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Academic year: 2021

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(1)

ﻪﺘﺎﻜﺭﺒﻭ ﻰﻟﺎﻌﺘ ﷲﺍ ﺔﻤﺤﺭ ﻭ ﻡﻜﻴﻠﻋ ﻡﻼﺴﻟﺍ

ﻪﺘﺎﻜﺭﺒﻭ ﻰﻟﺎﻌﺘ ﷲﺍ ﺔﻤﺤﺭ ﻭ ﻡﻜﻴﻠﻋ ﻡﻼﺴﻟﺍ

Bienvenue

Bienvenue

(2)

Université Mentouri Constantine

Faculté des sciences de la nature & de la vie

Th Th è è me me

Contribution à l’étude de la position taxonomique de Perinereis cultrifera

au niveau du bassin méditerranée (Baie d’Alger).

Mémoire de magister en Génétique Moléculaire

Présenté par: Melle FERROUDJ Sana Dirigé par: Dr ROUABAH.A

(3)

Diversité biologique

Appréhender la dynamique du monde du vivant Richesse et multiplicité des êtres vivants

Diversité au sein des espèce ( intraspécifique).

Diversité entre espèce ( interspécifique).

Diversité des écosystème ( écosystémique).

(4)

Compte tenu de l’apport taxonomique nécessaire à de nombreuses activités

axées sur la conservation et l’utilisation durable de la biodiversité, on s’attache à bien

connaître la biologie des populations, et à chercher des éléments

qui permettraient de statuer objectivement sur leur

rang taxonomique.

(5)

Perinereis cultrifera (Grube, 1840) (ver de rocher)

Branchement des annélides;

Un polychète errant à sexe séparé;

Nombreuses soies à fonction natatoire;

Espèce à intérêt économique;

Modèle type d’espèce à comportement différents selon sa localisations

géographiques.

(6)

Mode de reproduction

Mode atoque Mode épitoque

Marseille Alger et

(Marcel, 1962)

Manche Atlantique Méditerranée:

Dans la lagune de Venise (Italie) Sur les côtes de Tunisie

sur le littoral de Annaba et au Nord-Est

Algérien .

(7)

Mode atoque Mode épitoque

Aucune transformation morphologique entre l’état jeune et l’état adulte

Véritable métamorphose pubertaire assurant le passage de l’état

juvénile à l’état hétéronéréidien.

Ce passage est sous controle

de facteurs endocriniens.

(8)

La diversité intraspécifique La diversité génétique

Cycle de vie

Caractéristique phénotypiques

S’agit il d’un complexe d’espèce de même parents « espèces jumelles »

ou d’espèces génétiquement

différenciées ?

(9)

ALGERIE

TUNIS P-Pescade

Figuier ALGER

MER MEDITERRANEE

Localisation des sites d’échantillonnage de Perinereis.cultrifera au niveau de la baie d’Alger- littoral méditerranéen.

Cycle de vie et dynamique de populations de Perinereis cultrifera dans la baie d’Alger

Pointe-Pescade Figuier 50

km

Présentent deux biotopes différents.

(10)

Matériel et méthodes

Echantillonnage Echantillonnage

TriTri

Fixation Fixation

( à marrée basse avec utilisation de l’eau de Javel).

( élimination des vers dont le nombre de sétigère est inférieur au rang de cassure).

( fixation des vers dans du formol à 8 %).

Observation

Observation ( sous une loupe binoculaire).

(11)

Paramètres biométriques

Le poids frais essuyé des vers: par la méthode décrite par Desrosiers et al., ( 1988);

le sexe: une incision a été réalisée au niveau

du 20 ème sétigère et environ 1 ml du liquide coelomique a été prélevée à l’aide d’une pipette pasteur sur une lame et observée sous binoculaire.

Le diamètre ovocytaire: le diamètre de 40 ovocytes pour chaque femelle ont été mesurés à l’aide d’une loupe

binoculaire graduée et calibrée.

(12)

Évolution du diamètre ovocytaire moyen chez les femelles au cours d’un cycle annuel (Janvier 2005- Décembre 2005)

0 50 100 150 200 250

Janvier

vrier

Mars

Avril

Mai

Juin

Juillet

Août

Septembre

Octobre Novem

bre Décembre

Mois

Diamètre ovocytaire (µm)

Pointe-Pescade 212,79µm

147,99µm 150 µm

100µm

(13)

0 10 20 30 40 50 60 70 80

Janvier

vrier

Mars

Avril

Mai

Juin

Juillet

Août Septem

bre

Octobre

Novembre Décem

bre Mois

Pourcentage + Température (°C)

% des sexués P-P

% des sexués Fg T °C Eau de Mer P-P T °C Eau de Mer Fg

Relation entre l’évolution de l’état sexuel et la température de l’eau de mer

(14)

JAN N=56

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55 Nombre d'ndividus

FEV N=63

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

MARS N=59

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55 Femelles Mâles

Indifférenciés

AVR N=60

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nombre d'individus

MAI N=62

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

JUIN N=59

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Histogrammes de fréquence pondérale de la population de

Perinereis cultrifera, échantillonnée à la Pointe-Pescade, au cours d'un cycle annuel Janvier 2005-Décembre 2005

Poids frais essuyé indifférenciés

Sexués

(15)

JUILL N=63

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nomdre d'individus

S EPT N=66

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55 0.55-0.6

Femelles Mâles

Indifférenciés

OCT N=69

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nombre d'individus

NOV N=65

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

DEC N=48

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55 AOUT

N=73

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Histogrammes de fréquence pondérale de la population de

Perinereis cultrifera, échantillonnée à la Pointe-Pescade, au cours d'un cycle annuel Janvier 2005-Décembre 2005.

Poids frais essuyé

(16)

AVR N=71

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nombre d'individus

MAI N=60

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

JUIN N=51

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55 MARS

N=94

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Femelles Mâles

Indifférenciés FEV

N=40

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5 JAN

N=94

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nombre d'individus

Histogrammes de fréquence pondérale de la population de

Perinereis cultrifera, échantillonnée à Figuier, au cours d'un cycle annuel Janvier 2005-Décembre 2005

Poids frais essuyé

(17)

JUILL N=41

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nombred'individus

AOUT N=50

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

SEPT N=60

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55 0.55-0.6 Femelles Mâles

Indifférenciés

OCT N= 42

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Nombred'individus

NOV N=57

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

DEC N=80

0 5 10 15 20 25 30

0-0.05 0.05-0.1

0.1-0.15 0.15-0.20

0.20-0.25 0.25-0.3

0.3-0.35 0.35-0.4

0.4-0.45 0.45-0.5

0.5-0.55

Histogrammes de fréquence pondérale de la population de

Perinereis cultrifera, échantillonnée à Figuier, au cours d'un cycle annuel Janvier 2005-Décembre 2005

Poids frais essuyé

(18)

La caract

La caract é é risation de la phase benthique du cycle de vie de risation de la phase benthique du cycle de vie de deux population de

deux population de Perinereis Perinereis cultrifera cultrifera au niveau du littoral au niveau du littoral Alg Alg é é rois ( Janvier 2005 rois ( Janvier 2005 - - D D é é cembre 2005) cembre 2005)

Les individus se reproduisent exclusivement par Les individus se reproduisent exclusivement par

atoquie atoquie. .

La p La p é é riode de reproduction est longue, s riode de reproduction est longue, s ’é ’é tend sur 5 tend sur 5 à à 6 mois de l

6 mois de l ann ann é é e et semble plus active entre e et semble plus active entre Mars et Mars et Juillet.

Juillet.

La long

La long é é vit vit é é de l de l esp esp è è ce est ce est é é valu valu é é e e à à deux ans deux ans . . La diff

La diff érentiation sexuelle des femelles d é rentiation sexuelle des femelles dé ébute au bute au mois de

mois de Janvier de la premi Janvier de la premi ère ann è re anné ée. e.

Le d Le d é é veloppement ovocytaire s veloppement ovocytaire s ’é ’é tale sur une p tale sur une p é é riode riode de 12 mois de 12 mois. .

La taille des ovocytes

La taille des ovocytes à à maturit maturit é é est comprise entre est comprise entre 150 150 à à 250 250 µ µ m m . .

Le cycle de vie de l’espèce de Perinereis cultrifera présente à Alger est complètement différent

de celui de l’espèce présente au

Nord-Est d’Alger, et Manche Atlantique .

(19)

La présence de deux stratégies de reproduction sur le littoral Algérien, atoque à la baie d’Alger

et épitoque à Annaba;

la variation des paramètres biométriques et du cycle de vie de l’espèce selon la localité géographique des populations,

résultent-elles seulement des différences des conditions écologiques ou sont-elles en relation

avec l’existence d’un complexe d’espèces ?

(20)

Étude comparative au plan Morphologique de quatre populations de Perinereis cultrifera échantillonnées en

Méditerranée:

Pointe Pescade , Figuier (baie d’Alger) Saint-Cloud (Annaba)

Manche Atlantique

(Calvados: Saint-Aubin-sur-mer)

(21)

La taxonomie des polych

La taxonomie des polychè ètes a tes a é ét é souvent basé souvent bas ée sur les e sur les caract

caractè è res res morphom morphom é é triques triques

A l’intérieur de la vaste famille des Nereididae, les diagnoses sont complexes et les caractères génériques et spécifiques sont basés essentiellement sur la forme et la répartition des denticules cornés

« paragnathes » de la trompe dévaginée.

Anneau oral

Anneau maxillaire

Détail de la trompe extroversée de Perinereis cultrifera.

Paragnathes transversaux

(22)

II I II VI V VI

IV III IV VII

VIII VIII

Ordre des groupes de paragnathes indiqué par des chiffres romains (d’après Fauvel, 1923).

Face dorsale Face ventrale

(23)

Détail de la trompe extroversée de Perinereis cultrifera.

Face dorsale

Paragnathes Transversaux

Paragnathes coniques disposés en

Triangle au Niveau du

lobe V

Face dorsale

Lobe IV

Lobe III Lobe VII-VIII

collier

(24)

Matériel et méthode

Quatres populations

Pointe-Pescade

Alger Figuier

Alger Saint-Cloud

Annaba Saint-Aubain Manche 46 vers

Complets atoqueet

30 vers Complets

épitoqueet 46 vers

Complets atoqueet

30 vers Complets

épitoqueet

(25)

Echantillonnage Echantillonnage

TriTri

Fixation Fixation

( à marrée basse avec utilisation de l’eau de Javel).

( élimination des vers incomplet).

( fixation des vers dans du formol à 8 %).

Observation

Observation ( le nombre de sétigère, le nombre de chaque groupe de paragnathes , lobe I- lobe VII-VIII définis par Fauvel (1923) ainsi que le nombre total des

Paragnathes ont été comptéssous une loupe binoculaire).

(26)

Pour les quatre populations aucune relation d’allométrie entre le nombre de paragnathes

et la taille des individus n’a été mise en évidence, ce qui semble indiquer un déterminisme génétique

du patron de distribution

des paragnathes à la surface du proboscis

(27)

Lobe I

0 10 20 30 40

1 2 3

Nombre d'individus

Lobe II

0 5 10 15 20 25 30 35 40

1-2 3-4 5-6 7-8 9-1011-12 13-14

15-16 17-18

19-20 21-22

Lobe III

0 5 10 15 20 25 30 35 40

1-2 3-4 5-6 7-8 9-10

11-12 13-14

P - P e s c a d e Fig u i e r S t - C lo u d S t - A u b i n

Lobe V

0 5 10 15 20 25 30 35 40

1 2 3 4

Nombre d'individus

Lobe VII-VIII

0 5 10 15 20 25 30 35 40

26-30 31-35

36-40 41-45

46-50 51-55

56-60 61-65

66-70 71-75

Total

0 5 10 15 20 25 30 35 40

56-65 66-75

76-85 86-95

96-105 106-115

116-125 126-135

136-145 146-155

156-165

Nombre de paragnathes

Histogramme de distribution de fréquences du nombre total de paragnathes

et du nombre de paragnathes des différents groupes chez les quatre populations étudiées.

(28)

Traitements statistiques Traitements statistiques

Analyse univariée des caractères morphométriques

moyennes arithmétique, l’écart type, les valeurs minimales et maximales.

Analyse bivariée des caractères morphométriques

calcul des coefficients de corrélation de « Bravais-Pearson ».

Analyse multivariée des caractères morphométriques

(MANOVA) Distance de Manhattan.

(29)

Analyse univariée des caractères morphométriques

moyennes arithmétique, l’écart type, les valeurs minimales et maximales

Comparaison des caractères morphométriques des quatre populations à l’aide de l’analyse de la variance à un critère de classification ( ANOVA).

Les groupes de populations qui sont aussi homogène que possible ont été recherché par la méthode de la plus petite différence significative

(30)

Analyse bivariée des caractères morphométriques

calcul des coefficients de corrélation de « Bravais-Pearson ».

Analyse multivariée des caractères morphométriques

(MANOVA) Distance de Manhattan.

(31)

3131--4545 2626-40-40 5555-72-72 3333--4343 22--33

2-2-33 1-1-33 33--44 77--1818

5-5-1818 1111-21-21 1010--2121 77--1818

5-5-1818 11-11-1919 1010--2121 33--1212

1-1-88 6-6-1414 33--1111 33--1212

1-1-1010 10-10-2121

77--1818 33--1212

3-3-1414 1212--1919

77--1414 11--33

1-1-22 1-1-33 11--22

PP--PescadePescade (46)(46) Figuier (46) Figuier (46) St.Cloud St.Cloud (30)(30) St.Aubain St.Aubain(30)(30)

1,811,81 1,691,69 3,733,73 2,482,48 0,220,22

0,280,28 0,860,86 0,300,30 1,751,75

1,831,83 2,192,19 2,932,93 1,761,76

2,072,07 2,352,35 2,892,89 0,840,84

1,011,01 2,092,09 1,461,46 1,411,41

1,391,39 2,512,51 2,392,39 1,421,42

1,511,51 2,142,14 1,701,70 0,270,27

0,280,28 0,610,61 0,450,45

PP--PescadePescade (46)(46) Figuier (46) Figuier (46) St.Cloud St.Cloud (30)(30) St.Aubain St.Aubain(30)(30)

35,5 35,5 35,11 35,11 63,87 63,87 38,83 38,83 2,87

2,87 2,832,83 2,532,53 3,10 3,10 12,33

12,33 12.26 12.26 15,43 15,43 16,03 16,03 11,9

11,9 12,24 12,24 15,90 15,90 16,17 16,17 4,98

4,98 5,045,04 9,339,33 7,93 7,93 7,04

7,04 7,597,59 15,40 15,40 10,37 10,37 6,91

6,91 7,487,48 15,80 15,80 10,17 10,17 1,89

1,89 1,831,83 2,372,37 1,73 1,73 P

P--PescadePescade (46)(46) Figuier (46) Figuier (46) St.Cloud St.Cloud (30)(30) St.Aubain St.Aubain(30)(30)

VII-VII-VIIIVIII VV

IVgIVg IVdIVd

IIIIII IIgIIg

IIdIId II

Caractères morphométriques

MoyenneEcart-typesclasses

Valeurs des moyennes, des écart-types et des gammes dedistribution du nombre de paragnathes composant les différents groupes et du nombre total de paragnayhes chez les quatre populations

(Pp: Pointe-Pescade; Fg: Figuier; St.C: Saint-Cloud (Annaba);

St.A: Saint-Aubain (Manche Atlatique)

Le nombre de paragnathes est différent

d’un individu à l’autre

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