Table des matières
Abréviations 01
Introduction 04
1. La régulation de la transcription des gènes 04
1.1. La chromatine 05
a) Le nucléosome 05
b) Les modifications covalentes du nucléosome 06 L’acétylation et la désacétylation des histones 06
La méthylation des histones 08
La méthylation de l’ADN 10
Autres modifications post-traductionnelles des histones 10 c) Les modifications non-covalentes du nucléosome 11 1.2. La machinerie basale de transcription des gènes 12
1.3. Les facteurs de transcription 14
a) Les facteurs de transcription et leurs domaines
fonctionnels 15
Les DBD 15
Les domaines régulateurs 15
b) La modulation de l’activité des facteurs de transcription 16
Les modifications post-traductionnelles 16
Les partenaires protéiques 17
Les co-activateurs 17
Les co-répresseurs 18
2. Les facteurs de transcription de la famille Ets 20
2.1. La liaison à l’ADN 21
2.2. Les domaines activateurs et répresseurs 25
2.3. Les domaines d’interaction protéine-protéine 25 2.4. Les rôles biologiques des facteurs de transcription de la
famille Ets 26
3. Fev, un facteur de transcription du groupe ERG 27
3.1. Les membres du groupe ERG 27
3.2. Les tumeurs d’Ewing 30
3.3. Fev, un nouveau membre du groupe ERG 31 3.4. Les homologues de Fev chez le rat et la souris 34
4. Erm, un facteur de transcription de la famille Ets 37
4.1. Les membres du groupe PEA3 37
4.2. Partenaires protéiques et phosphorylation 41 4.3. Expression et fonctions des membres du groupe PEA3 42 4.4. Expression de Erm dans les lymphocytes 45
5. Les protéines kinases C (PKC) 47
5.1. La famille des PKC 48
5.2. Mécanismes d’action 49
Travail de recherche 1 :
Caractérisation moléculaire et identification
des partenaires de Fev 50
1. Le contexte 50
2. Caractérisation moléculaires de Fev 50
Article 1
3. Identification des partenaires de Fev dans la répression
transcriptionnelle 54
3.1. L’approche ciblée 54
a) Les interactions Fev-HDAC1 et Fev-HDAC3 55
La co-immuno-précipitation 56
Etude de la co-répression par co-transfections transitoires 57
Les essais HDAC 60
b) L’interaction Fev-Dnmt3A 61
3.2. L’approche par double hybride en levures 62 a) Le criblage de la banque mammaire humaine et
l’inteaction Fev-PLZF 62
Etude de l’interaction physique Fev-PLZF 63 Etude de la fonctionnalité de l’interaction Fev-PLZF 64
b) Le criblage de la banque « HeLa » 65
Etude de l’interaction physique Fev-DP103 67
Co-expression de Fev et DP103 69
Etude de la fonctionnalité de l’interaction Fev-DP103 69
4. Discussion et perspectives 72
a) Les interactions Fev-HDAC1 et Fev-HDAC3 73
b) L’interaction Fev-DP103 74
c) Perspectives 76
Travail de recherche 2 :
Modulation de l’expression de Erm 79
1. Le contexte 79
2. L’expression de Erm par les lymphocytes T 79
Article 1
3. Conclusions et perspectives 81
Bibliographie 84