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Texte intégral

(1)

Université Hassan II

Faculté de Médecine et de Pharmacie Casablanca

- Cours de Biologie Cellulaire-

Pr. Tahiri Jouti N.

Année Universitaire 2015-2016

(2)

Le Noyau

Interphasique

(3)

Introduction

Noyau

- centre organisateur de la cellule.

- présent dans la cellule eucaryote:

eu = vrai, caryos = noyau

- présent dans la cellule en Interphase

- disparaît au moment de la division cellulaire.

(4)

I / Définition et caractères généraux

- Organite volumineux , ovoïde - 6 % du volume cellulaire

- Contient l’information génétique - Caractérisé par : taille

forme

nombre

position

(5)

Taille

- 5 à 6 μm en fonction du type cellulaire - Volume donné par le rapport

nucléo-cytoplasmique : Vn/Vc

- > 1 dans les cellules indifférenciées - < 0,15 dans les cellules adultes

Sauf lymphocytes : RNC ~ O,8

(6)

Forme (1)

- Fonction du :

►type cellulaire arrondi :

Cellules lymphoïdes neurones

hépatocytes

(7)

Forme (2)

- Fonction du :

►type cellulaire ovoïde :

cellules musculaires, fibroblastes,

entérocytes

(8)

Forme (3)

- Fonction du :

►type cellulaire polylobé :

polynucléaires

(9)

Forme (4)

- stade de différenciation: encoché, « clivé » : dans les cellules lymphoïdes

- état fonctionnel

(10)

Nombre (1)

- Absent : hématie, kératinocyte….

(11)

Nombre (2)

- Généralement unique

- C. binucléées : hépatocytes,

cellules cardiaques, C. épithélium urinaire

(12)

Nombre (3)

- C. plurinucléées : ostéoclastes

30 à 50 noyaux

(13)

Position

- Centrale : lymphocytes, fibroblastes, C. des glandes endocrines

- Refoulé à la base de la cellule : C. muqueuses, C.exocrines

- Périphérique :

C. musculaires, adipocytes

(14)

Mise en évidence (1)

- Coloration standard : hématéine / éosine

► hématéine → chromatine colorée en bleu

► liaison due à l’électronégativité des groupements phosphates

►basophilie du noyau

(15)

Mise en évidence (2)

Colorations spéciales :

Au Bleu de Toluidine, Coloration de Feulgen Test de Brachet :

- Vert de méthyle → chromatine (noyau) en vert

- Pyronine → ARN (cytoplasme) en rouge traitement par DNAse, RNAse

→ annule la coloration → spécifité

(16)

II / Constituants du noyau

- L’enveloppe nucléaire - Le nucléole

- Le nucléoplasme - La chromatine

(17)

Enveloppe nucléaire

- Double membrane : externe, interne

- Lamina nucléaire

- Espace périnucléaire

- Pores nucléaires ou complexes de pores

(18)

Membrane externe

- Fait face au cytoplasme

- Trilaminaire : 6 à 8 nm épaisseur

- Porte des ribosomes

- Continuité avec REG : ponts (système endomembranaire)

(19)

Membrane interne

- En contact avec le nucléoplasme et la chromatine

- Trilaminaire : 6 à 8 nm épaisseur

- Tapissée par la lamina nucléaire du côté du nucléoplasme

(20)

Lamina nucléaire (1)

- Tapisse la face interne de la membrane interne

- Constituée par des filaments de lamine qui forment une structure grillagée

- Lamines: protéines, filaments intermédiaires

membres de la famille

des protéines du cytosquelette

(21)

Lamina nucléaire (2)

- deux types de lamines : - type A (lamine A et lamine C).

- type B (lamine B1 et lamine B2)

- Lamines A présentes dans toutes les cellules

- Lamines B présentes seulement dans les cellules indifférenciées

(22)

Lamina nucléaire (3)

- Stabilise

- l’enveloppe nucléaire

- les pores nucléaires à travers leur arrangement spatial

maintien de la forme du noyau et résistance mécanique de l’enveloppe nucléaire.

- fixe la chromatine

→ organisation et fonctionnement du génome:

réplication de l’ADN et transcription à travers la fixation à des facteurs de transcription

(23)

Espace périnucléaire

- Occupé par partie C-terminale des protéines intrinsèques de la membrane interne

- Protéines caractérisées :

- Peptides associés aux lamines (Lamine Associated Peptide) « LAP »

- Récepteur de la lamine B - Emerine

(24)

- Ensemble de troubles liés à une altération des lamines

- Une dizaine de pathologies déjà connue, près de 200 mutations du gène LMNA (code pour les protéines lamines A et C)

- Pathologies caractérisées par un spectre large de troubles musculaires, cardiaques, neurologiques, osseux ou cutanés.

laminopathies: Maladies génétiques dues à des mutations des lamines de type A (lamines A et C)

(25)

Nombreuses mutations décrites - Dystrophie musculaire d’Emery-Dreifuss

- Dystrophie musculaire de type IB et la cardiomyopathie dilatée

- Lipodystrophie de type Dunningan (pathologie du tissu adipeux)

- Dysplasie mandibuloacrale (pathologie affectant le développement osseux)

- Maladie de Charcot Marie Tooth (pathologie du nerf périphérique)

- Progéria (vieillissement prématuré) due à l'accumulation de lamine A

LAMINOPATHIES

(26)

- Progéria (vieillissement prématuré) due à l'accumulation de lamine A

Mutation du gène LMNA

situé sur le chromosome 1 production d’une

protéine tronquée: la progérine, qui

- reste ancrée dans la membrane du noyau des cellules

- s’y accumule

- entraîne sa déformation et des dysfonctions.

(27)

Protéines impliquées dans les

Maladies Neuromusculaires

(28)

Complexe de pore nucléaire (1)

-

Structure annulaire de 120 nm de diamètre 200 nm de hauteur - Constituée de 2 anneaux : - cytoplasmique

- nucléaire - 8 sous unités globulaires par anneau

- 50 protéines différentes : Nucléoporines

(29)

Complexe de pore nucléaire (2)

- Anneau cytoplasmique :

8 fibrilles de 50 nm long - Anneau nucléaire :

8 filaments de 100 nm long fixés sur

un anneau distal de diamètre plus faible

→ formation d’un « panier ou cage nucléaire »

(30)

Complexe de pore nucléaire (3)

(31)

Complexe de pore nucléaire (4)

(32)

Complexe de pore nucléaire (5)

Le complexe de pore est :

- encastré dans l’enveloppe nucléaire par un anneau luminal

- stabilisé par des protéines

membranaires dont les lamines

(33)

Complexe de pore nucléaire (6)

- Nucléoporines : 50 protéines différentes localisées :

- dans les sous unités (globulaires) des anneaux

- au niveau des fibrilles et des filaments

interviennent :

- reconnaissance et guidage des

molécules à travers le complexe

(34)

Rôle de l’enveloppe nucléaire (1)

Transports nucléo-cytoplasmiques

→ diffusion passive : PM < 5 kD

entrée de nucléotides, ions, enzymes, histones

→ diffusion facilitée : PM de 5 à 50 kD

→ mécanisme actif : PM > 50 kD

sortie d’ARN et de pré-ribosomes grâce à des récepteurs spécifiques

(35)

Dalton

Un dalton = 1/12e de la masse d'un atome de carbone

= la masse d'un atome d‘hydrogène

Le kilodalton (kDa) est beaucoup plus utilisé que le dalton en biologie et biochimie, du fait de la taille des molécules étudiées

Molécules cellulaires : masse comprise entre 20 et 100 kDa

Un acide aminé : 110 Da Une base : 330 Da

(36)

Rôle de l’enveloppe nucléaire (2)

- Transport bidirectionnel s'effectuant continuellement entre le cytosol et le noyau des:

- Protéines fonctionnant dans le noyau: les histones, les ADN et ARN polymérases, les protéines régulatrices de gènes et les protéines de maturation de l'ARN sélectivement importées du cytosol au compartiment nucléaire.

- ARNt et des ARNm synthétisés dans le compartiment nucléaire, puis exportés dans le cytosol

(37)

Transports Nucléo-Cytoplasmiques

Processus d'importation et d'exportation sélectifs - Exemples:

- les ARNm exportés qu'après modification par les réactions de maturation de l'ARN dans le noyau.

- les protéines ribosomiques sont 1- fabriquées dans le cytosol

2- importées dans le noyau où elles s'assemblent en particules avec l'ARN ribosomique néoformé

3- puis exportées dans le cytosol en tant que partie des sous-unités ribosomiques.

Chaque étape nécessite un transport sélectif au travers de l'enveloppe nucléaire.

(38)

• Sélectivité du processus d'importation nucléaire réside dans les signaux de localisation nucléaire (NLS pour Nuclear Localization Signal) qui n'existent que sur les protéines nucléaires.

NLS: une ou deux séquences riches en lysine et arginine (acides aminés de charge positive) dont la séquence varie entre les différentes protéines nucléaires.

Importation Nucléaire (1)

(39)

• Protéines nucléaires peuvent être transportées au travers du complexe du pore dans leur conformation complètement repliée

• Sous-unités ribosomiques néoformées transportées à l'extérieur du noyau sous forme de la particule assemblée

• les très grosses particules semblent se rétrécir lorsqu'elles se faufilent au travers du complexe:

restructuration pendant leur transport :

Exemple: Exportation de certains très gros ARNm

Importation Nucléaire (2)

(40)

Récepteurs d'importation: protéines cytosoliques solubles qui se fixent à la fois sur:

- les signaux de localisation nucléaire (NLS) de la protéine à transporter

et sur

- les nucléoporines, dont certaines forment les fibrilles

Importation Nucléaire (3)

(41)

- Fibrilles et autres nucléoporines contiennent un grand nombre de courtes répétitions d'acides aminés à base de phénylalanine et de glycine, appelées répétitions FG

- Les répétitions FG :

- Sont des sites de liaison aux récepteurs d'importation.

- tapissent la voie empruntée au travers du complexe du pore nucléaire par les récepteurs d'importation chargés de leur cargaison protéique.

Importation Nucléaire (4)

(42)

- Ces complexes protéiques se déplacent le long de la voie en se fixant, se dissociant et se fixant à nouveau de façon répétitive sur les séquences répétitives adjacentes.

- Une fois dans le noyau, les récepteurs d'importation se dissocient de leur cargaison et retournent dans le cytosol.

Importation Nucléaire (5)

Cargaison

protéique 1 Cargaison

protéique 2 Cargaison protéique 3

Signal de

localisation nucléaire Récepteur

d’importation nucléaire

(43)

Les récepteurs d'importation nucléaire:

- ne se fixent pas toujours directement sur les protéines nucléaires.

- utilisent parfois des protéines adaptatrices supplémentaires formant un pont entre le récepteur d'importation et les signaux de localisation nucléaire de la protéine à transporter

Importation Nucléaire (6)

(44)

Importation Nucléaire (7)

Cargaison

protéique Cargaison

protéique 2 Cargaison protéique 3

Protéine adaptatrice d’importation

nucléaire Récepteur

d’importation nucléaire

Signal de

localisation nucléaire

(45)

- l'exportation nucléaire s’effectue comme l’importation nucléaire, mais dans le sens inverse

- Les récepteurs d'exportation nucléaire structurellement proches des récepteurs d'importation nucléaire et codés par une même famille de gènes: celle des récepteurs de transport nucléaire ou

Caryophérines

Exportation Nucléaire (1)

(46)

Le transport consomme de l'énergie

- L’énergie provient de l'hydrolyse d'un GTP par une GTPase monomérique appelée Ran.

- La GTPase Ran actionne le transport directionnel au travers du complexe du pore nucléaire

- Ran est retrouvée à la lois dans le cytosol et dans le noyau et est nécessaire aux systèmes d'importation et d'exportation.

GTPase Ran (GuanineTriphosphatase Ran )

(47)

Ran: commutateur moléculaire existant sous deux conformations, selon qu'un GTP ou un GDP y est fixé

Conversion déclenchée par deux protéines régulatrices spécifiques du Ran :

- Protéine d'activation de la GTPase: GAP = GTP Activating Protein, cytosolique

- Facteur d'échange de la guanine, la GEF = Guanine Exchange Factor, nucléaire

GTPase Ran (GuanineTriphosphatase Ran )

(48)

Protéine d'activation de la GTPase: GAP = GTP Activating Protein, cytosolique

- déclenche l'hydrolyse du GTP

- transforme Ran-GTP en Ran-GDP

GAP = GTP Activating Protein

(49)

Facteur d'échange de la guanine, la GEF = Guanine Exchange Factor, nucléaire

- favorise l'échange du GDP en GTP - transforme Ran-GDP en Ran-GTP

GEF = Guanine Exchange Factor

(50)

GTPase Ran (GuanineTriphosphatase Ran )

(51)

CYTOSOL

NOYAU

(52)

GTPase Ran (GuanineTriphosphatase Ran )

(53)

Rôle de l’enveloppe nucléaire (2)

Nombre de CPN augmente en fonction de l’activité cellulaire

- Plus le noyau est transcriptionnellement actif, plus le nombre de complexes du pore nucléaire est important

- L'enveloppe nucléaire d'une cellule de mammifères contient entre 3000 et 4000 complexes du pore.

- Si la cellule synthétise de l'ADN, elle doit importer du cytosol environ 106 molécules d'histones toutes les 3 minutes pour empaqueter l'ADN néosynthétisé dans la chromatine.

(54)

Rôle de l’enveloppe nucléaire (3)

nombre de CPN augmente fonction de l’activité cellulaire.

chaque complexe du pore doit transporter 100 molécules histones par minute.

Dans une cellule de mammifères en prolifération

►1 MILLION de molécules transitent par les Complexes de Pores Nucléaires par MINUTE

(55)

Biogénèse de l’enveloppe nucléaire (1)

Les complexes de pores nucléaires - restent intacts

- seront réassociés lors de la

formation de l’enveloppe nucléaire

(56)

Biogénèse de l’enveloppe nucléaire (2)

- Apparaît en interphase

- Est le produit de :

- la fusion autour de la lamina des vésicules du RE

associée

- à des synthèses cytoplasmiques

- Disparaît en mitose après dissociation de la lamina

(57)

Biogénèse de l’enveloppe nucléaire (3)

(58)

Nucléole (1)

En microscopie optique :

- Organite nucléaire sphérique ou ovoïde - N’est pas limité par une membrane

- Incomplètement cerné par la chromatine - Disparaît en mitose

(59)

Nucléole (2)

En microscopie électronique, comporte 2 zones:

- Régions claires - Régions sombres

* Une zone périphérique granulaire : ARN, pré-ribosomes

* Une zone centrale fibrillaire : ADN ribosomal ou organisateur nucléolaire Les 2 zones contiennent des protéines

(60)

Nucléole (3)

(61)

Nucléole (4)

L’ADNr ou organisateur nucléolaire correspond à des boucles

- situées sur les CHS 13,14,15,21,22

- constituent, en fin de mitose, 10 petits nucléoles qui fusionneront

► nucléole unique

(62)

Nucléole : Synthèse des ribosomes

1/ transcription de l’ADNr en ARNr 45S 2/ clivage de l’ARNr 45S en :

ARNr 28S, 18S, 5,8S

3/ ARN 5S tanscrit à partir du CHS 1

4/ début d’association avec des protéines provenant du cytosol

(63)

Nucléole (4)

5/ Assemblage des protéines cytosoliques et des ARNr

deux sous-unités pré-ribosomiques 6/ Passage des pré-ribosomes à travers

les pores nucléaires

(64)

Nucléole (5)

cellule au repos → diminution du nombre des nucléoles

Synthèse protéique → augmentation de la taille du nucléole

(65)

Nucléoplasme (1)

- Gel renfermant : → nucléoles

→ chromatine

→ nucléocytosquelette

- Composition biochimique proche de celle du hyaloplasme

(66)

Nucléoplasme (2)

- Nucléocytosquelette constitué de protéines fibreuses dont l’actine

- Siège du métabolisme nucléaire :

Réplication de l’ADN, transcription de

l’ARN….

(67)

Chromatine (1)

- correspond à la forme décondensée des chromosomes

- structure complexe constituée : - d’ADN

- de protéines

- ~ 2 mètres d’ADN doivent être contenus dans un noyau de quelques microns

(68)

Chromatine (2)

- On distingue 2 types de chromatine :

- Euchromatine ou chromatine diffuse

- Hétérochromatine ou chromatine condensée

et la Chromatine sexuelle ou Corpuscule de Barr

(69)

Chromatine (3)

L’euchromatine :

- totalement décondensée pendant l’interphase

- répartie dans le nucléoplasme

- active sur le plan transcriptionnel - 10% de la chromatine totale

(70)

L’Euchromatine

correspond aux zones

grises

(71)

Chromatine (4)

L’hétérochromatine :

- plus ou moins condensée tout au long du cycle cellulaire

- localisée :

* principalement en périphérie

- du noyau (contre la lamina nucléaire) - du nucléole

* dispersée en mottes dans le nucléoplasme

(72)

L’Hétérochromatine

(73)

Chromatine (5)

L’hétérochromatine constitutive:

- 90% de la chromatine totale

- inactive sur le plan transcriptionnel

- située à proximité des centromères et des télomères

(74)

Chromatine (6)

Chromatine Sexuelle ou Corpuscule de Barr :

- petite masse d’hétérochromatine située contre l’enveloppe nucléaire

- résulte de l’inactivation au hasard de l’un des CHS X chez la FEMME

- Corpuscule de Barr n’existe pas chez l’homme normal

(75)

Chromatine Sexuelle ou Corpuscule de Barr

Chromatine Sexuelle :

Corpuscule de Barr

(76)

Chromatine Sexuelle ou Corpuscule de Barr

Chromatine Sexuelle :

Corpuscule de Barr

(77)

- Nombre de X – 1 = Nombre de Corpuscules de Barr

- Individu A : 46 chromosomes dont XY, 0 corpuscule de Barr

- Individu B : 46 chromosomes dont XX, 1 corpuscule de Barr

Chromatine Sexuelle :

Corpuscule de Barr

(78)

Chromatine Sexuelle :

Corpuscule de Barr

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