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Etude des vers de terre, des communautés aux fonctions dans les sols

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Academic year: 2022

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(1)

Etude des vers de terre, des communautés

aux fonctions dans les sols

Kevin Hoeffner,

Sarah Guillocheau, Daniel Cylly, Mathilde Plaire, Muriel Guernion, Daniel Cluzeau

Université de Rennes, UMR CNRS EcoBio Observatoire des Sciences de Rennes

ecobiosoil.univ-rennes1.fr

(2)

Pourquoi les étudier ?

Ingénieurs des écosystèmes

= groupes d’impacts fonctionnels

Ils modifient les propriétés du sol (biologiques, chimiques & physiques)

Bio-indicateurs des sols et de ses usages

= groupes de réponses aux contraintes exercées sur les sols

Sensibles aux modifications de leur environnement

Faciles à observer & à prélever

Méthodes de prélèvement transférables

Co-construction d’un référentiel national

(3)

Vivent en surface dans les amas organiques (compost, fumier, ...)

Creusent peu ou pas de galeries

2 3 1

Groupes fonctionnels Lombriciens

Taille : moyenne à grande (1 - 20 cm) Couleur : faiblement pigmentée

(rose à gris –clair)

Les endogés

2

• Vivent dans l’ensemble du sol

• Creusent des galeries permanentes verticales

• Rejettent des déjections à la surface du sol

• Vivent dans le sol et remontent rarement à la surface

• Creusent des galeries temporaires horizontales

Régime alimentaire :

géophages

Ils mangent de la terre qui contient de la matière organique plus ou moins dégradée

(racines mortes, humus …)

Taille : grande (10 - 110 cm) Couleur : rouge, gris clair, brun

(avec un gradient de la tête à la queue)

Les anéciques

3

Taille : petite (1 - 5 cm) Couleur : rouge sombre

Les épigés

1

Turricules

Epi- anéciques

Anéciques stricts

(4)

Règles d’assemblage des communautés lombriciennes selon l’évolution des usages et des modes de gestion des sols associées aux contraintes pédo-climatiques

(à différentes échelles spatiales)

Contribution fonctionnelle des lombriciens à la

dégradation des matières organiques et au transfert de Carbone & d’eau dans les sols

En développement : Diversité génétique, phylogénie des genres ancestraux & évolution des traits fonctionnels

Habitats prospectés

Espaces agricoles (prairies, vignobles, Grandes Cultures, …)

selon diff. modes de production (conventionnel, durable, agroforestier, …)

Espaces naturels (forêt, réserves naturelles, marais, …)

Espaces urbanisés (potagers, parcs, friche industrielle, aéroport…)

 Elaboration d’1 BDD nat.

 Construction de référentiels et de modèles prédictifs

 Traduction en termes de contribution aux services écosystémiques

(EcoFinders : Rutgers & al, 2016)

Recherches sur la biodiversité lombricienne

&

Fonctionnement écologique des sols en milieu tempéré

(5)

Mais comment faire + ?

(+vite, +territoires, +habitats)

Comment développer le référentiel national

tout en réalisant un transfert d’outil BioIndicateur à tous les utilisateurs

des sols agricoles, naturels ou urbains?

 Utiliser comme levier,

une démarche participative ou collaborative avec l’Observatoire Participatif des Vers de Terre

https://ecobiosoil.univ-rennes1.fr/OPVT_accueil.php

(6)

… de répondre aux objectifs suivants …

Proposer un outil d’auto-évaluation, accessible pour tous publics, de la biodiversité des sols à l’aide des vers de terre

- État des lieux d’un site ou d’un territoire - Impacts comparés des pratiques culturales - Évaluation d’effets dépressifs à court terme

Faire de la pédagogie sur l’importance du sol et de sa biodiversité

Établir progressivement des référentiels locaux, régionaux, … (Connaitre pour agir)

Participatif

Pédagogique Progressif

& Collaboratif

Que permet l’OPVT ?

(7)

Site web OPVT

https://ecobiosoil.univ-rennes1.fr/

(8)

OPVT contribution et participation

Nombre d’observation Nombre de programmes n > 13

Nombre de reseau n > 80

~ 3000 observations participatives

~ 1500 observations collaborative en 6 ans

[565]

[640]

[878]

[3157]

[4035]

7

(9)

Abondance lombricienne (nb ind/m²)

Indicateur national

Abondance par habitat

Collaboration avec l’ONB

(Observatoire National de la Biodiversité)

Pattern similaire selon l’occupation du sol peu importe le protocole

Protocole moutarde Test bêche

Vigne

Prairie

Grandes Cultures Jardins

Abondance lombricienne (nb ind/m²)

Standard error

9

a b

b b a

b

b

** ***

(10)

Atlas national de la distribution des espèces lombriciennes

ecobiosoil database

Atlas de biodiversité

13

n = 24 taxa recorded in all land use “habitats”

Source: ecobiosoil database, Cluzeau & al

(11)

Contribution fonctionnelle

f e

c

a

f

d

b

0 1 2 3 4 5

L. rubellus L. festivus L. centralis L. terrestris A. caliginosa meridionalis

A. nocturna A. giardi

Earthworm weight (gram)

Grande variabilité des traits morphologiques et physiologiques

selon les espèces de vers de terre

(Bouché, 1972, 1977)

Au sein des anéciques

F = 1084.8 p < 0.001

Epi-anéciques Anéciques stricts

Quelle est la contribution des principales espèces lombriciennes à la degradation de la litière prairiale

en interaction avec les micro-organismes du sol ?

(12)

Contribution fonctionnelle

13

Réalisation d’expérimentations en conditions contrôlées Focus dans les galeries de vers de terre

-0. 5 0. 0 0. 5 1. 0

NM DS2

LF LC

LR LT

Control Stress = 0.10

F = 4.56, P < 0.001

-2.0 -1.5 -1.0 -0.5 0.0 0.5

-1. 5 -1. 0 -0. 5 0. 0 0. 5 1. 0

N M D S2 LC

LF

LR LT Control

Stress = 0.10

F = 1.57, P = 0.033

NMDS1

-1.5 -1.0 -0.5 0.0 0.5

-1. 0 -0. 5 0. 0 0. 5 1. 0 1. 5

N M D S2

LC

LF LR

LT Control

Stress = 0.11

F = 3.47, P = 0.001

-1.0 -0.5 0.0 0.5 1.0

a)

b)

c)

Les epi-anéciques modifient

les communautés fongiques

dans leurs galeries

b

b

b

b

a

a

a

0 50 100 150 200

BS AM AN AG LR LC LT

nmol/gr/hr

Beta Glucosidase

Les epi-anéciques stimulent

les activités enzymatiques

comparés aux anéciques stricts

et au bulk soil (control sans VDT)

(13)

Merci de votre attention

& merci à ma task force Sarah, Mathilde, Guillaume, Marc et Clément

Références

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