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Influence des caractéristiques paysagères sur la dispersion et la gestion d'une épidémie chez les plantes

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Academic year: 2021

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HAL Id: hal-02740133

https://hal.inrae.fr/hal-02740133

Submitted on 2 Jun 2020

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Influence des caractéristiques paysagères sur la

dispersion et la gestion d’une épidémie chez les plantes

Coralie Picard, Emmanuel Jacquot, Gael Thébaud, Samuel Soubeyrand

To cite this version:

Coralie Picard, Emmanuel Jacquot, Gael Thébaud, Samuel Soubeyrand. Influence des caractéristiques

paysagères sur la dispersion et la gestion d’une épidémie chez les plantes. 8è Printemps de Baillarguet,

Jun 2016, Montferrier-Sur-Lez, France. �hal-02740133�

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SESSION SCIENTIFIQUE 3. MODÉLISATION EN BIOLOGIE : ET TOI, TU SIMULES ?

Inuence des caractéristiques paysagères sur la dispersion et la gestion d'une épidémie chez les plantes

Coralie PICARD

1,*

, Emmanuel JACQUOT

1

, Gaël THEBAUD

1

, Sa- muel SOUBEYRAND

2

1. UMR BGPI (INRA, CIRAD, SupAgro), Campus International de Baillar- guet, 34398 Montpellier Cedex 05, France.

2. INRA, UR 546 Biostatistics and Spatial Processes, 84914 Avignon Cedex 9, France

* Corresponding author : coralie.picard@supagro.inra.fr

Abstract De nombreuses études ont utilisé la modélisation pour com- prendre la dynamique des maladies, prédire les épidémies et améliorer les stratégies de gestion. Un modèle stochastique SEIR (susceptible exposed infectious removed) permettant de simuler la dispersion d'une épidémie dans un paysage a été utilisé pour optimiser la gestion de la sharka (cette maladie virale transmise par pucerons est causée par le Plum pox virus ; elle touche diérentes espèces d'arbres du genre Prunus). Ce modèle prend en compte des paramètres épidémiologiques et de gestion pour prédire la pro- ductivité d'un paysage principalement composé de vergers de pêchers. Il a notamment permis de démontrer que la stratégie de gestion actuelle préserve la productivité, et d'identier des stratégies de gestion moins couteuses sur un paysage xe. Néanmoins, le paysage peut inuencer la dynamique d'une épidémie. Dans ce contexte, nous souhaitons optimiser la stratégie de gestion de la sharka en considérant des caractéristiques paysagères. Pour cela, une approche in silico qui prédit l'inuence de caractéristiques du paysage sur les dommages engendrés par la maladie a été développée. Des paysages avec 3 niveaux d'agrégation des parcelles ont été simulés en utilisant un algorithme de tessellation en T. Des simulations de la dispersion et de la gestion de la sharka ont été réalisées dans ces diérents paysages et ont montré qu'avec la stratégie de gestion actuelle, les paysages les moins agrégés sont les plus pro- ductifs. De plus, des analyses de sensibilité ont permis d'évaluer l'inuence relative des paramètres épidémiologiques et de gestion en fonction des carac- téristiques paysagères.

Keywords : Modèle spatio temporel, SEIR, optimisation, paysage

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