Dynamique) biannuelle) de) la) qualité) et) de) la) quantité) de) la) ressource) trophique)
II. MATÉRIEL)ET)MÉTHODES)(Partie)2))
3. Analyse)des)données)
proportions!(%)!relatives!à!la!concentration!totale!d’acide!gras!d’un!échantillon.!Les!résultats!obtenus! par!l’analyse!de!l’isotopie!stable!du!carbone!(13C)!et!de!l’azote!(15N)!sont!les!différences!de!proportion! (‰)! du! carbone! 13! (noté! δ13C)! et! d’azote! 15! (noté! δ15N)! par! rapport! à! celles! des! standards! internationaux!(c.f.)Partie!1).! !
3. Analyse)des)données)
! Les!différences!de!densités!moyennes!des!groupes!composants!la!communauté!planctonique! (i.e.!les!fractions!pico;!et!nano!des!eucaryotes!et!cyanobactéries,!bactéries!HNA!et!LNA,!obtenus!par! l’analyse!de!cytométrie!en!flux),!de!concentrations!et!d’abondances!relatives!moyennes!d’acides!gras! (i.e.! 18:4ω3,! 20:5ω3! et! 22:6ω3),! de! classes! d’acides! gras! (i.e.)SFA,! BFA,! MUFA,! PUFA,! EFA)! et! de! rapports! entre! certains! acides! gras! (i.e.! DHA/EPA,! 18:1ω7/18:1ω9! et! (16:4ω3+18:3ω3)/ω3),! et! des! signatures! isotopiques! du!13C! et!15N,! sont! testées! entre! deux! dates! consécutives! du! suivi! de! l’année! 2014,!sur!l’ensemble!des!deux!années!de!suivi!et!entre!les!mois!de!chacune!des!deux!années!(Tableau! 13).!Les!tests!statistiques!utilisés!sont!une!ANOVA!à!un!facteur!suivi!d’un!test!post;hoc!de!Tukey!HSD.! Les! conditions! d’application! de! ces! tests! paramétriques! sont! vérifiées! par! l’utilisation! d’un! test! de! Shapiro;Wilk! (normalité)! sur! les! résidus! de! l’ANOVA! à! un! facteur! et! un! test! de! Bartlett! (homoscédasticité).!Si!nécessaire,!les!données!brutes!sont!transformées![log(x+1)!ou!racine!carré].!En! cas! de! non;normalité! ou! d’hétéroscédasticité,! des! tests,! non;paramétriques! de! comparaison! de! moyenne,! de! Kruskall;Wallis! sont! effectués.! Le! seuil! de! significativité! utilisé! pour! les! tests! de! normalité,!d’homoscédasticité!et!de!comparaisons!de!moyennes!est!α!<!0,05.!!La! corrélation! entre! les! densités! de! picoeucaryotes! et! les! valeurs! du! ratio! (16:4ω3+18:3ω3)/ω3! est! réalisée!sur!les!données!du!suivi!2014!seulement!et!sur!les!données!regroupées!des!deux!suivis.!Afin! de!tester!la!représentativité!de!ce!ratio!en!tant!que!«!proxy!»!de!la!densité!du!picoplancton!eucaryote,! nous! avons! utilisé! des! tests! de! significativité! du! coefficient! de! corrélation!r! de! Pearson.! Lorsque! la! distribution!conjointe!des!variables!n’est!pas!bi;normale,!des!tests!non;paramétriques!du!coefficient! de!corrélation!des!rangs!rho!de!Spearman!sont!effectués.!Le!seuil!de!significativité!utilisé!est!α!<!0,05.! Ces!analyses!sont!réalisées!à!l’aide!du!logiciel!R!version!2.14.0!sous!l’interface!RStudio!version! 0.98.501.!
Chapitre)3)) )
III. RÉSULTATS)(Partie)2))
!1. Cytométrie)
!La! densité! moyenne! de! picoeucaryotes! planctoniques! est! de! 17330! ±! 952! cellules! mlL;1! et! varie!de!7307!±!430!cellules!ml;1!le!18!mai!à!39673!±!1077!cellules!ml;1!le!11!juin!2014.!A!l’exception! des! 9! et! 15! aout! 2014,! la! densité! moyenne! de! picoeucaryotes! planctoniques! varie! significativement! entre!deux!dates!consécutives!(p)<!0,05!;!Figure!31a).!A!l’échelle!interannuelle,!la!densité!moyenne!de! picoeucaryotes!planctoniques!sur!l’ensemble!des!suivis!ne!varie!pas!(p!>!0,05),!mais!elle!diffère!entre! les!mois!de!mai,!juin!et!aout!2013!et!2014!(p)<!0,05!;!Tableau!13).!
Figure'31)Densité)(cellules)l-1);)moyenne)±)SE))du)pico-)(<)2)µm))et)nanoplancton)(<)20)µm))lors)du) suivi) 2014) a.) Eucaryotes) b.) Cyanobactéries) c.) Bactéries) hétérotrophes.) HNA) =) High) Nucleic) Acids) content);)LNA)=)Low)Nucleic)Acids)content!
Chapitre)3)) )
La!densité!moyenne!de!nanoeucaryotes!planctoniques!est!de!4616!±!164!cellules!ml;1!et!varie!de!2652! ±! 104! cellules! ml;1! le! 18! mai! à! 6775! ±! 320! cellules! ml;1! le! 29! juillet! 2014! (Figure! 28a).! La! densité! moyenne! de! nanoeucaryotes! planctoniques! fluctue! significativement! lors! du! mois! mai,! augmente! significativement! mi;septembre! et! la! dernière! semaine! des! mois! de! juin! et! septembre! et! diminue! significativement! la! première! et! troisième! semaine! du! mois! d’aout! 2014! (p)<! 0,05! ;! Figure! 31a).! La! densité! moyenne! de! nanoeucaryotes! planctoniques! sur! l’ensemble! des! suivis! est! significativement! supérieure!en!2014!par!rapport!à!2013!(p!<!0,05),!et!plus!précisément!cette!différence!est!présente! entre!tous!les!mois!de!2013!et!2014!(p!<!0,05!;!Tableau!13).!
La! fraction! picoplanctonique! représente! en! moyenne! 80! ±! 1%! de! la! composante! eucaryotique! du! seston!échantillonné!en!2014!et!elle!est!significativement!inférieure!à!celle!de!2013!qui!atteignait!une! valeur!moyenne!de!87%!(p)<!0,05).!La!densité!totale!de!cellule!eucaryotique!pélagique!ne!diffère!pas! entre!2013!et!2014!(Tableau!13).!!
Chapitre)3)) )
!
Tableau'13)Résumé)des)résultats)des)comparaisons)de)moyennes,)réalisées)entre)les)deux)années)de)
suivi) 2013) et) 2014,) et) entre) chaque) mois) de) ces) deux) années,) sur) les) variables) de) la) ressource) trophique) pélagique.) Les) astérisques) (*)) représentes) les) différences) significatives) entre) deux) moyennes)(p-<)0,05).)ns):)non-significatif)
!
! !
La!densité!moyenne!des!picocyanobactéries!planctoniques!est!de!2628!±!512!cellules!ml;1!et! varie!de!8!±!4,7!cellules!ml;1!le!12!mai!à!16115!±!53!cellules!ml;1!le!10!octobre!2014!(Figure!31b).!La! densité!moyenne!de!picocyanobactéries!planctoniques!augmente!significativement!de!mai!jusqu’à!fin!
Chapitre)3)) )
et!augmente!de!la!mi;septembre!jusqu’à!la!mi;octobre!(p)<!0,05!;!Figure!31b).!La!densité!moyenne!de! picocyanobactéries! planctoniques! sur! l’ensemble! des! suivis! ne! diffère! pas! entre! 2013! et! 2014! (p! >! 0,05),!cependant!elle!est!significativement!différente!entre!chacun!des!mois!des!deux!suivis!(p!<!0,05!;! Tableau!13).!
La!densité!moyenne!des!nanocyanobactéries!planctoniques!est!de!18!±!3,4!cellules!ml;1!et!varie!de!0! cellules!ml;1!les!07!et!23!septembre!à!85!±!21,3!cellules!ml;1!le!18!juillet!2014!(Figure!31b).!La!densité! moyenne!de!nanocyanobactéries!planctoniques!montre!deux!augmentations!significatives!le!28!mai!et! 10! octobre! 2014! et! un! pic! majeur! le! 18! juillet! 2014,! caractérisé! par! une! augmentation! et! une! diminution! significatives! autour! de! cette! date! (p)<! 0,05! ;! Figure! 31b).! La! densité! moyenne! de! nanoeucaryotes!planctoniques!sur!l’ensemble!des!suivis!est!significativement!supérieure!en!2013!par! rapport!à!2014!(p!<!0,05),!et!plus!précisément!cette!différence!entre!les!années!est!observée!les!mois! de!mai,!juin,!aout!et!septembre!(p!<!0,05!;!Tableau!13).!
!
La!densité!moyenne!de!bactéries!LNA!planctoniques!est!de!369!×103!±!31!×103!cellules!ml;1!et! varie!de!200!×103!±!20!×103!cellules!ml;1!le!29!juillet!à!554!×103!±!12!×103!cellules!ml;1!le!11!juin!2014! (Figure!31c).!A!l’exception!du!mois!de!juillet!et!de!la!mi;septembre!à!fin!octobre,!la!densité!moyenne! de! bactéries! LNA! planctoniques! fluctue! significativement! entre! deux! dates! consécutives! (p)<! 0,05! ;! Figure! 31c),! et! sur! l’ensemble! du! suivi! 2014,! elle! est! significativement! supérieure! à! celle! de! 2013! et! diffère,!à!partir!de!juin,!pour!chaque!mois!des!suivis!(p!<!0,05!;!Tableau!13).!
La!densité!moyenne!de!bactéries!HNA!planctoniques!est!de!897!×103!±!13!×103!cellules!ml;1!et!varie!de! 560!×103!±!24!×103!cellules!ml;1!le!18!mai!à!1404!×103!±!91!×103!cellules!ml;1!le!11!juin!2014!(Figure! 31c).!La!densité!moyenne!de!bactéries!HNA!planctoniques!fluctue!significativement!du!début!du!suivi! jusqu’à!mi;juin,!la!première!et!dernière!semaine!de!juillet,!puis!du!27!aout!2014!jusqu’à!la!fin!du!suivi! (p)<! 0,05! ;! Figure! 31c).! La! densité! moyenne! de! bactéries! HNA! planctoniques! est! significativement! supérieure! en! 2014! par! rapport! à! 2013,! particulièrement! les! mois! de! juin,! juillet! et! septembre! (p! <! 0,05!;!Tableau!13).!
Les! bactéries! HNA! représentent,! pour! les! deux! années! (p)>! 0,05),! 70,1! ±! 0,65%! de! la! composante! bactérienne!planctonique.!
!
Chapitre)3)) )