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Du prélèvement à l’archivage des écailles
Frédéric Marchand, Didier Azam, Jean-Luc Baglinière
To cite this version:
Frédéric Marchand, Didier Azam, Jean-Luc Baglinière. Du prélèvement à l’archivage des écailles.
Colloque de sclérochronologie, Jul 2013, Rennes, France. �hal-02878225�
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Du prélèvement à
l’archivage des écailles
Frédéric Marchand, Didier Azam et Jean-Luc Baglinière 02, 03 et 04 /07/2013
Colloque de
sclérochronologie
Rennes 2013
Thème 2 : « Du Prélèvement au stockage des pièces calcifiées»
Contexte
Recherche
Depuis les premières études dans les années 70 par le laboratoire INRA d’Ecologie Hydrobiologique.
Sur les sites ateliers Oir et Scorff de l’Observatoire de Recherche en Environnement sur les Petits Fleuves Côtiers (ORE PFC).
Essentiellement amphihalins Piégeage
Inventaires
Recherche et évaluation des stocks
Evaluation - gestion des stocks
Déclarations obligatoires ou volontaires des pêcheurs (amateurs et professionnels) de saumons ou de truites de mer auprès de l’ONEMA
CNICS (Centre National d’Interprétation des Captures de Salmonidés migrateurs)
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Prélèvements des échantillons
Matériels et méthodes
Sites de prélèvement en fonction de l’espèce
Saumon fraîchement arrivé de la mer
Saumon en période de reproduction
F. Marchand, D. Azam et J‐L. Baglinière / Du prélèvement à l’archivage des écailles
Scalpel inox
Pinces inox Sachets type
enveloppe bulle
Archigan Mulet Hareng
Perche
Flet Chevaine
Sardine Brochet Salmonidés
Aloses
Colloque de sclérochronologie Rennes, les 02, 03 et 04 juillet 2013
Prélèvements des échantillons
Echantillonnage
Selon les objectifs:
Saumon Lf
IAS-01 (Oir0)
IAS-02 (Oir1.3)
IAS-03 (Oir2.1)
IAS-04 (Oir2.8)
IAS-05 (Oir4.6)
IAS-06 (Oir4.7)
IAS-07 (Oir5.2)
IAS-08 (Oir5.5)
IAS-09 (Oir6)
IAS-10 (Oir6.5)
IAS-11 (PLAV)
IAS-12 (RR11)
<70 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I entre 70 et
90 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I entre 90 et
105 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I entre 106 et
145 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I
>145 Tous Tous Tous Tous Tous Tous Tous Tous Tous Tous Tous Tous
Secteurs
‐ Classes intermédiaires
‐ bien connaître la structure de la population
‐ Subjectif
‐ Parfois peu précis
‐ Echantillonnage systématique d’un nombre défini par classe de tailles
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Tri sous binoculaire Entre 4 et 6 écailles
Ecailles régénérées
Préparation des échantillons
Tri, sélection des écailles
Sur la ligne latérale Ecailles
utilisable
F. Marchand, D. Azam et J-L. Baglinière / Du prélèvement à l’archivage des écailles
Colloque de sclérochronologie Rennes, les 02, 03 et 04 juillet 2013
Entre lame et lame(lles)
Impression sur film plastique Pas de nettoyage
Préparation des échantillons
Nettoyage parfois nécessaire (soude, eau, mécanique)
Bord de l’écaille parfois peu visible
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Matériels, méthodes d’interprétation
Matériel
Lecteur de microfiche
Grossissement (16 - 55 X) Numériseur
Méthodes
Recommandations - guides
Intercalibration : Plusieurs lecteurs
Validation par marquage : Rifflart R., Marchand F., Rivot E., Baglinière J.L., (2006). Scale reading validation for estimating age from tagged fish recapture in a brown trout (Salmo trutta) population. Fisheries Research. 2006, 78 (2‐3) : 380‐384
F. Marchand, D. Azam et J-L. Baglinière / Du prélèvement à l’archivage des écailles
Colloque de sclérochronologie Rennes, les 02, 03 et 04 juillet 2013
Archivage – Collection
Conditionnement - Stockage
sachets numérotés Rangement
Qualité des échantillons
Retour possible pour des vérifications ou analyses ultérieures de génétiques, isotopiques sur des échantillons de plus de 40 ans …
Etagères
Archivage numériques des écailles Pédagogique
Partage
Trace avant destruction pour analyses
Armoires
9 Base de données
F. Marchand, D. Azam et J-L. Baglinière / Du prélèvement à l’archivage des écailles
Colloque de sclérochronologie Rennes, les 02, 03 et 04 juillet 2013
Près de 100 000 sachets écailles à l’U3E
Analyse des besoins en collaboration entre les unités INRA U3E (Rennes), CARRTEL (Thonon les bains) et ECOBIOP (St Pée sur Nivelle)
Evolution vers une base de données intégrant plusieurs types d’échantillons (écailles, otolithes, chair, etc.)
Développement d’une interface web de consultation
Nécessité de référentiels (à alimenter?) 9 Sandre, Darwin Core, …
