• Aucun résultat trouvé

Entre chimie et biologie : nutrition, organisation, identité

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

Partager "Entre chimie et biologie : nutrition, organisation, identité"

Copied!
505
0
0

Texte intégral

(1)

HAL Id: tel-02185015

https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02185015

Submitted on 16 Jul 2019

HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of sci-entific research documents, whether they are pub-lished or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers.

L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d’enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés.

Cecilia Bognon-Küss

To cite this version:

Cecilia Bognon-Küss. Entre chimie et biologie : nutrition, organisation, identité. Philosophie. Uni-versité Panthéon-Sorbonne - Paris I, 2018. Français. �NNT : 2018PA01H215�. �tel-02185015�

(2)

ECOLE DOCTORALE DE PHILOSOPHIE THÈSE ������������������������������������������������������������� ���������� ������������� ��������������������������������������� CÉCILIA BOGNON-KÜSS ��������������������� �

E

NTRE

C

HIMIE ET

B

IOLOGIE

:

N

UTRITION

,

O

RGANISATION

,

I

DENTITE

� ����������������� ���������������������� �� Jean GAYON �� �� Denis FOREST � ������������������� � Delphine�ANTOINE-MAHUT����������������������������������������������� ������������ François DUCHESNEAU� ������������������������������������������ Denis FOREST������������� ������������������������������������������������� Pierre-François MOREAU� ���������������������������������������������������� Stéphane SCHMITT� ����������������������������� ������������ Barbara STIEGLER� ��������������������������������������������

(3)
(4)
(5)

ECOLE DOCTORALE DE PHILOSOPHIE THÈSE ���� ������������������������������� ����������������������� ������������������������� ��������������������������������������� CÉCILIA BOGNON-KÜSS ��������������������� �

E

NTRE

C

HIMIE ET

B

IOLOGIE

:

N

UTRITION

,

O

RGANISATION

,

I

DENTITE

� ��������������������������������������������� Jean GAYON ������� Denis FOREST � ������������������� � Delphine�ANTOINE-MAHUT����������������������������������������������� ������������ François�DUCHESNEAU� ������������������������������������������ Denis FOREST������������� ������������������������������������������������� Pierre-François MOREAU� ���������������������������������������������������� Stéphane SCHMITT� ������������������������������������������� Barbara STIEGLER� ��������������������������������������������

(6)
(7)

S

OMMAIRE

Chapitre 1. La nutrition : esquisse de la question pour une philosophie du vivant ... 53 1.1 Le « mythe » de la digestion. A propos de Bachelard ... 53 1.2 Nutrition, Génération, Vie. Aristote ... 68 1.3 Les opérations vitales : Comment reconnaître un démon ? Saint Thomas d’Aquin ... 90

Chapitre 2. Modèles de la nutrition au 17e siècle ... 97

2.1 La vie existe-t-elle au 17e siècle ? ... 97 2.2 Fermentation. Van Helmont ... 106 2.3 Mécanisme. Descartes ... 118 2.4 Conclusion ... 153 Chapitre 3. Transition. Nutrition, Chimie, Vie ... 155 3.1 Du mécanisme matérialiste au matérialisme vital ... 155 3.2 Séparer l’inorganique et l’organique. Stahl : chimie, organisme, métabolisme ... 164

3.3 Nutrition directe ou métamorphose ? ...192

Chapitre 4. Nutrition, Organisation, Biologie ... 203 4.1 Génération, nutrition et organisation vitale ... 203 4.2 La Biologie avant la « Biologie » ... 212 Chapitre 5. Nutrition, Organisation, Préformation ... 237 5.1 L’analogie nutrition – génération : l’organisation déjà donnée ... 237 5.2 Préambule. Bonnet contre Buffon ... 241 5.3 Buffon. La nutrition entre épigenèse et préformation ... 254 5.4 Bonnet. Préexistence et nutrition ... 276 5.5 La nutrition comme préformation. L’organisation comme structure ... 287

(8)

Chapitre 6 Nutrition, Organisation, Epigenèse ... 289 6.1 La nutrition et le point de vue chimique sur le vivant ... 289 6.2 La nutrition comme épigenèse : penser la productivité du vivant ... 324 6.3 La nutrition directe, le retour de la préformation ? ... 357 Chapitre 7. Nutrition indirecte et synthèse organisatrice ... 381 7.1 Glycogénèse, chimie et processus ... 381 7.2 L’espace du métabolisme ... 398

(9)
(10)
(11)

������������������������������ ���������������������������� ���������������������

(12)

(13)

R

EMERCIEMENTS

� � ������� ������� ���� ������� ��� ����� ������� ��� ������� ��� ������� ��� ��� ������������ ��������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������� � ����������������������������������������������������������������������������� ��������� ��������������� ��������� ������������ ���������������� �������� ��������� �������� ��� �������� ���������� ���� ��� ��������� ����� ��������������� �������� �������� ���������������������� � ��� ��������� ����� ������������ ������ ������� ������� �������� ��� ���������� ��� ���������� ��� ������ ������ ����� ���� �������������� �������� ��� ����������� ��� �������� �������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��� ��������� ��� ���������� ������� ������� �������� ����� ����������� ��� ����� ����������� ��� ��� ���������� ������ �� ����� ������ ����������� ������ ���� ����� ������ ��� ��������� ��� ���������� ��������������� �������� ���� ���� ���� ������������ ��� ��� ���������� ��������� ��� �������� ������������������������������������������������������������������������������� � ��� ��������� ���������������� ������� �������� �������� ��� ������������ ��� �������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ��������� ����������� �� ���������� ��� �� ������ ��������� �� ��� ����� �� �������� �������� ������� ��� ����� ��� ����� ���������� ��� ���� ����������� ������������� ��� ���� �������������������������������������������������������������������������������������� ���������� ��� ����������� ��� ���� �������� ������ ������ ��� ��������������� ����� �������� ���������������� ����������� ��� �������������� �������� ���� ��������� ������ �������� ��� ��������������������������������������������������� �

(14)

�������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ������ ������� ����� ��� �������� ����������� ��������� ����� ��� ���������� ��� ����� ��� ������ �� ����� ����� ����� ��������������� ��� ����� ����� ���������� ����� ������ ��� �� �� ��� ���� ����� ���������� ���������� ����������� ������ ������� ���������� ���������� ����� ���������� ����� ������������������������������������������������������������������������������������� ���� ����� ����� ��� ��������� �� �� ���������� ����� ��������� �� ������� ���������� �� ����������������������������������������������������������������������������������������� ����������� ������ �� ������ ������������ ������� ��� �� �������� ���� ��� ����� ���� ������ ��� ������������� ����� ������ �� ����� ������ �������� ���� ������� ����� �������� �������� ������ ������������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������� �������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ��� ��������� ��� �� �������� ����� �������� �� ���������� ���� ���������� �������������� ��� ���� ������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ���� ���������������� ��� ����������� ��������� ����� ��� ���� ��������� ����� ���� ������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ���� ��� �������� ��� ���������� ��������������� ��� �� ������ ��������� ����� ���� ������� ����� �������� �� �������� ��������� �� ��� ������� ��� ������� �������������� ����� ���� ������ ��� ���������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������ � ����������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������� ��� ��������� �������� ���������� ��� ������������ ��� ������������� ������ ��� ��� ���� ��������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������� ��� ��������� ����� ��� ������������ ��� ���� ������������ ������������ ���������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������� ��� ��������� ��� ���������� ���� ��������� ��� �������� ������� ��� ��������� ���� ����������������������������������������������������������

(15)

������������������������������������������������������������������������������� ��� �������� �������� ��� �������� ������� ����������� �������� ����� ������������� ��� ��� ������������������������������������������������������������������������������������������ ������� ������������� ����� ���� ���������� ����� ���� ����� ��� ��� ������� ��� ������������� ������ ������������� �������� ���������� ��������� �������� ������� ������������ ������� ������� ��� ������������������������� �������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� �� ��������� ��������� ��� ������� ���� �� ��������� ���������� �� �������� ���� ��������������������������������������������������������������������������������������� ���� ��������� ��������� ����� ��� ������� ���� ���� ����� ��� ��� ������� ���� ����������� ������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������� � ��������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ������ ��� �������� ������� ��� �������� ��� ��� ������� ���� ���������� �������� ���� ������� ���� ���������� ���� ���� ����� ����� ���� ������ ���� ����� ����� ���� ������� ��� ���� ���� �������� �������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ����������� ����� ����������� ����� ��� ������ ����� ��� ��� ����������� ��� ����� ����� ����������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������ ���� ����� ����������� ������ �� ������� ������ � �� ����������� ��� ��������� �� �� ������������������������������������������������������������������ ��� ��������� ���������� ����� ����������������� ��������� ��������������� ��� ������������������������������������������������������������������������������������������ ��������� ������� ����� ��� �������� ��������� �� ���� ���������� ������� ������������ �� ������ ���������������������������������������������������������������������������������������� ���� ������������������ ��� ���� ����������� ���� �������� ���� ������������ ����� �� ����� ������ ������� ��� ��������� ������� ����� ��� ���� ��� ����� ��� ��� ��������� ����� ��� �������� ��� ���������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������������� ����� ��������� ����������� ��� �������������� �� ��� ����� ���� ���������� ��� ��� ����������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������ � ������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������

(16)

��������� ��� ����� ����������������� ����� ������� ������ ��������� ����� ���� ���������� �������������������������������������������������������������������������������������� ������������ ��� �� ��������������� ��� ���������� �������� ���� ����������������� ����������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������ ����� ���� ������� ������������� ����� ������ ��������� ��� ������� ��������� ������ ���������� �� ��������� �������� ������� ����� � ���� ������ ��������� �� ������ ���������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ������� ���������� ������� ��������� ������ ��������� ������� ����� ������� ������ �������� ��������� ������������ ��� ��������� ����� ����������������� ������� ����������������� ��� �������� ������� ����� ��� �������� �������������� ��� ���� ��������������� ����������� ������� ������������������������������������ � ����������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ����������� ���������������� ���� �������������� ��� ������������� �������������� ��� ������������������������������������������������������������������������������������� ����������� ��������� ���������� ����� ���� ��������� ��� ���� ������� ����� ������� �������� ��������� �� ��������� ��� ���� ����� ������� ������� ����� �������� ������� ��� �������� ���������� �������� ���������� ���������� ������ ��������� �������� ������������� �������� ������������������������������������������������������������������� � �� �������� �� ��������� �� ���������� �� �� ����� ����� ��� ��� ��� ��������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ������������� ���������������� ���� ���� ����� ������ �������������� ������� ��� ������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ����������� ������������������ ��������� ������������ ��������� ������ ��� ��������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ��������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������� � ������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������ ����������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������

(17)

��� ��������� �������� ������������� ��� ������� ������������������ ����� ��� ���������� ������� ������ ���������� ��� ����� �������� ��������� ����� ���� �������� ����������� ������������� � ������������������������������������������������������������������������� ������� ���� �� ������� ���� ��������� ���������� ������ ����� ������ �������������� ���������� ������ ����� ���� ������� ��� ��� �������� ���� ��� ����� �������� ����� ������������ ������ ������������������������������������������������������������������������������������������ � ��� ���� ��� ��� ���������� � ����� ������ ���� ��� �������������� �������� �� �� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������� � ������������������������������������������������������������������������������ �������������� ��������������������������������������������������������������������� ������ ���� �������� ��� �������� �������� ��� �������� ������� ������������ ������� ��������� ����������������������������������������������������������������������������������� �������� ������� ������ ������ ��� ������� �������� �������� �������� ������������� ������� ������ ������� �������� ������ ���������� ��������� �������� �������� ����������� ������� ���� �������� ������ �������� ������������� �������� �������� �������� �������� ���������� �������� ��������� ��������� ������� ����� ������� ����� ��������� ��������� �������� ���� �������� �������� �������� ������ �������������������� ������� ��������� ������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������� ������� ��������� ������� ������������ ������� ����� �������� ��������������� ��� ��������������� � ��� ��������� ���������������� ���� �������� ������������ ���� ������� ���� ���������� �������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������� � ��� ��������� ����� ���� ���������� �� ���� ����� ��� ��� ������� ������������ ���� ����� ����������������������������������������������������������������������������������������� ������ ��� ������� �� ������ ��������� �������� ����������� ����� ������ ��� �������� ���� �������� ��� �������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ����� ���� ������ ���� �������� ����� ����� ������������ �� ���� ���������� ��� ������ ����� ����

(18)

�������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������� � ��� ��������� ���� ����� ��� ������������ ��������� ��� ����� ����������������� ������� �������������� ���������� �������� ��� ����� �������� ��� �������� ������� ���� ������� ��� ����� ���������� ��� ��� �������� ������� ��������� ������ ��� ����� �������� ������ ��� ����������� ������ ������� ��� ��� �������� ����� ����� �� �������� ���� ����� ��� �� ����������� �� ���� ������� �� ��������� ��� ����� ��������� �� ������ ������ ���� � ��� ���� ������ ���������� �� ����� ��������� � ������������������������������������������������������������������������������ ���������������������������������������������������������������������� � ��� ��������� ���� ����� �������� �� ������ ���������������� ���������������� ���������� �������� ������������ �������� �������������� ��� �������� �������� ��� ����� ����������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ��� �������� ��� ���� ������������ �� ��� ������ �� ������ ��� ��������� ����������� ������ ��� ������ ����������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ������ �� ��� ������ ��� �������� ������ ������� ����� ��� ����� ������ �� ���� ��������� ������� ��� ������� �������� ��� �������� ������� ��� ���������� ����� ������ ������� ��� ����� ��� ����� ������ ������������ � �� �������� �� �������� ����������� ���� ������� ������� ��� ������� �������� ���������� ��� ��� ����������� ������� ��� ������������ ��� ����� �������� ��� ��� �������� ���� ���� �������������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ����� ��� ���������� �������� ����� ��� ��������� ��� ��� �������� ����������� ���� ��������� �������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ����������� �������� �������� �������� ������ ������� ��� ��� �������� ������� ��� ��� ����� ����� ������������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������� ����� ���� ��� ������������ ��� ����� ���� ����� ������ ��� ����� ��� ���� ��� ������ ��������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������� ����������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������

(19)

������ �������� ��� ����� ����������� ������ �� ��� ������������ ��������� ����� ��� ������� ��� ��������� ��� ��� ������ ������� �������� �������� ��� ����������� ������ ������ �� ���� ����� ������������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� �������������������������������������������������������������������������������������� ��������������������������������������������������������������������������������������� ���������������������������������������������������������������������������� �� ���� ���������������� �� ���� ���� ��� ����� ��������� ����� � ����������� ������ ������ ��� ������� ������ ����� ���� ��������� ����� ����� ��������� ��� �������� ��������� ��� ��� ������� ��� ����� ��� ���� ������������ ������������ ����� ������ ���������� ��� ��� ��������� ��� �������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������������ ����� ��� �������� ��� �������� ��� ��� ���������� �� ������ ���� ����������� ��������� ��� ������ ��� ������������������������������������������������������������������������������������������ ��������������������������������������������������������������������������������������� ��� ��������� ����� ��� �������� ���� ������������ ��� ������� ������� ���� ����� ������ ��������������������������������������������������������������������������������������� ���� ��� ��������� �� ���� �������� ��� �� ���� ���������� ��� �������� �� ���� ��� �� ��� ������� ��� ��������������������������� ������� ������ �������� ��� ��� �������� ����������� ��� ������� ��� ��������� ������ ��� ����������� ��� ������� ����� ����� ��� ��� �������� ���� ����� �������� ����� �������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������������������������������������������������������������������ ������������������������������������������������������������������������������������������ ������� ������ ������ ����������� ���� ���� �� ��� �� ���� ������ � �������� ��� ���������������������������������������������������������� � ������������������������������������������������������������������������������ ������� ����� ��� ���������� ����� ���� �������� ����� �������� ����� ���� ��������������� ���������������� ������������� ����� ������ ������ ��� ���� ����� ������ ��������� ���������� ��������������������������������������������������������������� ������������������������ �������������������������������������������������������������������������������������������� ������������������������� � � � �

(20)
(21)

� �

(22)

Références

Documents relatifs

To test whether the vesicular pool of Atat1 promotes the acetyl- ation of -tubulin in MTs, we isolated subcellular fractions from newborn mouse cortices and then assessed

Néanmoins, la dualité des acides (Lewis et Bronsted) est un système dispendieux, dont le recyclage est une opération complexe et par conséquent difficilement applicable à

Cette mutation familiale du gène MME est une substitution d’une base guanine par une base adenine sur le chromosome 3q25.2, ce qui induit un remplacement d’un acide aminé cystéine

En ouvrant cette page avec Netscape composer, vous verrez que le cadre prévu pour accueillir le panoramique a une taille déterminée, choisie par les concepteurs des hyperpaysages

Chaque séance durera deux heures, mais dans la seconde, seule la première heure sera consacrée à l'expérimentation décrite ici ; durant la seconde, les élèves travailleront sur

A time-varying respiratory elastance model is developed with a negative elastic component (E demand ), to describe the driving pressure generated during a patient initiated

The aim of this study was to assess, in three experimental fields representative of the various topoclimatological zones of Luxembourg, the impact of timing of fungicide

Attention to a relation ontology [...] refocuses security discourses to better reflect and appreciate three forms of interconnection that are not sufficiently attended to