Cette thèse est constituée d’un chapitre introductif ainsi que de deux parties principales. La pre-mière partie présente une synthèse des travaux de l’état de l’art et donne un aperçu sur le contexte de recherche et la problématique dans le cadre de la RI biomédicale, présentée en deux chapitres : Recherche d’information : concepts et modèles(Chapitre 1),Recherche d’information médicale (Cha-pitre 2). La deuxième partie présente nos contributions et est subdivisée en deux cha(Cha-pitres :Analyses exploratoires des facteurs caractéristiques des requêtes médicales expertes (Chapitre 3),Évaluation des requêtes cliniques : Modèles sémantiques pour mieux répondre aux questions PICO. (Chapitre 4). Enfin, nous concluons le manuscrit et discutons des perspectives de recherche. Nous présentons le contenu ci-après.
— Le Chapitre 1,Recherche d’Information : concepts et modèles, présente les principes et concepts de base de la RI classique. Nous présentons en particulier dans la section 2 les notions et concepts de base en RI de manière générale. Ensuite, nous décrivons le processus général de la RI dans la section 2.2. Nous passons par la suite en revue les modèles de RI les plus représentatifs de l’état de l’art dans la section 3. Les techniques de reformulation de requêtes sont présentées dans la section 4. Puis, nous abordons le protocole d’évaluation ainsi que les mesures d’évaluation des performances de la RI dans la section 5.
— Le Chapitre 2,Recherche d’information médicale : principes de base, présente d’une manière spécifique les fondements et les concepts de la RI médicale. Nous présentons en particulier dans la section 2 les principes et notions de base de la RI médicale en exposant
les enjeux du domaine ainsi qu’une description de la typologie de l’information médicale et de quelques ressources termino-ontologiques du domaine. Nous donnons dans la section 3 une classification du besoin du domaine médical, où nous détaillons la typologie des requêtes médicales et les caractéristiques de la recherche experte. Les différents techniques et modèles de la RI médicale sont présentés dans la section 4. Nous présentons les modèles de RI basés sur le paradigme PICO dans la section 5. Nous détaillons ainsi les deux volets de travaux concernant l’identification des éléments PICO et de leur utilisation en RI. Enfin, la section 6 présente les principales campagnes d’évaluation pour la RI médicale et la section 7 donne un aperçu sur les systèmes de RI médicaux.
— Le Chapitre 3,Analyses statistiques exploratoires des requêtes d’experts médicaux, présente nos contributions sur l’analyse des caractéristiques des besoins en information des experts du domaine médical. Le chapitre commence par les motivations et les questions de recherche posées dans le cadre de cette contribution. La section 3 détaille la formalisation des attributs de requêtes, utilisés pour nos analyses exploratoires. Nous décrivons dans la section 4 les données d’analyse. Les résultats des deux principales contributions sont détaillés dans les sections 5 et 6. La section 7 présente une analyse statistique complémentaire conduite sur les requêtes PICO.
— Le chapitre 4,Évaluation des requêtes cliniques : Modèles sémantiques pour mieux répondre aux questions PICO, nous commençons par présenter les motivations concernant la RI médicale basée sur le paradigme PICO ainsi que les hypothèses de recherche dans la section 2. La section 3 détaille notre approche de génération de graphes sémantiques. Nous présentons dans la section 4 nos contributions dans le cadre de l’évaluation des requêtes cliniques PICO, structurés en deux sections : la section 4.1 présente l’approche d’expansion de requêtes, la section 4.2 détaille le modèle d’ordonnancement basé sur une agrégation prioritaire des scores de pertinence que nous détaillons dans ce qui suit :
— Nous présentons une approche sémantique d’expansion de requêtes médicales PICO.
Nous donnons un aperçu général de notre approche sémantique basée sur un modèle de calcul de pertinence combiné, qui exploite les propriétés sémantiques de la requête et les documents pertinents. Nous présentons par la suite les expérimentations, avec une description du cadre expérimental. Les résultats expérimentaux obtenus sont présentés et discutés en utilisant la collection biomédicale dédiée à la médecine basée sur les faits, et les requêtes PICO, appelée CLIREC. Afin de montrer l’efficacité de notre approche de RI, nous comparons nos résultats expérimentaux aux meilleurs résultats obtenus avec un modèle testé sur cette même collection.
— Notre modèle d’appariement sémantique dans le cadre de la RI basée sur le paradigme PICO, qui a pour but d’améliorer la représentation des requêtes PICO et de répondre au mieux à ces questions. Cela comprend un aperçu général de l’architecture du modèle proposé, suivi des différentes approches de calcul de scores proposées : d’une part, le calcul de scores de pertinence des documents utilisant une fonction d’agrégation de scores avec l’ordre de priorité des éléments PICO ; d’autre part, le calcul de scores de pertinence pour ordonner les documents basés sur l’approche combinée qui se base sur les termes et les concepts. Les résultats expérimentaux obtenus sont présentés et discutés. Nous présentons tout d’abord le cadre d’évaluation, puis les résultats des deux contributions majeures : l’évaluation de l’impact de la représentation sémantique des requêtes sur la RI et l’évaluation des performances du modèle proposé. Nous terminons par une évaluation comparative des différentes approches avec les modèles de l’état de l’art.
L’évaluation expérimentale conduite ainsi que les résultats des performances de recherche sont
présentés dans la section 5.
Ce manuscrit se termine par une conclusion générale dans la laquelle nous présentons la synthèse de nos contributions et nous énonçons quelques perspectives de recherche.