Etude des vers de terre, des communautés
aux fonctions dans les sols
Kevin Hoeffner,
Sarah Guillocheau, Daniel Cylly, Mathilde Plaire, Muriel Guernion, Daniel Cluzeau
Université de Rennes, UMR CNRS EcoBio Observatoire des Sciences de Rennes
ecobiosoil.univ-rennes1.fr
Pourquoi les étudier ?
Ingénieurs des écosystèmes
= groupes d’impacts fonctionnels
Ils modifient les propriétés du sol (biologiques, chimiques & physiques)
Bio-indicateurs des sols et de ses usages
= groupes de réponses aux contraintes exercées sur les sols
Sensibles aux modifications de leur environnement
Faciles à observer & à prélever
Méthodes de prélèvement transférables
Co-construction d’un référentiel national
• Vivent en surface dans les amas organiques (compost, fumier, ...)
• Creusent peu ou pas de galeries
2 3 1
Groupes fonctionnels Lombriciens
Taille : moyenne à grande (1 - 20 cm) Couleur : faiblement pigmentée
(rose à gris –clair)
Les endogés
2
• Vivent dans l’ensemble du sol
• Creusent des galeries permanentes verticales
• Rejettent des déjections à la surface du sol
• Vivent dans le sol et remontent rarement à la surface
• Creusent des galeries temporaires horizontales
Régime alimentaire :
géophages
Ils mangent de la terre qui contient de la matière organique plus ou moins dégradée
(racines mortes, humus …)
Taille : grande (10 - 110 cm) Couleur : rouge, gris clair, brun
(avec un gradient de la tête à la queue)
Les anéciques
3
Taille : petite (1 - 5 cm) Couleur : rouge sombre
Les épigés
1
TurriculesEpi- anéciques
Anéciques stricts
• Règles d’assemblage des communautés lombriciennes selon l’évolution des usages et des modes de gestion des sols associées aux contraintes pédo-climatiques
(à différentes échelles spatiales)
• Contribution fonctionnelle des lombriciens à la
dégradation des matières organiques et au transfert de Carbone & d’eau dans les sols
• En développement : Diversité génétique, phylogénie des genres ancestraux & évolution des traits fonctionnels
Habitats prospectés
• Espaces agricoles (prairies, vignobles, Grandes Cultures, …)
selon diff. modes de production (conventionnel, durable, agroforestier, …)
• Espaces naturels (forêt, réserves naturelles, marais, …)
• Espaces urbanisés (potagers, parcs, friche industrielle, aéroport…)
Elaboration d’1 BDD nat.
Construction de référentiels et de modèles prédictifs
Traduction en termes de contribution aux services écosystémiques
(EcoFinders : Rutgers & al, 2016)
Recherches sur la biodiversité lombricienne
&
Fonctionnement écologique des sols en milieu tempéré
Mais comment faire + ?
(+vite, +territoires, +habitats)
Comment développer le référentiel national
tout en réalisant un transfert d’outil BioIndicateur à tous les utilisateurs
des sols agricoles, naturels ou urbains?
Utiliser comme levier,
une démarche participative ou collaborative avec l’Observatoire Participatif des Vers de Terre
https://ecobiosoil.univ-rennes1.fr/OPVT_accueil.php
… de répondre aux objectifs suivants …
Proposer un outil d’auto-évaluation, accessible pour tous publics, de la biodiversité des sols à l’aide des vers de terre
- État des lieux d’un site ou d’un territoire - Impacts comparés des pratiques culturales - Évaluation d’effets dépressifs à court terme
Faire de la pédagogie sur l’importance du sol et de sa biodiversité
Établir progressivement des référentiels locaux, régionaux, … (Connaitre pour agir)
Participatif
Pédagogique Progressif
& Collaboratif
Que permet l’OPVT ?
Site web OPVT
https://ecobiosoil.univ-rennes1.fr/
OPVT contribution et participation
Nombre d’observation Nombre de programmes n > 13
Nombre de reseau n > 80
~ 3000 observations participatives
~ 1500 observations collaborative en 6 ans
[565]
[640]
[878]
[3157]
[4035]
7
Abondance lombricienne (nb ind/m²)
Indicateur national
Abondance par habitat
Collaboration avec l’ONB
(Observatoire National de la Biodiversité)
Pattern similaire selon l’occupation du sol peu importe le protocole
Protocole moutarde Test bêche
Vigne
Prairie
Grandes Cultures Jardins
Abondance lombricienne (nb ind/m²)
Standard error
9
a b
b b a
b
b
** ***
Atlas national de la distribution des espèces lombriciennes
ecobiosoil database
Atlas de biodiversité
13
n = 24 taxa recorded in all land use “habitats”
Source: ecobiosoil database, Cluzeau & al
Contribution fonctionnelle
f e
c
a
f
d
b
0 1 2 3 4 5
L. rubellus L. festivus L. centralis L. terrestris A. caliginosa meridionalis
A. nocturna A. giardi
Earthworm weight (gram)
Grande variabilité des traits morphologiques et physiologiques
selon les espèces de vers de terre
(Bouché, 1972, 1977)Au sein des anéciques
F = 1084.8 p < 0.001
Epi-anéciques Anéciques stricts
Quelle est la contribution des principales espèces lombriciennes à la degradation de la litière prairiale
en interaction avec les micro-organismes du sol ?
Contribution fonctionnelle
13
Réalisation d’expérimentations en conditions contrôlées Focus dans les galeries de vers de terre
-0. 5 0. 0 0. 5 1. 0
NM DS2
LF LC
LR LT
Control Stress = 0.10
F = 4.56, P < 0.001
-2.0 -1.5 -1.0 -0.5 0.0 0.5
-1. 5 -1. 0 -0. 5 0. 0 0. 5 1. 0
N M D S2 LC
LF
LR LT Control
Stress = 0.10
F = 1.57, P = 0.033
NMDS1
-1.5 -1.0 -0.5 0.0 0.5
-1. 0 -0. 5 0. 0 0. 5 1. 0 1. 5
N M D S2
LC
LF LR
LT Control
Stress = 0.11
F = 3.47, P = 0.001
-1.0 -0.5 0.0 0.5 1.0
a)
b)
c)
Les epi-anéciques modifient
les communautés fongiques
dans leurs galeries
b
b
b
b
a
a
a
0 50 100 150 200
BS AM AN AG LR LC LT
nmol/gr/hr