Chapitre 2 : Objectifs et méthodologie
2.2 Méthodes
2.2.8 Analyses spécifiques au troisième article: « Impact of using multiple sources of information and
Définitions des variables utilisées :
Pour cet article, nous avons également évalué, comme issue principale, le statut vaccinal à l’âge de 24 mois. Ce dernier était défini comme étant complet ou incomplet et a été évalué en utilisant les antigènes utilisés pour l’évaluation du statut vaccinal pour chacune des enquêtes. Les critères pour considérer un enfant complètement
vacciné pour chacune des enquêtes ont été présentés à la section 2.2.2 et dans l’article. À l’aide de ces critères, des algorithmes ont été créés afin d’identifier les enfants incomplètement vaccinés ou avec des données de vaccination non valides (e.g. intervalles minimaux entre deux doses non respectés). Pour ces enfants ainsi que ceux sans carnet de vaccination, les vaccinateurs identifiés par les parents dans le formulaire de consentement complété ont été contactés pour valider ou obtenir l’information sur tous les vaccins reçus depuis la naissance. Nous avons créé une variable dichotomique afin de classer les enfants pour lesquels une validation était nécessaire et ceux pour lesquels la validation n’était pas nécessaire (i.e. les enfants avec un statut vaccinal complet et valide selon l’information disponible au carnet et ceux n’ayant reçu aucun vaccin). L’information collectée à partir des deux sources d’information (le carnet de vaccination et le vaccinateur) a été utilisée pour estimer le statut vaccinal final de chaque enfant. La proportion d’enfants complètement vaccinés pour chacun des antigènes incluait toutes les doses reçues avant l’âge de 24 mois.
Pour évaluer l’impact de chacune des étapes de la collecte des données sur les couvertures vaccinales estimées, chacun des répondants a été catégorisé dans une étape où le questionnaire a été complété en fonction de la date de réception de leur questionnaire par l’équipe de recherche et des périodes allouées à chacune des étapes. Les périodes selon l’année de l’enquête sont présentées au Tableau 2.7. L’information n’était pas disponible pour l’année 2006 qui a été exclue de ces analyses. Pour les analyses, les répondants du questionnaire 1 et de la carte postale ont été regroupés puisque la carte postale a été envoyée rapidement après le questionnaire 1 et qu’il était ainsi difficile d’attribuer la réponse à l’une ou l’autre de ces étapes.
Analyses statistiques :
L’analyse a porté sur les cohortes « 2 ans » de chacune des enquêtes afin d’évaluer le calendrier complet de vaccination à l’âge de 24 mois. Nous avons d’abord comparé les caractéristiques des répondants complètement vaccinés uniquement à partir des informations disponibles dans le carnet de vaccination à ceux qui étaient complètement vaccinés après la validation auprès des vaccinateurs. Un test de khi-deux a été utilisé pour faire ces comparaisons. Les couvertures vaccinales ont été estimées en utilisant les critères pour considérer un enfant complètement vacciné présentés à la section 2.2.2. Les intervalles de confiance à 95 % pour les couvertures vaccinales ont été calculés avec la méthode exacte de Clopper & Pearson (1934) (100). L’augmentation dans l’estimation de la couverture vaccinale avec l’ajout des données provenant du vaccinateur a été calculée par la différence entre la couverture vaccinale finale et celle obtenue à l’aide des carnets de vaccination (14). Les taux de réponse de chacune des enquêtes ont considéré au dénominateur tous les enfants de l’échantillon nés au Québec, soit 95 % des 1000 enfants invités de la cohorte 2 ans (n=4779 pour 2008 à 2016) (91). La proportion cumulative d’enfants complètement vaccinés à 24 mois avec l’ajout des répondants à chacune des étapes a été calculée par une moyenne pondérée des couvertures vaccinales (CV) pour chacune
des étapes, avec le nombre de répondants à chacune des étapes, utilisé pour la pondération (Wi), tel que présenté en (e).
(e) 𝐶𝑉 =∑ (𝑊𝑛𝑖 𝑖 𝐶𝑉𝑖)
∑ 𝑤𝑖
Tableau 2.7 Périodes allouées à chacune des étapes de la collecte des données selon l’année de l’enquête de 2008 à 2016. Année de l’enquête Questionnaire 1 (Contact # 1) Carte postale (Contact # 1) Questionnaire 2 (Contact # 2) Relance téléphonique (Contact # 3) Questionnaire 3 (Contact # 4) Enquête 2008 du 2008-05-15 au 2008-05-26 du 2008-05-27 au 2008-06-05 du 2008-06-06 au 2008-06-23 du 2008-06-24 au 2008-11-15 NA Enquête 2010 du 2010-02-08 au 2010-02-26 du 2010-02-27 au 2010-03-09 du 2010-03-10 au 2010-03-17 du 2010-03-18 au 2010-08-10 NA Enquête 2012 du 2012-01-09 au 2012-01-29 du 2012-01-30 au 2012-02-19 du 2012-02-20 au 2012-03-06 du 2012-03-07 au 2012-05-06 du 2012-05-07 au 2012-07-31 Enquête 2014 du 2014-01-07 au 2014-01-28 du 2014-01-29 au 2014-02-09 du 2014-02-10 au 2014-02-23 du 2014-02-24 au 2014-05-14 du 2014-05-15 au 2014-09-30 Enquête 2016 du 2016-06-23 au 2016-07-12 du 2016-07-13 au 2016-07-25 du 2016-07-26 au 2016-08-09 du 2016-08-10 au 2016-09-30 du 2016-10-01 au 2016-11-29 Les mesures de sensibilité, de spécificité et de valeurs prédictives positives et négatives du carnet de vaccination n’ont pas été présentées dans le cadre de cet article, puisque la validation chez le vaccinateur n’était réalisée que pour les enfants avec un statut vaccinal incomplet. Toutefois, ces concepts sont présentés dans plusieurs articles consultés qui ont évalué la validité de l’information provenant du carnet de vaccination et il apparaissait pertinent de les définir ici. Les vaccinateurs ou les dossiers médicaux sont habituellement considérés comme l’étalon-or pour valider l’information provenant du carnet de vaccination, tel que décrit au Tableau 2.8 (14,15,80,81,114). La sensibilité du carnet de vaccination est ainsi généralement définie comme la proportion des enfants qui ont été identifiés complètement vaccinés par le carnet parmi ceux complètement vaccinés selon le vaccinateur (VP / (VP+FN). La spécificité correspond à la proportion des enfants qui ont été identifiés incomplètement vaccinés par le carnet parmi ceux incomplètement vaccinés par le vaccinateur (VN / (VN+FP). La valeur prédictive positive est la proportion des enfants complètement vaccinés parmi les enfants identifiés complètement vaccinés par le carnet (VP / (VP+FP). Enfin, la valeur prédictive négative est la proportion des enfants incomplètement vaccinés parmi les enfants identifiés incomplètement vaccinés par le carnet (VN / (VN+FN) (14,15).
Tableau 2.8 Tableau deux par deux pour la comparaison des informations vaccinales provenant du carnet de vaccination avec celles provenant des vaccinateurs ou des dossiers médicaux
Enfants complètement vaccinés selon les informations provenant du vaccinateurs / dossiers médicaux
Oui Non
Enfants complètement vaccinés selon les informations
provenant du carnet de vaccination
Oui
Vrai positifs (VP) Faux positifs (FP) Non
Faux négatifs (FN) Vrai négatifs (VN)
En assumant que ceux qui répondent après plusieurs efforts ont des caractéristiques similaires aux non répondants, des analyses de sensibilité ont été réalisées afin d’attribuer aux non répondants les couvertures vaccinales estimées auprès des répondants aux contacts 3 et 4. La proportion cumulative d’enfants complètement vaccinés à 24 mois a ainsi été recalculée en incluant la CV estimée chez les non répondants. Ce résultat a été comparé avec la CV obtenue pour l’ensemble des répondants.