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La complexité cellulaire à la lumière de la physique

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Academic year: 2021

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La complexité cellulaire à la lumière de la physique

Joanny

Moteurs moléculaires

Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

La complexité cellulaire à la lumière de la physique

J.F. Joanny

Physico-Chimie Curie Institut Curie

Marathon des Sciences août 2013

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La complexité cellulaire à la lumière de la physique

Joanny

Moteurs moléculaires

Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Outline

1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Joanny

Moteurs moléculaires

Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Outline

1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Moteurs moléculaires

Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

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1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

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Propriétés mécaniques des tissus

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1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

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3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Organelles et Cytosquelette

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Moteurs moléculaires dans la cellule

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3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Propriétés mécaniques des tissus

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Aknowledgements Curie Theory Group

Fonction des moteurs moléculaires

Protéines motrices

Contraction des muscles (myosines II)

Cils, flagelles et axonèmes (Dynéine) Mitose

Transport

intracellulaire(kinésine, myosine V)

Cellules de l’oreille interne (Myosine 1c) Moteurs rotatifs

Structure des moteurs moléculaires

Vale

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Cytosquelette

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Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Expériences sur molécules uniques

Moteurs processifs, Tests de bille

Détachement du moteur Processivité ∼ 1µm Force d’arrêt 6pN Block Vitesse 1µm/s

Pas des moteurs

Cappello

Pas à la période des microtubules

Pas en arrière

Processivité 200 pas

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Aknowledgements Curie Theory Group

Processivité et tests de motiltié

Test de motilité

Processivité

Taux d’accrochage et de décrochage k on , k off Duty ratio r = k k on

on +k off

Fraction de moteurs liés r , 1/r moteurs par filament

Les myosines non-processives r = 0.02. Filaments de

myosines

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1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

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3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Mouvement de cellules Kératocytes, Verkhovsky

Mouvement de lamellipode

Mouvement rapide : 10µm/min.

Lamellipode plat

Fragments cellulaires

Fragments de Kératocyte :

actine +myosine II

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Elasticité d’une cellule, Asnacios

Mesure de fluage

La complaisance de fluage augmente avec un exposant faible J(t) ∼ t 0.24

Module complexe G(ω) ∼ ω 0.24 . Large distribution de temps de relaxation

Effet actif

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Gels actifs in vitro, G.Koenderink

Gel

Actine-Myosine

Croissance de la contrainte active Gel d’actine-myosine dans un capillaire de 400µm de diamètre Accéléré 180 fois

ATP introduit à t = 0. La contrainte

de tension augmente avec le temps

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

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1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Systèmes actifs

Tissus

Colonies de bactéries Kessler, Goldstein Vibrated granular materials Menon et al.

Colloïdes actifs, Nématiques actifs Ramaswamy et al.

Bancs d’oiseaux et de poissons Vicsek, Toner, Chaté,

Carere

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

Propriétés mécaniques des tissus

Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin Structures cellulaires tubulaires

Aknowledgements Curie Theory Group

Outline

1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

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Propriétés mécaniques des tissus

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Aknowledgements Curie Theory Group

Tissus épithéliaux

Structure épitheliale Division cellulaire Differentiation cellulaire Cellules apoptotiques

Division cellulaire et apoptose

Taux de division k d (ρ, etat biochimique) Taux d’apoptose k a (ρ, etat biochimique)

Mécanique des tissus Comportement solide Comportement liquide

Liquide visco-élastique, temsp de relaxation T

Comportement plastique

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Aknowledgements Curie Theory Group

Description microscopique et macroscopique des tissus

Description microscopique Analogie avec les mousses

Bellaiche, Graner Numerical simulations

Description hydrodynamique continue Grandes distances, temps longs

Equation constitutive pour déterminer le champ de

contrainte

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Pression homéostatique F.Montel, M.Delarue

Expérience de croissance

Expériences indirectes Sac de dialyse Pression exercée par le Dextrane

Expériences directes Sphéroïde en contact avec une solution de Dextrane

Pas de pénétration du

Dextrane dans le

sphéroïde

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Croissance de surface

Dépendance en pression

∂ t V = (k d − k a )V + 4π( 3 4π )

2/3

δk s λV 2/3

Effet des nutriments

Effet d’encombrement

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Outline

1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

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3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Cryptes et Villi

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

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Propriétés mécaniques des tissus

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Aknowledgements Curie Theory Group

Transition de flambage E. Hannezo

Ecoulement dans la couche de cellules

Division dépend de pression et courbure locale Equilibre des forces dans la monocouche Tension locale négative γ = γ 0 − pw , γ 0 = P h h c

Flambage

Equilibre des forces dans la direction verticale Seuil de flambage γ c = (3KE s 2 ) 1 3

Longueur de flambage λ c = 2π (K /E s ) 1 3 , λ ∼ 100µm

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Petit intestin et Colon

Petit intestin : faible couplage à la courbure

Colon : Fort couplage à la

courbure

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

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Structure des villi

Transition entre structures

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Même motif des papilles de la peau

Motif hexagonal

Polarité inversée

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Propriétés mécaniques des tissus

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Aknowledgements Curie Theory Group

Outline

1 Moteurs moléculaires Structure de la cellule

Moteurs moléculaires dans la cellule

2 Cytosquelette

Propriétés mécaniques des cellules Matière active

3 Propriétés mécaniques des tissus Tisssus solides et liquides Villi de l’intestin

Structures cellulaires tubulaires

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

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Propriétés mécaniques des tissus

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Aknowledgements Curie Theory Group

Instabilité des tubes cellulaires

Onde stationnaire

artérielle Dysplasie Fibromusculaire

Trachée de la drosophile

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Structure de la cellule Moteurs moléculaires dans la cellule

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Curie Theory Group

Thomas Risler Philippe Marcq Jacques Prost

Christoph Erlenkämper Jonas Ranft Pierre Recho

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