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Comparaison des transcriptomes mammaires de chèvres placées dans des (...)

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Academic year: 2022

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Renc. Rech. Ruminants, 2005, 12 303 INTRODUCTION

L’alimentation est le moyen le plus rapide pour moduler la quantité et la composition des matières grasses laitières (MGL) qui conditionnent en grande partie la qualité nutritionnelle du lait recherchée par la filière et les consommateurs (Chilliard et Ferlay, 2004). Les acides gras (AG) du lait ont une double origine (Chilliard et al., 2001) : ils proviennent de la captation et du remaniement des AG circulants ou d’une synthèse de novo par la glande mammaire (GM) qui fait intervenir de nombreux gènes dont la régulation nutritionnelle reste mal connue. Dans le but de relier les effets de l’alimentation sur la composition en AG du lait au métabolisme lipidique mammaire, nous avons entrepris d’identifier, chez les ruminants, les gènes nutri- régulés ayant un impact sur la synthèse et la sécrétion des lipides par la GM. Pour cela, dans un premier temps, une analyse globale de l’expression des gènes dans la GM de chèvres placées dans des conditions nutritionnelles extrêmes a été réalisée.

1. MATERIEL ET METHODES 1.1. PROTOCOLE EXPERIMENTAL

Six chèvres en lactation de race Alpine ont été choisies selon leur numéro de lactation et leur production laitière (PL).

Trois animaux ont été alimentés de façon à couvrir leurs besoins et les 3 autres ont été privés d’alimentation pendant 48 heures.

1.2. DONNEES ZOOTECHNIQUES

La PL, le taux de lactose, les matières protéiques (MP) et les matières grasses (MG) ont été mesurés sur le lait prélevé juste avant l’abattage.

1.3. QUANTIFICATION DES ARN

Les ARN ont été extraits à partir de tissu mammaire prélevé après l’abattage. Les ARNm de gènes candidats ont été quantifiés par RT-PCR quantitative en temps réel (Bernard et al., 2005). L’analyse du transcriptome a été réalisée, après rétro-transcription en présence de traceurs fluorescents (Cy3 et Cy5), selon un protocole de marquage direct, par hybridation sur micro-réseaux d’oligonucléotides (500 sondes géniques spécifiques du tissu mammaire en lactation).

2. RESULTATS

2.1. DONNEES ZOOTECHNIQUES

Comme attendu, la restriction alimentaire a entraîné une chute de la PL (- 89 %), de la sécrétion du lactose (- 93 %), des MP (- 82 %) et des MG (- 67 %).

2.2 ANALYSE PAR RT-PCR EN TEMPS REEL DE L’EXPRESSION DE GENES CANDIDATS DANS LA GM L’étude, par RT-PCR en temps réel, de l’expression de 11 gènes candidats acteurs de la synthèse ou de la sécrétion des lipides (figure 1), a montré une variation significative,

en réponse à la restriction alimentaire, de la quantité d’ARNm pour 3 d’entre eux : l’acétyl-CoA carboxylase (ACC), la lipoprotéine lipase (LPL) et l’acide lysophosphatidique acyltransférase (LPAAT).

Figure 1 : étude de l’expression de gènes acteurs de la synthèse ou de la sécrétion des lipides dans la GM de chèvres alimentées (Alim.) ou restreintes (Res.) par RT-PCR en temps réel : rapports ARNm intérêt/ARNm cyclophiline (témoin).

2.3 ANALYSE DU TRANSCRIPTOME MAMMAIRE Une analyse plus globale des profils d’expression a montré que parmi les 500 gènes représentés sur le micro-réseau utilisé, 6 présentent un signal différentiel d’au moins un facteur 1,5 entre les chèvres alimentées et restreintes. Parmi ces gènes, 2 spécifient des protéines majeures du lait (la caséine

αs2 et l’α-lactalbumine), et 2 des enzymes

impliqués dans la captation ou la synthèse des lipides (la LPL et la synthétase des acides gras ou FAS). Les 2 derniers spécifient l’annexine IV et la γ-actine.

3. DISCUSSION

Les résultats d’analyse d’expression, par RT-PCR et en utilisant le micro-réseau, de 4 des 5 gènes communs aux deux types d’analyse sont en accord (LPL, stéaroyl-CoA désaturase ou SCD, butyrophiline ou BTN, xanthine oxydase ou XOR). Les réductions de l’expression de la caséine αs2, l’α-lactalbumine, la LPL et la FAS, suite à la restriction sont en accord avec les données zootechniques.

Les résultats observés pour les 2 autres gènes (annexine IV et

γ-actine), différentiellement exprimés, sont plus

inattendus.

CONCLUSION

Ce premier répertoire génique restreint a permis d’identifier des gènes nutri-régulés. L’acquisition de répertoires plus complets et leur utilisation pour comparer différents régimes permettront de préciser les mécanismes responsables de l’impact de l’alimentation sur la qualité des MGL.

Bernard L., Leroux C., Bonnet M., Rouel J., Martin P., Chilliard Y., 2005. J. Dairy Res., 72, 250-255

Chilliard Y., Ferlay A., Doreau M., 2001. INRA Prod. Anim., 14, 323-335

Chilliard Y., Ferlay A., 2004. Reprod. Nutr. Dev., 44, 467-492.

Comparaison des transcriptomes mammaires de chèvres placées dans des conditions nutritionnelles extrêmes, pour étudier la synthèse et la sécrétion des lipides du lait

Comparison of mammary transcriptomes from goats under extreme nutritional conditions in order to study milk lipid synthesis and secretion

S. OLLIER (1), S. POLLET (2), C. BAUCHART (1), M. GOUTTE (1), S. BES (1), E. ZALACHAS (2), J. ROUEL (1), L. BERNARD (1), P. MARTIN (2), Y. CHILLIARD (1), C. LEROUX (1)

(1) INRA, Unité de Recherches sur les Herbivores, Theix, 63122 Saint-Genès-Champanelle

(2) INRA, Unité Génomique et Physiologie de la Lactation, 78352 Jouy-en-Josas

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