Famille de HAT et Organisme FonctionComplexeStructure d’un membre typeFamille GNAT

Famille de HAT et Organisme Fonction Complexe Structure d’un membre type

Famille GNAT

GCN5 levure Homme co-activateur

PCAF Homme co-activateur

Famille MYST

Tip60 Homme interaction avec Tat de HIV

MOZ Homme leucemogenèse

Esa1(homologue de Tip60) levure progression du cycle cellulaire Famille CBP/p300

CBP/p300 nématode Homme co-activateur global Famille SRC

ATF-2 levure Homme activateur liant une séquence d’ADN spécifique

SRC1 souris et Homme ?

Famille TAFII 250

levure Homme facteur associé à la protéine TBP (Tata-binding protein)

HAT Bromo

yGCN5 1 439

HAT

Chromo Zn 445

yEsa1 1

TRAPP ou autre GCN5

ou pCAF ADA3

ADA2

SPT3 TAF30 TAF20 TAF

PAF 31 65

PAF 65

TRAPP ou autre Tip60

Tip48 Tip49

BAF53

p400

Figure 6 : Les familles des HAT

Quelques membres de chaque famille sont cités ainsi que leur présence dans différents organismes et leurs fonctions. La structure d’un membre type de chaque famille est illustrée, la lettre en minuscule devant le nom de l’enzyme indique si la protéine illustrée est humaine (h) ou de levure (y).HAT=domaine catalytique d’acétyltransférase d’histones, Bromo=bromodomaine, Chromo=chromodomaine, Zn= domaine de liaison au zinc, C/H-1,2,3=domaines riches en résidus cystéines et histidines, TAD=domaine de transactivation transcriptionnelle, bZip=domaine en structure de tirette à leucines, kinase= domaine à activité kinase.

TAD HAT ^{bZip 505}

ATF-2 1

1875

hTAF

250 1 kinase HAT Bromo Bromo

1 2441

hCBP C/H-1 Bromo C/H-2 HAT C/H-3

HDAC Complexe ou protéines partenaires Famille classique

Classe I Membre type : HDAC1

HDAC1, HDAC2 SIN3 NuRD

YY1, Rb, Sp1, Ikaros, NF-KB, MeCP2, HDAC10

Dnmt1, Dnmt3a, MBD3, Suv39H1, PML-RARb, p53, NF-Y, Aiolos, ER, GR, TR, Mad/Max, Mxi/Max

HDAC3 RbAp48, SMRT, N-CoR, YY1, Rb, HDAC4,5,7,9,10

HDAC6 SIRT2

Classe II

Membre type : HDAC4 HDAC4, HDAC5, HDAC7 recruteurs : MEF2

HDAC9 SMRT, N-CoR

HDAC10 Famille Sir2

(HDAC NAD

-dépendantes) Membre type : SIRT1

SIRT1 p53, PML, PCAF/GCN5, CTIP2, HES1

SIRT2 HDAC6

SIRT3, SIRT5 ?

SIRT4, SIRT6, SIRT7 ?

HDAC1 HDAC2 RbAp46 MBD3 RbAp48

Mi-2 MTA1/2

p66

Aiolos Ikaros Hb Rb

HDAC1 HDAC2 RbAp46 RbAp48 Sin3 SAP18 SAP30 N-CoR SMRTER

SMRT

HDAC _NLS

1 482

NLS HDAC

1 1084

Figure 7 : Les familles des HDAC

Il y a deux familles de HDAC : la classique et Sir2. Les membres de chaque famille sont cités ainsi qu’une partie des protéines partenaires qui sont des régulateurs des HDAC et/ou des cibles des HDAC. Pour HDAC1 et HDAC2, deux complexes multi- protéiques sont illustrés. La structure d’un membre type de chaque famille est illustrée. (HDAC=domaine catalytique de désacétyltransférase des histones, NLS=signal de localisation nucléaire, NAD+ cat= domaine catalytique HDAC et ADP ribosyl transferase)

NAD+ cat

1 555

PRMT Site et type de méthylation Fonction Membre type

PRMT1 H4-R3, asymétrique activation

PRMT2 ? activation

PRMT3 ? activation

PRMT4/CARM1 H3-R2, R17, R26; asymétrique activation

PRMT5/JBP1 H2A et H4; symétrique activation

HKMT

Famille Suv39

Suv39H1 H3-K9 répression

Suv39H2 H3-K9 répression

SETDB1 H3-K9 répression

G9A H3-K27 répression

Famille SET1

hSET1 H3-K4 activation

hSET2

EZH2 H3-K27 répression

Famille SET2

NSD1 H3-K36 activation

SAMB CD

1 392

Figure 8 : Les familles des méthyltransférases d’histones

Il y a deux types de méthyltransférases : les PRMT qui rajoutent un groupement méthyl sur des arginines et les HKMT qui le rajoutent sur des lysines. Certains membres (trouvés chez les mammifères) de chaque type de méthyltransférases sont indiqués mais cette liste n’est pas complète. La colonne « fonction » décrit la conséquence de cette modification sur la transcription.

SAMB=domaine de liaison du substrat S-adenosyl, CD=domaine conservée, Chromo=chromodomaine, SET=domaine catalytique, SANT= domaine à activité hélicase, PHD=homéodomaine de plante, PwwP= Pro-Trp-Trp-Pro

SET

1 412

hPRMT4/CARM1

Chromo

SET

1 SANT SANT 746

Suv39H1

EZH2

1 PwwP PHD PwwP SET PHD 1388