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Tableau I : Mécanismes de résistance bactérienne. ... 5 Tableau II : Principaux mécanismes de résistance selon la classe pharmacologique. ... 9 Tableau III : Facteurs contribuant à la résistance aux antibiotiques ... 10 Tableau IV : Résistance naturelle chez les entérobactéries... 11 Tableau V : Résistance naturelle chez les bacilles à Gram négatif non fermentaires. ... 12 Tableau VI : Milieux de détermination la sensibilité des bactéries aux antibiotiques ... 20 Tableau VII : Préparation de l’étalon de turbidité McFarland 0,5 ... 22 Tableau VIII : Conditions d’incubation ... 24 Tableau IX : Souches du contrôle de qualité en routine ... 27 Tableau X : Souches complémentaires du contrôle de qualité pour la détection de mécanismes de résistance spécifiques et le contrôle des inhibiteurs ... 27 Tableau XI : Contrôle de qualité interne de staphylococcus aureus ... 28 Tableau XII: Contrôle de qualité interne de Escherichia coli ... 30 Tableau XIII : Contrôle de qualité interne de Klebsiella pneumoniae ... 31 Tableau XIV : Contrôle de qualité interne de Enterococcus faecalis Résistant haut niveau à la gentamicine Vancomycine R, VanB+ ... 32 Tableau XV : Critères de catégorisation selon les valeurs critiques ... 35 Tableau XVI : concentrations critiques des Pénicillines ... 39 Tableau XVII : concentrations critiques des Céphalosporines ... 40 Tableau XIX : concentrations critiques des Carbapénèmes ... 41 Tableau XX : concentrations critiques des Monobactames ... 41 Tableau XXI : concentrations critiques des Fluoroquinolones ... 41 Tableau XXII : concentrations critiques des Aminoglycosides ... 42 Tableau XXIII : concentrations critiques des Glycopeptides ... 42 Tableau XXIV : concentrations critiques des Tétracyclines ... 42 Tableau XXV : concentrations critiques des Macrolides, lincosamides et streptogramines . 43 Tableau XXVI : concentrations critiques des Divers ... 43 Tableau XXVII : Les listes standards et complémentaires des Enterobacteriaceae ... 46

Tableau XXVIII : tableaux des concentrations critiques des Pénicillines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterobacteriaceae ... 48 Tableau XXIX : tableaux des concentrations critiques des Céphalosporines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des

Enterobacteriaceae ... 49

Tableau XXX : tableaux des concentrations critiques des Carbapénèmes pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterobacteriaceae ... 53 Tableau XXXI : tableaux des concentrations critiques des Monobactames pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des

Enterobacteriaceae ... 54

Tableau XXXII : tableaux des concentrations critiques des Fluoroquinolones pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des

Enterobacteriaceae ... 55

Tableau XXXIII : tableaux des concentrations critiques des Aminosides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des

Enterobacteriaceae ... 56

Tableau XXXIV : tableaux des concentrations critiques des Macrolides, lincosamides et streptogramines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterobacteriaceae ... 58 Tableau XXXV : tableaux des concentrations critiques des Macrolides, lincosamides et streptogramines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterobacteriaceae ... 58 Tableau XXXVI : tableaux des concentrations critiques des Autres antibiotiques pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des

Enterobacteriaceae ... 59

Tableau XXXVII: Les listes standards et complémentaires des Pseudomonas spp. ... 62 Tableau XXXVIII : tableaux des concentrations critiques des Pénicillines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas

Tableau XXXIX : tableaux des concentrations critiques des Céphalosporines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas

spp ... 64

Tableau XL: tableaux des concentrations critiques des Carbapénèmes pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas spp ... 65 Tableau XLI: tableaux des concentrations critiques des Monobactames pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas spp ... 65 Tableau XLII: tableaux des concentrations critiques des Fluoroquinolones pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas

spp ... 66

Tableau XLIII : tableaux des concentrations critiques des Aminosides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas spp ... 66 Tableau XLIV : tableaux des concentrations critiques des Divers pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Pseudomonas spp ... 67 Tableau XLV : Les listes standards et complémentaires des Acinetobacter spp. ... 68 Tableau XLVI : tableaux des concentrations critiques des Pénicillines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Acinetobacter spp. ... 68 Tableau XLVII : tableaux des concentrations critiques des Céphalosporines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Acinetobacter

spp. ... 69

Tableau XLVIII : tableaux des concentrations critiques des Carbapénèmes ... 69 Tableau XLIX : tableaux des concentrations critiques des Fluoroquinolones pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Acinetobacter

spp. ... 70

Tableau L : tableaux des concentrations critiques des Aminosides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Acinetobacter spp. ... 70 Tableau LI : tableaux des concentrations critiques des Tétracyclines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Acinetobacter spp. ... 71 Tableau LII : tableaux des concentrations critiques des Divers pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Acinetobacter spp. ... 71 Tableau LIII : Les listes standards et complémentaires des Staphylococcus spp ... 72

Tableau LIV : tableaux des concentrations critiques des Pénicillines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Staphylococcus spp . ... 73 Tableau LV: tableaux des concentrations critiques des Céphalosporines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Staphylococcus spp . ... 75 Tableau LVI : tableaux des concentrations critiques des Carbapénèmes pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Staphylococcus spp . ... 76 Tableau LVII : tableaux des concentrations critiques des Fluoroquinolones pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Staphylococcus spp . ... 77 Tableau LVIII : tableaux des concentrations critiques des Aminosides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Staphylococcus spp . ... 78 Tableau LIX : tableaux des concentrations critiques des Glycopeptides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Staphylococcus spp . ... 79 Tableau LX : tableaux des concentrations critiques des Macrolides, lincosamides et streptogramines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition de Staphylococcus spp . ... 82 Tableau LXI : tableaux des concentrations critiques des Tétracyclines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Staphylococcus spp . ... 83 Tableau LXII : tableaux des concentrations critiques des Autres pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Staphylococcus spp . ... 84 Tableau LXIII : Les listes standards et complémentaires des Enterococcus spp. ... 86 Tableau LXIV: tableaux des concentrations critiques des Pénicillines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus spp. ... 87 Tableau LXV : tableaux des concentrations critiques des Céphalosporines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus

spp. ... 88

Tableau LXVI : tableaux des concentrations critiques des Carbapénèmes pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus

Tableau LXVII : tableaux des concentrations critiques des Fluoroquinolones pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus

spp. ... 89

Tableau LXVIII : tableaux des concentrations critiques des Aminosides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus spp. ... 90 Tableau LXIX : tableaux des concentrations critiques des Glycopeptides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus

spp. ... 91

Tableau LXX : tableaux des concentrations critiques des Macrolides, lincosamides et streptogramines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus spp. ... 92 Tableau LXXI : tableaux des concentrations critiques des Tétracycline pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Enterococcus spp. ... 92 Tableau LXXII : La listes standard de Listeria monocytogenes ... 95 Tableau LXXIII : tableaux des concentrations critiques des Pénicillines pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition de Listeria monocytogenes ... 95 Tableau LXXIV : tableaux des concentrations critiques des Carbapénèmes pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition de Listeria

monocytogenes ... 95

Tableau LXXV : tableaux des concentrations critiques des Macrolides pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition de Listeria monocytogenes ... 96 Tableau LXXVI : tableaux des concentrations critiques des Divers pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition Listeria monocytogenes ... 96 Tableau LXXVII : Les listes standards et complémentaires des Aerococcus sp ... 97 Tableau LXXVIII : tableaux des concentrations critiques des Antibiotiques pour l’interpretation des CMI et des diamètres critiques des zones d’inhibition des Aerococcus sp ... 97 Tableau LXXIX : nombre de critères et etat de fragilité du sujet âgé ... 110

Introduction ... 1

I. Résistance bactérienne aux antibiotiques ... 4

1. Définition ... 4 2. Mécanisme de l’antibiorésistance acquise ... 5 3. Support génétique de l’antibiorésistances acquise ... 5

3.1 Résistance par mutation chromosomique ... 6

3.1.1 Caractères de la résistance par mutation chromosomique ... 6 3.1.2 Conséquences cliniques de la mutation chromosomique ... 6

3.2 Résistance par acquisition de gènes ... 7

3.2.1 Caractéres de l’antibiorésistance par acquisition de génes ... 7 3.2.2 Conséquences cliniques de l’antibiorésistance par acquisition de gènes ... 8 4. Antibiorésistance acquise selon les familles d’antibiotiques: ... 9 5. Facteurs contribuant à l’émergence et à la propagation de résistance ... 10

II. Resistances naturelles aux antibiotiques des principales especes

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