Caractérisation de complexes protéiques : etude statique et dynamique d'association entre des proétines membranaires

Texte intégral

(1)Caractérisation de complexes protéiques : etude statique et dynamique d’association entre des proétines membranaires Myriam Reffay. To cite this version: Myriam Reffay. Caractérisation de complexes protéiques : etude statique et dynamique d’association entre des proétines membranaires. Biophysique [physics.bio-ph]. Université Pierre et Marie Curie Paris VI, 2007. Français. �tel-00442387�. HAL Id: tel-00442387 https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00442387 Submitted on 21 Dec 2009. HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers.. L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d’enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés..

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(28) Remerciements Un travail scientique ne se fait jamais seul. Je suis donc heureuse d'avoir ici l'occasion de remercier tous ceux qui ont apporté leur contribution à ce projet. En premier lieu, je remercie tous les membres de mon jury, notamment mes rapporteurs Marc LE MAIRE et Patricia BASSEREAU qui ont accepté de lire cette thèse alors que les vacances approchaient et ont su, par leurs commentaires, améliorer ce manuscrit. Je tiens à remercier les directeurs du Laboratoire de Physique Statistique Jacques Meunier puis Eric Perez ainsi que ceux du Laboratoire de RMN et Cristallographie Biologiques, Arnaud DUCRUIX et Frédéric DARDEL de m'avoir accueilli au sein de leurs unités. Pendant ces trois années, j'ai eu la chance d'être heureuse de partir le matin travailler dans l'un ou l'autre des laboratoires qui ont hébergé mes expériences et ce pour deux raisons principales qui sont : d'une part le sujet de ma thèse qui m'a intéressée du premier au dernier jour et continue de m'intéresser encore (j'espère que je continuerai à participer à ce projet passionnant) et d'autre part, les ambiances exceptionnelles que j'ai rencontrées dans chacun de ces laboratoires. Au Laboratoire de RMN et Cristallographie Biologiques, je tiens à témoigner toute ma gratitude à Arnaud DUCRUIX pour sa conance, pour ces explications patientes à la nonbiologiste que je suis, pour ces questions aussi qui ont permis la démarche que je décris ici sur la dynamique à deux dimensions. Un grand merci à Houssain BENABDELHAK qui m'a appris tout ce que je sais en biochimie et qui a été à l'initiative de ce projet. Travailler avec lui a été très enrichissant et très agréable. Je le considère vraiment comme un magicien, demandez lui une protéine et il vous la fait apparaître... Je remercie Gilles PHAN qui a commencé sa thèse avec moi. Nous avons réalisé beaucoup d'expériences en parallèle, cela aide à se sentir moins seule quand la purication d'une protéine se refuse. J'ai apprécié notre collaboration et notre amitié, je souhaite sincèrement qu'elles perdureront malgré la n de la thèse. Je remercie aussi Philipppe BENAS pour ses conseils et ses idées, Dimitri LEROUGE pour ses leçons de production de OprM et son humour, Xavier MOREEL pour ses cours de rattrapage en vocabulaire biochimique et ses photos du Canada, Isabelle BROUTIN pour ses conseils en interprétations de données cristallographiques, Frédérique MAURICE, Pierre BARRAUD, Marie-Bernard LASCOMBE, Luc PONCHON, Franck BRACHET, Stéphane RETY, Carine TISNE, Valery LARUE pour leur bonne humeur et l'ambiance qu'ils ont su donner au Laboratoire. Je les remercie pour leur gentillesse. Je voudrais remercier tous ceux qui ont participé à cette aventure au Laboratoire de Physique Statistique. Tout d'abord, je remercie Wladimir URBACH, mon directeur de thèse, pour ce magnique projet qu'il m'a laissé mener à bien selon mes intuitions. J'ai apprécié la conance qu'il m'a témoigné. Grâce à lui j'ai appris le métier de chercheur. Je le remercie aussi pour nos discussions non scientiques sur l'opéra, les spectacles, ... Je vais procéder pour n'oublier personne à un remerciement par ordre géographique. Si on pénètre dans le couloir du grand hall, on rencontre bien vite une porte souvent ouverte qui est le bureau GH28. J'ai passé de très bons moments dans ce bureau et quiconque a déjà contemplé la vue depuis cette pièce sait que le paysage n'y est pour rien. Christine GOURIER est l'âme de ce bureau, j'ai apprécié sa gentillesse, sa disponibilité de tous les.

(29) jours, ces délicieuses attentions culinaires et nos discussions botaniques. Eric PEREZ a aussi été très présent lors de ces trois ans, merci pour les sandwichs du midi et les cerises au printemps. Pour continuer, je remercie le locataire du GH29 Frédéric PINCET pour ses idées, sa compétence scientique qui ont ouvert de nombreuses nouvelles voies dans ce travail. Les résidants du GH30 sont les victimes suivantes de ma petite dénonciation. Je remercie Erol KURTISOVSKI avec lequel j'ai partagé mon bureau pendant un an et qui m'a tout appris en ce qui concerne les rayons X et les lois de dilution. Antoine JEGOU m'a encouragé dans mes expériences de Biomembrane Force Probe, je lui souhaite bon courage pour la suite. Je remercie Jean-Erik GUET pour sa gentillesse. Je remercie aussi Olivier MARNETTE pour les longues discussions que nous avons pu avoir, Feng LI pour sa compagnie lors des samedis de manips. Je salue bien sûr Yann GAMBIN pour son enthousiasme, Ricardo LOPEZ-ESPARZA pour sa présence au deuxième sous-sol et ses chansons mexicaines, Julien HUSSON pour ses explications sur le Biomembrane Force Probe. Je tiens aussi à remercier tous ceux qui ont fait l'ambiance du deuxième sous-sol comme Georoy GUENA, Ulysse DELARBRE, Alberto MOLINA, Clara MARTINEZ, ... Je tiens aussi à dire un chaleureux Merci à tous ceux que j'ai ennuyés lors de ma thèse avec les questions les plus diverses, j'espère que je n'oublierai personne. David TARESTE m'a appris comment reconstituer des protéines en vésicules. Je lui souhaite de continuer à avoir d'aussi beaux résultats sur les SNARE. Je remercie aussi Faris ALAOUI (Physico-chimie Curie) pour ces conseils sur cette dicile étape de reconstitution de protéines. Nicolas TAULIER est arrivé lors de ma troisième année au Laboratoire d'Imagerie Paramétrique. Il m'a beaucoup apporté dans la rédaction du manuscrit. J'espère qu'il me tiendra au courant de l'évolution des expériences. La compréhension des phases avec lesquelles nous travaillons a fait l'objet de nombreuses interrogations. Elles ont nécessité la collaboration de multiples personnes dont Raymond OBER au Collège de France, Laurence NAVAILLES et Fréderic NALLET au CRPP, Pierre LEVITZ au LPMC, Amir MALDONADO à l'Université de Sonora, Dominique LANGEVIN au Laboratoire de Physique du Solide, Jean-Marc VERBAVATZ au LPM ainsi que Frédéric MARCHAL et Patrick GUENOUN au LIONS. Je les remercie pour le temps qu'ils ont accepté de consacré à cette étude, pour leur conseils et leurs idées. Je voudrais aussi saluer Pierre SENS qui a accepté de travailler sur mes "ressorts membranaires". Je concluerai en remerciant tous les personnels du Laboratoire de Physique Statistique que je n'ai pas manqué de solliciter pendant ces trois ans. Tout d'abord Mr et Mme GUERARD qui m'accueillaient chaque matin par un sourire. Je loue comme chacun l'ecacité des trois secrétaires du Laboratoire Nora, Marie et Annie. Je tiens à souligner l'adresse de José et d'Olivier qui parviennent toujours à réaliser tous les objets désirés et facilitent grandement les expériences grâce à leur savoir-faire. Je remercie les électroniciens et les électriciens qui ont su répondre à toutes mes demandes. J'espère n'avoir oublié personne et encore un grand merci pour ces trois années d'intense travail scientique et d'amitié. Cette thèse a été pour moi une formidable expérience..

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