Mise au point d’un protocole d’inoculation intra-mammaire avec Staphylococcus aureus visant à comparer la sensibilité de deux lignées de souris à l’infection

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Eprints ID : 10733

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Gérard, Marion. Mise au point d’un protocole d’inoculation

intra-mammaire avec Staphylococcus aureus visant à comparer la sensibilité de deux lignées de souris à l’infection. Thèse d'exercice,

Médecine vétérinaire, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse - ENVT, 2013, 246 p.

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ANNEE 2013 THESE : 2013 – TOU 3 – 4061

MISE AU POINT D’UN PROTOCOLE

D’INOCULATION INTRA-MAMMAIRE AVEC

STAPHYLOCOCCUS AUREUS VISANT A

COMPARER LA SENSIBILITÉ DE DEUX LIGNÉES

DE SOURIS A L’INFECTION

_________________

THESE

pour obtenir le grade de DOCTEUR VETERINAIRE

DIPLOME D’ETAT

présentée et soutenue publiquement devant l’Université Paul-Sabatier de Toulouse

par

GERARD Marion

Née, le 23 juillet 1988 à FONTENAY AUX ROSES (92)

___________

Directeur de thèse : Mme Séverine BOULLIER

___________

JURY

PRESIDENT :

Mme Bettina COUDERC

ASSESSEURS :

Mme Séverine BOULLIER

Mme Isabelle RAYMOND-LETRON

Professeur à l’Université Paul-Sabatier de TOULOUSE

Maître de Conférences à l’Ecole Nationale Vétérinaire de TOULOUSE Maître de Conférences à l’Ecole Nationale Vétérinaire de TOULOUSE

Minis tère de l' Agriculture de l’ Agroa limentaire et de la Forê t ECOLE N ATION AL E VETERIN AIRE DE TOULOUSE

Directeur : M. A. MILON

PROFESSEURS DE CLASSE EXCEPTIONNELLE

M. AUTEFAGE André, Pathologie chirurgicale

M. CORPET Denis, Science de l'Aliment et Technologies dans les Industries agro-alimentaires M DELVERDIER Maxence, Anatomie Pathologique

M. ENJALBERT Francis, Alimentation

M. EUZEBY Jean, Pathologie générale, Microbiologie, Immunologie M. FRANC Michel, Parasitologie et Maladies parasitaires

M. MARTINEAU Guy, Pathologie médicale du Bétail et des Animaux de Basse-cour M. PETIT Claude, Pharmacie et Toxicologie

M. REGNIER Alain, Physiopathologie oculaire M. SAUTET Jean, Anatomie

M. SCHELCHER François, Pathologie médicale du Bétail et des Animaux de Basse-cour

PROFESSEURS 1° CLASSE

M. BERTHELOT Xavier, Pathologie de la Reproduction M. BOUSQUET-MELOU Alain, Physiologie et Thérapeutique Mme CLAUW Martine, Pharmacie-Toxicologie

M. CONCORDET Didier, Mathématiques, Statistiques, Modélisation M. FOUCRAS Gilles, Pathologie des ruminants

M. LEFEBVRE Hervé, Physiologie et Thérapeutique

PROFESSEURS 2° CLASSE

Mme BENARD Geneviève, Hygiène et Industrie des Denrées alimentaires d'Origine animale M. BERTAGNOLI Stéphane, Pathologie infectieuse

Mme CHASTANT-MAILLARD Sylvie, Pathologie de la Reproduction M. DUCOS Alain, Zootechnie

M. DUCOS DE LAHITTE Jacques, Parasitologie et Maladies parasitaires

Mme GAYRARD-TROY Véronique, Physiologie de la Reproduction, Endocrinologie M. GUERRE Philippe, Pharmacie et Toxicologie

Mme HAGEN-PICARD Nicole, Pathologie de la Reproduction M. JACQUIET Philippe, Parasitologie et Maladies Parasitaires M. LIGNEREUX Yves, Anatomie

M MEYER Gilles, Pathologie des ruminants M. PICAVET Dominique, Pathologie infectieuse M. SANS Pierre, Productions animales

Mme TRUMEL Catherine, Pathologie médicale des Equidés et Carnivores

PROFESSEURS CERTIFIES DE L’ENSEIGNEMENT AGRICOLE

Mme MICHAUD Françoise, Professeur d'Anglais M SEVERAC Benoît, Professeur d'Anglais

MATRES DE CONFERENCES HORS CLASSE

M. BAILLY Jean-Denis, Hygiène et Industrie des Denrées alimentaires d'Origine animale M. BERGONIER Dominique, Pathologie de la Reproduction

Mlle BOULLIER Séverine, Immunologie générale et médicale

Mme BOURGES-ABELLA Nathalie, Histologie, Anatomie pathologique

M. BRUGERE Hubert, Hygiène et Industrie des Denrées alimentaires d'Origine animale Mlle DIQUELOU Armelle, Pathologie médicale des Equidés et des Carnivores

M. JOUGLAR Jean-Yves, Pathologie médicale du Bétail et des Animaux de Basse-cour Mme LETRON-RAYMOND Isabelle, Anatomie pathologique

M. LYAZRHI Faouzi, Statistiques biologiques et Mathématiques M. MATHON Didier, Pathologie chirurgicale

Mme PRIYMENKO Nathalie, Alimentation

MAITRES DE CONFERENCES (classe Normale)

M. ASIMUS Erik, Pathologie chirurgicale

Mme BENNIS-BRET Lydie, Physique et Chimie biologiques et médicales

Mlle BIBBAL Delphine, Hygiène et Industrie des Denrées alimentaires d'Origine animale Mme BOUCLAINVILLE-CAMUS Christelle, Biologie cellulaire et moléculaire

Mlle CADIERGUES Marie-Christine, Dermatologie M. CONCHOU Fabrice, Imagerie médicale M. CORBIERE Fabien, Pathologie des ruminants M. CUEVAS RAMOS Gabriel, Chirurgie Equine

Mme DANIELS Hélène, Microbiologie-Pathologie infectieuse

M. DOSSIN Olivier, Pathologie médicale des Equidés et des Carnivores Mlle FERRAN Aude, Physiologie

M. GUERIN Jean-Luc, Elevage et Santé avicoles et cunicoles M. JAEG Jean-Philippe, Pharmacie et Toxicologie

Mlle LACROUX Caroline, Anatomie Pathologique des animaux de rente M. LIENARD Emmanuel, Parasitologie et maladies parasitaires M. MAILLARD Renaud, Pathologie des Ruminants

Mme MEYNAUD-COLLARD Patricia, Pathologie Chirurgicale M. MOGICATO Giovanni, Anatomie, Imagerie médicale M. NOUVEL Laurent, Pathologie de la reproduction

Mlle PALIERNE Sophie, Chirurgie des animaux de compagnie

Mlle PAUL Mathilde, Epidémiologie, gestion de la santé des élevages avicoles et porcins Mme PRADIER Sophie, Médecine interne des équidés

M. RABOISSON Didier, Productions animales (ruminants) Mme TROEGELER-MEYNADIER Annabelle, Alimentation

M. VOLMER Romain, Microbiologie et Infectiologie (disponibilité à cpt du 01/09/10) M. VERWAERDE Patrick, Anesthésie, Réanimation

Mme WARET-SZKUTA Agnès, Production et pathologie porcine

MAITRES DE CONFERENCES et AGENTS CONTRACTUELS

M. BOURRET Vincent, Microbiologie et infectiologie Mme FERNANDEZ Laura, Pathologie de la reproduction

ASSISTANTS D’ENSEIGNEMENT ET DE RECHERCHE CONTRACTUELS

Mlle DEVIERS Alexandra, Anatomie-Imagerie M. DOUET Jean-Yves, Ophtalmologie Mlle LAVOUE Rachel, Médecine Interne Mlle PASTOR Mélanie, Médecine Interne

REMERCIEMENTS

A la présidente de thèse,

Madame le Professeur Bettina COUDERC

Professeur des universités Praticien hospitalier Médecin biologiste

Pour m’avoir fait l’honneur d’accepter la présidence de mon jury de thèse, veuillez accepter mes respectueux hommages.

Au jury de thèse,

Madame le Docteur Séverine BOULLIER,

Maître de conférences à l'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse Immunologie générale et médicale

Pour m'avoir proposé ce sujet, pour votre soutien et vos précieux conseils dans la réalisation de ce travail, veuillez accepter mes sincères remerciements.

Madame le Docteur Isabelle RAYMOND LETRON,

Maître de conférences à l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse Anatomie Pathologique

Pour votre aide dans l’élaboration et la lecture des coupes histologiques, pour m’avoir fait l’honneur d’accepter de faire partie du jury de cette thèse, veuillez accepter mes sincères remerciements.

A ma famille,

A ma Maman,

Pour cette force immense qui émane de toi, pour ta sagesse, pour ta sérénité, pour ton optimisme. Pour ta vision du monde, pour ce que tu nous as donné chaque jour, pour cet instinct maternel, cet amour hors norme. Pour ta patience, ton soutien, pour ton réconfort, ton écoute. Pour le champagne, les apéritifs dinatoires, pour « mais j'ai l'appareil en mains je te dis ! », pour « temponado la vitra ». Pour ce regard que tu portes sur nous, plein d'amour et de fierté. Parce qu'il y a des choses que tu as gardées pour toi, pour mieux nous protéger. Parce que tu nous as permis de grandir, parce que tu nous as laissés vivre nos passions, parce que tu nous as toujours accompagnés et soutenus, parce que tu ne nous as jamais jugés. Parce que j'admire la femme et la maman que tu es. Je t'aime de tout mon cœur.

A mon Papa,

Pour ton soutien, tes conseils, ta confiance. Pour nos caractères forts, qui nous rapprochent et nous éloignent parfois. Pour « y'a plein de terre et de fumier là dessous », pour « et on dirait que les fourmis sortent de ton ventre et que tu les remanges », pour les « vitesses en corde », pour les « queue haute, queue basse ou couettes ? », pour « Pierre, on joue à Mongeois Saint Denis ? », pour « Monsieur Pressé, Monsieur Maladroit, Monsieur Tatillon … », pour le « bouvieur », pour la Grande Vadrouille, pour Les Visiteurs … et j'en passe … pour l'imagination et l'amour que tu mettais à jouer avec nous. Pour cette façon que tu as eue de nous ouvrir au monde, pour ton esprit critique, pour ton indépendance, ton immense liberté. Pour ton intelligence, pour ton humour, pour les regards que tu portes sur nous dans lesquels je lis que tu nous aimes au delà de tout. Parce que je suis si fière de toi, parce que je t'aime, parce que tu es mon Papa.

A vous deux, mes parents,

A ce couple que vous formez, à cette famille que vous avez su construire, à ce cocon que vous nous avez offert et au sein duquel vous nous avez aidés à grandir. Parce que vous nous avez permis de faire des études, et vous nous avez soutenus dans nos choix. A votre amour, à l'exemple que vous êtes sans le vouloir. Je vous aime d'un amour sans limites.

A mon frère Pierre,

Parce ce que tu es mon Pedro. Pour ton caractère, ton humour, ton immense gentillesse, ton intelligence. Pour tout ce que nous avons vécu ensemble : pour les playmobils, pour Rio Bravo, pour Jurassic Park, pour les « on joue à la maîtresse », pour les « on joue au coiffeur », pour John et Johnny, pour les grands ménages de la cochonière, pour la barricade, pour « Faramir, il cuisine ! » … et plus récemment, pour les apéros, les fiestas toulousaines, … Parce que tu es mon frère, que tu mérites de vivre le meilleur et de réussir tout ce que tu entreprends. Parce que je suis excessivement fière de toi et qu’il n’est rien que je ne sois pas capable de faire pour toi. Je t'aime mon frère.

A ma Tatie Michèle,

Mimi, je n'oublierai jamais que venir vivre à Toulouse m'a permis d'apprendre à te connaître. A tous ces moments que nous avons partagés ensemble, aux soirées flamenco, aux apéros à Roques, aux dîners et aux repas du midi, à nos discussions. A cette façon que tu as de réunir la famille autour de toi, à ta vision de la vie. A ta vie, justement, tournée vers les autres, à ta générosité, ton organisation, ta gentillesse, ton soutien, ton amour pour les voyages. A tout ce que tu m'as apporté ces cinq dernières années, à toutes les fois où sans le savoir, tu étais ma bouffée d'oxygène. A ce lien qui nous unit, parce que nous nous ressemblons. A toi désormais, si jeune dans ta tête, prends soin de toi, fais tes valises et montes dans l’avion direction un pays chaud ! Merci d'être là, je t'aime.

A mon cousin Benoît,

Grand cousin, à ton parcours, à ta force, à ton humour. A cette philosophie de vie que tu as développée et qui, je crois, te guide désormais. A cette complicité qui est née entre nous depuis cinq ans, à toutes les fois où tu m'as gentiment accueillie chez toi. A tes envies d'Asie, à ton futur voyage ! Et à tous les moments qu'il nous reste à partager, parce qu'il y en aura : c'est la famille !

A ma Grand – Maman,

A ton caractère, aux épreuves que tu as surmontées. A tout ce que tu sais, à ton intelligence et ta façon de prendre des décisions. A ton don pour la cuisine : les tartes aux pommes, les tartes à la rhubarbe, les bouchées à la reine, les kouglofs, les confitures, les pâtes de fruits, les petits gâteaux de Noël, les rôtis de veau, les gigots d'agneau. A ta façon de cuisiner le chou rouge, à ta technique pour réussir la pâte brisée, à ta façon de sublimer les restes … la liste est interminable. A toutes ses discussions que nous avons partagées ces dernières années, à ton expérience que tu sais si bien nous raconter. A ton soutien. Merci d'avoir été là pour moi.

A Louis,

Comment ne pas commencer par « à l'Ariège », « à La Bastide » ? A ta gentillesse, à tes jeux de mots, à toutes les fois où tu m'as accueillie si gentiment. Parce qu'à chaque fois que tu entends, vois ou lis quelque chose en rapport de près ou de loin avec nous, tu le retiens et tu nous le dis, parce que tu penses à nous. Incontestablement, tu es le roi des crêpes ! Merci du fond du cœur pour tous ces moments.

A Jean-Marc,

Je suis heureuse que nous ayons appris à nous connaître au cours de ces cinq ans. A ta générosité, à tout ce que tu fais et apportes à ceux qui t'entourent, à ta façon de réunir la famille, simplement. Merci pour tes coups de pouce.

A Isabelle,

A ta générosité et ta vie donnée aux autres, à ta façon de toujours penser à la famille, à tes coups de fil pour les anniversaires : merci !

A Marinette et Alain,

A Benagues où vous nous accueilliez si gentiment, au foie gras, aux pâtissons, aux éclairs au café, aux sangliers et aux tomates du jardin. Merci.

A Antoine et Rosette,

Savourez ce qui vous attend dans votre belle maison à Verniolle, je me souviens de votre crémaillère à Toulon, une réunion de famille autour de vous, un beau moment, si précieux en fait. Merci de prendre toujours de nos nouvelles.

A Diego et Mila,

A cette fois où vous nous avez fait découvrir Tolède, à l'humour de Diego, à votre amour pour Gabriel. La distance limite les moments partagés avec vous mais ce sera toujours la famille. Prenez soin de vous.

A ma Mamie,

Je n'oublie pas les moments passés à La Gloriette, je n'oublie pas comme tu étais heureuse de nous voir. Je me souviens des chocolatines, de tes gratins de farfales, des Corn Flakes que tu achetais pour nous. Je me souviens des promenades au bord de l'Ariège, de ton tour des commerçants de Pamiers … Je me souviens des réunions de familles dans ton petit salon, c'était mon enfance, l'âge d'or. Tu es ma mamie, je ne t'oublie pas et je crois que tu aurais été heureuse de voir tes petits enfants aujourd'hui.

A mon Pépé,

Pour tout le monde merveilleux que tu avais créé pour nous à Blancherupt, pour les tours en petit tracteur, pour le jour où tu m'as appris à bêcher et où nous avons planté de la mâche tous les deux, pour ce jour où je t'ai accompagné au marché et que nous avons croisé un chevreuil sur la route, pour les fromages de chèvre frais dégustés avec de la ciboulette du jardin, pour les placards pleins de petits gâteaux alsaciens à Noël, pour les maisons aux oiseaux, pour les escargots dédicacés, pour le ramassage des pommes et le jus de pomme qui suivait, pour la salamandre de la cave… la liste est longue. Parce que je n'oublie pas ton goût pour la vie, pour les bonnes choses, à ton humour. Parce que je n'oublie pas le grand-père que tu as été pour moi.

A mes amis,

A Vincent,

A l'immense fierté que j'ai pour toi, à tout ce que tu as surmonté et surmontera encore, à ton talent immense, ta sensibilité, ta fragilité et ta force, ton intelligence, ton humour. A tout ce que tu exprimes désormais, à tout ce chemin parcouru, à la vie qui t'attend, à tout ce que tu apportes aux gens que tu aimes. A ton année à San Francisco qui ne nous a jamais éloignés, à ce lien entre nous, à ce besoin de se parler, de se voir. A notre amitié, à ton soutien, à ton écoute, à ta façon de m'aider, de me conseiller. A toutes nos soirées confidences, à ces choses que nous savons l'un sur l'autre et que personne d'autre ne sait, à ta capacité à me faire exprimer mes sentiments les plus cachés. A nos fous rires, à nos voyages, à nos apéros, à nos marathons de la fête, à ton tablier « seins nus », à nos révisions du bac, à la forêt noire, à nos gâteaux pas cuits, au soleil d'Oléron, à ces midis où l'on mangeait ensemble pendant mes années de prépa : tu étais ma force pour affronter la suite de la journée. Merci Vincent, tu es l'une de mes plus belles rencontres, te connaître est une richesse. Que rien ne change mais que tout avance. Je t'aime.

A Auréanne,

Je me souviens de notre rencontre, trois jours après la rentrée en sixième, sur le chemin du stade Louis Chabrat à Bur(n)es sur Yvette ! Je me souviens comme nous nous sommes de suite entendues, le soir même je venais te voir à vélo, Placette de la Garrigue ! Je découvrais alors une grande famille, pleine de vie ! Comment résumer 13 ans d'amitié ? A nos fous rires de jeunesse : Monique, la fausse racaille à lunettes, les cours de latin, Mme Thiennot, la taupe, la moche araignée, l'éléphant (projet farfelu numéro 1), le mobile (projet farfelu numéro 2), le masque (projet farfelu numéro 3), le nain péteur, les après-midi « cuisine », les ratages culinaires surtout, les grimaces du fond de la classe, Mme Gauzdoue, l'heure de permanence obligatoire, Gianni, Les fous rires dans l'ascenseur avec mon pied dans le plâtre ... A ces moments plus sérieux : « être une jeune fille aujourd'hui », nos échanges de lettres l'été, tous ces moments d'adolescentes partagés avec toi. A notre amitié maintenant, à la femme que tu es devenue, à nos fous rires qui n'ont pas changé, à nos discussions. A tout ce que tu as pu m'apporter, à tout ce que nous avons partagé, à tout ce que je te dois aujourd'hui ! Parce que tu m'as fait découvrir ton univers, ta famille, ta façon de vivre, ta philosophie, ta

force et ta soif de vivre. Pour tout ça, pour tout ce qu'il nous reste encore à vivre ensemble, merci Auréanne, je t'aime fort.

A Tifenn,

Je n'oublie pas la jeune Tifenn : ton rire, ta maison complètement dingue, ton talent artistique, ton don pour le piano, tes couleurs, ta joie de vivre ! Je retrouve tout ça chez la femme que tu es devenue et je suis admirative du chemin que tu as choisi. Merci pour cette sérénité et cet apaisement que tu apportes à ceux qui t’entourent.

A Lucie,

Tout a commencé avec les poneys ! Deauville, les concours, les embarquements à 4h du matin, l'année des éclopées, les championnats de France, les salades « Petit Navire », l'hymne de nos campagnes, les fous rires, les fêtes du Club … A notre amitié qui dure et qui n'a pas changé. Je me souviens des heures de discussions sur la petite borne devant chez moi, des après-midi « cookies » … Tu m'as fait l'honneur d'être témoin de ton mariage avec Mathieu : quel bonheur et quelle fierté pour moi, merci de m'avoir permis de partager ces beaux moments. De l'émotion et des rires comme toujours. A tous ces moments partagés avec toi, à ta bonne humeur, ton énergie, ta détermination, à nos confidences, à nos chemins de vie différents mais qui ne nous éloignent pas. Merci pour tout ma Lucie.

A Delphine,

A ton soutien lors des championnats, à ton sourire, à ton immense gentillesse, à ta sensibilité à ton amour pour Nicolas, à Mickie, à « c'est mou ! », à l'enterrement de vie de jeune fille de Lucie, aux kilomètres de tulle du Marché Saint-Pierre, à tes trois kiffs par jour. Merci de m'avoir accueillie, merci pour tous ces moments simples partagés avec toi. De tout mon coeur, je souhaite que tu t'épanouisses aux côtés de Nicolas au Nigeria.

A Adrien,

Mon drap-housse ! A ton rire, ta bonne humeur, ton amour pour la fiesta, à tes déhanchés, aux cougars d'Oléron, à nos fous rires à vélos … bravo pour ta belle réussite ! A notre prochain apéro !

A Henri et Alice,

Merci de m'avoir ouvert les portes de votre famille, merci pour tous ces dimanches levés tôt pour les concours, merci pour Lamotte Beuvron, merci pour les deux beaux mariages que j'ai eu la chance de vivre à vos côtés. Je pense souvent à vous.

A Pascal et Thérèse-Marie,

Merci de m'avoir accueillie tant de fois chez vous, à Bures et à Oléron ! Merci pour tous ces bons moments vécus autour de vous : les pic-nic aux Saumonards, les 20 ans de Vincent, les apéros à Oléron … Merci !

Au FC7,

A Daphnée,

A toi ma Dadée, parce que souvent, les mots ne sont pas nécessaires pour que l'on se comprenne ! Merci pour les fiestas que tu nous as permis de faire chez toi : rue de Marignan, à Avizé, à Luxembourg … A ton don pour les cocktails, au Café Marignan, à « tes bars fétiches », à « c'est canon », à Vincent Clerc … ah non, pardon à Yachvili, au rugby donc ! A tes voyages que tu nous fais partager à ton retour : le Québec, l'Amérique du Sud. Plus récemment, à l'Arty Bar, à « j'suis bourrée ! », au poseur de fenêtre (je crois que c'était son métier …), à tous ces moments vécus à tes côtés ! Je suis fière de toi, pour ta bonne humeur, ta force, ta foi, ce que tu donnes aux autres sans le savoir. A ce qui nous attend, à nos futurs apéros, nos futurs fous rires, nos futures confidences. Je t'aime ma Dadée !

A Clémence,

A ta sérénité, à nos secrets partagés dans les chambres du foyer, à Saint-Thibault où tu nous as accueillies, à nos semaines de révisions, à cette fois où nous avons récupéré un numéro de téléphone par le balcon du foyer, aux interminables goûters, aux vendredis soirs veilles de D.S. où il fallait faire le ménage dans la chambre et regarder la Star Ac', à nos grogs et nos séances DVD du dimanche soir, à Saint-Raphaël, au Jungle Speed, au GR 10, à nos petits restos à Toulouse … Merci pour tout le soutien que tu as pu m'apporter. A la belle jeune femme que tu es, à ton courage lorsque tu as changé de projet pour tes études et à ton épanouissement dans ta nouvelle voie désormais. A ta douceur, ta gentillesse, ta fragilité, ton humour … je sais qu'il nous reste encore de beaux moments à vivre ensemble !

A Aurélie,

A ton humour, ta joie de vivre. A cette amitié qui est née de ces deux années au foyer : nos fous rires, nos larmes, nos confidences, nos secrets partagés, nos projets pour l'avenir, au GR 52, à ce voyage en Italie, au nouvel an chez toi ! A la SL-Night, à « tu parles trop », à « c'est bon, je sais où on est : c'est pas la bonne vallée ! », aux goûters à rallonge dans les chambres, à ton prof de physique de Sup, à la langue allemande (une de nos passions communes), à Cyril … euh non Loïc … euh c'est quoi son prénom déjà ? A ton don pour la musique et aux nombreuses fois où tu m'as émue en chantant accompagnée de ta guitare. A ta nouvelle vie à Pau !

A Marie-Thérèse,

A cette fois où je t'ai croisée un matin dans les couloirs du foyer et que j'ai découvert l'imagination de tes cheveux, à « il fume le bedo ! », à nos fous rires, à nos confidences, à ta rencontre avec Jean-Denis et à l'amour qui vous lie désormais.

A Solène,

A ta bonne humeur, tes secrets, ta force. A tes convictions politiques : gardes les ! A ce soir où nous avons formé le FC7, à nos fous rires dans la salle télé, à notre voyage en Italie. Merci pour tous ces beaux moments, ne changes rien !

A la prépa,

A Aurore,

Comment ne pas commencer par « à l'eau des doigts de pieds », à nos fous rires, aux TIPE et aux hortensias massacrés, à ta bonne humeur, à ta caractère, ton optimisme … Merci pour tous ces bons moments ! Avec le recul j’en oublie la routine difficile du quotidien en prépa ! Que ta vie soit heureuse !

A Audrey et Lucie,

Pour ces deux années de prépa, vécues ensemble. Pour les fous rires, les larmes, les colles, les sorties géologie, le concours, les SL Night. Au soutien que nous nous sommes apporté

pendant deux ans, aux craquages complets … Au chemin parcouru depuis et à nos choix de vie différents. Merci les filles !

A Ludivine et Emilie,

A nos confidences dans la queue de la cantine, au Parc Astérix, aux coups de fil tard le soir la veille des D.S., à Patatoïde (!!!), aux pieds « péniches » de la prof de Physique, à la bonne humeur que vous avez su garder pendant ces deux années à Saint-Louis, aux moments de doutes partagés, à votre réussite désormais. Merci les filles !

Aux vétos toulousains,

A Soài,

Je ne veux rien oublier : rien de tout ce que l'on a vécu ensemble pendant ces cinq années ! A notre vie de poulottes : à Aragon, à tes ballerines, aux boums, à Zézette, à ton chat sans pieds, à tes guppys, à notre déménagement, aux rattrapages, à Pastis, à toutes ces soirées confidences, à tous nos fous rires, à toutes nos aventures, au célibat de Katia, à nos chargements de voiture au retour des vacances, au Baby Cook... Et la suite : à ce stage aux Etats-Unis, à notre voyage en Thaïlande, aux monkeys, aux bébés requins, aux noodles, à tes micro-siestes, à nos goûters chez les gays, à nos après-midis shopping, à tes cookies aux formes toujours plus improbables, à Maria Rodriguez. A ta vision de la vie, ton énergie, ton optimisme. A ton humour, ta joie de vivre, ton charme. A ta force que tu as su me transmettre, à ta présence, ton soutien dans les moments difficiles. A ton besoin de voyages, à ton ouverture d'esprit, à ton aventure à Tahiti : parce que tout ce que tu fais te ressemble, parce que tu as cette soif de vivre. A tout ce que tu m'as apporté ! A notre amitié, à la confiance qu'il y a entre nous, à tout ce que je te souhaite pour la suite. A notre prochain voyage, ne change rien ma Soài : je t'aime !

A Mathieu,

A mes angoisses, mes peurs, mes doutes que tu sais si bien apaiser. A ton soutien sans faille, à toutes ces fois où auprès de toi j'ai trouvé ce dont j'avais besoin, ton écoute, ta confiance, ton respect. A toutes ces ballades avec Tais partagées avec toi, à ce que tu réussissais à me faire dire dans ces moments là, à la bouffé d'oxygène que tu as été. Parce que je ne peux pas te cacher grand chose, parce que tu m'as aidée à traverser des moments difficiles, parce que tu as

toujours eu les bons mots. A combien je suis fière de toi, à la chance que j'ai de te connaître, à l'amour que j'ai pour toi, à notre amitié, à ces fois où je n'arrive même pas à « te faire du boudin ». A ton humour, tes blagues à deux sesterces, à tes conflits capillaires, à tes cuites express, à ta coquillette, à ton torse rasé, à nos soirées lentilles, au Sol de Malaga, à nos révisions de partiels de première année devant Roland Garros, à nos échanges de texto, à tes exploits en randonnées, au Merial Music Tour, à ta 106, à la compagnie créole, à ton côté « mauvais joueur ». A tout ce qu'il nous reste à vivre ensemble, à l'avenir. Je t'aime ma Brigitte.

A Céline,

A notre première cuite ensemble lors de la boum fin d'exams de poulots, à notre incontestable domination au Beer-Pong, à TA paire de chaussures, à tes multiples déguisements, au Gang des Mayo, au crottin de cheval parsemé, au toit du R.U., au saumon à l'oseille, à « on vient voir la morte », au Beaujolais nouveau, à « Can you speak slowly ? », à « You can go ! », à « mais ça sent l'égout ! », à Jacquard le gueux, au jaune d'œuf dans le Pousse-Mousse, à nos cascades alcooliques, à nos grands écarts, à nos représentations publiques … au Bazar, au Connexion … à nos spectacle quoi ! A la fourrière, aux pigeons qui payent des coups, à ton talent pour le piano chez un inconnu, aux doigts de pieds boudinés, à l'inconnu de la douche, à l'ange argenté, à Robert De Nirgal, au TER/Tramway, à ces fois où sans toi je ne serai pas rentrée chez moi, à « y'avait un bibelot », à nos préchauffes, à nos shooters, à nos têtes à grimaces, aux prémisses, au whisky-coca que tu aimes tant, au plan B, à « non, ce soir on va juste boire un verre », à « Frankie du soir, Francis du matin », à nos agonies, à notre visite de Paris et notre covoiturage reporté pour cause de « pneu crevé », à nos FOUS RIRES, à toutes ces fois où nous avons pris l'apéro en cuisinant, à nos heures passées aux fourneaux … J'en oublie c'est certain ! Mais aussi et surtout, à nos confidences, à tout ce que tu m'as apporté pendant ces cinq ans. A notre belle amitié ! Merci pour ton soutien, merci pour toutes ces fois où, tu ne le savais pas mais, tu me changeais les idées et me donnais confiance. Merci pour ton humour, ta joie de vivre, ton caractère. Merci pour tes conseils, merci de ne m'avoir jamais jugée. Merci pour ce que tu es, ne changes rien, tu mérites le meilleur. Je souhaite que notre amitié dure, que nous vivions encore de folles soirées … à notre future escapade aux Antilles ou ailleurs tant qu'il y a du rhum ! Je t'aime ma Clamboune, fort !

A Aude,

A ces brimades vécues ensemble, à ces journées où nous venions à l'école uniquement pour manger au R.U. et jouer au tarot sur la terrasse du Cercle, à tous ces fous rires partagés à

Aragon, à Powéo, à Kikiou, aux révisions de A2 (ah mince, il nous reste toute la virologie …), à Yves, à ce week-end chez toi à Bordeaux, à ce matin où vous êtes venues récupérer « mes habits » à l'hôpital, à ton amour pour Guillaume … Parce que tu n'aimes ni les yaourts « à morceaux », ni les boissons « à bulles ». Merci pour ton soutien, ta compréhension, ton écoute, merci de m'avoir parfois sorti la tête de l'eau ! Parce que notre amitié est restée solide, parce que je te souhaite le meilleur pour la suite et que je suis heureuse de te connaître !

A Bastien,

A toutes ces fois où tu as amené ta jumelle en soirée, à ta perruque blonde, à ta perruque N.B.A., à ta perruque de fête du village de Verfeuil sur Seye, à ta valse lors du bal de la même fête de village, au football, aux footings, aux randonnées, au Pastis, aux apéros, au cagibis, aux tripoux, à l'Aveyron, à Saint Sernin sur Rance, à « éponger c'est tricher », à Jean Claude Disco Mobile, à ton lapereau de 6 semaines (ah bon, on dit un laperal ?), aux tagliatelles, à « c'est du même acabit ». A tout le bonheur que je te souhaite pour la suite ! Merci pour ces cinq années avec toi, à nos futures retrouvailles totalement indécentes !

A Alexis,

A toi Alex, à ta gentillesse et ton écoute, à ton humour et ton intelligence, à Kaamelott, au nouvel an passé chez toi dans le Queyras, à toutes ses tournées de Jagerbomb, aux bouteilles de whisky du Bazar … merci de nous avoir fait découvrir ce lieu hautement culturel ! A notre année de A4 dans le même groupe : aux petits-déjeuners au Lardenne Bar, aux réveils difficiles les lendemains de fête, à Port Aventura où nous avons courageusement fait TOUS les manèges, à toutes ces soirées et à celles à venir ! A notre esprit gamin, notre vocabulaire sous la ceinture, nos discussions hautement politico-philosophiques, à tes convictions politiques (ne changes pas !) ! Merci Alex, de m'avoir permis de devenir ton amie !

A Clément,

Au Ch'Nord, à ton humour et ta force, à tes déguisements de boums, à Cadaquès, à ton amour pour Laure, à ta nouvelle vie en Meurthe et Moselle ! A ton duo avec Olive, à vos kebabs nocturnes, à cette fois où tu dormais sur le capot de la voiture bien emmitouflé dans ton duvet, à ton « torse râpe cantal », à la chasse à l'ours, à cette bataille de pâtes pendant les WEIEL et aux spaghettis collés sur les chambranles, à ton amour pour le ménage, aux couscous et aux paninis que tu nous as cuisinés … merci Clément pour ces cinq années !

A Doui,

Mon Doudou ! A ta gentillesse, ton amitié fidèle, ton humour, ton soutien … à tes fesses indépendantes, aux soirées « filles-salades toutes nues » auxquelles tu as participé, aux préchauffes dans ton appartement, à Archambal, à ton talent pour l'autographe, à tes blagues : aux corn flakes dans les duvets, au roquefort dans les poches, aux serviettes nouées, aux œufs dans les poches des blouses de dissection, aux piles de l'horloge de la cuisine du bloc cachées dans le congélateur, aux poignées de placard retirées et cachées, à l'appartement d'Olive revisité … à ces soirées où nous avons partagé nos secrets, je sais que je peux compter sur toi, merci mon Doudou !

A Olive,

Aux nombrils, à ton exploit au rugby lors des inter-agros, à « y'a la voiture à Lafuma », à « j’suis de garde », à Gatsby, à ton amour pour Alison, à ton duo avec Clément, à cette fois où tu mettais les warning à chaque rond-point, à la patte de brebis que tu as jetée, à ta voiture customisée à la mayonnaise, « et viens là que je t'em----brasse ! », à la chenille … Merci Olive pour ton humour, tes étourderies (les clefs laissées à l'extérieur), ta gentillesse. On se reverra, le plus souvent possible pour continuer nos bêtises !

A Thibaut,

A ton amour pour Camille, à la belle carrière qui t'attend, à ta réussite, à ton talent culinaire, à ta gentillesse, à cette fois où tu nous as accompagnés au Bazar, merci Thibaut pour ces cinq années !

A Charlotte,

A ton talent pour les gâteaux au chocolat multi-usages, à « Vous avez vu mon duvet ? Oui Oui t'inquiètes, il est dans le coffre ! », à « Hein ?! Non … ??!! En cristal ?! », à ta bonne humeur, ton sourire, tes petites gaffes. A ce road trip californien !

A Pauline,

A cette fois où tu avais enfermé tes clefs dans ta voiture et que nous l'avons cherché partout à la forêt de Boucone, au sport, au Lac Bleu, à ces traversées de Toulouse à vélos pour aller à L'Arsenal. A ta nouvelle vie dans le Charolais, à ta « niak » dans la vie, à ton amour pour Mika.

A Claire,

A ton calme, ta sérénité, ta gentillesse, ton sourire, ton intelligence, à la brique que tu as reçu sur la tête ... Merci d'avoir apporté un peu de raison à la famille !

A Laure,

A ta bonne humeur et ta gentillesse, à Jean Claude Disco Mobile, à ton couple avec Clément. Je te souhaite le meilleur pour la suite !

A Pauline D.,

A la première année où ce n’était pas vraiment ça entre nous … mais à ce que nous avons su nous dire depuis, à ta franchise, ta bonne humeur, à Tabata la tortue !

A Annabelle,

A ton accent mauricien, à tes rhums arrangés, à ces folles soirées, à ton rire, ta joie de vivre. Et bien sûr à Francis et Shéhérazade …

A Charles,

A Aurélix, à notre binôme de A5 glandeurs !

A la promo Denaud,

A notre Romain Muhlach-Chen national, à Clément Leroy, à Julien Cheylan, à Arnold et Lili, à Alexia, à Virginie, à Loïc, à Maxime, à Hugues et Léa, à Agnès, à Franck et Paul, à Katy, à Carole. Aux égyptiens tout petits vu d'ici, à Décalé Gwada, à « Parle à ma main », à notre WEP et à tous ceux à venir, à Francis Moildar de notre promo, à Amada !

A mes poulots,

A mon Pupuj,

A la tête de poney, à tes cocktails, aux boums, aux apéros à la coloc', à notre week-end à Perpignan, aux gravillons que tu as malencontreusement retrouvés incrustés dans ta main un lendemain de Gala, à « allez Marion, on sort ce soir ! », à « allez Pupuj, on sort ce soir ! », à toutes ces fiestas, ces fous rires ! Merci pour ta bonne humeur !

A Coco, à Julie, à Juliette, à Pierre, à Mr Hugnet, à Mr La Chatte, à Mr Lemaître,

A notre week-end à Verfeuil, à la douche cassée, à 22h22, au Pastis, au reverse … ! Merci les poulots !

Mais aussi,

Au Foyer de l'avenue Vavin,

Pour les repas du soir, les goûters du week-end, pour la salle télé, pour tous ces instants partagés pendant deux ans. A l'ambiance qui y règne, aux fous rires, aux larmes, aux crises de nerfs … FC7 quoi !

Au GR 52,

A notre organisation, nos rencontres, aux ronfleurs des refuges, aux pansements contre les ampoules, aux baignades dans la Vallée des Merveilles, aux apéros dans les refuges, à « Buvons un coup », à « vous nous chantez une petite aubade ? », à nos sacs lourds de 13 kilos, à notre unique bain et à la couleur de l'eau, aux marmottes, aux chamois, à notre arrivée à Menton, à tout ce que nous avons partagé en marchant !

Au cercle et à son bar,

A cette bière qui coule à flots, à la réconcil', à la boum mauvais goût (je salue mes malléoles au passage !), à la boum rurale, à la salle sono, au WEIET, aux boumettes sauvages.

A la Résidence Aragon,

A tous les retardataires qui n'ont pas eu de logement à l'école et qui s'y sont retrouvés, au parking plutôt carrément glauque, à l'ascenseur en panne, aux salades toutes nues, à la gérante, aux matelas en mousse, aux appartements avec un angle mort, aux parties de « trou du cul » la veille des partiels, au « Tour d'Aragon », au vol de jeu vidéo, au piratage de caleçons « tout hibouriffé » et « jusqu'hibou de la nuit », aux préchauffes aragonaises … à tous les liens créés là-bas en un an !

Aux brimades,

Elles font des vétos toulousains une grande famille !

Au Bloc,

A la crémaillère, à toutes ces fiestas, à tous ces dîners, à tous ces apéros, aux repas de Noël de la famille, à tous les moments vécus dans cette maison, au réconfort que j'y ai toujours trouvé, aux fous rires partagés … à cette coloc et surtout à ces cinq habitants !

A Soulac,

A ce camping où nous avons troublé la tranquillité du sommeil des voisins et particulièrement du phacochère !

A la Feria de Nîmes,

A Nicolas Palau, aux apéros en pleine ville, au type qui joue du saxophone devant le même bar tous les ans !

Aux Pyrénées et aux randonnées du dimanche,

A la brèche de Rolland, au Pic du Montaigu, au Pid du Midi, au Lac Bleu … bouffée d'oxygène et retour à une vie saine après quelques petits excès …

A Knoxville,

Je n'y reviendrai probablement pas, mais je me souviendrai longtemps de ces six semaines : à Stephen, Randal, Linda et l'autre frère cossu, au wedding time, au pizza song, à la piscine, à nos vélos, à la randonnée dans les Smoky Mountains, à l'inondation … à Patoche et sa fraternité, à Jésus … euh non pardon, à John, à Ryan le gros, à Bobby, à Max, à la push-in, au beer pong dans le garage, à ces quelques soirées, au Franzia, à ces légers apéros … à l'accent français !

A Nashville,

A Fredo Mercure,

Au rocher sur lequel tu es monté, aux kilomètres parcourus avec toi, au dentifrice, aux tonnes de pain de mie entassées sur la plage arrière, à ton coffre si grand qui a accueilli nos petites valises !

A l'Operation George,

Je ne sais toujours pas ce que sais, mais j'ai adoré !

Au Bazar,

A Morad, Paddy, Max, Raph, Loran, Nidhal et Fred … le Bazar quoi ! A tout ce qu'ils savent sur nous, que nous ignorons nous mêmes, aux shooters de vodka caramel !

A la Thaïlande,

Dommage que je n'aime pas revenir deux fois au même endroit … à la Full Moon Party, aux Monkeys, aux khlongs, au cheval à vapeur, à la turista … euh non pardon, aux effets secondaires de la Malarone !

A Oléron,

A Domino, au Moulin, à Pinoche, à Rico et Polo, aux folles épopées à vélo, au marché de La Brée, au Pineau, au soleil, aux siestes sur la plage les lendemains de soirées, aux fêtes qui finissent le lendemain à 17h, au Commerce, à Pue des Pieds, au gros Henry, à Boyardville et ses piscines, aux apéros, aux vacances, aux milles confidences partagées là-bas ...

Au Kazakhstan,

Mon pays d'adoption.

Au TER,

Nous l’avons parfois confondu avec le tramway, il nous a vu dans des situations pas toujours avantageuses !

A Nanard, cet incorrigible fêtard !

A Jacquouille la Fripouille, il n'a malheureusement pas pu être présent aujourd'hui, à « ça

à ma main », à « allez l'eau ! », à Godefroy le Hardi, à Jacques-Henri Jacquart, au cousin Hubert, à Ginette Barclay née à Rungis, à Dame Béatrice la pouffiasse, à cette bague qui flamboie, à la dentelette de Sainte Rolande ...

A Katia, à Thérèse, à Monsieur Preskovic, aux Doubitchous de Sophia, à ce fromage qui

coince, à « je dis merde à l'amour », à cette chose longue et molle, à « je pourrais m'introduire », à Zézette (double dédicace !), à « y'a une deuxième couche à l'intérieur » …

A Dédé, le cochon de la Française des Jeux.

A Perseval et Karadoc, à Yvin et Gauvin, à Guenièvre … au roi Arthur, bon courage dans ta

quête du graal !

A Titine 1.0, remplacée il y a 2 ans par Titine 2.0.

A Mossieur Mouki, à ton succès à la Réconcil'.

A Atchoum, à ton cerveau, ton air idiot, tes micros siestes, tes bijoux de famille, je me

souviens avoir travaillé alors que tu dormais sur mes genoux : vieux veinard ! Que tu puisses profiter de ta condition de chat encore longtemps !

A Maurice, le chat rétrognathe, avec une dent en moins, qui louche … et qui « chasse » les

mouches, arrête de sauter par la fenêtre !

A Tais, parce que tu es liée à Mathieu et que de tes balades sont nés des moments partagés

avec lui, des confidences et des fous rires. Arrête de chouiner quand il y a de l'orage !

A Bibou, le chat râleur …

A Grozette, à tes fugues « foutu youyou d'am » !

A Etna, grosse doudou va !

TABLE DES MATIERES

REMERCIEMENTS

TABLE DES MATIERES

LISTE DES FIGURES

LISTE DES ABBREVIATIONS

INTRODUCTION

PARTIE I : ETUDE BIBLIOGRAPHIQUE

SECTION 1 : LE STAPYLOCOCCUS AUREUS

I. CLASSIFICATION ... 45 1) LA FAMILLE MICROCOCCACEAE ... 45 2) LE GENRE STAPHYLOCOCCUS ... 46 3) L'ÉSPÈCE STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 48

II. CARACTÉRISTIQUES PHYSIOLOGIQUES ... 51 1) CONDITIONS DE CULTURE ... 51 2) COURBE DE CROISSANCE ... 53 3) ÉQUIPEMENT ENZYMATIQUE, HORS FACTEURS DE VIRULENCE ... 54

III. STRUCTURE ... 55 1) LA PAROI CELLULAIRE ... 55 2) LA CAPSULE ... 56 3) LE GÉNOME ... 57 4) BILAN : LA STRUCTURE DU STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 58

IV. EPIDEMIOLOGIE ... 59 1) RÉSERVOIR ... 59 2) MODE DE TRANSMISSION ... 61

V. INFECTIONS À STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 63 1) PRÉVALENCE ET TYPES D'INFECTIONS À STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 63 2) FACTEURS DE RISQUES ... 64 3) DIFFERENTS TYPES D'INFECTIONS DUES AU STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 65

VI. INVASION DU TISSU DE L'HÔTE LORS DE MAMMITES A STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 67

1) INVASION TISSULAIRE ... 67 2) ADHESION AU TISSU MAMMAIRE : LES INTERACTIONS NON SPECIFIQUES ... 68 3) ADHESION AU TISSU MAMMAIRE : LES INTERACTIONS SPECIFIQUES ... 68 a) La protéine A ... 69 b) La protéine de liaison à la fibronectine (FnBP) ... 69 c) La protéine de liaison au collagène (Cna) ... 70 d) La protéine de liaison au fibrinogène (Clumping Factor, Clf) ... 70

VII. CROISSANCE ET VIRULENCE DU STAPHYLOCOCCUS AUREUS LORS DE MAMMITES ... 73

1) LES ENZYMES EXTRACELLULAIRES ... 73 2) LES TOXINES HEMOLYSINES ... 74 a) L'Hémolysine Alpha ... 74 b) L'Hémolysine Beta ... 76 c) L'Hémolysine Delta ... 76 d) L'Hémolysine Gamma ... 76 3) LES TOXINES LEUCOTOXINES ... 77 4) LES TOXINES PYROGENIQUES – SUPER ANTIGENES (PTSAg) ... 77 a) La toxine TSCT1 ... 78 b) Les entérotoxines ... 79 5) LES TOXINES EXFOLIATIVES (ET) ... 79 6) BILAN : LES FACTEURS DE VIRULENCE ... 80 7) REGULATION DES FACTEURS DE VIRULENCE ... 80

SECTION 2 : L'IMMUNITE DE LA MAMELLE

I. DÉFENSES ANATOMIQUES ... 83

II. DÉFENSES CELLULAIRES ... 85 1) LES NEUTROPHILES ... 85 a) Le recrutement des neutrophiles sur le site d'infection ... 85 b) La Phagocytose ... 86 c) L'activité bactéricide des neutrophiles hors phagocytose ... 88 d) Bilan concernant l'activité bactéricide des neutrophiles et son efficacité ... 89 2) LES MACROPHAGES... 90 a) Activité bactéricide : la phagocytose ... 90 b) Cellules présentatrices d'antigènes ... 90 c) Contrôle de l'inflammation ... 91 3) LES LYMPHOCYTES ... 91 a) Les Lymphocytes T CD4+ (T helper) : ... 92 b) Les Lymphocytes T CD8+ (T cytotoxiques) : ... 92 c) Les Lymphocytes T gamma-delta : ... 92 d) Les Lymphocytes B : ... 93 4) LES CELLULES NATURAL KILLER (NK) ... 93 5) LES CELLULES ÉPITHÉLIALES MAMMAIRES ... 93

III. FACTEURS DE DÉFENSE SOLUBLES ... 97 1) LA LACTOFERRINE... 97 2) LA TRANSFERRINE ... 97 3) LE LYSOZYME ... 98 4) LA LACTOPEROXIDASE ... 98 5) LA XANTHINE OXYDASE ... 98 6) LES DÉFENSINES ... 98 7) LES CYTOKINES ... 99 a) Les Interleukines IL-1, IL-6 et IL-8 : ... 99 b) L'Interleukine IL-2 :... 99 c) Les Interleukines IL-4 et IL-13 : ... 99 d) Les Colony Stimulating Factors, CSF : ... 100

e) Les Interférons, IFN : ... 100 f) Les Tumor Necrosing Factors, TNF : ... 100 8) LES ANTICORPS... 101 a) Les Immunoglobulines M : ... 101 b) Les Immunoglobulines G1 : ... 102 c) Les Immunoglobulines G2 : ... 102 d) Les Immunoglobulines A : ... 102 9) LE COMPLÉMENT ... 103 a) L'opsonisation des bactéries ... 104 b) Le recrutement des phagocytes ... 105 c) L'activation des phagocytes ... 106 d) Limites de l'activité du complément dans le lait... 106

IV. RÉGULATION DE L'IMMUNITÉ DE LA MAMELLE ... 107 1) LES HORMONES ... 107 2) LA REGULATION GENETIQUE ... 107

V. ÉCHAPPEMENT ET RESISTANCE AU SYSTÈME IMMUNITAIRE MAMMAIRE LORS D'INFECTIONS PAR LE STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 109

1) LA PROTEINE A ... 109

2) AUTRES MECANISMES DE BLOCAGE DES RECEPTEURS DE

RECONNAISSANCE ... 109 3) LA CAPSULE ... 110 4) MECANISMES D'ECHAPPEMENT A LA RECONNAISSANCE : LES BIOFILMS ... 111 5) MECANISMES DE SURVIE DANS LE PHAGOSOME ... 111 6) BILAN : ECHAPPEMENT ET RESISTANCE AU SYSTEME IMMUNITAIRE ... 113 7) MODULATION DE LA REPONSE IMMUNITAIRE DE L'HÔTE PAR LE STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 113

VI. MODIFICATIONS HISTOLOGIQUES ET FONCTIONNELLES DU TISSU MAMMAIRE CONSECUTIVES A L'INFECTION PAR LE STAPHYLOCOCCUS AUREUS ... 117

1) MODIFICATIONS HISTOPATHOLOGIQUES DE LA MAMELLE ... 117 a) Modifications histologiques observées ... 117 b) Modifications fonctionnelles observées ... 118 2) MODIFICATIONS DANS L'EXPRESSION DE CERTAINS GENES DE L'HÔTE ... 120

PARTIE II : ETUDE EXPERIMENTALE

SECTION 1 : MATERIEL ET METHODES

I. LES ANIMAUX ... 127

II. LA SOUCHE BACTERIENNE ... 129

III. TECHNIQUE D'INFECTION INTRA-MAMMAIRE ... 133

IV. CODAGE / IDENTIFICATION DES SOURIS ... 135

V. OBSERVATIONS MACROSCOPIQUES DU TISSU MAMMAIRE ... 137

VI. PRELEVEMENTS ... 139

VII. COMPTAGES BACTERIENS ... 141

VIII. PREPARATION DES COUPES HISTOLOGIQUES ... 143

SECTION 2 : RESULTATS

I. COMPTAGES BACTERIENS ... 149 1) CONCENTRATIONS THEORIQUES ET CONCENTRATIONS RELLES DES INOCULUMS BACTERIENS ... 149 2) RESULTATS DES COMPTAGES BACTERIENS ET COMPARAISON DES DEUX LIGNEES DE SOURIS ... 150 3) RELATION ENTRE LA CONCENTRATION DE L'INOCULUM ET LES COMPTAGES BACTERIENS ... 155

II. OBSERVATIONS MACROSCOPIQUES DU TISSU MAMMAIRE INFECTE ... 161

III. COUPES HISTOLOGIQUES ... Erreur ! Signet non défini. 1) DESCRIPTION DU TISSU MAMMAIRE ET COMPARAISON DES DEUX LIGNEES DE SOURIS ... 163

a) Description de l'évolution du tissu mammaire des souris des deux lignées ... 163 b) Absence de différence dans l'évolution du tissu mammaire des deux lignées de souris ... 174

2) DESCRIPTION DE L'INFLAMMATION ET DES CELLULES IMMUNITAIRES RECRUTEES ET COMPARAISON DES DEUX LIGNEES ... 175

a) Description de la réponse immunitaire des souris des deux lignées ... 175 b) Absence de différence dans le type de réponse immunitaire mise en place chez les deux lignées de souris ... 194 3) VARIATIONS HISTO-PATHOLOGIQUES OBSERVEES POUR UNE MEME MAMELLE INFECTEE... 195

a) Variations concernant l'évolution du tissu mammaire pour chaque mamelle infectée ... 195 b) Variations concernant la réponse immunitaire pour chaque mamelle infectée ... 198 c) Proportions des coupes à évolution pathologique pour chaque mamelle infectée ... 200

SECTION 3 : DISCUSSION

I. ABSENCE DE DIFFERENCE SIGNIFICATIVE CONCERNANT LES SENSIBILITES AUX INFECTIONS EN INTRA-MAMMAIRE CHEZ LES LIGNEES DE SOURIS DBA/2 ET C57B1/6J ... 205

1) VALIDITE DE L’HYPOTHESE DE DEPART : EN QUOI LES SOURIS DBA/2 SERAIENT ELLES PLUS SENSIBLES QUE LES SOURIS C57B1/6J AUX INFECTIONS EN VOIE INTRA-MAMMAIRE ? ... 206 2) INFLUENCE DE LA VIRULENCE DE LA SOUCHE BACTERIENNE UTILISEE ... 208

II. VALIDATION D'UN PROTOCOLE EXPERIMENTAL D'INFECTION DES SOURIS EN INTRA- MAMMAIRE ... 211

1) VALIDATION DES RESULTATS CONCERNANT LES MAMELLES TEMOINS ... 211 2) ABSENCE DE CORRELATION ENTRE LA CHARGE BACTERIENNE INOCULEE ET LES COMPTAGES BACTERIENS 24 HEURES APRES ... 211 2) DEFAUTS DE FIABILITE ET DE REPRODUCTIBILITE DU PROTOCOLE ... 213 a) Existence d’une variabilité individuelle élevée des comptages bactériens ... 213 b) Variations majeures observées selon les coupes histologiques au sein d'une même mamelle infectée ... 214 c) Défaut d'inoculation : présence d'abcès sous cutané sans atteinte du tissu mammaire ... 214 3) CORRECTIONS ENVISAGEABLES POUR LE PROTOCOLE D'INFECTION DES SOURIS EN INTRA-MAMMAIRE ... 216

a) Notion de choix du fragment de tissu mammaire à prélever pour les comptages et les coupes histologiques ... 216 b) Pré-définition et choix des coupes histologiques à observer pour chaque mamelle... 219 c) Nécessité de l'introduction d'une étude cinétique ... 222 d) Possibilité d'une étude in vitro sur des cellules épithéliales mammaires ... 224

CONCLUSION

LISTE DES FIGURES

Figure 1 : Classification des espèces du genre Staphylococcus selon leur capacité à réduire ou

non certains sucres [Bergey, 1923]. ... 47

Figure 2 : Classification des espèces du genre Staphylococcus selon la présence ou non de

l’enzyme coagulase [Bergey 1957]. ... 47

Figure 3 : Liste non exhaustive des critères de différenciation des espèces du genre

Staphylococcus [Hill, 1981]. ... 48

Figure 4 : Exemples de gènes de résistance du Staphylococcus aureus, gènes localisés et

séquencés [Juroda, 2001]. ... 49

Figure 5 : Morphologie du Staphylococcus aureus, photo en microscopie électronique à

balayage, grossissement x 17000 [Goldsmith, 2007]. ... 51

Figure 6 : Coloration « jaune or » des colonies de Staphylococcus aureus, boîte de Pétri avec

culture de colonies de Staphylococcus aureus [Shrestha, 2010]. ... 52

Figure 7 : Courbe de croissance du Staphylococcus aureus en milieu non renouvelé [Courcol,

2006]. ... 54

Figure 8 : Structure de la paroi bactérienne du Staphylococcus aureus : composants

capsulaires, paroi bactérienne et membrane plasmique [Euzéby, 2008]. ... 56

Figure 9 : Structure du Staphylococcus aureus [Lowy, 1998]. ... 58 Figure 10 : Pourcentages d'isolement du Staphylococcus aureus parmi les Staphylocoques à

coagulase positifs chez différentes espèces d’animaux domestiques [Biberstein, 1984]. ... 60

Figure 11 : Infections dues au Staphylococcus aureus, critères de distinction entre les

infections contractées à l'hôpital (IAH) et celles contactées en communauté (IAC) [Leonard, 2008] et [Maltezou, 2006]. ... 63

Figure 12 : Différentes causes de bactériémies dues au Staphylococcus aureus, étude portant

Figure 13 : Bilan concernant les facteurs de risques de développer une infection au

Staphylococcus aureus [Boucher, 2008], et [Maltezou, 2006]. ... 65

Figure 14 : Les facteurs de virulence du Staphylococcus aureus [Jonsson, 1985]. ... 80

Figure 15 : Mécanisme de recrutement des neutrophiles sur le site de l'infection :

chimiotactisme et diapédèse [Collège français des pathologistes, 2012]. ... 86

Figure 16 : Exemples de récepteurs TLR et de leurs ligands spécifiques [Schukken, 2011]. ... 87

Figure 17 : Le mécanisme de la phagocytose par les neutrophiles [Moreda, 2012]. ... 88

Figure 18 : Bilan concernant les mécanismes de l'activité bactéricide des neutrophiles [Deleo,

2009]. ... 89

Figure 19 : Reconnaissance d'antigènes bactériens par les récepteurs TLR exprimés à la

surface des cellules épithéliales et cascade d'activation aboutissant à l'expression de différents gènes : gènes codant pour des peptides antimicrobiens et gènes codant pour des molécules pro-inflammatoires [Thibault, 2008]. ... 94

Figure 20 : Différentes voies d'activation du complément suite à la détection d'antigènes

bactériens : la voie classique, la voie alterne et la voie des lectines [Mbouiti, 2008]. ... 104

Figure 21 : Exemples de mécanismes d'échappement et de résistance au système immunitaire

de l'hôte développés par le Staphylococcus aureus. ... 113

Figure 22 : Modifications des populations de lymphocytes T et B dans le lait et le sang de

vaches à mammites chroniques provoquées par le Staphylococcus aureus [Grönlund, 2006]. ... 114

Figure 23 : Evolution histologique et fonctionnelle du tissu mammaire après infection,

description des populations cellulaires retrouvées au cours du temps [Chandler, 1970]. ... 119

Figure 24 : Différents niveaux d'expression de gènes codant pour des molécules

pro-inflamatoires et des peptides antibactériens selon leur localisation dans la mamelle et après infection du tissu mammaire par le Staphylococcus aureus [Whelehan, 2011]. ... 121

Figure 25 : Composition du bouillon de culture TSB [MAST Diagnosis, 2009]. ... 129

Figure 26 : Composition de la gélose de Chapman [Composition de la gélose Chapman,

Figure 27 : Protocole de préparation de l'inoculum bactérien à Staphylococcus aureus pour

injection en intra-mammaire [Tabouret, 2011]. ... 132

Figure 28 : Protocole de manipulation de la mamelle « M4D - Témoin », protocole appliqué

pour chaque souris de l’étude. ... 134

Figure 29 : Protocole d'infection de la mamelle M4G, protocole appliqué pour chaque souris

de l’étude. ... 134

Figure 30 : Détermination du score macroscopique de chaque lignée, le score macroscopique

est défini selon la présence ou l'absence de différents critères : hypertrophie, œdème, hémorragie, adhérences aux tissus voisins, décoloration du tissu mammaire. ... 138

Figure 31 : Positionnement de la souris avant le prélèvement du tissu mammaire et lignes

d'incisions du plan cutané [Dissection de la souris, 2007]. ... 139

Figure 32 : Description des séries de dilution du tissu mammaire préparées pour chaque

mamelle. ... 142

Figure 33 : Représentation schématique des plaques de Gélose Chapman à 6 puits et des

dilutions déposées dans chaque puit et mises en culture pour les comptages bactériens. ... 142

Figure 34 : Description du protocole de recoupe des prélèvements après fixation, cas d’un

prélèvement avec une lésion circulaire et une découpe en 6 lambeaux. Les lambeaux sont orientés afin de permettre une observation représentative de tout le prélèvement : les lésions du tissu mammaire sont observées en continuité avec les plans cutanés et les plans musculaires [Planat, 2013]. ... 144

Figure 35 : Obtention de blocs de paraffine dans lesquels le tissu mammaire prélevé est inclus

[Bourges-Abella, 2006]. ... 145

Figure 36 : Obtention du ruban de paraffine constitué des coupes sagittales successives de

tissu mammaire de 3 à 5 µm d'épaisseur grâce au microtome [Bourges-Abella, 2006]. ... 145

Figure 37 : Description du protocole de coloration des « lames blanches » à l’hémalun-éosine

: étapes de déparaffinage, de réhydratation, de coloration, de déshydratation et de montage définitif [Bourges-Abella, 2006]. ... 147

Figure 38 : Concentrations théoriques et concentration réelles des inoculums utilisés pour les

Figure 39 : Comptages bactériens en bactéries / mg de tissu mammaire pour les souris de la

lignée DBA/2, comptages réalisés 24 heures après l’inoculation du Staphylococcus aureus. ... 151

Figure 40 : Comptages bactériens en bactéries / mg de tissu mammaire pour les souris de la

lignée C57B1/6J, comptages réalisés 24 heures après l’inoculation du Staphylococcus aureus. .... 152

Figure 41 : Représentation graphique de la répartition des valeurs de comptages bactériens 24

heures après l'infection intra-mammaire à Staphylococcus aureus pour les souris de la lignée DBA/2. ... 153

Figure 42 : Représentation graphique de la répartition des valeurs de comptages bactériens 24

heures après l'infection intra-mammaire à Staphylococcus aureus pour les souris de la lignée C57B1/6J. ... 154

Figure 43 : Moyennes des comptages pour chacune des deux mamelles pour les souris des

deux lignées ; DBA/2 et C57B1/6J. ... 154

Figure 44 : Concentrations réelles des inoculums et valeurs des comptages bactériens de la

mamelle infectée 24 après l’inoculation pour les souris de la lignée DBA/2. ... 156

Figure 45 : Représentation graphique des valeurs de comptages bactériens 24 heures après

l’infection selon la concentration réelle de l'inoculum injecté pour les souris de la lignée DBA/2. ... 157

Figure 46 : Concentrations réelles des inoculums et valeurs des comptages bactériens de la

mamelle infectée 24 après l’inoculation pour les souris de la lignée C57B1/6J. ... 158

Figure 47 : Représentation graphique des comptages bactériens 24 heures après infections

selon la concentration réelle de l'inoculum injecté pour les souris de la lignée C57B1/6J. ... 159

Figure 48 : Coefficients de corrélation entre la concentration de l'inoculum et le comptage

bactérien 24 heures après l'infection pour les deux lignées de souris : DBA/2 et C57B1/6J... 160

Figure 49 : Scores macroscopiques obtenus pour les deux lignées de souris. ... 161

Figure 50 : Nombre de souris présentant chaque critère de description macroscopique du tissu

mammaire pour les deux lignées de souris : 18 souris DBA/2 et 23 souris C57B1/6J. ... 162

Figure 51 : Mamelle M4D Témoin de la souris DBA-121008-2, coupe histologique HE x 40 :

tissu mammaire physiologique, architecture alvéolaire et activité sécrétrice conservées, tissu mammaire en lactation, pas de souffrance cellulaire. ... 164

Figure 52 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique HE x 40,

tissu mammaire physiologique, sain, pas de modifications histologiques observées, architecture alvéolaire et activité sécrétrice conservées. ... 166

Figure 53 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-130124-23, coupe histologique HE x 40,

observation de cellules épithéliales qui desquament dans la lumières des alvéoles, congestion du tissu mammaire : tissu mammaire pathologique suit à l’inoculation du Staphylococcus aureus. ... 167

Figure 54 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-130124-23, coupe histologique HE x 200,

observation de cellules épithéliales qui desquament dans la lumières des alvéoles, présence de vacuoles dans le cytoplasme des cellules épithéliales : signes de souffrance et de dégénérescence cellulaire. ... 168

Figure 55 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique HE x 100,

observation de zones nécrose du tissu mammaire. ... 169

Figure 56 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-130108-22, coupe histologique HE x 40,

infiltration œdémateuse du tissu mammaire, zones de nécrose cutanée et sous cutanée au niveau du point d’injection de la charge bactérienne. ... 170

Figure 57 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique HE x 100,

œdème massif et congestion du tissu mammaire : évolution pathologique 24 heures après l’inoculation du Staphylococcus aureus. ... 171

Figure 58 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique HE x 1000,

cellules épithéliales macrophagiques, observation de débris phagocytés dans le cytoplasme de cellules épithéliales ayant desquamé dans la lumière d'une alvéole mammaire. ... 172

Figure 59 : Comptabilisation des lames d'apparence saine et des lames à évolution

pathologique pour les mamelles M4G des souris de la lignée DBA/2. ... 173

Figure 60 : Comptabilisation des lames d'apparence saine et des lames d'apparence

pathologique pour les mamelles M3G des souris de la lignée C57B1/6J. ... 173

Figure 61 : Pourcentages de souris chez lesquelles l'observation des coupes de tissu

mammaire a montré une évolution pathologique 24 heures après l'infection par le Staphylococcus aureus chez les deux lignées DBA/2 et C57B1/6J. ... 174

Figure 62 : Mamelle M4D Témoin de la souris B6-121002-3, coupe histologique HE x 40,

tissu mammaire en lactation, pas d'inflammation ni de recrutement de cellules immunitaires, nœud lymphatique physiologique non réactionnel riche en mastocytes et en lymphocytes. ... 176

Figure 63 : Mamelle M4G Infectée de la souris DBA-121022-4, coupe histologique HE x 10,

présence d'un abcès envahissant le tissu mammaire et s’étendant en infiltrations plus ou moins linéaires dans le tissu mammaire sous-jacent. ... 178

Figure 64 : Mamelle M4G Infectée de la souris DBA-121008-2, coupe histologique HE x 40,

présence d'un abcès mammaire évoluant en une infiltration neutrophilique du tissu mammaire sous jacent, l’abcès est bien circonscrit et on y observe exclusivement des neutrophiles. ... 179

Figure 65 : Mamelle M4G infectée de la souris DBA-121008-2, coupe histologique HE x

1000, abcès envahissant le tissu mammaire, activité de phagocytose importante mise en évidence par la présence de bactéries dans le cytoplasme de certains neutrophiles. ... 180

Figure 66 : Mamelle M4G Infectée de la souris DBA-121206-12, coupe histologique HE x

200, infiltration neutrophilique interstitielle et alvéolaire focale du tissu mammaire. ... 182

Figure 67 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-130108-22, coupe histologique HE x 200,

infiltration neutrophilique interstitielle et alvéolaire focale du tissu mammaire associée à une desquamation de cellules épithéliales dans la lumière des alvéoles. ... 183

Figure 68 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique HE x 200,

infiltrations neutrophiliques interstitielle et alvéolaire diffuses du tissu mammaire, présence d’une mammite suppurative majeure. ... 184

Figure 69 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique HE x 1000,

infiltration neutrophilique interstitielle et alvéolaire du tissu mammaire, mammite suppurative, activité de phagocytose mise en évidence par la présence de bactéries dans le cytoplasme de certains neutrophiles alvéolaires. ... 185

Figure 70 : Mamelle M4G Infectée de la souris DBA-130124-14, coupe histologique HE x

40, infiltration neutrophilique et hémorragique du tissu conjonctif supra-mammaire avec prolongement dans le tissu mammaire le long des septas conjonctifs. ... 186

Figure 71 : Mamelle M4G Infectée de la souris DBA-130124-14, coupe histologique HE x

200, infiltration neutrophilique et hémorragique du tissu conjonctif supra-mammaire avec prolongement dans le tissu mammaire le long des septas conjonctifs, l’infiltration hémorragique est probablement due à l’action délabrante de l’aiguille utilisée pour l’inoculation du Staphylococcus aureus. ... 187

Figure 72 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-2, coupe histologique HE x 10,

présence d'un abcès envahissant le tissu mammaire évoluant en une infiltration locale du tissu sous-jacent, image évocatrice d’un phlegmon. ... 189

Figure 73 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-2, coupe histologique HE x 40,

présence d'un abcès du tissu mammaire évoluant en une infiltration neutrophilique interstitielle et alvéolaire locale du tissu mammaire sous-jacent. ... 190

Figure 74 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-2, coupe histologique HE x 200,

présence d'un abcès envahissant le tissu mammaire, évoluant en une infiltration neutrophilique interstitielle et alvéolaire du tissu mammaire sous-jacent. ... 191

Figure 75 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-2, coupe histologique HE x 1000,

neutrophiles de l'abcès mammaire, activité de phagocytose : présence de bactéries dans le cytoplasme de certains neutrophiles. ... 192

Figure 76 : Comptabilisation des lames sur lesquelles on observe un abcès, une infiltration

neutrophilique ou aucune réaction inflammatoire pour les mamelles infectées des souris de la lignée DBA/2. ... 193

Figure 77 : Comptabilisation des lames sur lesquelles on observe un abcès, une infiltration

neutrophilique ou aucune réaction inflammatoire pour les mamelles infectées des souris de la lignée C57B1/6J. ... 193

Figure 78 : Pourcentages de souris chez lesquelles l'observation des coupes de tissu

mammaire a montré une inflammation 24 heures après l'infection par le Staphylococcus aureus chez les deux lignées DBA/2 et C57B1/6J. ... 194

Figure 79 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique n°1 HE x

200, mammite neutrophilique, infiltration neutrophilique interstitielle et alvéolaire, présence de cellules épithéliales qui desquament dans la lumière des alvéoles. ... 196

Figure 80 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121002-1, coupe histologique n°2 HE x

100, tissu mammaire sain ayant conservé son activité sécrétrice, pas d'infiltration neutrophilique, pas de dégénérescence des cellules épithéliales. ... 197

Figure 81 : Mamelle M4G Infectée de la souris B6-121022-5, coupes histologiques n°1 et n°2

HE x 10, abcès du tissu mammaire sur la coupe n°1, pas de réaction inflammatoire ni de recrutement de cellules immunitaires sur la coupe n°2. ... 199

Figure 82 : Recensement des coupes histologiques à évolution pathologique pour chaque

mamelle infectée chez les souris de la lignée DBA/2. ... 201

Figure 83 : Recensement des coupes histologiques à évolution pathologique pour chaque