������������������������������������� �� ��������� ���� ��������� ������������� ���������� ��� ���� ����������������� ������������ �� ���������������������������������������������������������������������������������������� ���� �������� ������� ����� ������� �������� ���������������� ����� ����������� ��� ��������� ������� ����� ����� �� ������� ������� ��������� ����� ���� ���� ����� ������� ������ ������������ ������ ����� ����� ������������ ����� ��� �������� ��� ������ ��� ����� ���� ��������� �������� ������ �������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ����� ��� �������������� ��� �������� ���� ��������� ��� ������ ������ ���� ������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ �������������� ���� ���������� ��� ������ ����������� ��� ����� ������������ ������������ ���������� ������������� ���� ����� ������ ��� �������������� �������������� ������������ ����� ��� ��������� ����������������������������������������������������������������������������������� ���������� ����� ����������� ���������������� ��� ����� ����� ������� ��� �������� ��� ������ ������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ����� ������������ ��� ������ ��� ��� ������ ������������ ����� �������� ����� ������ ������� �������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ����� ��� �� ���������� ������� �� ���������� ���������� ��� ���������� ����� �������� ��������������������������������� ������������ ��������� ����������������� ������������ ����������������������������� ��������������������������� ����������������� ��������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��� ������������ ��� ���������� ��� �������� �������� ���� ������� �� ��� ���� �������� ���� ������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������� ��� ������������� ��� ��� ��������������� ���� ������� ���� �������������� ���������������������� ������� ���� ��������� ��� ���� ���������� �������������� ��� �������������� ������� ���� ���� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ���� ��� ������� ���� ��� ����������� �� ��� ���� ��������� ������������ ��� ����� ������ ������������������������������������������������������������������������������������������ �������� ���� ���� �������������� ����������� ���� ���� ����� ��� ����� ����� ���������� ����� ��� ����������� ��� ������� ���� ������� ��������� ���� ��������� ���� ������������� ��� ����������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ����������� ���������� ������� ����� ��� ������� ���� ��������� ����� ����� ����� �������� ����� ������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ������ ��� ��� ������������ ����� ��� ��������� ����������� ���� ��� �������������� ������ ���� ����� ��������������� ����� ������ �������� ��� ��������� ����������� ���� ������ ���������� ������� ����� ��������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������� ��� ������ ���������� ���������� ������������� �������� ������� ���������������� ����� �������������� ������ ��� ���� ��� ��� ������� ��� ������ ��������� ��� ���� ��� ���� ����� ��� ������������ ��� ��� ���������� ����������� ��� �������� ��� ��������� ������������ ����� ��� ������� ���� ��� ��������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ���� ������� �� ���������� ����� ��� ������� �������������� ��������� ��� �������������� ������ ���� ����� ���������� ��������� ��� �������������� ��� ������ ����� ��� ����� ���������� ����� ��������� ���������� ����� ��� ���������� ��� ���������� ������ ��� �������������� ��� ��������� ����� ��� ������� �� ���� ���������� ������ ������ �������� ����� ��� ������������ ��� ������������ ��� �������� ���� �������� ������� ����������� ��� ���������� ����������������������� ���� ���� ����������������� ������������ ��� �������������� ���������� ����� ���� ��������� ��� �������� ��� ������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������� ������������ ���������� ������������������������ ����������������������� ������ ���������������������������������������������������������������������� ���������������� ��������������� ����� ��� ���������� ��� ���� ��� ���� ������� ���� ��� ����������� ��� ��������� ������ ��� ��������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ���������� ��� ��������� �������� ���� �������� ��� ����� ������������ ����������� ���� ������ ���������� ��� ��������� ��� ��� ���������� ��� ��� ������� ���� ������������ ������� ���� ������ ����
�������������� ��� ��� ��������� ��������������� ������ ��� ����� ������������ ������ ��� ������ ��������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� �������� ����� �� ������ �� ���������������� ������� ��� ���� �� �������� ����� ���� �� ��������� ���� ��� �������� ������������� ��� ���������� ����� �������������� �� ��� �������� ���� ���������������������������������������������������������������������������������������� ����� ����� ���� ��������� ��� ���������� ���� ������� ���� ����� ��� ������� ����� ����� �������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������� ����� ��� ����������� ��� ����� ���������� ��� ������� ����� ��� ���������� ����������� ����� ������ ������� ����������� ��� �������� ����������� ����� �� ��� �������� ��� ������ ������ ���� ���� �������� ��� �������� ��� ���������� ������������ ������������ ��� �������� ������ ���� ����� ������������ ��� ��������� �������� ��� ��������� ��������������� ����� ���� ��� ����� �������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ��� ���� ��� ��������������� ������� ����� ��� ������� ����������� ������ ���� ��� ��������� ��������� ���� ����� ���� ���������� ���������� ��� ���������� ������� ������ ��� ����� ���������� ����� ������ ������ ���� ������������ ����� ������ ����� ������ ������� ��� ������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ������� ���������������� ������ ������������ ���� ������������ ����� ������� ��� ��� ���� ���� ���� ��������� ���� ��� ������� ��� ��� ����������� ���� ��������� ��� ���� ���������������� ����������� ���� �������� �� ������������� ����� ��������� �������� ������� �� �� ���� ����� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������� ����� �������� ���� ������ �������� ��� �������������� ������������ ��� ����� ���� ������ ��� ���������� ������ ��������� ��� ��������� �������� ��� ����� ������ �������������� �������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ����� ���� ��������� ����� ���� ������� ����� ���������� �������������� ���� �������� ������������ ����� ���������� ���� ��������� ��������� �������� ����������� ��� �������� ������������� ����