VARIABILITE INDIVIDUELLE DE L’EFFICIENCE
ALIMENTAIRE CHEZ LE BOVIN EN ENGRAISSEMENT : DETERMINANTS ET BIOMARQUEURS
Gonzalo CANTALAPIEDRA-HIJAR (INRAE; France)
.02
• Qu’est‐ce que c’est l’efficience alimentaire? Définitions
• Importance de la variabilité individuelle de l’EA
• Comment identifier les animaux efficients?
Recherche de biomarqueurs
• Quels sont les mécanismes à l’origine des ces différences?
Etudes de déterminants
SOMMAIRE
2. Réseaux fermes (Beefalim)
1.Littérature
3. Expérimentation (EffiScience)
.03
• 600 jeunes bovins testés
• 4 ans d’étude (2015‐2019)
• 4 fermes expérimentales
• 2 mêmes régimes contrastés (Maïs vs Herbe)
PROGRAMME BEEFALIM : AMELIORER L’EFFICIENCE ALIMENTAIRE CHEZ LE BOVIN ALLAITANTE
Etude des déterminants génétiques et biologiques de l’EA
Recherche de biomarqueurs de l’EA (prises de sang) En interaction avec le régime
.04
Gain poids/ingestion
Potentiel de croissance
Ingéré observé ‐ théorique
Besoin d’entretien
vs
FEED CONVERSION EFFICIENCY
RESIDUAL FEED INTAKE
COMMENT MESURE-T-ON L’EFFICIENCE ALIMENTAIRE?
NutritionGénétique
La sélection sur RFI n’affecte pas les performances (pas d’impact sur le
poids vif des vaches adultes)
.05
> 1/2 1/3 1/10
±Δ
FAIBLE EFFICIENCE ALIMENTAIRE CHEZ LE RUMINANT
(+250% depuis 1957)
Feed conversion efficiency (FCE),
gain poids/MSI
Tolkamp et al., 2010
.06
0.22 0.20 0.18 0.16 0.14 0.12 0.10
ENS MAÏS ENS HERBE
CV inter‐individu= 8.4% CV inter‐individu= 9.5%
FCE ajusté, kg/kg
CV inter‐régime = 13.4%
NUTRITION VS GENETIQUE
Fossaert et al., 2020 (3R)
COMPRENDRE :
DETERMINANTS BIOLOGIQUES PREDIRE :
BIOMARQUEURS
Réseaux fermes (Beefalim)
.07
1.5
1.0
0.5
0.0
-0.5
-1.0
-1.5
RFI, kg MS, j
CV = 4.6%
Fossaert et al., 2020 (3R)
Les 10 animaux les plus efficients consomment en moyenne 2,35 kg de MSI/j de moins que les 10 les moins efficients tout en maintenant la même performance
VARIABILITE GENETIQUE DE L’EA
Réseaux fermes (Beefalim).08
Efficients (p75)
Inefficients (p25)
Efficients (p25)
Inefficients (p75)
SELECTION DE L’EA: GAIN ECONOMIQUE
€
Renand et al. (unpublished)
Réseaux fermes (Beefalim)
ENS MAÏS
ENS HERBE ENS HERBE
ENS MAÏS
Bilan économique pour la phase d’engraissement
.09
DETERMINANTS BIOLOGIQUES DE L’EA
Littérature.010
DETERMINANTS DES VARIATIONS INDIVIDUELLES D’EA
PROBABILITE D’ETRE UN VRAI DETERMINANT
‐ +
DIGESTIBILITE
EMISSIONS CH4 COMPORTEMENT
ALIMENTAIRE
MICROBIOTE RUMINAL
COMPOSITION CORPORELLE SYSTEME
ENDOCRINE
METABOLISME ET TURNOVER PROTEIQUE
RESPIRATION MITOCHONDRIAL
METABOLISME ENERGETIQUE
Ces conclusions ne s’appliquent qu’aux régimes d’engraissement riches en céreales!
Cantalapiedra‐Hijar et al., 2018
Littérature
Richardson and Herd, 2004 .011
DETERMINANTS DES VARIATIONS INDIVIDUELLES D’EA
Littérature
.012
TURNOVER PROTEIQUE
• La vitesse de renouvellement protéique est un des mécanismes métaboliques souvent évoqué comme facteur déterminant des variations individuelles d’EA
SYNTHESE DEGRADATION SYNTHESE DEGRADATION SYNTHESE DEGRADATION
Gain protéique Perte azoté Bilan nul
g/j
PERTE
GAIN ENTRETIEN
SYNTHESE DEGRADATION Gian proteique
g/d
Synthèse≈ 20% des besoins énergétiques
basales
(Waterlow, 1988)
GAIN
1.Littérature
.013
PROTOCOLE EFFI‐SCIENCE
100 animaux en 2 ans (50/an) et sur 2 régimes (50 Maïs vs 50 Herbe)
TEST RFI DEBUT
GREENFEED (CH4/H2/CO2/O2)
TURNOVER PROTEIQUE TEST RFI FIN
ABATTAGE DIGEST/BILAN N
BIOPS ECHO
BIOPS ECHO
BIOPS ECHO COMPORTEMENT ALIMENTAIRE
CLASSEMENT
OCT JANV MAI
BOLUS PH ET MICROBIOTE
Prélèvement de sang
M
M Administration marqueurs
COMPO CORP
.014
PROJET EFFI‐SCIENCE
.015
RECHERCHE DE BIOMARQUEURS DE L’EFFICIENCE ALIMENTAIRE
CHEZ LE BOVIN EN ENGRAISSEMENT
.016
RECHERCHE DE BIOMARQUEURS DE RFI CHEZ LES ANIMAUX EXTREMES
1.5
1.0
0.5
0.0
-0.5
-1.0
-1.5
RFI, kg MS, j
n= 24
n= 24
Δ = 1.5 kg MSI (+13%)
• Génomique
• Biochimie sanguine
• Isotopomique
• Protéine totale (n ≈ 600)
• Acides aminés (n ≈ 48)
• Metabolomique
• Proteomique
• Hormones
• Vitamines B
.017
LES ABONDANCES NATURELLE DE L’AZOTE 15 N
DANS LES PROTEINES ANIMALES
.018
DISCRIMINATION ISOTOPIQUE DE L’AZOTE
TRANSAMINASE HEPATIQUES : Affinité pour 14N‐AA > 15N‐AA
• Les protéines animales sont naturellement plus enrichies en 15N lorsque le catabolisme
hépatique d’AA augment
ASSIMILATION N PAR LES BACTERIES DU RUMEN : Affinité pour 14N‐NH3 > 15N‐NH3
• Les protéines animales sont naturellement plus enrichies en 15N lorsque la synthèse microbienne diminue
(Macko et al., 1986)
(Wattiaux and Reed, 1995)
14
N
99,63%
15
N
0,37%
CONSEQUENCES BIOLOGIQUES
ENZYMES
.019
ABONDANCE 15 N ET EFFICIENCE PROTEIQUE
0.4 0.3
0.2 0.1
0.0 -0.1
-0.2 7 6 5 4 3 2 1 0
Efficience d’utilisation de l’azote, g/g
Cantalapiedra‐Hijar et al., 2018
Δ15 N animal‐régime
CONFIRMATION PAR META‐ANALYSE
0.40 0.35
0.30 0.25
0.20 0.15
4.5 4.0 3.5
3.0 2.5 2.0 1.5
Δ15 N animal‐régime
n = 19 n = 35
PREUVE DE CONCEPT
Efficience d’utilisation de l’azote, g/g
Cantalapiedra‐Hijar et al., 2015
.020
LIEN EFFICIENCE ALIMENTAIRE VS PROTEIQUE
0.22 0.20
0.18 0.16
0.14 0.12
0.33 0.30 0.27 0.24 0.21 0.18
0.15
0.21 0.20 0.19 0.18 0.17 0.16 0.15 0.14 0.22
0.20 0.18
0.16 0.14
0.12
0.10
GrassCorn
0.17 0.16 0.15 0.14 0.13 0.12 0.11 0.10 0.09 0.08 0.325 0.300 0.275 0.250 0.225 0.200 0.175 0.150
GrassCorn
Cantalapiedra‐Hijar et al., 2015 Nasrollahi et al., 2020 Guarnido et al., 3R 2020
FCE, kg/kg FCE, kg/kg FCE, kg/kg
Efficience protéique, kg/kg
GrassCorn
RETENTION PROTEIQUE
ESTIMEE DIAMETRE
ADYPOCITES DISSECTION 6èmeCÔTE
.021
ABONDANCE 15 N ET EFFICIENCE ALIMENTAIRE
0.25 0.24 0.23 0.22 0.21 0.20 0.19 0.18 0.17 0.16 4.6 4.4 4.2 4.0 3.8 3.6 3.4 3.2
Meale et al., 2017
Efficience alimentaire, g/g
PREUVE DE CONCEPT
n = 54 r2 = 0,53
Δ15 N animal‐régime
5.5 5.0
4.5 4.0
3.5 3.0
2.5 2.0
0.25
0.20
0.15
0.10
0.05
0.00
Δ15Nanimal‐régime
Efficience alimentaire, g/g
Cantalapiedra‐Hijar et al., EAAP2020
CONFIRMATION PAR META‐ANALYSE
n = 493 r2=0.37
.022
5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 0.25
0.20
0.15
0.10
0.05
0.00
Δ
15N
animal‐diet, ‰FC E, g/ g
5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 0.25
0.20
0.15
0.10
0.05
0.00
ABONDANCE 15 N ET EFFICIENCE ALIMENTAIRE
Régression intra‐régime
FCE = - 0.030** (se 0.0056) ×Δ15N
Cantalapiedra‐Hijar et al., EAAP 2020
.023
plasma δ15N, ‰ plasma urea, g/L FCE, g/g RFI, kg/d
r = 0.28***
r = ‐0.01 r = ‐0.43***
r = 0.01
VARIABILITE INDIVIDUELLE DE L’EA: 15N vs UREE
Thèse Pablo Guarnido
Guarnido et al., 2019 (ISEP)
.024
UNE RELATION SIGNIFICATIVE ENTRE 15N ET EA
…..MAIS DIFFERENTE SELON LA NATURE DU REGIME
FCE Model
Intercept Slope
HERBE 0.249 ±0.017*** ‐0.017a ± 0.002***
MAÏS 0.292 ±0.015*** ‐0.024b ± 0.002***
FCE, kg/kg
15N plasma, ‰
Guarnido et al. 2021 (méta‐analyse en cours)
Thèse Pablo Guarnido
.025
LES ABONDANCES NATURELLE DE L’AZOTE 15N
DANS DES ACIDES AMINES SPECIFIQUES
.026
plasma δ15N, ‰
RFI, kg/d
r = 0.28***
QUE SE PASSE‐T‐IL LORSQUE LES ABONDANCES
15N SONT ANALYSES DANS DES ACIDES AMINES INDIVIDUELS???
Les acides aminés constitutifs des protéines participent dans différents voies métaboliques selon leur nature et donc contiennent des information isotopiques qui signent son comportement métabolique spécifique
Cantalapiedra‐Hijar et al., 2020 .027
L’ABONDANCE PLASMATIQUE EN 15N DISCRIMINE
LES EXTREMES RFI!
.028
LES ACIDES AMINES QUI NE SUBISSENT PAS DES
TRANSAMINATIONS NE SONT PAS AFFECTES
.029
MOINS DE TRANSAMINATION CHEZ LES ANIMAUX
EFFICIENTS!
.030
RECHERCHE DE BIOMARQUEURS PLASMATIQUE PAR UNE APPROCHE CIBLEE EN
METABOLOMIQUE
.031
LE METABOLOME PLASMATIQUE EST FORTEMENT
IMPACTE PAR LE REGIME MAIS TRES PEU MODIFIE PAR RFI
RFI+
RFI‐
.032
RFI NEG POS NEG POS
250
200
150
100
50
0
P<0.001*
Créatinine plasmatique, mM
MAÏS HERBE
Cantalapiedra‐Hijar et al. 2020 (EAAP)
LES ANIMAUX PLUS EFFICIENTS ONT UNE
MASSE MUSCULAIRE PLUS IMPORTANTE?
.033
DIETRFI
GRASS
CORN POS NEG POS
NEG 2.00 1.75 1.50 1.25 1.00 0.75 0.50
METHYLARGININE
DIETRFI
GRASS
CORN POS NEG POS
NEG 50
40
30
20
10
0
trans-4-Hydroxyproline
HYDROXYPROLINE*
DIETRFI
GRASS
CORN POS NEG POS
NEG 12 10 8 6 4 2 0
1-methylhistidine
DIET RFI
GRASS CORN
POS NEG POS
NEG 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0
beta-Alanine
METHYL‐ARG 1 METHYL‐HIS
β‐ALANINE*
0.001<P<0.10
Cantalapiedra‐Hijar et al. 2020 (EAAP)
LES ANIMAUX PLUS EFFICIENTS ONT UNE
MASSE MUSCULAIRE PLUS IMPORTANTE?
.034
DIET RFI
Grass Corn
POS NEG
POS NEG
1.4 1.2 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2
0.0
Regime RFI
GRASS CORN
POS NEG
POS NEG
12
10
8
6
4
2
0
GRAISSE VISCERALE, %PV PROTEINE/GRAISSE CARCASSE
MAÏS HERBE MAÏS HERBE
Réseaux fermes (Beefalim)
Expérimentation
Interaction RFI x régime P = 0.07 Interaction RFI x régime P = 0.04
.035
LES ANIMAUX LES PLUS EFFICIENTS UTILISENT MIEUX L’AZOTE ALIMENTAIRE
DIET RFI
Grass Corn
POS NEG
POS NEG
0.25
0.20
0.15
0.10
0.05
0.00
MAÏS HERBE
Urée plasmatique, g/L Abondance 15N plasma, ‰
HERBE MAÏS
.036 Protein turnover
S D
LES ANIMAUX PLUS EFFICIENTS MONTRENT UN TURNOVER PROTEIQUE PLUS FAIBLE
DIET RFI
GRASS CORN
POS NEG
POS NEG
0.035 0.030 0.025 0.020 0.015 0.010 0.005 0.000
/
P = 0.007
Plasma 3MH/Creatn, µmol
MAÏS HERBE
.037
DietRFI
GRASS
CORN POS NEG POS
NEG 20
15
10
5
0 DIETRFI
GRASS
CORN POS NEG POS
NEG 0.035
0.030 0.025 0.020 0.015 0.010 0.005 0.000
/
Réseaux fermes (Beefalim)
P = 0.007 P = 0.08
Expérimentation
PLASMA 3MH/Creat URINE3MH/Creat
MAÏS HERBE MAÏS HERBE
.038
EVALUATION INDIRECTE DU TP
Cantalapiedra‐Hijar et al., 2019
.039
Taux déplétion RFI+: k = 5.04%
Taux déplétion RFI‐: k = 4.67%
+8%***
Plasma δ15 N relatif, ‰
Temps, j
MAÏS
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
0 20 40 60 80 100
RATION MAIS : TAUX DE SYNTHESE ET DEGRADATION PROTEIQUE PLUS FAIBLE CHEZ LES EFFICIENTS
Diet RFI
CORN POS NEG
20
15
10
5
Urine 3MH/Creatn, µmol 0
P = 0.02
MAÏS
Résultats préliminaires thèse Pablo Guarnido
.040
RATION HERBE: PAS DE DIFFERENCES DANS LA SYNTHESE ET DEGRADATION PROTEIQUE ENTRE GROUPES RFI
Diet RFI 20
15
10
5
Urine 3MH/Creatn, µmol 0
P = 0.02
HERBE
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
0 20 40 60 80 100
Taux déplétion RFI+: k = 4.30%
Taux déplétion RFI‐: k = 4.40%
‐2%
nsTemps, j
HERBE
GRASS POS NEG
Plasma δ15 N relatif, ‰
NS
.041
• Higher N use efficiency in low RFI
• Higher muscle mass in low RFI?
A confirmer avec rations cellulosiques
• Lower protein turnover in low RFI?
A confirmer avec rations cellulosiques
COMMUNS REGIME DEPENDANT
DETERMINANTS DE RFI COMMUNS ET REGIME‐DEPENDANTS
EN COURS DE DEPOUILLEMENT….
Strong RFI x DIET interaction for key metabolites
La part du métabolisme protéique et composition corporelle dans les variations RFI semble être très importante chez des animaux recevant des régimes denses en énergie mais moins importante avec des régimes riches en fibre (hypothèse en cours de vérification)
.042