Travaux pratiques de mycologie

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Travaux pratiques de mycologie

Veronica RODRIGUEZ-NAVA – Aymeric MENARD – Frédéric LAURENT

Patrick BOIRON

Laboratoire de Mycologie

Faculté de Pharmacie, Lyon, France

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Classification

Spores

Asexuée Sexuée

Endospores

Conidies

Zygospores Zygomycètes

Ascospores Ascomycètes

Basidiospores Basidiomycètes Deutéromycètes

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Champignons inférieurs

Classe des Zygomycètes

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Les Zygomycètes

• Les champignons de la Classe des Zygomycètes sont caractérisés par :

• Un mycélium non cloisonné (= siphonné = cœnocytique)

• Une multiplication asexuée par endospores : sporocystospores

• Une reproduction sexuée : zygospore

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Intérêts des Zygomycètes

•

Moisissures communes : agents de pourritures et d’altérations alimentaires (Mucor, Absidia, Rhizopus, Rhizomucor, …)

•

Mycoses humaines, peu fréquentes mais graves : mucormycoses (Rhizopus,

…)

•

Industries agro-alimentaires :

•

Fermentation de l’amidon en anaérobiose : alcool de riz, de pomme de terre, … (choum choum, whiskys, vodkas, schnaps, …)

•

Affinage de certains fromages (Cantal), galettes de soja (Tempeh)

•

Industries chimiques et pharmaceutiques :

•

Production d’acides aminés, acide lactique, présure, vitamine A, …

•

Bioconversion des stéroïdes

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Absidia glauca

Sporocystophore Sporocyste

Columelle Apophyse

Aspect macroscopique

Mucor

Absidia

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Zygorhynchus heterogamus

Suspenseurs

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Les Rhizopus (non vu en TP)

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Les Rhizopus (non vu en TP)

• Cosmopolites et ubiquitaires

• Environ 12 espèces de Rhizopus

• Allergies de type I et III

• Mycoses : mucormycoses

• Industries agro-alimentaires (fromages, fermentations

diverses), chimiques (alcool,

acides organiques) et papetières

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Les Mucor (non vu en TP)

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Les Mucor (non vu en TP)

• Cosmopolites et ubiquitaires

• Environ 50 espèces de Mucor

• Allergies de type I et III

• Mycoses (rares) : mucormycoses

• Industries agro-alimentaires

(fromages)

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Champignons supérieurs

Classe des Ascomycètes

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Les Ascomycètes

• Les champignons de la Classe des Ascomycètes sont caractérisés par :

• Un mycélium cloisonné (= septé = articulé)

• Une multiplication asexuée par conidies : modes de conidiogénèse très variés

• Une reproduction sexuée : ascospores dans les

asques

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Intérêts des Aspergillacées

Les Aspergillus

•

Moisissures très communes : bois, pain, confiture, fruits, …

•

Biodétérioration : textiles, papiers, cuirs, matières plastiques, matériels électroniques et optiques, …

•

Mycotoxicoses : aflatoxines, ochratoxine, …

•

Mycoses souvent graves : API, aspergillome, ABPA, AAE, …

•

Industrie chimique : acides (citrique, gluconique, oxalique, fumarique,

gallique, …), dextranes, amylases, …

Les Penicillium

•

Industries agro-alimentaires : affinage de fromages (roqueforts, bleus,

camemberts, …)

•

Pourriture des fruits : agrumes, pommes

•

Mycotoxicose : patuline

•

Industrie pharmaceutique : antibiotique (pénicilline), antifongique

(griséofulvine)

•

Industrie chimique : acide citrique, …

•

Mycose tropicale : pénicilliose à Penicillium marneffei

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Aspects macroscopiques

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Aspergillus flavus

Vésicule Phialides

Conidiophore (stipe) Phialoconidies

Métules

Aspérités

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Aspergillus ochraceus

Zones concentriques

(18)

Aspergillus niger (non vu en TP)

(19)

Aspergillus versicolor (non vu en TP)

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Penicillium frequentans

Phialides

Conidiophore (stipe)

Phialoconidies

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Complexité du conidiophore

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Complexité du conidiophore

Penicillium

(23)

Chaetomium globosum

Asques

Ascocarpe : périthèce

Ascospores

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Les Chaetomium

•

Cosmopolites et ubiquitaires, très communs

•

Environ 80 espèces de Chaetomium

•

Intérêt industriel : production de cellulase

•

Mycotoxines : chaetomine, sterigmatocystine chez quelques espèces de Chaetomium, chaetoglobosines chez Chaetomium globosum

•

Mycoses (rares) : onychomycose

•

Allergie de type I ?

•

Phytopathogènes

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Champignons supérieurs

« Classe » des Deutéromycètes

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Aspergillus fumigatus (non vu en TP)

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Aspergillus fumigatus

• Un des 3 principaux agents responsables de mycoses profondes (avec Candida albicans et Cryptococcus neoformans)

• Responsable de 95 % des aspergilloses, notamment de l’aspergillose pulmonaire invasive (API), mais

également d’aspergilloses

allergiques (ABPA, AAE)

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Fusarium oxysporum

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Les Fusarium

• Cosmopolites et ubiquitaires, très communs

• 50 à 70 espèces de Fusarium

• Phytopathogènes

• Mycotoxines : trichothécènes, toxine T-2, zéaralénone (= toxine F-2), vomitoxine, déoxynivalénol, fumonisine, …

• Mycoses graves (kératites, endophthalmies,

onychomycoses, mycétomes), notamment chez les patients immunodéprimés (fusariose profonde,

résistante aux antifongiques) et chez les grands brûlés

• Allergies de type I

• Intérêt vétérinaire : zéaralénone (stimulant de croissance animale, anabolisant, contraception)

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Alternaria alternata

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Les Alternaria

•

Cosmopolites et ubiquitaires, très communs

•

40 à 50 espèces d’Alternaria

•

Phytopathogènes

•

Allergies de type I et III

•

Mycoses (rares) : lésions sous- cutanées, onychomycoses

•

Mycotoxines : alternariol, alternariol monométhylether (AME), acide

tenuazonic, altertoxines (mutagénique)

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Stemphylium botryosum

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Les Stemphylium

• Cosmopolites et ubiquitaires

• 6 espèces de Stemphylium

• Phytopathogènes

• Allergies de type I

• Mycoses (très rares) :

sinusites

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Cladosporium herbarum

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Les Cladosporium

•

Cosmopolites et ubiquitaires, extrêmement communs

•

28 à 40 espèces de Cladosporium

•

Phytopathogènes

•

Allergies de type I et III

•

Mycoses tropicales : chromoblastomycoses (

Cladiophialophora carrionii, C. bantiana)

•

Mycotoxines : cladosporine, émodine (toxicité ?)

•

Intérêt pharmaceutique : bioconversion de précurseurs stéroïdiens en progestérone et pregnenolone

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Aureobasidium pullulans

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Les Aureobasidium

•

Cosmopolites et ubiquitaires

•

15 espèces d’Aureobasidium

•

Phytopathogènes

•

Allergies de types I et III

•

Mycoses (rares) : lésions cutanées, kératites, abcès splénique

•

Intérêt industriel (préparation de

textiles) et agro-alimentaire (pullulane : polysaccharide biodégradable, utilisé pour la protection d’aliments)