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Infections et colonisations urinaires masculines en urologie

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Academic year: 2021

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(1)

UNIVERSITE MOHAMMED V RABAT

FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE RABAT

ANNEE : 2016 THESE N° : 50

INFECTIONS ET COLONISATIONS

URINAIRES MASCULINES EN

UROLOGIE

THESE

Présentée et soutenue publiquement le : ……….. PAR

Mlle Sara RHARRIT

Née le 18 Mars 1989 à Casablanca

Pour l’Obtention du Doctorat en Pharmacie

MOTS CLES :

Infection urinaire masculine – Colonisation urinaire masculine – Bactériurie –

Prostate – Urologie

JURY

Mr. M. ZOUHDI PRESIDENT

Professeur de Microbiologie

Mme. M. CHADLI RAPPORTEUR

Professeur de Microbiologie Mr. A. AMEUR Professeur d’Urologie Mme. S. TELLAL Professeur de Biochimie Mr. Y. SEKHSOKH Professeur de Microbiologie JUGES

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UNIVERSITE MOHAMMED V DE RABAT

FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT

DOYENS HONORAIRES :

1962 – 1969 : ProfesseurAbdelmalek FARAJ 1969 – 1974 : Professeur Abdellatif BERBICH 1974 – 1981 : Professeur Bachir LAZRAK 1981 – 1989 : Professeur Taieb CHKILI

1989 – 1997 : Professeur Mohamed Tahar ALAOUI 1997 – 2003 : Professeur Abdelmajid BELMAHI 2003 – 2013 : Professeur Najia HAJJAJ - HASSOUNI

ADMINISTRATION : a

Doyen : Professeur Mohamed ADNAOUI

Vice Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines

Professeur Mohammed AHALLAT

Vice Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération

Professeur Taoufiq DAKKA

Vice Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie

Professeur Jamal TAOUFIK

Secrétaire Général : Mr. El Hassane AHALLAT

1- ENSEIGNANTS-CHERCHEURS MEDECINS ETPHARMACIENS

PROFESSEURS :

Mai et Octobre 1981

Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajih Chirurgie Cardio-Vasculaire Pr. TAOBANE Hamid* Chirurgie Thoracique

Mai et Novembre 1982

Pr. BENOSMAN Abdellatif Chirurgie Thoracique

Novembre 1983

Pr. HAJJAJ Najia ép. HASSOUNI Rhumatologie

Décembre 1984

Pr. MAAOUNI Abdelaziz Médecine Interne – Clinique Royale Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi Anesthésie -Réanimation

Pr. SETTAF Abdellatif pathologie Chirurgicale

Novembre et Décembre 1985

Pr. BENJELLOUN Halima Cardiologie

Pr. BENSAID Younes Pathologie Chirurgicale Pr. EL ALAOUI Faris Moulay El Mostafa Neurologie

(4)

Janvier, Février et Décembre 1987

Pr. AJANA Ali Radiologie

Pr. CHAHED OUAZZANI Houria Gastro-Entérologie Pr. EL YAACOUBI Moradh Traumatologie Orthopédie Pr. ESSAID EL FEYDI Abdellah Gastro-Entérologie

Pr. LACHKAR Hassan Médecine Interne

Pr. YAHYAOUI Mohamed Neurologie

Décembre 1988

Pr. BENHAMAMOUCH Mohamed Najib Chirurgie Pédiatrique

Pr. DAFIRI Rachida Radiologie

Pr. HERMAS Mohamed Traumatologie Orthopédie

Décembre 1989

Pr. ADNAOUI Mohamed Médecine Interne –Doyen de la FMPR Pr. BOUKILI MAKHOUKHI Abdelali* Cardiologie

Pr. CHAD Bouziane Pathologie Chirurgicale Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda Neurologie

Janvier et Novembre 1990

Pr. CHKOFF Rachid Pathologie Chirurgicale Pr. HACHIM Mohammed* Médecine-Interne

Pr. KHARBACH Aîcha Gynécologie -Obstétrique Pr. MANSOURI Fatima Anatomie-Pathologique Pr. TAZI Saoud Anas Anesthésie Réanimation

Février Avril Juillet et Décembre 1991

Pr. AL HAMANY Zaîtounia Anatomie-Pathologique

Pr. AZZOUZI Abderrahim Anesthésie Réanimation –Doyen de la FMPO

Pr. BAYAHIA Rabéa Néphrologie

Pr. BELKOUCHI Abdelkader Chirurgie Générale Pr. BENCHEKROUN Belabbes Abdellatif Chirurgie Générale Pr. BENSOUDA Yahia Pharmacie galénique

Pr. BERRAHO Amina Ophtalmologie

Pr. BEZZAD Rachid Gynécologie Obstétrique Pr. CHABRAOUI Layachi Biochimie et Chimie

Pr. CHERRAH Yahia Pharmacologie

Pr. CHOKAIRI Omar Histologie Embryologie

Pr. KHATTAB Mohamed Pédiatrie

Pr. SOULAYMANI Rachida Pharmacologie – Dir. du Centre National PV Pr. TAOUFIK Jamal Chimie thérapeutique

Décembre 1992

Pr. AHALLAT Mohamed Chirurgie Générale Pr. BENSOUDA Adil Anesthésie Réanimation Pr. BOUJIDA Mohamed Najib Radiologie

(5)

Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza Gastro-Entérologie Pr. CHRAIBI Chafiq Gynécologie Obstétrique

Pr. DAOUDI Rajae Ophtalmologie

Pr. DEHAYNI Mohamed* Gynécologie Obstétrique Pr. EL OUAHABI Abdessamad Neurochirurgie

Pr. FELLAT Rokaya Cardiologie

Pr. GHAFIR Driss* Médecine Interne

Pr. JIDDANE Mohamed Anatomie

Pr. TAGHY Ahmed Chirurgie Générale

Pr. ZOUHDI Mimoun Microbiologie

Mars 1994

Pr. BENJAAFAR Noureddine Radiothérapie

Pr. BEN RAIS Nozha Biophysique

Pr. CAOUI Malika Biophysique

Pr. CHRAIBI Abdelmjid Endocrinologie et Maladies Métaboliques Pr. EL AMRANI Sabah Gynécologie Obstétrique

Pr. EL AOUAD Rajae Immunologie

Pr. EL BARDOUNI Ahmed Traumato-Orthopédie Pr. EL HASSANI My Rachid Radiologie

Pr. ERROUGANI Abdelkader Chirurgie Générale- Directeur CHIS

Pr. ESSAKALI Malika Immunologie

Pr. ETTAYEBI Fouad Chirurgie Pédiatrique

Pr. HADRI Larbi* Médecine Interne

Pr. HASSAM Badredine Dermatologie

Pr. IFRINE Lahssan Chirurgie Générale

Pr. JELTHI Ahmed Anatomie Pathologique

Pr. MAHFOUD Mustapha Traumatologie – Orthopédie Pr. MOUDENE Ahmed* Traumatologie- Orthopédie Pr. RHRAB Brahim Gynécologie –Obstétrique

Pr. SENOUCI Karima Dermatologie

Mars 1994

Pr. ABBAR Mohamed* Urologie

Pr. ABDELHAK M’barek Chirurgie Pédiatrique

Pr. BELAIDI Halima Neurologie

Pr. BRAHMI Rida Slimane Gynécologie Obstétrique Pr. BENTAHILA Abdelali Pédiatrie

Pr. BENYAHIA Mohammed Ali Gynécologie Obstétrique Pr. BERRADA Mohamed Saleh Traumatologie – Orthopédie

Pr. CHAMI Ilham Radiologie

Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae Ophtalmologie Pr. EL ABBADI Najia Neurochirurgie

(6)

Pr. JALIL Abdelouahed Chirurgie Générale Pr. LAKHDAR Amina Gynécologie Obstétrique

Pr. MOUANE Nezha Pédiatrie

Mars 1995

Pr. ABOUQUAL Redouane Réanimation Médicale Pr. AMRAOUI Mohamed Chirurgie Générale Pr. BAIDADA Abdelaziz Gynécologie Obstétrique Pr. BARGACH Samir Gynécologie Obstétrique

Pr. CHAARI Jilali* Médecine Interne

Pr. DIMOU M’barek* Anesthésie Réanimation Pr. DRISSI KAMILI Med Nordine* Anesthésie Réanimation Pr. EL MESNAOUI Abbes Chirurgie Générale Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila Oto-Rhino-Laryngologie Pr. HDA Abdelhamid* Cardiologie - Dir. HMIMV Pr. IBEN ATTYA ANDALOUSSI Ahmed Urologie

Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia Ophtalmologie

Pr. SEFIANI Abdelaziz Génétique

Pr. ZEGGWAGH Amine Ali Réanimation Médicale

Décembre 1996

Pr. AMIL Touriya* Radiologie

Pr. BELKACEM Rachid Chirurgie Pédiatrie Pr. BOULANOUAR Abdelkrim Ophtalmologie Pr. EL ALAMI EL FARICHA EL Hassan Chirurgie Générale

Pr. GAOUZI Ahmed Pédiatrie

Pr. MAHFOUDI M’barek* Radiologie

Pr. MOHAMMADI Mohamed Médecine Interne

Pr. OUADGHIRI Mohamed Traumatologie-Orthopédie

Pr. OUZEDDOUN Naima Néphrologie

Pr. ZBIR EL Mehdi* Cardiologie

Novembre 1997

Pr. ALAMI Mohamed Hassan Gynécologie-Obstétrique Pr. BEN SLIMANE Lounis Urologie

Pr. BIROUK Nazha Neurologie

Pr. CHAOUIR Souad* Radiologie

Pr. ERREIMI Naima Pédiatrie

Pr. FELLAT Nadia Cardiologie

Pr. HAIMEUR Charki* Anesthésie Réanimation Pr. KADDOURI Noureddine Chirurgie Pédiatrique

Pr. KOUTANI Abdellatif Urologie

Pr. LAHLOU Mohamed Khalid Chirurgie Générale

Pr. MAHRAOUI CHAFIQ Pédiatrie

(7)

Pr. TAOUFIQ Jallal Psychiatrie

Pr. YOUSFI MALKI Mounia Gynécologie Obstétrique

Novembre 1998

Pr. AFIFI RAJAA Gastro-Entérologie

Pr. BENOMAR ALI Neurologie – Doyen Abulcassis Pr. BOUGTAB Abdesslam Chirurgie Générale

Pr. ER RIHANI Hassan Oncologie Médicale Pr. EZZAITOUNI Fatima Néphrologie

Pr. LAZRAK Khalid * Traumatologie Orthopédie

Pr. BENKIRANE Majid* Hématologie

Pr. KHATOURI ALI* Cardiologie

Pr. LABRAIMI Ahmed* Anatomie Pathologique

Janvier 2000

Pr. ABID Ahmed* Pneumophtisiologie

Pr. AIT OUMAR Hassan Pédiatrie

Pr. BENJELLOUN Dakhama Badr.Sououd Pédiatrie

Pr. BOURKADI Jamal-Eddine Pneumo-phtisiologie Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer Chirurgie Générale Pr. ECHARRAB El Mahjoub Chirurgie Générale Pr. EL FTOUH Mustapha Pneumo-phtisiologie Pr. EL MOSTARCHID Brahim* Neurochirurgie

Pr. ISMAILI Hassane* Traumatologie Orthopédie

Pr. MAHMOUDI Abdelkrim* Anesthésie-Réanimationinspecteur SS Pr. TACHINANTE Rajae Anesthésie-Réanimation

Pr. TAZI MEZALEK Zoubida Médecine Interne

Novembre 2000

Pr. AIDI Saadia Neurologie

Pr. AIT OURHROUI Mohamed Dermatologie Pr. AJANA Fatima Zohra Gastro-Entérologie

Pr. BENAMR Said Chirurgie Générale

Pr. CHERTI Mohammed Cardiologie

Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Selma Anesthésie-Réanimation

Pr. EL HASSANI Amine Pédiatrie

Pr. EL KHADER Khalid Urologie

Pr. EL MAGHRAOUI Abdellah* Rhumatologie

Pr. GHARBI Mohamed El Hassan Endocrinologie et Maladies Métaboliques Pr. HSSAIDA Rachid* Anesthésie-Réanimation

Pr. LAHLOU Abdou Traumatologie Orthopédie

Pr. MAFTAH Mohamed* Neurochirurgie

Pr. MAHASSINI Najat Anatomie Pathologique Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae Pédiatrie

Pr. NASSIH Mohamed* Stomatologie Et Chirurgie Maxillo-Faciale

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Décembre 2000

Pr. ZOHAIR ABDELAH* ORL

Décembre 2001

Pr. ABABOU Adil Anesthésie-Réanimation

Pr. BALKHI Hicham* Anesthésie-Réanimation Pr. BENABDELJLIL Maria Neurologie

Pr. BENAMAR Loubna Néphrologie

Pr. BENAMOR Jouda Pneumo-phtisiologie Pr. BENELBARHDADI Imane Gastro-Entérologie

Pr. BENNANI Rajae Cardiologie

Pr. BENOUACHANE Thami Pédiatrie

Pr. BEZZA Ahmed* Rhumatologie

Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi Anatomie Pr. BOUMDIN El Hassane* Radiologie

Pr. CHAT Latifa Radiologie

Pr. DAALI Mustapha* Chirurgie Générale Pr. DRISSI Sidi Mourad* Radiologie

Pr. EL HIJRI Ahmed Anesthésie-Réanimation Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid Neuro-Chirurgie

Pr. EL MADHI Tarik Chirurgie-Pédiatrique Pr. EL OUNANI Mohamed Chirurgie Générale

Pr. ETTAIR Said Pédiatrie

Pr. GAZZAZ Miloudi* Neuro-Chirurgie Pr. HRORA Abdelmalek Chirurgie Générale

Pr. KABBAJ Saad Anesthésie-Réanimation

Pr. KABIRI EL Hassane* Chirurgie Thoracique Pr. LAMRANI Moulay Omar Traumatologie Orthopédie

Pr. LEKEHAL Brahim Chirurgie Vasculaire Périphérique Pr. MAHASSIN Fattouma* Médecine Interne

Pr. MEDARHRI Jalil Chirurgie Générale Pr. MIKDAME Mohammed* Hématologie Clinique Pr. MOHSINE Raouf Chirurgie Générale

Pr. NOUINI Yassine Urologie

Pr. SABBAH Farid Chirurgie Générale

Pr. SEFIANI Yasser Chirurgie Vasculaire Périphérique Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Soumia Pédiatrie

Décembre 2002

Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane* Anatomie Pathologique

Pr. AMEUR Ahmed * Urologie

Pr. AMRI Rachida Cardiologie

Pr. AOURARH Aziz* Gastro-Entérologie Pr. BAMOU Youssef * Biochimie-Chimie

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Pr. BENZEKRI Laila Dermatologie Pr. BENZZOUBEIR Nadia Gastro-Entérologie Pr. BERNOUSSI Zakiya Anatomie Pathologique Pr. BICHRA Mohamed Zakariya* Psychiatrie

Pr. CHOHO Abdelkrim * Chirurgie Générale

Pr. CHKIRATE Bouchra Pédiatrie

Pr. EL ALAMI EL FELLOUS Sidi Zouhair Chirurgie Pédiatrique Pr. EL HAOURI Mohamed * Dermatologie

Pr. EL MANSARI Omar* Chirurgie Générale Pr. FILALI ADIB Abdelhai Gynécologie Obstétrique

Pr. HAJJI Zakia Ophtalmologie

Pr. IKEN Ali Urologie

Pr. JAAFAR Abdeloihab* Traumatologie Orthopédie

Pr. KRIOUILE Yamina Pédiatrie

Pr. LAGHMARI Mina Ophtalmologie

Pr. MABROUK Hfid* Traumatologie Orthopédie Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss* Gynécologie Obstétrique Pr. MOUSTAGHFIR Abdelhamid* Cardiologie

Pr. NAITLHO Abdelhamid* Médecine Interne

Pr. OUJILAL Abdelilah Oto-Rhino-Laryngologie Pr. RACHID Khalid * Traumatologie Orthopédie Pr. RAISS Mohamed Chirurgie Générale

Pr. RGUIBI IDRISSI Sidi Mustapha* Pneumophtisiologie

Pr. RHOU Hakima Néphrologie

Pr. SIAH Samir * Anesthésie Réanimation

Pr. THIMOU Amal Pédiatrie

Pr. ZENTAR Aziz* Chirurgie Générale

Janvier 2004

Pr. ABDELLAH El Hassan Ophtalmologie

Pr. AMRANI Mariam Anatomie Pathologique Pr. BENBOUZID Mohammed Anas Oto-Rhino-Laryngologie Pr. BENKIRANE Ahmed* Gastro-Entérologie Pr. BOUGHALEM Mohamed* Anesthésie Réanimation

Pr. BOULAADAS Malik Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale Pr. BOURAZZA Ahmed* Neurologie

Pr. CHAGAR Belkacem* Traumatologie Orthopédie Pr. CHERRADI Nadia Anatomie Pathologique Pr. EL FENNI Jamal* Radiologie

Pr. EL HANCHI ZAKI Gynécologie Obstétrique Pr. EL KHORASSANI Mohamed Pédiatrie

Pr. EL YOUNASSI Badreddine* Cardiologie

Pr. HACHI Hafid Chirurgie Générale

Pr. JABOUIRIK Fatima Pédiatrie

(10)

Pr. KHARMAZ Mohamed Traumatologie Orthopédie

Pr. LEZREK Mohammed* Urologie

Pr. MOUGHIL Said Chirurgie Cardio-Vasculaire Pr. OUBAAZ Abdelbarre* Ophtalmologie

Pr. TARIB Abdelilah* Pharmacie Clinique Pr. TIJAMI Fouad Chirurgie Générale Pr. ZARZUR Jamila Cardiologie

Janvier 2005

Pr. ABBASSI Abdellah Chirurgie Réparatrice et Plastique Pr. AL KANDRY Sif Eddine* Chirurgie Générale

Pr. ALAOUI Ahmed Essaid Microbiologie

Pr. ALLALI Fadoua Rhumatologie

Pr. AMAZOUZI Abdellah Ophtalmologie

Pr. AZIZ Noureddine* Radiologie

Pr. BAHIRI Rachid Rhumatologie

Pr. BARKAT Amina Pédiatrie

Pr. BENHALIMA Hanane Stomatologie et Chirurgie Maxillo Faciale

Pr. BENYASS Aatif Cardiologie

Pr. BERNOUSSI Abdelghani Ophtalmologie Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Mohamed Ophtalmologie Pr. DOUDOUH Abderrahim* Biophysique Pr. EL HAMZAOUI Sakina* Microbiologie

Pr. HAJJI Leila Cardiologie (mise en disponibilité)

Pr. HESSISSEN Leila Pédiatrie

Pr. JIDAL Mohamed* Radiologie

Pr. LAAROUSSI Mohamed Chirurgie Cardio-vasculaire Pr. LYAGOUBI Mohammed Parasitologie

Pr. NIAMANE Radouane* Rhumatologie

Pr. RAGALA Abdelhak Gynécologie Obstétrique

Pr. SBIHI Souad Histo-Embryologie Cytogénétique Pr. ZERAIDI Najia Gynécologie Obstétrique

Décembre 2005

Pr. CHANI Mohamed Anesthésie Réanimation

Avril 2006

Pr. ACHEMLAL Lahsen* Rhumatologie

Pr. AKJOUJ Said* Radiologie

Pr. BELMEKKI Abdelkader* Hématologie

Pr. BENCHEIKH Razika O.R.L

Pr. BIYI Abdelhamid* Biophysique

Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine Chirurgie - Pédiatrique Pr. BOULAHYA Abdellatif* Chirurgie Cardio – Vasculaire Pr. CHENGUETI ANSARI Anas Gynécologie Obstétrique

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Pr. ESSAMRI Wafaa Gastro-entérologie Pr. FELLAT Ibtissam Cardiologie

Pr. FAROUDY Mamoun Anesthésie Réanimation Pr. GHADOUANE Mohammed* Urologie

Pr. HARMOUCHE Hicham Médecine Interne Pr. HANAFI Sidi Mohamed* Anesthésie Réanimation Pr. IDRISS LAHLOU Amine* Microbiologie

Pr. JROUNDI Laila Radiologie

Pr. KARMOUNI Tariq Urologie

Pr. KILI Amina Pédiatrie

Pr. KISRA Hassan Psychiatrie

Pr. KISRA Mounir Chirurgie – Pédiatrique Pr. LAATIRIS Abdelkader* Pharmacie Galénique Pr. LMIMOUNI Badreddine* Parasitologie

Pr. MANSOURI Hamid* Radiothérapie

Pr. OUANASS Abderrazzak Psychiatrie

Pr. SAFI Soumaya* Endocrinologie

Pr. SEKKAT Fatima Zahra Psychiatrie

Pr. SOUALHI Mouna Pneumo – Phtisiologie

Pr. TELLAL Saida* Biochimie

Pr. ZAHRAOUI Rachida Pneumo – Phtisiologie

Octobre 2007

Pr. ABIDI Khalid Réanimation médicale

Pr. ACHACHI Leila Pneumo phtisiologie

Pr. ACHOUR Abdessamad* Chirurgie générale

Pr. AIT HOUSSA Mahdi* Chirurgie cardio vasculaire Pr. AMHAJJI Larbi* Traumatologie orthopédie

Pr. AMMAR Haddou* ORL

Pr. AOUFI Sarra Parasitologie

Pr. BAITE Abdelouahed* Anesthésie réanimationdirecteur ERSSM Pr. BALOUCH Lhousaine* Biochimie-chimie

Pr. BENZIANE Hamid* Pharmacie clinique Pr. BOUTIMZINE Nourdine Ophtalmologie Pr. CHARKAOUI Naoual* Pharmacie galénique Pr. EHIRCHIOU Abdelkader* Chirurgie générale Pr. ELABSI Mohamed Chirurgie générale Pr. EL MOUSSAOUI Rachid Anesthésie réanimation

Pr. EL OMARI Fatima Psychiatrie

Pr. GANA Rachid Neuro chirurgie

Pr. GHARIB Noureddine Chirurgie plastique et réparatrice Pr. HADADI Khalid* Radiothérapie

Pr. ICHOU Mohamed* Oncologie médicale

Pr. ISMAILI Nadia Dermatologie

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Pr. LALAOUI SALIM Jaafar* Anesthésie réanimation Pr. LOUZI Lhoussain* Microbiologie

Pr. MADANI Naoufel Réanimation médicale

Pr. MAHI Mohamed* Radiologie

Pr. MARC Karima Pneumo phtisiologie

Pr. MASRAR Azlarab Hématologie biologique Pr. MOUTAJ Redouane * Parasitologie

Pr. MRABET Mustapha* Médecine préventive santé publique et hygiène

Pr. MRANI Saad* Virologie

Pr. OUZZIF Ez zohra* Biochimie-chimie Pr. RABHI Monsef* Médecine interne Pr. RADOUANE Bouchaib* Radiologie Pr. SEFFAR Myriame Microbiologie Pr. SEKHSOKH Yessine* Microbiologie

Pr. SIFAT Hassan* Radiothérapie

Pr. TABERKANET Mustafa* Chirurgie vasculaire périphérique

Pr. TACHFOUTI Samira Ophtalmologie

Pr. TAJDINE Mohammed Tariq* Chirurgie générale

Pr. TANANE Mansour* Traumatologie orthopédie Pr. TLIGUI Houssain Parasitologie

Pr. TOUATI Zakia Cardiologie

Décembre 2007

Pr. DOUHAL ABDERRAHMAN Ophtalmologie

Décembre 2008

Pr ZOUBIR Mohamed* Anesthésie Réanimation Pr TAHIRI My El Hassan* Chirurgie Générale

Mars 2009

Pr. ABOUZAHIR Ali* Médecine interne

Pr. AGDR Aomar* Pédiatre

Pr. AIT ALI Abdelmounaim* Chirurgie Générale Pr. AIT BENHADDOU El hachmia Neurologie

Pr. AKHADDAR Ali* Neuro-chirurgie

Pr. ALLALI Nazik Radiologie

Pr. AMAHZOUNE Brahim* Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. AMINE Bouchra Rhumatologie

Pr. ARKHA Yassir Neuro-chirurgie

Pr. AZENDOUR Hicham* Anesthésie Réanimation Pr. BELYAMANI Lahcen* Anesthésie Réanimation

Pr. BJIJOU Younes Anatomie

Pr. BOUHSAIN Sanae* Biochimie-chimie

Pr. BOUI Mohammed* Dermatologie

(13)

Pr. BOUSSOUGA Mostapha* Traumatologie orthopédique Pr. CHAKOUR Mohammed * Hématologie biologique

Pr. CHTATA Hassan Toufik* Chirurgie vasculaire périphérique Pr. DOGHMI Kamal* Hématologie clinique

Pr. EL MALKI Hadj Omar Chirurgie Générale Pr. EL OUENNASS Mostapha* Microbiologie

Pr. ENNIBI Khalid* Médecine interne

Pr. FATHI Khalid Gynécologie obstétrique

Pr. HASSIKOU Hasna * Rhumatologie

Pr. KABBAJ Nawal Gastro-entérologie

Pr. KABIRI Meryem Pédiatrie

Pr. KARBOUBI Lamya Pédiatrie

Pr. L’KASSIMI Hachemi* Microbiologie

Pr. LAMSAOURI Jamal* Chimie Thérapeutique Pr. MARMADE Lahcen Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. MESKINI Toufik Pédiatrie

Pr. MESSAOUDI Nezha * Hématologie biologique Pr. MSSROURI Rahal Chirurgie Générale

Pr. NASSAR Ittimade Radiologie

Pr. OUKERRAJ Latifa Cardiologie

Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani * Pneumo-phtisiologie

Pr. ZOUHAIR Said* Microbiologie

PROFESSEURS AGREGES :

Octobre 2010

Pr. ALILOU Mustapha Anesthésie réanimation Pr. AMEZIANE Taoufiq* Médecine interne Pr. BELAGUID Abdelaziz Physiologie

Pr. BOUAITY Brahim* ORL

Pr. CHADLI Mariama* Microbiologie

Pr. CHEMSI Mohamed* Médecine aéronautique Pr. DAMI Abdellah* Biochimie chimie Pr. DARBI Abdellatif* Radiologie

Pr. DENDANE Mohammed Anouar Chirurgie pédiatrique

Pr. EL HAFIDI Naima Pédiatrie

Pr. EL KHARRAS Abdennasser* Radiologie

Pr. EL MAZOUZ Samir Chirurgie plastique et réparatrice

Pr. EL SAYEGH Hachem Urologie

Pr. ERRABIH Ikram Gastro entérologie Pr. LAMALMI Najat Anatomie pathologique

Pr. LEZREK Mounir Ophtalmologie

Pr. MALIH Mohamed* Pédiatrie

Pr. MOSADIK Ahlam Anesthésie Réanimation Pr. MOUJAHID Mountassir* Chirurgie générale

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Pr. ZOUAIDIA Fouad Anatomie pathologique

Mai 2012

Pr. AMRANI Abdelouahed Chirurgie Pédiatrique Pr. ABOUELALAA Khalil* Anesthésie Réanimation Pr. BELAIZI Mohamed* Psychiatrie

Pr. BENCHEBBA Driss* Traumatologie Orthopédique Pr. DRISSI Mohamed* Anesthésie Réanimation Pr. EL ALAOUI MHAMDI Mouna Chirurgie Générale Pr. EL KHATTABI Abdessadek* Médecine Interne Pr. EL OUAZZANI Hanane* Pneumophtisiologie Pr. ER-RAJI Mounir Chirurgie Pédiatrique Pr. JAHID Ahmed Anatomie pathologique Pr. MEHSSANI Jamal* Psychiatrie

Pr. RAISSOUNI Maha* Cardiologie

Février 2013

Pr. AHID Samir Pharmacologie – Chimie Pr. AIT EL CADI Mina Toxicologie

Pr. AMRANI HANCHI Laila Gastro-Entérologie Pr. AMOUR Mourad Anesthésie Réanimation Pr. AWAB Almahdi Anesthésie Réanimation Pr. BELAYACHI Jihane Réanimation Médicale Pr. BELKHADIR Zakaria Houssain Anesthésie Réanimation Pr. BENCHEKROUN Laila Biochimie-Chimie Pr. BENKIRANE Souad Hématologie biologi

Pr. BENNANA Ahmed* Informatique Pharmaceutique Pr. BENSEFFAJ Nadia Immunologie

Pr. BENSGHIR Mustapha* Anesthésie Réanimation Pr. BENYAHIA Mohammed* Néphrologie

Pr. BOUATIA Mustapha Chimie Analytique

Pr. BOUABID Ahmed Salim* Traumatologie Orthopédie Pr. BOUTARBOUCH Mahjouba Anatomie

Pr. CHAIB Ali* Cardiologie

Pr. DENDANE Tarek Réanimation Médicale

Pr. DINI Nouzha* Pédiatrie

Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Mohamed Ali Anesthésie Réanimation Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Najwa Radiologie

Pr. ELFATEMI Nizare Neuro-Chirurgie Pr. EL GUERROUJ Hasnae Médecine Nucléaire Pr. EL HARTI Jaouad Chimie Thérapeutique Pr. EL JOUDI Rachid* Toxicologie

Pr. EL KABABRI Maria Pédiatrie

Pr. EL KHANNOUSSI Basma Anatomie Pathologie Pr. EL KHLOUFI Samir Anatomie

(15)

Pr. EN-NOUALI Hassane* Radiologie Pr. ERRGUIG Laila Physiologie

Pr. FIKRI Meryim Radiologie

Pr. GHANIMI Zineb Pédiatrie

Pr. GHFIR Imade Médecine Nucléaire

Pr. IMANE Zineb Pédiatrie

Pr. IRAQI Hind Endocrinologie et maladies métaboliques Pr. KABBAJ Hakima Microbiologie

Pr. KADIRI Mohamed* Psychiatrie

Pr. LATIB Rachida Radiologie

Pr. MAAMAR Mouna Fatima Zahra Médecine Interne Pr. MEDDAH Bouchra Pharmacologie Pr. MELHAOUI Adyl Neuro-chirurgie Pr. MRABTI Hind Oncologie Médicale Pr. NEJJARI Rachid Pharmacognosie Pr. OUBEJJA Houda Chirurgie Pédiatrique Pr. OUKABLI Mohamed* Anatomie Pathologique Pr. RAHALI Younes Pharmacie Galénique

Pr. RATBI Ilham Génétique

Pr. RAHMANI Mounia Neurologie

Pr. REDA Karim* Ophtalmologie

Pr. REGRAGUI Wafa Neurologie

Pr. RKAIN Hanan Physiologie

Pr. ROSTOM Samira Rhumatologie

Pr. ROUAS Lamiaa Anatomie Pathologique Pr. ROUIBAA Fedoua* Gastro-Entérologie Pr. SALIHOUN Mouna Gastro-Entérologie

Pr. SAYAH Rochde Chirurgie Cardio-Vasculaire Pr. SEDDIK Hassan* Gastro-Entérologie

Pr. ZERHOUNI Hicham Chirurgie Pédiatrique Pr. ZINE Ali* Traumatologie Orthopédie

Avril 2013

Pr. EL KHATIB Mohamed Karim* Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale Pr. GHOUNDALE Omar* Urologie

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2- ENSEIGNANTS – CHERCHEURS SCIENTIFIQUES

PROFESSEURS / PRs. HABILITES

Pr. ABOUDRAR Saadia Physiologie

Pr. ALAMI OUHABI Naima Biochimie – chimie

Pr. ALAOUI KATIM Pharmacologie

Pr. ALAOUI SLIMANI Lalla Naïma Histologie-Embryologie

Pr. ANSAR M’hammed Chimie Organique et Pharmacie Chimique Pr. BOUHOUCHE Ahmed Génétique Humaine

Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz Applications Pharmaceutiques Pr. BOURJOUANE Mohamed Microbiologie

Pr. BARKYOU Malika Histologie-Embryologie Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia Biochimie – chimie

Pr. DAKKA Taoufiq Physiologie

Pr. DRAOUI Mustapha Chimie Analytique Pr. EL GUESSABI Lahcen Pharmacognosie

Pr. ETTAIB Abdelkader Zootechnie

Pr. FAOUZI Moulay El Abbes Pharmacologie

Pr. HAMZAOUI Laila Biophysique

Pr. HMAMOUCHI Mohamed Chimie Organique Pr. IBRAHIMI Azeddine Biologie moléculaire Pr. KHANFRI Jamal Eddine Biologie

Pr. OULAD BOUYAHYA IDRISSI Med Chimie Organique

Pr. REDHA Ahlam Chimie

Pr. TOUATI Driss Pharmacognosie

Pr. ZAHIDI Ahmed Pharmacologie

Pr. ZELLOU Amina Chimie Organique

Mise à jour le 09/01/2015 par le Service des Ressources Humaines

(17)
(18)

A Allah

Tout puissant

Qui m’a inspiré

Qui m’a guidé dans le bon chemin

Je vous dois ce que je suis devenu

Louanges et remerciements

(19)

A MA MERE

C’est pour moi un jour d’une grande importance, car je sais que tu es à la fois fière et heureuse de voir le fruit de ton éducation et de tes efforts

inlassables se concrétiser.

Aucun mot, aussi expressif qu’il soit, ne saurait remercier à sa juste valeur, l’être qui a consacré sa vie à parfaire mon éducation avec un dévouement

inégal.

C’est grâce à Dieu puis à toi que je suis devenu ce que je suis aujourd’hui. Accepte ce travail comme le témoignage de ma reconnaissance, ma gratitude

et mon profond amour.

Puisse ALLAH m’aider pour rendre un peu soit-il de ce que tu m’as donné. Puisse ALLAH t’accorder santé, bonheur et longue vie.

A MON PERE

Des mots ne pourront jamais exprimer la profondeur de ma gratitude et affection pour tous les sacrifices que tu as fait et la peine que tu t’es donné.

A toi mon père qui a sacrifié sa vie pour mon éducation, mon bonheur et mon bien être.

A toi mon père qui a toujours su être à mon écoute et me comprendre à demi-mot, près de moi à me réconforter au bon moment.

A tes encouragements et tes prières qui m’ont toujours soutenu et guidé. Merci d’être le père idéal. Merci d’être le premier enseignant.

J’implore DIEU qu’il te procure santé. Pour que plus jamais le chagrin ne pénètre ton cœur, car j’aurais encore et à toujours besoin de ton amour.

(20)

A MES FRERES YOUNES ET ZAKARIA

Je ne peux exprimer à travers ses lignes tous mes sentiments d’amour et de tendresse envers vous. Puisse l’amour et la fraternité nous unissent à jamais.

Je vous souhaite la réussite dans vos vies familiales et professionnelles, avec tout le bonheur qu’il faut pour vous combler. Je remercie Dieu de vous avoir comme frères.

A LA MEMOIRE DE FEU MES GRANDS-PARENTS

Je prie le Grand Dieu pour qu’il ait pitié de leurs âmes et de celles de tous les croyants.

A TOUTE MA FAMILLE

Qu’Allah nous aide à maintenir l’union et la solidarité dans chaque famille.

A MOHAMMED ALAE TOUZANI

Depuis que je t’ai rencontré, tu as toujours su m’encourager, me pousser à donner le meilleur de moi-même. Tu as toujours cru en moi même quand j’ai eu des moments de doute. Tu as été d’une aide inestimable dans l’élaboration de ce travail… Je ne te remercierai jamais assez…

A WALAA SAAIDI, , MERIEM MAKHCHOUNE, RACHIDI

NEZHA, MORCHIDE SARA, KAWTAR BAHBAH, HIDKI FATINE,

TASSOUIKET SARA, MESKINI TOURIA

Mes amies, vous étiez toujours là, à mes cotés, et vous le resterez inchaallah, je vous remercie pour tous les moments de joie et de fête que nous avons partagé. Je vous dédie ce travail spécialement en guise de symbole des forts sentiments amicaux qui nous lient, et au nom de la très longue amitié que nous contractons je vous exprime mes remerciements et la sincérité de mes affections.

(21)

A MES TRES CHERS AMIS

Souhail Dahraoui, Sanaa El Hajoui, Nada Benjelloun, Fatima-Zahra Bandadi, Hind Ouhaddouch, Lina Abdellatifi, Sanae Lanjri, Chaimae Raiss, Mustapha Chachi, Younes Sallate, Youness Mechaal, Amina Biallaten, Zineb Aliat, Lamyae Yachi, Hajar Benhadou.

Vous êtes pour moi plus que des amis, vous êtes des frères et soeurs que j’aime, que je respecte et surtout que j’apprécie. Merci pour votre soutien et votre amitié. Merci pour tout ce que vous avez fait pour moi.

A TOUTE L’EQUIPE D’HEMATOLOGIE AVICENNES

A TOUTE L’EQUIPE DE BACTERIOLOGIE HMIMV

A TOUS LES MEMBRES DE L’APIRR

(22)
(23)

A MON CHER MAITRE ET PRESIDENT DE THESE

Mr ZOUHDI MIMOUN

PROFESSEUR DE MICROBIOLOGIE

CHEF DE SERVICE DE BACTERIOLOGIE

HÔPITAL IBN SINA

Pour plusieurs générations d’étudiants de notre

faculté, votre nom est synonyme de compétence,

simplicité, excellence et désir de mettre à la portée

de vos disciples, un enseignement simple, efficace

et complet.

Nous sommes très honorés par l’accueil que

vous nous avez réservé à votre service, où la

formation est d’une qualité rare, et nous vous

demeurerons infiniment redevables.

Nous ne trouvons pas les mots pour vous

remercier du grand privilège que vous nous faites

en acceptant de présider le jury de notre thèse.

Nous

vous

donnerons

toujours

comme

exemple, faute de ne pouvoir l’être suffisamment,

pour nos enfants, que Dieu vous garde.

(24)

A MON MAITRE ET DIRECTEUR DE THESE

Mme CHADLI MARIAMA

PROFESSEUR DE MICROBIOLOGIE

SERVICE DE BACTERIOLOGIE

HMIMV

Plus d’une fois j’ai eu à admirer votre sagesse,

tendresse et simplicité, et ce depuis le premier

jour, votre rigueur et compétence constitue pour

n’importe quel biologiste un idéal, le moteur qui

nous anime.

Permettez moi de vous assurer ma sincère

gratitude et haute considération, cela a été pour

moi un grand honneur de bénéficier de vos

précieuses directives qui m’ont permis de mener à

bien ce travail que vous m’avez confiée, je ne

saurais suffisamment vous remercier.

(25)

A NOTRE MAITRE ET JUGE DE THESE

Mr. AMEUR Ahmed

PROFESSEUR D’UROLOGIE

CHEF DE SERVICE D’UROLOGIE

HMIMV

C’est pour nous un immense privilège de vous voir

accepter de juger ce travail.

Veuillez croire cher maître à notre très haute

considération et notre profond respect.

(26)

A NOTRE MAITRE ET JUGE DE THESE

Mr SEKHSOKH YASSINE

PROFESSEUR DE MICROBIOLOGIE

HMIMV

Nous avons le privilège et l'honneur de vous avoir

parmi les membres de notre jury.

Veuillez accepter nos remerciements et notre

admiration pour vos qualités d'enseignant et votre

(27)

A NOTRE MAITRE ET JUGE DE THESE

Mme TELLAL SAIDA

PROFESSEUR DE BIOCHIMIE

HMIMV

Nous sommes très sensibles à l’honneur que vous

nous faites en acceptant de juger ce travail.

Veuillez accepter, maître, l’expression de notre

(28)

Table des matières

INTRODUCTION ... 1

PARTIE 1 : ETUDE THEORIQUE

I- RAPPEL ANATOMIQUE DE L’APPAREIL URINAIRE ... 4

II- DEFINITIONS ... 5

A- Infection urinaire ... 10

1- Infections urinaires simples ... 10

2- Infections à risque de complications ... 11

3- Infections urinaires graves ... 11

B- Infections urinaires masculines ... 12

C- Infections urinaires nosocomiales (IUN ... 12

D- Colonisation ou bactériurie asymptomatique ... 13

III- PHYSIOPATHOLOGIE ... 14

A- Défenses naturelles ... 16

B- Origine de l’infection ... 16

C- Transmission ... 18

1- Infection communautaire ... 19

2- Infection nosocomiale ... 20

D- Facteurs favorisants la prolifération bactérienne ... 23

E- Facteurs de risque des IUN ... 24

1- Facteurs intrinsèques ... 25

(29)

2- Facteurs extrinsèques ... 26

IV- SYMPTOMATOLOGIE CLINIQUE CHEZ L’HOMME ... 30

A- Prostatites aiguës ... 31

B- Prostatites chroniques (PC) bactériennes récidivantes .... 33

C- Syndrome douloureux pelvien (SDP) et vésical (SDV) ... 34

D- Pyélonéphrite aigue ... 34

V- DIAGNOSTIC D’UNE IU OU COLONISATION URINAIRE ... 36

A- Diagnostic clinique ... 36

B- Dépistage ... 39

C- Examen cytobactériologique des urines ... 43

1- Prélèvement des urines ... 44

2- Conservation et transport des urines ... 46

3- Réalisation de l’ECBU ... 47

3-1. Examen direct ... 47

a- Examen macroscopique ... 47

b- Examen microscopique... 47

3-2. Uro-culture. ... 50

a- Milieux non chromogènes. ... 50

b- Milieu chromogènes ... 52

4- Identification ... 53

5- Antibiogramme ... 54

6- Interprétation des résultats ... 55

a- Leucocyturie. ... 55

b- Bactériurie ... 56

(30)

c- Antibiogramme ... 62

PARTIE 2 : ETUDE PRATIQUE

MATERIEL ET METHODES.. ... 65

I- PRESENTATION DE L’ETUDE. ... 65

II- CRITERES D’INCLUSION ... 65

III- CRITERES D’EXCLUSION ... 66

IV- RECUEIL DES DONNEES ... 66

V- LES TECHNIQUES DE DIAGNOSTIC UTILISEES... 67

A- Le test à la bandelette urinaire (BU) ... 67

1- Indications de la BU dans le diagnostic d'IU ... 67

2- Conditions de prélèvement ... 68

3- Interprétation ... 68

4- Performances diagnostiques de la BU ... 69

B- Examen cytobactériologique des urines (ECBU) ... 69

1- Conditions de prélèvement ... 69

2- Conditions de transport et de conservation ... 70

3- Examen macroscopique ... 70

4- Examen microscopique ... 71

5- Mise en culture ... 71

6- Distinction entre infection et colonisation ... 72

7- Identification et antibiogramme ... 72

RESULTATS. ... 74

I- Difficultés et limites de l’étude ... 74

II- Taux d’incidence. ... 74

(31)

III- Fréquence des infections urinaires nosocomiales.. ... 74

IV- Résultats des bandelettes réactives.. ... 75

V- Caractéristiques de la population étudiée... ... 76

A- L’âge.. ... 76

B- Les antécédents.. ... 79

C- Le motif d’hospitalisation.. ... 80

D- Le sondage vésical.. ... 81

E- La durée de séjour. ... 81

F- Les interventions.. ... 82

G- L’antibiothérapie.. ... 83

VI- Profil bactériologique des isolats.. ... 84

A- Fréquence des différents types de germes.. ... 84

B- Profil de résistance des isolats.. ... 88

1- Entérobactéries. ... 88

1.1- Escherichia coli... ... 88

1.2- Klebsiella pneumoniae.. ... 90

1.3- Klebsiella oxytoca.. ... 92

1.4- Enterobacer cloacae.. ... 94

1.5- Proteus mirabilis. ... 96

2- Cocci à gram positif (CGP). ... 98

2.1- Genre streptococcus.. ... 98

2.2- Genre staphylococcus. ... 102

3- Bacilles à gram négatif non fermentants.. ... 106

VII- Phénotypes de résistance des entérobactéries. ... 111

A- Répartition globale. ... 111

(32)

B- Fréquence des bactéries selon le phénotype

de résistance. ... 113

C- Fréquence des entérobactéries BLSE. ... 113

D- Entérobactéries productrices de carbapénémases. ... 114

DISCUSSION.. ... 115

I- Analyse et discussion des résultats. ... 115

A- Taux d’incidence. ... 115

B- Répartition des infections et colonisations urinaires

masculines. ... 116

C- Fréquence des infections urinaires nosocomiales. ... 116

D- Bandelette urinaire. ... 117

E- Facteurs de risque. ... 117

F- Profil bactériologique des isolats. ... 124

1. Fréquence des différents types de germes... 124

2. Répartition en fonction des tranches d’âge... 128

3. Profil de résistance des différents isolats... 129

G- Phénotypes de résistance des entérobactéries. ... 144

II- TRAITEMENT ET RECOMMENDATIONS. ... 148

A- Traitement des IU. ... 148

1. Traitement médical. ... 148

a) Traitement probabiliste. ... 149

b) Traitement documenté. ... 152

c) Durée du traitement antibiotique. ... 154

2. Traitement urologique. ... 155

3. Suivi ... 155

(33)

B- Faut-il traiter certains patients asymptomatiques ayant

une colonisation urinaire ? ... 158

C- Recommandations ... 160

CONCLUSION ... 163

RESUME. ... 165

BIBLIOGRAPHIE ... 169

WEBOGRAPHIE ... 184

(34)

ABREVIATIONS

AFSSAPS : Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé AFU : Association française d’urologie

AK : Amikacine

AMC : Amoxicilline+ Acide clavulanique AMX : Amoxicilline

ATM : Aztréonam

BGN : Bacille à gram négatif

BLSE : Β Lactamase à spectre Etendu BU : Bandelette urinaire

C : Chloramphénicol

CASFM : Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie CAZ : Ceftazidime

CBN : Céphalosporinase Bas Niveau CGP : Cocci à gram positif

CI : Cystite interstitielle CIP : Ciprofloxacine

CMI : Concentration minimale inhibitrice CRO : Ceftriaxone

CRP : Protéine C réactive CT : Colistine

E : Erythromycine

EBLSE : Entérobactérie productrice de β-lactamase à spectre étendu ECBU : Examen cytobactériologique des urines

E COLI : Escherichia coli ETP : Ertapenème

(35)

FD : Acide Fusidique FEP : Céfépime FOS : Fosfomycine FOX : Céfoxitine GN : Gentamicine

HBP : Hypertrophie bénigne de la prostate

HMIMV : Hôpital Militaire d’Instruction Mohammed V IHC : Insuffisance hépatocellulaire

IMP : Imipenème IU : Infection urinaire

IUC : Infection urinaire communautaire IUN : Infection urinaire nosocomiale IRC : Insuffisance rénale chronique K : Kanamycine KF : Céfalotine LEV : Lévofloxacine MXF : Moxifloxacine MY : Lincomycine NA : Acide nalidixique NET : Netilmicine NLPC : Néphro-lithotomie percutanée NOR : Norfloxacine OX : Oxacilline

PBN : Pénicillinase Bas Niveau PEF : Péfloxacine

PHN : Pénicillinase Haut Niveau PNA : Pyélonéphrite aigue PRL : Pipéracilline

(36)

PSA : Antigène spécifique de la prostate PT : Pristinamycine

RD : Rifampicine

RTUP : Résection trans-urétrale de la prostate RTUV : Résection trans-urétrale de la vessie SDP : Syndrome douloureux pelvien

SDV : syndrome douloureux vésical

SF2H : Société Française d’Hygiène Hospitalière

SPILF : Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française SXT : Sulfaméthoxazole+Trimétoprime (Cotrimoxazole) TCC : Ticarcilline + acide clavulanique

TEC : Teicoplanine TE : Tétracycline TIC : Ticarcilline TOB : Tobramycine

TZP : Pipéracilline + Tazobactam UFC : Unité formant colonie VA : Vancomycine

VPN : Valeur prédictive négative VPP : Valeur prédictive positive

(37)

Liste des figures

Figure 1: Système Urinaire chez l’homme et la femme

Figure 2 : Appareil génito-urinaire de l’homme vu de profil. Figure 3 : Appareil génito-urinaire de l’homme vu de face

Figure 4 : Schéma d’une sonde vésicale avec les portes d’entrées possibles des micro-organismes.

Figure 5 : Réglette d’échelles colorimétrique Figure 6 : Bandelette urinaire réactive

Figure 7 : Bandelette urinaire positive pour nitrite et leucocyte.

Figure 8 : Leucocytes et globules rouges sur cellule de Malassez observés au grossissement x400

Figure 9 : Coloration de Gram sur culot de centrifugation observé au grossissement x1000

Figure 10 : Aspect du milieu BCP avant utilisation et après culture Figure 11: Aspect du milieu CLED avant utilisation et après culture

Figure 12: Aspect du milieu Mac Conkey avant utilisation et après culture Figure 13 : Milieu de culture chromogène

Figure 14 : Galerie API 20E d’E coli

Figure 15 : Estimation de la numération bactérienne sur ensemencement urinaire

(38)

Figure 17: Répartition des patients ayant contracté une IU en fonction de la tranche d’âge

Figure 18 : Répartition des colonisations urinaires en fonction de la tranche d’âge

Figure 19 : Répartition des infections et colonisations urinaires en fonction de la tranche d’âge

Figure 20 : Répartition des antécédents recensés au cours de notre étude Figure 21 : Répartition des patients en fonction du motif d’hospitalisation Figure 22 : Répartition des patients selon le type d’intervention

Figure 23 : Fréquence globale des germes urinaires

Figure 24 : Répartition des germes isolés dans notre étude

Figure 25 : Répartition des germes isolés en fonction des tranches d’âge Figure 26 : Sensibilité des isolats d’Escherichia coli aux antibiotiques Figure 27: Profil de Sensibilité des isolats de Klebsiella pneumoniae Figure 28 : Profil de Sensibilité des isolats de Klebsiella oxytoca Figure 29 : Profil de Sensibilité des isolats d’Enterobacter cloacae Figure 30 : Profil de Sensibilité des isolats de Proteus mirabilis Figure 31 : Répartition des streptocoques selon les espèces Figure 32 : Profil de sensibilité d’Entérococcus spp

Figure 33 : Profil de sensibilité du streptococcus agalactiae

(39)

Figure 35 : Antibiorésistance du Staphylocoques coagulase-négatifs

Figure 36 : Répartition des bacilles à gram négatif non fermentant selon l’espèce

Figure 37 : Profil de sensibilité des souches de Pseudomonas aeruginosa Figure 38 : Antibiorésistance des isolats d’Acinetobacter baumanii Figure 39 : Phénotypes de résistance chez les entérobactéries

Figure 40 : Fréquence des EBLSE selon les espèces Bactériennes

Figure 41 : Fréquence des entérobactéries productrices de carbapénèmases selon l’espèce bactérienne

Figure 42: Comparaison de l’antibiorésistance d’Escherichia coli entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 43 : Comparaison de l’antibiorésistance de K. pneumoniae entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 44 : Comparaison de l’antibiorésistance de K. oxytoca entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 45 : Comparaison de l’antibiorésistance d’Enterobacter cloacae entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 46 : Comparaison de l’antibiorésistance de Proteus mirabilis entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 47 : Comparaison de l’antibiorésistance de Pseudomonas aeruginosa entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 48 : Comparaison de l’antibiorésistance d’Acinetobacter baumannii entre notre étude et celle réalisée en 2013

(40)

Figure 49 : Comparaison de l’antibiorésistance d’Enterococcus faecalis entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 50 : Comparaison de l’antibiorésistance du Staphylococcus coagulase négative entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 51: Comparaison des phénotypes de résistance des entérobactéries entre notre étude et celle réalisée en 2013

Figure 52: Arbre décisionnel de la prise en charge d’une infection urinaire masculine

(41)

Liste des tableaux

Tableau I : Les seuils de bactériurie considérés comme significatifs pour les espèces bactériennes les plus courantes

Tableau II : Principales situations cliniques et cytobactériologiques des IUC Tableau III : Principales situations cliniques et cytobactériologiques des IUN Tableau IV : Critères de catégorisation selon les valeurs critiques

Tableau V : Comparaison des résultats des bandelettes et des ECBU

Tableau VI : Répartition des patients ayant contracté une IU en fonction des tranches d’âge

Tableau VII : Répartition des colonisations urinaires en fonction des tranches d’âge

Tableau VIII : Répartition des antécédents recensés au cours de notre étude Tableau IX : Répartition des patients selon le motif d’hospitalisation

Tableau X : Répartition des patients selon le type d’intervention Tableau XI : Molécules d’antibiotiques utilisées

Tableau XII : Répartition des différents germes isolés dans notre étude

Tableau XIII : Répartition des germes isolés chez les hommes selon la tranche d’âge

Tableau XIV : Sensibilité d’Escherichia coli aux antibiotiques

Tableau XV : Profil de sensibilité de Klebsiella pneumoniae aux antibiotiques Tableau XVI : Profil de sensibilité de Klebsiella oxytoca aux antibiotiques

(42)

Tableau XVII : Profil de sensibilité de l’Enterobacter cloacae aux antibiotiques Tableau XVIII : Profil de sensibilité de Proteus mirabilis aux antibiotiques Tableau XIX : Répartition des streptocoques selon l’espèce

Tableau XX : Profil de sensibilité d’Entérococcus spp

Tableau XXI : Profil de sensibilité des isolats du streptocoque agalactiae Tableau XXII : Répartition des staphylocoques selon l’espèce

Tableau XXIII : Profil de sensibilité du Staphylocoques coagulase-négatifs

Tableau XXIV : Répartition des bacilles à gram négatif non fermentant selon l’espèce

Tableau XXV : Profil de sensibilité de Pseudomonas aeruginosa

Tableau XXVI : Antibiorésistance des isolats d’Acinetobacter baumanii

Tableau XXVII : Répartition des phénotypes de résistance chez les entérobactéries

Tableau XXVIII : Fréquence des bactéries isolées selon les phénotypes de résistance

Tableau XXIX : Fréquence des EBLSE selon les espèces

Tableau XXX : Comparaison des profils bactériologiques des IUM

Tableau XXXI : Antibiorésistance des isolats d’E. coli selon différentes études Tableau XXXII : Traitement probabiliste d’une IUM sans signe de gravité Tableau XXXIII : Traitement probabiliste d’une IUM avec signes de gravité Tableau XXXIV : Traitement de l’IUM après obtention de l’antibiogramme

(43)

1

(44)

2

Les infections urinaires (IU) se placent au 2ème rang

des infections bactériennes communautaires, après les

infections de l’appareil respiratoire, et au 1er rang des

infections associées aux soins, représentant 40% d’entre elles.[1]

[2]

Les infections urinaires sont remarquables par leurs variétés

cliniques liées aux différents sites topographiques de l’infection.

La prise en charge diagnostique et thérapeutique de l’infection

urinaire est un problème de santé publique. [3][4]

Du fait des particularités anatomiques de l’appareil

uro-génital masculin et d’une épidémiologie plus diverse et associée à

des taux de résistance accrus, les infections urinaires masculines

(IUM) ont longtemps été intégrées au seul cadre nosologique des

prostatites aigues (≪ Toute infection urinaire masculine doit être

gérée comme une prostatite ≫).

Du fait d’un manque de données, les recommandations

étaient alors largement calquées sur celles des IU compliquées de

la femme, et seules les modalités de traitement différaient. Des

données récentes de la littérature permettent désormais de

considérer avec plus de précision la diversité des IUM et leurs

spécificités. [5]

Les infections urinaires chez l’homme sont généralement

considérées comme compliquées ou à risque de complication en

raison des facteurs urologiques associés fréquents et de

l’implication de la prostate comme organe parenchymateux. Si les

(45)

3

infections urinaires sont rares chez les hommes jeunes et en

bonne santé, la prévalence d’une bactériurie et l’incidence

d’infections symptomatiques augmentent chez l’homme âgé. [6]

Et pour bien élucider ce concept, nous avons entrepris une

étude prospective sur les infections et les colonisations urinaires

masculines en urologie en collaboration avec le service de

bactériologie de l’hôpital militaire d’instruction Mohamed V sur

une période de six mois (Novembre 2014-Avril 2015), et a pour

objectifs de :

Evaluer l’incidence des bactériuries masculines dans le

service d’urologie.

Déterminer les principaux facteurs de risque de l’IU et de

la colonisation urinaire masculine.

Déterminer la fréquence des différentes bactéries

uropathogènes isolées chez l’homme.

Etudier la résistance aux antibiotiques des principales

bactéries isolées ainsi que leurs phénotypes de résistance.

(46)

4

Xàâwx

(47)

5

I)

RAPPEL ANATOMIQUE DE L’APPAREIL

URINAIRE

:

L'appareil urinaire se compose des reins, des uretères, d’une vessie, d’un urètre, d'un méat urinaire et d’une prostate.

Le rôle des reins est de filtrer le sang et d’en retirer les déchets azotés (urée et autres) et les substances en surplus comme l'eau et les sels minéraux. Les substances recueillies formeront l'urine qui sera évacuée. Cette urine est acheminée par les uretères jusqu'à la vessie, une poche retenant l'urine, ensuite rejetée à l'extérieur de l'organisme lors de la miction par l'urètre s'abouchant au méat urinaire. [4]

L’urètre sert aussi de passage au sperme. Chez l'homme, il est long d'environ 16 centimètres. Il comporte trois segments: l'urètre prostatique, l'urètre membraneux et l'urètre spongieux. [14]

La prostate est une glande qui entoure la portion initiale de l'urètre masculin. Située sous la vessie, derrière la symphyse pubienne, en avant du rectum, elle est traversée par l'urètre et les canaux déférents. Au moment de l'éjaculation, la prostate se contracte et comprime les canaux déférents. Ce qui aide à pousser le sperme dans l'urètre.

(48)

Figure 1 : Système Urinaire chez l’homme et la femme

Pour des raisons anatomiques, l'IU est plus fréquente chez la femme. En effet, chez la femme, le méat urinaire court est proche du vagin et de l'anus où sont toujours présentes des bactéries.

Ces bactéries peuvent remonter le long de l'urètre vers la vessie et proliférer dans l'urine. Un défaut d'hygiène locale peut donc favoriser les IU de la femme.

L’homme est relativement protégé des IU par la distance qui sépare l'anus de son méat urétral, un environneme

activité antibactérienne des sécrétions prostatiques.

longueur de l'urètre masculin est en moyenne de 16 cm, alors que celle de l'urètre féminin est de

3-présence d'une anomalie

6

Système Urinaire chez l’homme et la femme

Pour des raisons anatomiques, l'IU est plus fréquente chez la femme. En effet, chez la femme, le méat urinaire court est proche du vagin et de l'anus où sont toujours présentes des bactéries. [15]

euvent remonter le long de l'urètre vers la vessie et proliférer dans l'urine. Un défaut d'hygiène locale peut donc favoriser les IU de la

L’homme est relativement protégé des IU par la distance qui sépare l'anus de , un environnement plus sec à l’ouverture urétrale, et une activité antibactérienne des sécrétions prostatiques. [16] On note aussi que la longueur de l'urètre masculin est en moyenne de 16 cm, alors que celle de -4 cm. Ainsi, l'IU masculine traduit le plus souvent la présence d'une anomalie des voies urinaires, en particulier l'existence d'un

Système Urinaire chez l’homme et la femme

Pour des raisons anatomiques, l'IU est plus fréquente chez la femme. En effet, chez la femme, le méat urinaire court est proche du vagin et de l'anus

euvent remonter le long de l'urètre vers la vessie et proliférer dans l'urine. Un défaut d'hygiène locale peut donc favoriser les IU de la

L’homme est relativement protégé des IU par la distance qui sépare l'anus de nt plus sec à l’ouverture urétrale, et une On note aussi que la longueur de l'urètre masculin est en moyenne de 16 cm, alors que celle de it le plus souvent la des voies urinaires, en particulier l'existence d'un

(49)

adénome de la prostate urinaire intra-vésicale).

Figure 2: Appareil génito

7

ou une sténose urétrale (qui provoque

Appareil génito-urinaire de l’homme vu de profil

(qui provoquent une stase

(50)

Figure 3 : Appareil génito

8

(51)

9

 Caractéristiques de l’urine :

Couleur : liquide jaune clair à jaune foncé, la couleur jaune étant due à l’urochrome, pigment résultant de la transformation de la bilirubine. L’intensité de la couleur est proportionnelle à la concentration de l’urine. pH : le pH physiologique de l’urine est d’environ 6, mais il peut varier entre 4,5 et 8 en fonction du métabolisme et du régime alimentaire.

Composition chimique : l’urine est composée de 95% d’eau et de 5% de solutés : l’urée (issue du catabolisme des protéines), les électrolytes (sodium, potassium, bicarbonates, sulfates), la créatinine (métabolite de la créatine phosphate), l’acide urique (produit final du métabolisme des acides nucléiques), l’ammoniaque et des toxines exogènes.

L’urine ne contient normalement pas de protéines, ni de glucides ou de lipides et la présence de ces substances dans l’urine peut traduire un état pathologique. Il est important de souligner que l'urine est, chez le sujet sain, stérile.

(52)

10

II) DEFINITIONS :

A- Infections urinaires :

Une infection urinaire correspond à l’agression d’un tissu par un (ou plusieurs) microorganismes, générant une réponse inflammatoire et des symptômes de nature et d’intensité variable selon le terrain. Elle associe :

• au moins un des signes suivants : fièvre, impériosité mictionnelle, pollakiurie, brûlures mictionnelles ou douleur sus-pubienne, en l’absence d’autres causes infectieuses ou non;

• à une uro-culture positive. [17] [18]

Les facteurs favorisant la survenue des infections urinaires : -Sexe féminin

-Grossesse

-Activité sexuelle

-Utilisation de spermicides

-Troubles du comportement mictionnel (mictions rares, retenues, incomplètes)

-Diabète déséquilibré et /ou compliqué (neuropathie vésicale) -Anomalie organique ou fonctionnelle du tractus urinaire. [11]

Dans les recommandations de 2014, les termes d’IU basses, hautes ou compliquées sont désormais abandonnés ainsi que ceux d’IU primitive ou secondaire. Le type de bactérie isolée n’intervient pas dans la classification de l’infection urinaire. Les définitions actuellement proposées dans la littérature séparent deux entités : [5]

(53)

11

1. Infections urinaires simples :

Ce sont des IU survenant chez des patients ne présentant pas de facteurs de risque de complication. En pratique, elles ne concernent que la femme sans terrain particulier et sans co-morbidités.

Les IU simples comprennent :

 Les cystites aiguës simples

 Les pyélonéphrites aiguës simples 2. Infections à risque de complication :

Selon les dernières recommandations 2014 de la SPILF, les IU à risque de complication remplacent le terme d’IU compliquée. [5] Ce sont des IU survenant chez des patients ayant au moins un facteur de risque pouvant rendre l’infection plus grave et le traitement plus complexe.

Ces facteurs de risque de complication sont :

• Le sexe masculin, du fait de la fréquence des anomalies anatomiques ou fonctionnelles sous-jacentes.

• Toute anomalie organique ou fonctionnelle de l'arbre urinaire, quelle qu’elle soit (résidu vésical, reflux, lithiase, tumeur, acte récent …).

• La grossesse.

• L'âge : patient de plus de 65 ans avec au moins 3 critères de fragilité ou plus (critères de Fried : perte de poids involontaire au cours de la dernière année, vitesse de marche lente, faible endurance, faiblesse/fatigue, activité physique réduite), ou patient de plus de 75 ans.

• Immunodépression grave

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Le diabète, même insulino-requérant, n’est plus considéré comme un facteur de risque de complications. En effet, bien que les IU soient plus fréquentes chez les patients diabétiques, la plupart des études ne mettent pas en évidence de pronostic plus défavorable des IU chez les patients diabétiques comparés aux patients non-diabétiques.

Les IU compliquées regroupent :  Les cystites compliquées

 Les pyélonéphrites compliquées  Les prostatites

3. Infections urinaires graves :

Les infections urinaires graves sont les pyélonéphrites aiguës (PNA) et les infections urinaires masculines associées à :

• un sepsis grave

• un choc septique

• une indication de drainage chirurgical ou interventionnel (risque d'aggravation du sepsis en péri-opératoire). [19]

B- Infections urinaires masculines :

Les IUM sont très hétérogènes, des formes peu symptomatiques sans fièvre jusqu'au choc septique. Cette diversité justifie de moduler la prise en charge initiale en fonction des signes cliniques. Cependant, aucun test diagnostique non invasif ne permet d'écarter une infection prostatique, qui doit donc être prise en compte dans la prise en charge ultérieure (choix des antibiotiques, durée du traitement, bilan urologique).

Ainsi, les données expérimentales, cliniques et radiologiques incitent à penser que les infections urinaires masculines s’accompagnent d’une prostatite dans plus de 90% des cas. Aucun moyen diagnostic non

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invasif ne permettant d’exclure cette atteinte, les différentes sociétés savantes s’accordent à dire que les infections urinaires masculines doivent être considérées comme associées à une extension prostatique de l’infection. [1] [20]

Les principales complications des infections urinaires masculines sont :

• la rétention d'urines (parfois révélatrice) ;

• l'épididymite aiguë associée (par voie déférentielle) ;

• l'abcès prostatique à suspecter devant des signes infectieux persistant malgré 48 heures d'antibiothérapie efficace et l'existence au toucher rectale d'une zone fluctuante très douloureuse ;

• le sepsis grave, voire le choc septique, mettant en jeu le pronostic vital du patient ;

• Et enfin, le passage à la chronicité. C- Infection urinaire nosocomiale :

Une infection urinaire est dite nosocomiale lorsqu’elle n'était ni présente ni en cours d'incubation à l’admission du patient dans une structure de soins dans les 48 heures. Si l’état infectieux du patient à l’admission n'est pas connu, l’infection est habituellement considérée comme nosocomiale si elle survient après un délai de 48 heures d'hospitalisation.

L’origine des bactéries nosocomiales est endogène (flore du patient) dans les deux tiers des cas, ou exogène.

Le délai de 48 heures correspond à la durée d’incubation de la plupart des infections aigues liées à une bactérie à croissance rapide. [21] [22]

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Ce délai de 48 heures peut cependant être réduit chez les patients porteurs de sonde vésicale, de la possibilité d’une contamination dès l’insertion et de la vitesse de développement de la bactériurie qui peut atteindre un seuil significatif (>105UFC/mL) en 24-48 heures à partir d’une bactériurie initiale

à peine détectable située entre 1 et 99 UFC/mL. [23]

Elles surviennent majoritairement chez des patients porteurs d’un cathéter urinaire. [24] La présence d’un cathéter urinaire contribue également à pérenniser l’infection : urothélium endommagé par la sonde urinaire, formation de biofilm bactérien à la surface de la sonde, Enfin, chez le patient sondé, la vidange vésicale n’est pas complète, et le résidu urinaire permanent favorise la multiplication bactérienne . [2]

Plus rarement, les infections urinaires nosocomiales surviennent après un geste invasif sur les voies urinaires (cystoscopie, geste chirurgical). Dans 20% des infections urinaires nosocomiales, aucun facteur favorisant évident n’est retrouvé. [2] [24]

D- Colonisation ou bactériurie asymptomatique :

La colonisation urinaire ou bactériurie asymptomatique est la présence d’un micro-organisme (ou de plusieurs micro-organismes) dans l’arbre urinaire sans manifestations cliniques associées. Il n’y a pas de seuil de bactériurie, sauf chez la femme enceinte, où un seuil de bactériurie ≥105 UFC /mL est

classiquement retenu. La leucocyturie n’intervient pas dans la définition. [5] [17]

La prévalence de la colonisation urinaire varie en fonction du sexe, de l’âge et de l’existence ou non d’une anomalie urologique sous-jacente. Chez l’homme jeune, la colonisation urinaire est rare ; elle augmente après 60 ans. En effet, la prévalence rapportée par une étude canadienne peut aller jusqu’à 40% des hommes âgés vivant en institution. [25] Contrairement à la femme,

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la prévalence serait la même chez le patient diabétique et non diabétique. Dans les deux sexes, la prévalence est plus élevée chez les personnes âgées (15 à 50 % des personnes). [25] [26]

Dans le cas particulier des personnes porteuses d’une sonde urinaire à demeure on estime que l’incidence journalière de la bactériurie sur sonde varie de 3% à10% avec un risque cumulé de 100% après 1mois de sondage. [27] Deux situations seulement justifient le dépistage et le traitement des colonisations urinaires:

-Avant une procédure invasive programmée sur les voies urinaires ; -Chez la femme enceinte à partir du 4e mois.

Il est recommandé de ne pas dépister ni traiter les colonisations urinaires chez la femme en dehors de la grossesse et chez l’homme. En effet, les colonisations urinaires évoluent très rarement vers des IU, et n’y a pas de conséquences à long terme sur la fonction rénale. [28]

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III) PHYSIOPATHOLOGIE :

L’arbre urinaire est normalement stérile, à l’exception de la partie distale de l’urètre qui comprend une flore diverse, à la fois la flore digestive (entérobactéries, streptocoques, anaérobies), la flore cutanée (staphylocoques à coagulase négative, Corynébactéries) et la flore génitale (lactobacilles chez la femme). [29]

Les infections urinaires masculines sont favorisées par l'existence d'un obstacle sous-urétral responsable d'une mauvaise vidange vésicale : hyperplasie bénigne de prostate (HBP), cancer de la prostate ou sténose urétrale.

Elles peuvent également être d'origine vénérienne dans le cadre d'une infection génitale chez l'homme ou iatrogène après biopsies de prostate.

A- Défenses naturelles :

De nombreux mécanismes physiologiques de défense limitent le risque d'infection Urinaire à l’exception de la partie distale de l’urètre, colonisée par des germes de la flore cutanée, digestive, et vaginale chez les femmes, l’appareil urinaire est normalement stérile.

La longueur de l’urètre est un premier mécanisme de défense, expliquant l’incidence nettement plus faible des infections urinaires chez les hommes. Le rinçage mécanique de l’urètre lors des mictions et des éjaculations est également un moyen naturel de protection.

En cas de colonisation bactérienne, 3 facteurs concourent à éviter l’invasion de la muqueuse vésicale: [7]

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•La protéine de Tamm-Horsfall présente chez l'homme dans la branche large ascendante de l'anse de Henlé et la partie proximale du tube contourné distal et certains oligosaccharides, agissent comme des récepteurs solubles pour les bactéries et favorisent ainsi leur clairance urinaire. [30] Malgré tout, si une bactérie réussit à coloniser la muqueuse vésicale, l’intégrité de celle-ci doit empêcher l’invasion tissulaire.

•Les inhibiteurs de l’adhésion bactérienne sont présents à la surface de l’urothélium.

•Des phénomènes de bactéricidie locale, de mécanisme inconnu, et d’exfoliation des cellules urothéliales infectées, contribuant aussi à la lutte antibactérienne naturelle. [31]

L’invasion bactérienne vers les reins est limitée par le sphincter vésico-urétéral, ainsi que le flux permanent de l’urine pyélique.

Chez l’homme, la prostate participe également aux mécanismes de défense, en sécrétant certaines substances ayant un effet antibactérien . [29]

Les infections urinaires résultent d’un déséquilibre entre ces défenses naturelles et la virulence de la souche bactérienne.

Il en ressort donc que, la survenue d’une IU implique : [7] soit une absence des défenses de l’hôte, qui correspond aux IU « compliquées », c’est-à-dire favorisées par une anomalie fonctionnelle ou organique de l’arbre urinaire ou un terrain particulier, soit le développement dans la flore urétrale d’une bactérie particulièrement virulente dite « uropathogène », correspondant aux IU « non compliquées », c’est-à-dire survenant sur un appareil urinaire sain (dans ce cas la virulence du germe joue un rôle primordial).

Figure

Figure 3 : Appareil génito
Figure 4 : Schéma d’une sonde vésicale avec les portes d’entrées possibles  des micro-organismes
Figure 7 : Bandelette urinaire positive pour nitrite et leucocyte.
Figure 8 : Leucocytes et globules rouges sur cellule de Malassez observés au
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