Mécanisme général de la CSR

AID va cibler de longues régions répétitives (de 1 à 10 kb), appelée S, situées en amont

deà ha ueàr gio à o sta teà àl’ex eptio àdeàC à uiàpartageàlaà eàr gio à“à ueàCµ .àDura tà

l’ e e tàdeàC“R,àlaàr gio à“µ,à o sid r eà à ha ueàfoisà o eàr gio àdo euse,à aàsu ir

l’a tio àd’áID,àetàparàu à a is eàdeà oupure-ligature, va être fusionnée à une autre région

S accepteuse plus en amont (Kataoka et al., 1980). Ces coupures peuvent avoir lieu à de

multiples localisations sur les régions S. La région Sµ ayant subi une coupure double brin de

l’áDNà aà treàli eà àlaàr gio à“a a tàelleàaussià t à oup eàsousàl’a tio àd’áIDàparàdesà oiesàdeà

r paratio à deà l’áDNà ueà so tà laà lassi alà o -homologous end-joining (C-NHEJ) mais

égalementàl’alter ati eàe d-joining (A-EJ .àCesàdeuxàs st esàdeàr paratio àdeàl’áDNàso tàdesà

voies présentes dans tous les types cellulaires. Cette coupure-ligature au niveau du locus IgH

auraàpourà o s ue eàlaàd l tio àtotaleàetàd fi iti eàdeàl’i for atio àg étique présente

e treàlesàdeuxàr gio sà“àsousàlaàfor eàd’u à piso eà(Matsuoka et al., 1990; von Schwedler et

al., 1990) etàper etàauàl pho teàBàd’exprimer une nouvelle classe d’i u oglo uli e.àDeà

plus, pour uà ueà laà C“Rà ’aià pasà li à “µà a e à “ à der ierà g eà o sta t ,à deà ou eauxà

évènements de CSR pourront avoir lieu avec les régions S plus en aval.

Figure 18 : Mécanisme de CSR. Dans l’exe pleàpr sent, une transcription germinale permet

àáIDàdeà i leràlesàr gio sà“µàetà“ ,àpro o ua tàu eà assureàdou leà ri àdeàl’áDN.àLaàligatureà

deà laà partieà ’à deà “µà a e à laà partieà 3’à deà “ à per età leà ha ge e tà de classe de

l’i u oglo uli eàIgM ersà IgG .à L’épisome est quant à lui éliminé lors des divisions

successives du lymphocyte B.

3.2.Ci lage d’AID su les gio s S

Pouràper ettreà àáIDàd’exer eràso àa tio àdeà oupureàdeàl’áDN,à elle-ci doit dans un

pre ieràte psàa oiràa sà àlaàse tio àd’áDNà àse tio er. Cette approche est possible grâce

à la transcription des régions S (Yancopoulos et al., 1986).àCetteàtra s riptio àper etàd’u eà

partàd’ arteràlesào sta lesàd’áID,à o eàparàexe pleàlaà hro ati e,àetàdeà i leràu eàr gio à

S bien particulière afin de répondre au mieuxà àl’i fe tio à(Manis et al., 2002). Une autre

preu eàdeàl’i porta eàdeàlaàtra s riptio àger i aleàda sàleà i lageàd’áIDàsuràlesàr gio sà“àestà

leàfaità ueàáIDàestàasso i eà àl’áRNàpol raseàIIàdura tàlaàC“Rà(figure 19-1)(Nambu et al.,

2003), présente en plus grande quantité sur les régions S transcrites que sur les régions

voisines (Wang et al., 2009). Cette transcription est possible grâce à un promoteur I présent

en amont de chaque région S (figure 18).àL’unité transcrite est composée du promoteur I et

deà laà r gio à o sta te,à laà r gio à “à te a tà pla eà d’i tro .à C’està laà tra s riptio à ger i aleà

(Gauchat et al., 1990). En cas de délétion du promoteur I, la CSR sur la région S correspondante

ne peut plus avoir lieu (Jung et al., 1993).

Lesà toki esà r gule tà l’a ti it à desà pro oteursà I,à età laà for eà desà pro oteursà r gule tà leà

ciblage de la CSR. Ainsi, une stimulation par du CD40/CD40L et IL4 dirigera la CSR vers IgG1 et

IgE (Esser and Radbruch, 1989; Gauchat et al., 1990).àU eàsti ulatio àparàdeàl’IFN- àa outiraà

àlaàprodu tio àd’IgG aà(Collins and Dunnick, 1993) età àdesàIgáàlorsàd’u eàsti ulatio àparàduà

TGF-βà(Lebman et al., 1990). Du fait de cette activation de la transcription sur une région S

ciblée, la CSR a lieu sur les deux allèles du locus IgH (Radbruch et al., 1986). Ainsi, les cellules

pr se tesàda sàl’e iro e e tàduàl pho teàBàlorsàdeàson activation vont pouvoir diriger

laàC“Ràparàlaàs r tio àdeà toki esàafi àd’ li i eràauà ieuxàl’a tig e.àIlàaà gale e tà t à

o tr à ueàl’a ti it àdesàpro oteursàIà taitàa rueàsousàl’i flue eàdeàlaàr gio àr gulatri eàe à

3’duàlo usàIgH.àL’ li i atio àpartielle des éléments de cette région, à savoir hs3b et hs4, altère

sérieusement la CSR sur toutes les régions S du locus, sans pour autant porter atteinte à la

SHM (Pinaud et al., 2001). La délétion co pl teàdeàlaà3’RRàelleàdesàeffetsà fastesàsuràlaàC“Rà

comme sur la SHM (Rouaud et al., 2013; Vincent-Fabert et al., 2010). Il a en effet été montré

ueàlaà3’RRài teragissaitàdeàfaço àph si ueàa e àlesàpro oteursàIà(Ju et al., 2007, 2011; Pinaud

et al., 2011), interaction qui faciliteraitàleà i lageàd’áIDà(Blagodatski et al., 2009).

áIDà a a tà u eà a tio à deà d a i atio à deà l’áDNà u i ue e tà surà lesà si plesà ri sà

(Chaudhuri et al., 2003; Pham et al., 2003), la transcription des régions S prend une nouvelle

fois son sens. En effet, lors de la trans riptio ,à à à à pairesà deà asesà deà l’áDNà so tà

d sappareill es,àetàseulàleà ri à atri eàestào up àparàl’áRNàe à oursàdeàs th se.àLeà ri à

d’áDNà o - oda tàestàdo àli reàdeàsu iràl’a tio àd’áIDà(figure 19-2)(Nudler, 2009). De plus,

leàpassageàdeàl’áRNàpol raseàIIàaàpourà o s ue eàlaà r atio àdeàsurenroulements négatifs

fa ilita tàleàd roule e tàdeàl’áDNà(Liu and Wang, 1987). Les brins non-transcrits sont riches

en G, tout comme l’áRNàg r .àLeà oupleàáRN-ADN matrice est plus stable que le ADN-ADN

originel. Cette structure, nommée R-loop et détectée dans les régions S activement transcrites

durant la CSR (Kao et al., 2013; Yu et al., 2003),àlaisseàleà ri à o à oda tàdeàlaàr gio à“à àl’ tatà

de simple brin sur de longues distances, pouvant être ciblé par AID (figure 19-3).

Les régions S sont également très riches en AGCT, un motif très ciblé par AID, ce qui permet

de recruter AID s’ilà ’estàpasàpossi leàdeà r eràdesà otifsàe àR-loop lors de la transcription de

la région S (Zarrin et al., 2004). Ainsi, la capacité à former des R-loops accroît le ciblage par

áIDà aisà ’estàpasài dispe sa le.àE àeffet,àilàaà t à o tr à ueàlaàprot i eàdeàr pli atio àáà

(RPA) facilitait la déamination des séquences transcrites ne formant pas de R-loop (Chaudhuri

et al., 2004) en accrochant AID si celle-ci est phosphorylée sur sa sérine 38 (figure 19-4). Mais

elaà ’expli ueàtoujoursàpasà o e tàáIDàfaitàpouràdésaminer le brin matrice, celui-ci étant

o up àparàl’áRNàe à oursàdeàs th se.àC’estài ià ueàre treàe àjeuàl’exoso eàd’áRN.àLeà odelà

présenté est le suivant :àu eàfoisà ueàl’exoso eàd’áRNàli reàlaàpla eàsuràleà ri à atri eàparà

l’ex lusio àouàlaàdestru tio àdeàl’áRNà aissa t,àRPáàlieàetàsta iliseàleàsi pleà ri àd’áDNàtoutà

e àre ruta tàáIDàpouràper ettreàlaàd sa i atio àdeàl’áDNà(Basu et al., 2011).

Figure 9 : Ci lage d’AID su les gio s S g â e à la t a s iptio . Le brin non codant est

représenté en vert, le brin codant en rouge. Dans le cas 1), AID accède au brin non codant

grâce à la bulle de transcription. Dans le cas 2), AID accède au brin non codant grâce aux

sur-e roulsur-e sur-e tsà gatifsàg r sàapr sàleàpassageàdeàl’áRNàpol raseàII.àDa sàleà asà3 ,àáIDà

a deà àl’áDNàgr eàauà otifàdeàR-loop. Dansàleà asà ,àáIDàa deà àl’áDNàgr eà àl’a tio àdeà

RPáàetàdeàl’exoso eà àáRN.