Phylogénomique
des lignées photosynthétiques
Denis Baurain1,2,
Henner Brinkmann2, Hervé Philippe2
1Université de Liège 2Université de Montréal
Simpson et Rogers (2004) Curr. Biol. 14:R693-696
Endosymbioses chloroplastiques
1 2
3
Endosymbioses chloroplastiques
Bhattacharya et al. (2004) Bioessays 26:50-60
Chromalveolata
Phylogénomique
Delsuc et al. (2005) Nat. Rev. Genet. 6:361-375 1
2
3
4a 4b
Ph ylo gé nie d es c hlo ro pla ste s 10823 aa (55 gènes) / ML
Ph ylo gé nie d es c ellu le s h ôte s 12776 aa (112 gènes) / ML
variable length bootstrap
N pos Robustesse des phylogénies
N pos / 100x n1 < N pos / 100x n2 < N pos / 100x … N pos
Robustesse des phylogénies
Robustesse des phylogénies
cellules hôtes
Scénario alternatif n x 2
+
1 x 2 n x 3 1 x 2Remerciements Hervé Philippe Henner Brinkmann Naiara Rodriguez-Ezpeleta Vincent Demoulin Nicolas Lartillot