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Biologie Moléculaire

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Academic year: 2022

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Texte intégral

(1)

Biologie Moléculaire

3ème Année Biochimie 2019/2020 Responsable de la Matière :

Dr. BOUDIAF K.

(2)

Chez les Procaryotes

(3)

3

Les opérons et leur régulation

Opéron : Un ensemble de gènes de structure, ayant une fonction

commune, groupés sur le même segment d’ADN et contrôlés par les mêmes séquences régulatrices

P : Promoteur : Site de fixation de l’ARN polymérase

O : Opérateur : Contrôle la liaison de l’ARN polymérase au promoteur

(4)

4

Les opérons et leur régulation

La régulation de l’expression des gènes d’un opéron implique:

Des séquences régulatrices : Le Promoteur et l’Opérateur

Des protéines régulatrices : Activateurs et Répresseurs Il existe deux types de régulation :

Régulation Positive Régulation Négative

Active la transcription

Implique un Activateur

Inhibe la transcription

Implique un Répresseur

(5)

5

Les opérons et leur régulation

Types d’opérons

Code pour les enzymes d’une voie catabolique (processus de dégradation).

Son expression est contrôlée donc par le substrat

Son état normal est inactif (OFF)

Il devient actif (ON) si le substrat est présent => le substrat est un

« inducteur »

Code pour les enzymes d’une voie anabolique (processus de

biosynthèse).

Son expression est contrôlée donc par le produit

Son état normal est actif (ON)

Il devient inactif (OFF) si le

produit est présent => le produit est un « co-répresseur »

Opérons répressibles Opérons inductibles

(6)

L’opéron Lactose

(7)

7

Structure de l’opéron Lactose

lacZ

β-galactosidase

lacY

Lactose perméase

lacA

thiogalactoside transacétylase lacI

Répresseur Lac

(8)

8

Fonction de l’opéron Lactose

Code pour les enzymes d’utilisation du Lactose

L’enzyme responsable de la dégradation du lactose est la

β-galactosidase

(codée par le gène

lacZ

)

(9)

9

Régulation négative de

l’opéron lactose

(10)

10

Régulation négative de l’opéron lactose

L’état normal de l’opéron lac est réprimé (OFF)

L’opéron est inactivé par le Répresseur Lac qui est fonctionnel en l’absence du lactose

Le Répresseur Lac se lie à l’opérateur et bloque la progression de l’ARN

polymérase vers les gènes à partir du promoteur

(11)

11

Régulation négative de l’opéron lactose

La présence du lactose induit l’opéron lac : Lactose = Inducteur

Le lactose se lie au répresseur Lac

Le répresseur Lac devient inactif

Le répresseur Lac n’est plus capable de lier l’opérateur

L’ARN polymérase peut progresser et transcrire les gènes de l’opéron lac

(12)

L’opéron Tryptophane

(13)

13

Structure de l’opéron Tryptophane

(14)

14

Régulation négative de

l’opéron tryptophane

(15)

15

Régulation négative de l’opéron Tryptophane

L’état normal de l’opéron trp est actif (ON)

=> Répresseur

non-fonctionnel L’opéron est actif

en absence du tryptophane

(16)

16

Régulation négative de l’opéron Tryptophane

L’opéron est inactivé par le Répresseur Trp qui

devient fonctionnel en présence du tryptophane

=> Le tryptophane active le répresseur

Le tryptophane est un

« co-répresseur »

(17)

Chez les Eucaryotes

(18)

18

Beaucoup plus complexe que celle des bactéries

Régulation de l’expression des gènes chez les Eucaryotes

Points communs :

Présence d’un promoteur qui spécifie le taux de l'initiation de transcription

Présence de séquences régulatrices

Présence de protéines régulatrices (activateurs/répresseurs) qui interagissent spécifiquement avec des séquences

régulatrices correspondantes

Les différences résultent de l'organisation plus complexe

de la cellule eucaryote

(19)

19

Niveaux de régulation de l’expression des gènes chez les Eucaryotes

(1) Niveau chromatinien (condensation de la chromatine :

méthylation/deméthylation, acétylation/désacétylation des histones ; remodelage de la chromatine…)

(2) Niveau transcriptionnel (disponibilité ou non des facteurs de transcription ; activation par des activateurs, suppression par des répresseurs…)

(3) Niveau post-transcriptionnel (cap, excision- épissage ; queue poly- A, épissage alternatif…)

(4) Transport de l’ARNm du noyau vers le cytoplasme (5) Stabilité de l’ARNm (dégradation)

(6) Niveau traductionnel (facteurs d’initiation de traduction ; répresseurs de traduction par ex. les micro-ARN

(7) Niveau post-traductionnel (clivage, repliement, modification chimique, transport vers des compartiments cellulaires…

(8) Stabilité de la protéine (dégradation).

(20)

20

Régulation au niveau de la

chromatine

(21)

21

Condensation de la chromatine et transcription

Hétérochromatine

(fibre de 30 nm)

Euchromatine

Figure 4-22 Molecular Biology of the Cell(© Garland Science 2008)

(22)

22

Condensation de la chromatine et transcription

ADN transcriptionnellement inactif ADN transcriptionnellement actif

Modification des histones

Méthylation d’ADN

Remodelage de la

chromatine

(23)

23

Modification des histones

Régulation au niveau de la chromatine

Histone Acétyle-transférases Histone désacétylases

(désacétylation)

Histone méthyltransférases 1) Acétylation

des Histone

2) Méthylation des Histone

(Activation ou répression selon le site de méthylation)

désacétylation

(24)

24

Modification des histones

Régulation au niveau de la chromatine

Histone Acétyle-transférases Histone désacétylases

(désacétylation)

Histone méthyltransférases 1) Acétylation

des Histone

2) Méthylation des Histone

(Activation ou répression selon le site de méthylation)

Décondensation :

Euchromatine

(Activation de la transcription)

Condensation :

Hétérochromatine

(Répression de la transcription) Acétylation des histones

par les Histone Acétyle- transférases

Désacétylation des histones par les Histone

désacétylases

Méthylation des histones par les Histone

méthyltransférases sur les lysine 4, 36 et 79 de

l’histone H3 (H3K4me, H3K36me, H3K79me)

Méthylation des histones par les Histone

méthyltransférases sur les lysines 9 et 27 de

l’histone H3 (H3K9me et H3K27me) et la lysine 20 de l'histone H4 (H4K20me)

(25)

25

Remodelage de la chromatine

Régulation au niveau de la chromatine

(26)

26

Méthylation d’ADN

Régulation au niveau de la chromatine

ADN méthylé sur la cytosine

de la séquence CG Condensation en Hétérochromatine (Expression réprimée)

(27)

27

Régulation au niveau

Transcriptionnel

(28)

28

La régulation transcriptionnelle

La régulation de la transcription implique :

Des séquences régulatrices (éléments cis-régulateurs)

Promoteur central, éléments proximaux, éléments distaux (enhancers (UAS chez la levure), silencers …etc.

Des protéines (éléments trans-régulateurs)

Facteurs de transcription, activateurs, co-activateurs, répresseurs

(29)

29

Activation de l'initiation de la transcription

chez les eucaryotes

(30)

30

Activation de l'initiation de la transcription

chez les eucaryotes

(31)

31

Activateurs, co-activateurs et répresseurs

Les activateurs Activent la transcription en stimulant l’assemblage du complexe de transcription basale ou en le stabilisant au niveau du promoteur

Activent la transcription en interagissant avec le complexe de transcription basale directement ou indirectement par intermédiaire de co-activateurs

Se lient à l’ADN au niveau de séquences spécifiques de l’ADN (éléments proximaux du promoteur, Enhancers…)

Certains activateurs/co-activateurs possèdent une activité actétyle-transférase, d’autres recrutent les Histone acétyle-transférases ou les systèmes de

remodelage de la chromatine

(32)

32

Activateurs, co-activateurs et répresseurs

(33)

33

Activateurs, co-activateurs et répresseurs

Les Répresseurs Inhibent la transcription

Se lient à des séquences spécifiques de l’ADN (éléments proximaux du promoteur, Silencers).

a) Compétition 4 Modes d’actions

(34)

34

Activateurs, co-activateurs et répresseurs

Les Répresseurs Inhibent la transcription

Se lient à des séquences spécifiques de l’ADN (éléments proximaux du promoteur, Silencers).

b) Inhibition 4 Modes d’actions

(35)

35

Activateurs, co-activateurs et répresseurs

Les Répresseurs Inhibent la transcription

Se lient à des séquences spécifiques de l’ADN (éléments proximaux du promoteur, Silencers).

c) Répression directe

4 Modes d’actions

(36)

36

Activateurs, co-activateurs et répresseurs

Les Répresseurs Inhibent la transcription

Se lient à des séquences spécifiques de l’ADN (éléments proximaux du promoteur, Silencers).

4 Modes d’actions

d) Répression indirecte

(37)

37

Exemples de la régulation transcriptionnelle par des

signaux extracellulaires

(38)

38

Signaux impliquant un récepteur

membranaire

Ex. Voie JAK-STAT de signalisation des

Cytokines

(39)

39

Signaux

impliquant un récepteur

intracellulaire

Ex. Régulation

par les hormones

stéroïdiennes

(40)

40

Exemple de la régulation

Post-transcriptionnelle

(41)

41

Sites multiples de poly-

adénylation + Epissage

alternatif

Ex. Gène de la

calcitonine

(42)

42

Sites multiples de poly-

adénylation

Ex. Expression des formes

membranaires et secrétées des

anticorps

(43)

43

Régulation par le petit ARN

interférent (siRNA)

(44)

44

Régulation par le petit ARN interférent (siRNA)

(45)

45

Régulation par le petit ARN interférent (siRNA)

(46)

46

Régulation par le petit ARN interférent (siRNA)

(47)

47

Régulation Traductionnelle

(48)

48

Régulation par les répresseurs de la traduction

Références

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