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Lung Mesh Generation to Simulate Breathing Motion
with a Finite Element Method
Pierre-Frédéric Villard, Michaël Beuve, Behzad Shariat, Vincent Baudet,
Fabrice Jaillet
To cite this version:
3 # 4 5 7698
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Figure 1. Constraints application scheme
Figure 2. hexahedral mesh (a.), quadrangle
mesh (b.)
áÜ!ÙgÚfÜ1Ø@äÜ1ë ö SáÝ1ßCØ~ëßCäßcâ@øêÞÜ1éÜÀÜ1ß@Ý2Þ7ÞÜßgÞÜ1ëéègØÝègé éÜ1áúaè@Øcëáäèß ö ÃáÝ!ßgØlçgèBÜ1Ö 2Zà²Ùcü üß ü ^äÜ1éØcßgÖá×é vßgÝ!Üà²á5äÞÜ!ØÙ@à·ç@Ü!ØKæH÷ßþH×cß@ëé2ßCØÙ@×Ö²ßgé\ÚfÜAá¨Þ 2à²Ùcü üæ ,ü ýÖ·äÞcèg×Ù@Þè@×é5úéÜ1ç^à·è@×cáiÚfÜ!äÞèëÝè@ØHç@Ü!éÙgÜAásøêÞà²Ö·Ü<ßgú úÖ²÷^à·ØÙ¶ëà³á¨úÖ³ßgÝ!Ü!ÚfÜ!ØHä2á~à²Ø0äÞܼëà·éÜ1Ýäà²ègØ0è <äÞÜá¨×cé vß@ÝÜ Ùgé2ßgëà·Ü1Ø@äAâUàqäsÙ@Ü!ØÜ1éßCäÜAááègÖ²×äà·è@Øcá ØèCäsÝ!ègØcáà²á¨äÜ1ØHä øêà·äÞäÞÜ éÜ1ßCÖ²à·äo÷)à Fø ÜÀßCúcúÖ·÷ß ×Øà ÅègéÚ úéÜAáá×éÜgü2à·Ù@×éÜ áÞèUøá äÞcÜ éÜ1á×Ö·äáè aäÞà³ááà·Ú)×Ö²ßCäà²ègØåü5ÞÜ5úéègæÖ²Ü!ÚÃßgéà³á¨ÜAá Åéè@Ú á¨äéÜ1áá ¹Ýè@ØcÝÜ1Ø@äéßCäà²ègØßCéäà vßgÝä ë×cÜäè äÞÜáÞcßgéú7ÜAëÙgÜAáià²Ø Ý×cæaÜAá!üFigure 3. geometry after applying a uniform
pressure simulation
5Þà³á0ø ègéù ßCà²ÚáSßCähÝè@Ú æà²Øà²ØÙ&ßgÝ1Ý×é2ßgÝ!÷&ègذäÞÜ æPègרcëcßCé÷á×é vß@ÝÜ ßgØcëKÞÜßgÞÜ1ëé2ßCÖFÚÜAá¨ÞFüýÝ!Ý!×é2ßgÝ÷ègØ äÞcÜá×é vßgÝÜÀÝègÚfÜAá& ÅéègÚ ß áÚfè^èCäÞ~Ü^äÜ1éØcßgÖcÚfÜ1áÞåü&Ü ßCÞcÜ1ëé2ßCÖæ×Ö²ù ÚfÜ1áÞSà³áÝ!ègØ^çgÜ1Øà·Ü1ØHäæPÜ1Ý!ßg×cáÜà·äëà·éÜ1ÝäÖ²÷ Ýè@ÚfÜ1á Åéè@Ú ö ´áÝ!ßCØ ßCØcëúéèUç^à³ëÜ1áëà²éÜAÝ,äà·Ø ÅègéÚfßCäà²ègØ ègØÜ1Ö·ÜAÝ,äéègØcà²ÝfëÜ1Øcá¨à·äo÷ ßgØcë¼úéègæcßgæÖ·÷ Åègé(ÞÜ!äÜ1éè@ÙgÜ!ØcÜ!à·äo÷gü è@éÜ1èUçgÜ!éAâ ßgáÚfÜ!ØHäà²ègØÜAë9æPÜ Åè@éÜ@âsÞÜßgÞÜ1ëé2ßCÖ\Ü!Ö²Ü!ÚfÜ!ØHä2á ßCéÜúéÜ ÅÜ!ééÜAë7äèäÜäéßgÞÜ1ëéßgÖPÜ1Ö·Ü1ÚfÜ!ØHä( Åègé5ãcØà·äÜ<Ü1Ö·Ü1ÚfÜ!ØHä á¨ä×cëà²Ü1á 7B9Oü ègäà²çÂßCäÜAë<æ^÷ßÀá¨Úfè^èCäÞØÜAááZà²ëÜ1ßø Üi×aá¨ÜAëäÞÜ ÚßCé2Ý2Þ à²ØÙ¼Ý!׿PÜ ö ßCÖ²Ùgè@éà·äÞcÚËúéÜAá¨Ü1ØHäÜ1ëà·Ø 7B9>ü05ÞÜç^à·é ä×aßCÖiÝ!׿aÜç@Ü!éäà³ÝÜAáßgéÜfëÜ!ãcØÜ1ë¼æ^÷läÞÜ7ÝÜ1ØHäéÜ1áè 5Ü!à²ÙgÞHä ö +áÝ1ßCضçgèBÜ!Ö³á!ü 2cègé7ÜAßgÝ2Þ¶è äÞÜ1ÚKâ äÞÜà·Ø ÅègéÚfßCäà²ègØ ßCæPèg×äÚßCäÜ!éà³ßCÖ<à³áègæä2ßCà²ØÜ1ë`ëà²éÜAÝ,äÖ·÷ ÅéègÚ/äÞÜà²ØHäÜ!Ø áàqäo÷9è äÞÜ áÜ!Ù@ÚÜ1ØHäÜ1ë à²ÚfßgÙgÜAá!ü ÿ ß¼ç@Ü!éäÜ9Þaßgáß ëà·ûPÜ1éÜ1ØHä~ÚßUäÜ1éà³ßCÖÀà·Ø ÅègéÚfßCäà²ègØ0 ÅéègÚ"àqä2á~ØÜ1à·Ù@Þ^æaè@×éà²ØÙ çgÜ1é¨äà²Ý!Ü1á1âiß æaè@רcëßgé÷á×é vß@ÝÜá¨Þcèg×Ö³ë9Ü^à³á¨äæPÜäoø Ü!Ü1Ø à·ä à·Ø ÅègéÚfßCäà²ègØcáäÞcßUä~Ý!׿PÜçgÜ!éäà³ÝÜAáfÝèg×cÖ²ë¦ëÜ!ãcØÜgüC5ÞcÜ1áÜ Ýè@Ú æà²ØcßUäà·è@ØcásÝ1ßCØfæaÜéÜAë×cÝÜAëäè 8 á¨à·ä×aßUäà²ègØaáøêàqäÞäÞcÜ ÝÖ³ßgáá¨à·ãaÝ1ßUäà²ègØè \áà·Úfà²Ö²ßgéÀÝ!ß@á¨ÜAá!ü 5ÞÜfá¨×cé vß@ÝÜ Ù@Ü!ØÜ1éßCäà²ègØ úéè^Ý!Ü1ááà²áÜHäéÜ1ÚfÜ!Ö²÷ vßgá¨ä ë×ÜäèäÞÜëà²éÜAÝ,ä<äéà³ßCØÙ@×Ö²ß äà²ègØ ÅéègÚ¸äÞÜêÖ·è^è@ù O×ú>äßgæÖ²Ü úcéè@úaÜ1é¨äà·ÜAá è cäÞÜêÚßCé2Ý2Þà²ØÙ Ý׿PÜ éèg×äà²ØÜgüýÀáÀáÞèUøêØà·Ø2Zà²Ùcü5cüßâcäÞÜá¨×cé vß@ÝÜ(ÚfèëÜ!Ö ÝéÜ1ßCäÜ1ë)æ^÷(äÞÜ ö ßCÖ²Ùgègéà·äÞÚÃÞaßgááÚè^ègäÞÜ1ésÝ×éçUßUä×céÜAá äÞcßgØ7ègØ~äÞÜÀúéÜ!ç^à·è@×cá)2Zà²Ùcü üæåüZè(ãcÖ²ÖPäÞà³á\á×é vßgÝ!ÜÚfÜ1áÞ øêàqäÞ Ü1Ö·Ü1ÚÜ1ØHäá1âåø\Üæc×à·Ö³ëß ÚfÜ1áÞ¼øêàqäÞ9ß~äéß@ëà äà²ègØcßgÖåëÜ!Ö³ßC×cØcßÂ÷7ÚfÜäÞèë 2à·Ùaü5aüæåüFigure 4. triangle mesh issue from MC (a.),
3D Delaunay mesh (b.)
2Zà²Ùcü áÞèUøá5äÞÜ éÜ1á×Ö·äáè äÞÜÝègØHä2ßgÝ,äÀÚÜ!äÞèëúcéÜ á¨Ü1ØHäÜ1ëà²ØláÜ1Ý,äà·è@Ø ü2éègÚ äÞÜ)à·Øcàqäà²ßgÖZá¨äßUäÜ#2à·Ùaü üßcâø Ü ßCúúcÖ·÷¼ßרà ÅègéÚúcéÜAáá×éÜ7ßCØcëßÝ!ègØHäß@Ý,ä Ýè@Øcëà·äà²ègØäè äÞÜ~ãcØcßgÖ\á¨äßUäÜ 2à·Ùaü üæFü ? Úfè^èCäÞcÜ1ëÜ1ëÙgÜ1á ègæä2ßCà²ØÜ1ëæ^÷ äÞÜ ö ßCÖ²Ùgè@éà·äÞÚßCÖ²Ö·èUøáäèÝè@Úfú×äÜÝègØHä2ßgÝ,ä)øêàqäÞ9ß ×Øà ÅègéÚhúcéÜAáá×éÜgü 5ÞÜ\éÜAá¨×cÖqä2áåè ^äÞÜiֲרÙÀà·Ø!PßUäà²ègØ(áà²Ú ×Ö³ßUäà²ègضègæäßCà²ØÜAëøêà·äÞ¦èg×céÚÜ!äÞèë 2à²Ùcü üÝ)ãä2áfø\Ü1Ö·Ö øêàqäÞַרcÙÚfèëÜ1Ö²áêà³áá¨×ÜAë ÅéègÚ ö háÝ!ßgØç@èB^Ü1ÖMüZ
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Figure 6. lung cut with 3D cubic mesh and a
triangle surface mesh (a.), Uniform pressure
simulation (b.)
ÿ ØcëÜ1Ü1ëeâUøêÞcÜ!Ø ø Ü5ßgëë(ßäéà³ßCØÙ@×Ö²ßgéFÚfÜ1áÞ è@Ø ßCØ)à·Øcàqäà²ßgÖ ÚfÜ1áÞÝè@ÚfúaèHá¨ÜAëè ÞcÜßCÞÜAëé2ßâ àqäßCúcúaÜAßCé2á áègÚfÜ~Þè@Ö·ÜAá æPÜäoø Ü!Ü!ØÜ1Ö·Ü1ÚfÜ!ØHäá1ü2Zà²Ùcü+^âaá¨ÞèUøáßCØà²Ö·Ö²×cá¨äé2ßUäà²ègØè äÞà³á úéègæÖ²Ü!Ú+à²Ø ü 5ÞcÜ æPègÖ³ëÖ·à²ØÜ@âPéÜ!úcéÜAá¨Ü1Ø@äà·ØcÙfäÞÜ äéà²ßgØ Ùg×cÖ²ßgé Ü1Ö·Ü1ÚfÜ!ØHäáêè FäÞÜ<ÚfÜ1áÞåâÖ²Üäáá¨è@ÚÜרãcÖ·Ö²Ü1ëáúcßgÝ!Ügühexahedral element
triangle element
missing element
Figure 7. missing elements filling holes
ÿ ئègé2ëÜ!éäè9ßgëë äÞcÜÚà³áá¨à²ØÙÜ!Ö²Ü!ÚfÜ!ØHä2áø\Üúcéè@úaèHá¨Ü ßCØ~Ü^äÜ1Øcá¨à²ègØè eäÞÜÀÚßgéÝ2Þà²ØÙÝ׿PÜäè)úcéèUç^à³ëÜêäÜ!äé2ßCÞÜ ëé2ß Åè@éÜ1ßgÝ2Þ è \äÞÜ ,7úPè@áá¨à²æÖ²ÜÝ!ègØãaÙg×é2ßUäà·è@Øcáè iäÞÜ ÚfÜäÞèëeü 2ègé<ÜAßgÝ2Þ Ö·à³áoä<è \äéà³ßCØÙ@Ö·ÜAáÖ·à²ØùgÜAëläèßÝ!ègØãcÙ ×é2ßUäà·è@Øø\Ü~ß@ááèÝà³ßUäÜ~ßÖ²à²á¨ä)è êäÜäéßgÞÜ1ëéßKäèHèaü ÿØäÞÜ ÝÖ³ßgááà²Ý1ßCÖÚßCé2Ý2Þà²ØÙÝ׿PÜgâ ÅÜ!øÌÝè@ØãcÙ@×éßCäà²ègØcá<ßgéÜá¨ä×cë à²Ü1ë(æPÜ1Ý1ßC×cáÜsÚfè@á¨ä è äÞcÜ ßgéé2ßCØÙ@Ü!ÚfÜ!ØHä2áåßCéÜäè@úaè@Ö·è@Ùgà³Ý!ßgÖ·Ö²÷ Ü1þH×à²çUßCÖ²Ü!ØHä1ü 2cègéêÜßgÚfúÖ·Ü@âäÞcÜ!éÜ<à²á5Øèfäéà³ßCØcÙgֲܸêÞcÜ!ØßCÖ²Ö Ü!à²ÙgÞHäsØèëÜAásÖ²à·Üêà²Øcáà²ëÜcèg×äáà²ëÜ5äÞÜæPègרaëßCé÷)á×é vßgÝÜ@ü 5ÞÜ ßCæFü 8(áÞèUøáêÜßgÚfúÖ·ÜAáêè äéà³ßCØÙ@×Ö³ßCéúcßCäÝ2ÞÜAá!ü 2è@é Ü1ß@Ý2ÞlÝ!ß@á¨Ü@âaè@ØÜ Ý!ßgØßCúcúÖ·÷KäÞÜ)áßCÚfÜ<äéÜAßUäÚfÜ1Ø@äÀäèæaègäÞ Ýè@ØãcÙ@×éßCäà²ègØcá ÅøêÞÜ1éÜ à²áäÞÜÝè@ÚúcÖ·Ü1ÚÜ1ØHäßCé÷~è i ü ÿ ؼäÞÜÝ1ßgáÜè \à²ØHäÜ!éØcßgÖÞÜßCÞcÜ1ëé2ßâeäoø èÝègØãcÙg×é2ßUäà·è@Øcá ÞcßÂç@Ü<äèKæaÜÝè@Øcá¨à³ëÜ1éÜAë@ ÅègéÜ1ß@Ý2Þäéà²ßgØÙg×Ö³ßCéÀúcßUä2Ý2Þåü 5ÞÜ ßCæåü8ÀáÞèUøáiäÞéÜ!ÜÜßCÚfúÖ²Ü1á\è Fäéà²ßgØÙg×Ö³ßCé\úcßUä2Ý2ÞÜ1á\Ùgà²ç à²ØÙäoø èÀëà·û[Ü!éÜ!ØHä áÜä2áè cÝè@ØãcÙ@×éßCäà²ègØcá1ü 5ÞÜ ÞÜßgÞÜ1ëéß Ý!ègØãcÙ@×é2ßUäà²ègØKý Ý!ègØãcÙ@×é2ßUäà²ègØ Ý!ß@á¨Ü 8 Ý!ß@á¨Ü Ý!ß@á¨Ü4
Table 1. 6 examples of configurations for the
MC 3D extension
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hexahedron
triangle
tetrahedron
Figure 8. tetrahedral, triangle and
hexahe-dral mesh (a.), detail (b.)
1.1e-19
1.5e+01
p
15
0
displacement [mm]
Figure 9. three steps of a uniform inflating
ñiîô ó /^õoñ\î ÿ ØäÞà³á5ø\è@éù[â^ø ÜÞaßÂçgÜÀáègÖ²çgÜAëäÞÜ(Ýè@ØHç@Ü!éÙgÜ1ØcÝÜúcéè@æ Ö²Ü!Ú°äÞaßUäÀÞaßgáÀæaÜ1Ü!ØúPègà²ØHäÜAëlèg×äÀà²Øèg×céÀúéÜ!ç^à²èg×cáÀáoä×cë÷@â ×cáà·ØcÙKßáúaÜAÝà³ßCÖ ÚfÜ1áÞ æcß@á¨ÜAëlè@ØläÞcÜÚßgéÝ2Þà²ØÙÝ׿PÜßCÖ Ùgè@éà·äÞcÚKü 5Þà²á<áúPÜ1Ýà³ßCÖÚfÜAá¨Þ ÞcßgáÚßCØ^÷ß@ëçUßCØHäßgÙgÜ1áà·ä Ùgà²çgÜAáßß@Ý!Ý×céßCäÜfÝègØHäèg×é< ÅègéäÞÜfÜ^äÜ1éØcßgÖá¨×é vßgÝ!ÜßgØcë ßßgÝ1Ý×é2ßUäÜÚfÜ1áÞ¼è 5äÞÜ7Ü^äÜ!éØcßgÖiáoäéßCä×Úü=5ÞÜ7à²Ø@äÜ!é ØcßgÖiÚfÜ1áÞÜ1á)ßCéÜ~ëà²éÜAÝ,äÖ·÷¼Ü^äé2ßgÝäÜAë Åéè@Ú ö áÝ!ßgØßgØcë äÞcÜÞcÜßCÞÜAëé2ß7ßCéÜ)ø Ü!Ö²Öá¨×càqäÜ1ë Åè@éØègØOÖ²à·ØÜAßCéßCØcßgÖ·÷áà²á1ü è@éÜ1èUçgÜ!éAâåà²Ø ÅègéÚßUäà·è@Ø Åè@é ëèHá¨à²ÚfÜäé÷ vÜ!Ö²Ü1ÝäéègØà³ÝëÜ!Ø áàqäo÷ à³áêáoäéßgà·Ù@Þ@ä Åègéø ßgéëåü óêïóð;,"ñsð 2à·é2á¨äÖ²÷gâHø\Üøêà²Ö²Ö[ß@ëëfÞÜ!äÜ!éègÙ@Ü!ØÜ1àqäo÷à²Ø@äè<äÞcÜÀֲרÙ(ÚfÜ Ý2ÞcßgØà²Ý úéègúPÜ!éäà²Ü1á1üý´úcéègäèÝè@ÖFà³áרaëÜ!éÜ!Ö³ßCæPègé2ßUäà·è@Øäè úPÜ!é ÅègéÚ Ý!ègÚfúéÜ1áá¨à²ègؼäÜAáoä2á Åäè ÚÜAßgá×éÜÜ!Ö³ßgá¨äà³Ýà·äo÷(ègØ çUßCéà·è@×cá5áßgÚfúÖ·ÜAá5è äÞÜ(áßCÚfÜֲרÙäà³áá×Ü@ü ýÝä×cßgÖ·Ö²÷gâ ø Ü~ßCéÜø ègéùHà²ØÙè@ØäÞÜ7éÜ1Ý!ègØcá¨äé×cÝäà²ègØè ö %áÝ!ßgØ áÖ·à³ÝÜAáègæä2ßCà²ØÜ1ë Åéè@Ú äÞcܦáßCÚfúÖ²à²ØÙhè è@×é ÚfèëÜ!ÖßUäçUßCéà²èg×cá5Ö²Ü!ç@Ü!Öåè à²Ø!aßCäà²ègØåü ÿ ØcëÜ1Ü1ëeâaäÞcÜ1áÜ á¨à²Ú ×Ö³ßUäÜ1ë ö háÝ!ßgØ~à²ÚfßgÙgÜAá ßgéÜ×cáÜ Å×cÖåþ@×aßCØHäà·äà²Ü1á Åè@é5äéÜ1ßUä ÚfÜ!ØHäúÖ³ßCØØcà·ØÙaü ZèäÜAáoääÞÜ)çUßCÖ²à²ëà·äo÷è sè@×éÀÚfèëÜ1Ößáoä×cë÷øêà·Ö²Ö Ü1á¨äà ÚßUäÜäÞÜKëà·ûPÜ1éÜ1ØcÝÜ7æPÜäoø Ü!Ü1ØäÞÜKá¨à²Ú ×cÖ²ßCäÜ1ë ö ÌáÝ!ßgØcá ègæäßCà²ØÜAë ÅéègÚ4è@×é<ÚfèëÜ!ÖsßgØcëläÞÜ7ëßCäß Åéè@Ú4éÜ1ßCÖ ö áÝ!ßCØaá!ü 2à·ØaßCÖ²Ö·÷@â(ø\Üøêà·Ö²Ö ÜHäéß@Ý,ääÞègé2ß%ºëà²áúÖ³ßgÝ!Ü!ÚfÜ!ØHäáègØ æPè^ë÷Ká×é vßgÝÜ<ßgØcëëà²ßgúÞé2ßCÙ@Ú&ÚfèCäà²ègØKäè7ÞcßÂçgÜäÞÜãcØcßgÖ áà·Ú)×Ö²ßCäà²ègØÝ!ègØHäéègÖ²Ö²Ü1ëæ^÷Käoø\èúcßCé2ßCÚfÜäÜ!é2á!ü<5ø\è~äÜAßCÚá ßCéÜø\è@éù^à²ØÙ è@ØKäÞÜAá¨Üäè@úà³Ý!á1ü ô êîñ 3 ,Zò&, ,Fî\ï/ 5¼ÜäÞaßCØùfßCÖ²Öcè@×éiúcßgé¨äØÜ!é2áåäÞcÜ ! Ü!ègØ Ü1éßgéë ö Ü!ØHäéÜ ßCØaë7äÞÜ'2l ÿ! | úéè "oÜ1Ýä( Åègé5äÞcÜ!à²éá¨×úcúaè@é¨äAü +-, ,åð,FîÀô., / 7 89 ö èëÜ<ýá¨äÜ1é1üÞHääú Uøêøêø<üÝ!è^ëܹßgá¨äÜ!éAüègéÙ^ü ! #"%$&(')&*,+-"%./-&0(&12/314$65875898.:2;)&( #"%+<=581) ü ? ÞcßCéà³ßUä1üFèUø5ßCé2ëá\ßgÝ!Ý!×é2ßUäÜÀä×cÚè@×é äé2ßgÝ2ù^à²ØÙ à²Ø Ö·×cØÙ@á1ü<N 2¢U£«ALOÊQP¡C¤1§!!¤P2 ¡C¤SR,¤1§¡C,fC¬Mv¡C¤UTF³®,½ U yLOAC¬Mv¡C¤ âPúcßCÙ@Ü1á )V 5 câ AA cü 7%9 ? üü Ü1Ø !Ö²Ü!÷@â ü ( Ü!éé÷@âJfü Ü1éù^Ö²Ügâ ü ö Ö²ßgéù[âcßgØcë ü ü ? "¨ß@ßCé2ëÜ!Úßcü(ý Ý!ègÚfúcßgéà³á¨è@Ølè 5ßCÖ²Ö ÞÜßCÙ@ègØcßgÖ ßCØcëßgÖ·ÖåäÜäéßgÞÜ1ëéßgÖeãcØà·äÜ(Ü1Ö·Ü1ÚfÜ!ØHäÚfÜ1áÞÜ1á ÅègéÜ!Ö³ßgá äà³ÝßCØcë Ü!Ö³ßgá¨äè>úcÖ²ß@áoäà²ÝKßCØcßgÖ·÷áà²á1üXW ¡1222¢U£¤^¥U®2ÊZY¬Åª U¤a¤ccU £¤a¬O!,¤PC¬Mv¡C¤PU <®¨ª£¤H¥0¡U¤[¢U¬¹g©! · âúcßgÙgÜAá 8 +*)V 8 *8@â 8 * * ü 759 & ü ègÖ³ëÜ1߸ßgØcë ü ? ßCéé×ä1ü ! רcÙ´ëÜ Åè@éÚßCäà²ègØ Ü1á¨äà²ÚßUäà²ègØ øêàqäÞØè@ØOéà²Ùgà³ëéÜ!Ùgà³á¨äé2ßUäà²ègØ Åè@éféß@ëà·è äÞÜ1éßgú^÷häéÜAßUäÚÜ1ØHä1ü[N 2¢Uv2U \R,!¥H]Ps¡U¯P¬>£¤H¥ U¤[¢^Ps¡C¯[¬O!,½!_®2®,³®,¬O2¢`R¤c¬¹,«U!¤c¬>v¡U¤ N RaPbPE_cRÁâ + + +A)V+ + +â A A cü