Présence/Absence
11. Description des habitats selon la Typologie EUNIS
L’assemblage des sédiments grossiers caractérisé par les graviers ensablés et les sables graveleux correspondent à l’habitat à Mediomastus fragilis, Lumbrineris spp. et bivalves Vénéridés des graviers et sables grossiers circalittoraux (A5.142). On y trouve des mollusques tels que Glycymeris glycymeris et Polititapes rhomboides et le cortège décrit dans les tableaux 44 et les annexes 2, 3 et 4. Certaines stations dominées par l’amphioxus Branchiostoma lanceolatum correspondent plutôt à l’habitat A5.145 : sables grossiers et graviers coquilliers circalittoraux à Branchiostoma lanceolatum.
L’assemblage des sables moyens dunaires est caractéristique de l’habitat à Echinocyamus pusillus, Ophelia borealis et Abra prismatica des sables fins circalittoraux (A5.251) établis sur des sables propres dunaires et dominé par la polychète Nephtys cirrosa et le cortège d’espèces décrites dans les tableaux 45 et les annexes 2, 3 et 4.
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12. Analyse des traits biologiques
Un trait biologique se définit comme une caractéristique morphologique, comportementale, physiologique ou décrivant l’histoire de vie d’une espèce (Violle et al., 2007). L’analyse des traits biologiques donne des informations sur le fonctionnement de l’écosystème en reliant les paramètres abiotiques et la structure de la communauté (Bremmer et al., 2006 ; Bolam & Eggleton, 2014). Les traits biologiques changent le long d’un gradient environnemental, aussi appelé trait fonctionnel d’effet, qui peut également être en interaction avec les paramètres abiotiques (Bolam & Eggleton, 2014). Par exemple, les stratégies d’alimentation et les mouvements des individus modifient la distribution des sédiments et donc influencent la pénétration de l’oxygène et des nutriments dans les sédiments. L’analyse des traits biologiques est complémentaire de l’analyse taxonomique et permet de comparer un habitat différent ou géographiquement distant car il ne tient pas compte de la taxonomie (et n’est pas sensible à la présence d’espèces endémiques) (Bolam & Eggleton, 2014)
Quelques modalités diffèrent par rapport au choix de catégoriser le benthos précédemment, notamment pour le trait de position de vie où la modalité de vie suprabenthique n’a pas été prise en compte, puisque les taxa holosuprabenthiques peuvent aussi bien vivre dans le sédiment, donc être dans l’endofaune, ou à la surface du sédiment, donc dans l’épifaune, sans pour autant migrer dans la colonne d’eau adjacente au fond. De plus, les espèces holosuprabenthiques, de par leurs caractéristiques comportementales particulières peuvent ressortir de l’analyse sans prendre en compte ce compartiment de vie. Pour le trait de l’affinité du substrat, la caractérisation des sédiments est un trait qui est actuellement encore discuté par de nombreux scientifiques. Cependant, dans mon étude, il a été choisi de prendre en compte 11 modalités pour ce trait en essayant de représenter au mieux et de manière simple les différentes caractéristiques sédimentaires observables pour la répartition des taxa (Tableau 47).
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12.1 Choix des traits biologiques
Un total de 18 traits ont été sélectionnés couvrant différents aspects de morphologie, d’écologie et d’histoire de vie pour chaque taxon : taille de l’individu, structure minérale, protection externe du corps, mobilité, position de vie, habitat, bioturbation, groupe trophique, groupe écologique, affinité du substrat, fourniture d’habitat, taille de la nourriture, capacités maximales de déplacement, différenciation sexuelle, sociabilité, fréquence de reproduction, développement larvaire et durée de vie. Dans mon étude, il a été choisi de ne pas réduire le nombre de traits biologiques (ainsi que les modalités, comme recommandé dans certaines études et par certains auteurs) car actuellement c’est un écosystème qui n’est pas sous influence d’une activité humaine (état initial avant construction). Il est donc important de définir les traits et modalités qui structurent le mieux les deux communautés benthiques identifiées sur mon site d’étude. Si cette approche, via l’analyse des traits biologiques est conservé durant les études en phase de construction et d’exploitation, il sera alors possible d’identifier quels traits seront modifiés durant ces activités de construction et sur le plus long terme durant l’exploitation. Ainsi, le choix d’un maximum de traits et de modalités dans ces analyses favorisera l’identification des changements de ces derniers dans la structure de l’écosystème du futur parc éolien de Dieppe-Le Tréport dans un contexte d’état initial puis après aménagement de la zone.
La création de la base de données pour les modalités de chaque trait pour chaque taxa a été obtenu grâce à la base de données de la thèse de Garcia (2010), du site UK Marlin (http://www.marlin.ac.uk/biotic/), de la bibliographie et si aucune information n’a pu être trouvée, de l’expertise scientifique pour la faune de la Manche. Pour chacun des 307 taxa benthiques présents sur le site de Dieppe-Le Tréport pour l’ensemble des trois types sédimentaires, les informations relatives au total des 18 traits ont été rassemblées en trois groupes principaux : les traits morphologiques (3), les traits écologiques (10) et les traits d’histoire de vie (5).
12.1.1 Traits morphologiques
La catégorie des traits morphologiques regroupe les traits les plus faciles à renseigner car leurs modalités sont directement observables sur l’individu telles que la taille (en mm) ou la structure minérale (Tableau 46).
155 Tableau 46 : Traits morphologiques avec modalités et abréviations correspondantes.
Traits Modalités Abréviation
Taille de l’individu (Individual size)
< 10 mm SI_vsml
10 – 20 mm SI_sml
21 – 100 mm SI_med
> 100 mm SI_big
Structure minérale (Mineral structure)
Non MS_no
Carbonates de calcium MS_CaCo
Silicium MS_Si
Protection externe du corps (External body protection)
Non EB_no
Cuticule EB_cut
Tube EB_tub
Carapace/test/coquille EB_car
12.1.2 Traits écologiques
Cette catégorie regroupe les traits correspondant aux comportements des espèces au niveau de leur environnement. Le tableau 47 illustre les différents traits et modalités de cette catégorie.
Tableau 47 : Traits écologiques avec modalités et abréviations correspondantes.
Traits Modalités Abréviation
Mobilité (Mobility)
Nageur (Swimmer) MO_swi
Marcheur (Walker) MO_wlk
Rampant (Crawler) MO_crw
Creuseur (Burrower) MO_bur
Sessile MO_ses
Position de vie (Living position) Epifaune (Epifauna) LP_epi
Endofaune (Endofauna) LP_endo
Habitat
Habitant un tube (Tube dweller) HA_tdw
Habitant un terrier (Burrow dweller) HA_bdw
Libre (Free living) HA_free
Attaché (Attached) HA_att
Bioturbation
Pas de Bioturbation (No bioturbation) BI_nob
Dépôts de surface (Surface deposition) BI_sdep
156 Convoyeur dans le sédiment (Downward conveyor) BI_doc
Diffuseur (Diffusive mixing) BI_dif
Groupes trophiques (Trophic Group)
Déposivore sélectifs (Selective deposit feeder) TG_sdf Déposivore non sélectifs (Non-selective deposit
feeder) TG_ssdf
Suspensivore actif (Suspension feeder) TG_susp
Prédateur (Carnivorous) TG_car
Nécrophage (Scavenger) TG_sca
Brouteur (Grazer) TG_gra
Groupes écologiques AMBI (Ecological Group)
Sensible (Sensitive) I EG_I
Indifférent (Indifferent) II EG_II
Tolérant (Tolerant) III EG_III
Opportuniste de 2nd ordre (Second-order
opportunistic) IV EG_IV
Opportuniste de 1er ordre (First order opportunistic) V EG_V
Affinité du substrat (substrat affinity)
Vase (Mud) SA_mud
Vase sableuse (Sandy mud) SA_smud
Sable vaseux (Muddy sand) SA_msand
Sable fin propre (Fine clean sand) SA_fsand
Sable grossier propre (Coarse clean sand) SA_csand
Graviers (Gravel) SA_grav
Cailloutis (Pebble) SA_pebb
Rochers (Rocks) SA_rock
Détritus (Detritus) SA_det
Biologique (Biological as Algua, seeweed…) SA_biol
Coquille (Shell) SA_shell
Fournisseur d’habitat (Habitat provider)
Oui (Yes) HP_yes
Non (No) HP_no
Taille de la nourriture (Food size)
Microphage FS_mif
Macrophage FS_maf
Capacité maximale des mouvements journaliers (Maximal Capacity of daily
movements)
0-10 cm MC_10
10-100 cm MC_50
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12.1.3 Traits d’histoire de vie
Cette troisième catégorie correspond aux traits d’histoire de vie des espèces, et sont présentés dans le tableau 48.
Tableau 48 : Traits d’histoire de vie avec modalités et abréviations correspondantes.
Traits Modalités Abréviation
Différenciation sexuelle (Sexual Differenciation) Hermaphrodite (Hermaphrodism) SD_herm Gonochorique (Gonochorism) SD_gono Sociabilité (Sociability) Solitaire (Solitary) SO_soli
Grégaire (Gregarism) SO_greg Fréquence de reproduction (Reproduction Frequency) Itéroparité (Iteroparity) RF_ite
Semelparité (Semelparity) RF_sem
Développement larvaire (Larval development)
Planctotrophique (Planktotrophic) LD_plk Lécitotrophique (Lecitotrophic) LD_lec Développement direct (Direct development) LD_dde
Durée de vie (Life span)
Courte (Short) <2 années LS_sht Moyenne (Medium) 2-5 années LS_med Longue (Long) >5 années LS_lng
12.2 Analyse des traits biologiques
Chaque trait (18) a été divisé en modalités (68). Le codage flou (Chevenet et al., 1994) a ensuite été utilisé pour permettre une analyse statistique : une matrice d’espèces par trait biologique a été créée, dans laquelle chaque colonne représente une modalité de trait biologique. Si la modalité correspond à l’espèce, un score de 1 est attribué (ex : Liocarcinus depurator, libre, 1), sinon le score de l’espèce pour la modalité est de 0 (ex : Liocarcinus depurator, attaché, 0). Si les espèces ont une affinité pour plusieurs modalités d’un même trait, les scores pour chaque modalité sont divisés par le nombre des modalités caractérisant l’espèce afin que le score total de l’espèce pour un trait ne soit pas supérieur à 1 (ex : Liocarcinus depurator, nageur 0,5 et marcheur 0,5, somme de 1 pour la mobilité). Cette matrice est utilisée pour identifier les groupes fonctionnels (c’est-à-dire, des groupes d’espèces ayant des traits biologiques similaires). Ceci a été réalisé selon la procédure décrite par Usseglio-Polatera et al. (2000). Tout d’abord, une analyse de correspondance en codage flou a été réalisée. Ensuite, un dendrogramme utilisant la méthode de Ward (Ward, 1963) sur les distances euclidiennes, a été effectué à la suite de l’analyse multiple en codage flou. Une