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Ceratonia siliqua, une légumineuse non nodulée, héberge des endophytes bactériens nodulants

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Academic year: 2021

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Ceratonia siliqua, une légumineuse non nodulée, héberge des endophytes bactériens nodulants

Bonnet Clothilde, Sanguin Hervé, Galiana Antoine, Hafidi Mohamed, Duponnois Robin, Bressan Mélanie, Yves Prin

UMR LSTM, Cirad IRD UM2 SupAgro USC INRA, Campus International de Baillarguet, ,34398 Montpellier Cedex 5, France Laboratoire d’Ecologie et Environnement, Université Cadi Ayad, Marrakech, Maroc

Caroubier (Ceratonia siliqua) associé à de l’orge. Ounara, Maroc. Fruits (immatures)

Fleurs

Le caroubier (Ceratonia siliqua L.) est une légumineuse ligneuse très appréciée au Maroc, notamment en raison de ses usages multiples pour les agriculteurs (fourrage, agroforesterie...) et pour les industries alimentaires, cosmétiques et pharmaceutiques (additif gélifiant : farine de caroube). Ceratonia siliqua est donc

une carte majeure pour la diversification des productions et des ressources financières pour les petits agriculteurs. Polygala californica Suriana maritima Mirbelioids IRLC Cladrastris Genistoids Mimosoids Dalbergioids Caesalpinioids Millettioids Là !

Phylogeny of Leguminosae based on parsimony analyses of matK gene sequences, adapted from Wojciechowski et al. (2004).

Robinioids

Travail réalisé dans le cadre du projet CeraMyc, subventionné par et par le Partenariat Hubert Curien PRAD 09/09

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Ceratonia siliqua occupe une position basale dans

la phylogénie des caesalpinioideae, à la fois sur les caractères phénotypiques (Polhill et al. 1981) et

génotypiques (Wojciechowski et al. 2004).

Comme la plupart des caesalpinioideae, C. siliqua est non nodulé, mais il est à mycorhizes

arbusculaires (AM), cette symbiose étant importante pour son développement (Cruz et al. 2004).

- La symbiose AM étant considérée comme à

l’origine des symbioses rhizobium légumineuses, - Les champignons AM utilisant chez la plante la même voie de signalisation que les rhizobia,

- Les champignons AM hébergeant divers taxons bactériens,

l’objectif global de ce travail est de tester si les symbioses MA pourraient être la voie d’entrée ou le vecteur d’une association fixatrice d’azote

nouvelle. Essaouira -2 -1 0 1 2 3

C.siliqua Cistus sp. Ononis natrix

! 15N N%

> Comportement similaire à Ononis natrix, légumineuse nodulée et fixatrice d’azote

(δ15N proche de 0, N% et Ndfa élevés sur milieu

pauvre en azote )

1- C. siliqua a-t-il un comportement d’espèce

fixatrice d’azote ? 2- Quelle est la diversité des champignons

mycorhiziens AM associés à C. siliqua ?

Caractérisation

moléculaire (DGGE, Clonage/séquençage) Glomeromycetes

Papilionioids

Tests de nodulation hétérologue

- Mimosa pudica

- Macroptilium atropurpureum

Isolement bactérien

Caractérisation moléculaire ADNr 16S Stérilisation

de surface

3 - Quelle est la diversité des bactéries endophytes des racines de C. siliqua ?

> Analyse de l’abondance isotopique naturelle sur feuilles de C. siliqua, d’une légumineuse et d’une non-légumineuse accompagnatrices

(avec des conditions édaphiques similaires)

Validation sur 6 sites différents, avec des accompagnatrices (légumineuses et non-légumineuses) diversifiées.

Statut mycorhizien AM de nos plants confirmé Eclaircissement et

Coloration Bleu Trypan ou WGA / Alexa

Extraction/purification de spores de sols sous C. siliqua : - Inoculations homologues avec et sans bactéries

- Inoculations hétérologues de spores stérilisées en surface sur légumineuses nodulantes (Mimosa et Macroptilium)

En cours :

Phénotypes remarquables

boursouflures nodules

Taxons bactériens identifiés :

Agrobacterium, Rhizobium, Pseudomonas, Bacillus, Paenibacillus.

Inoculations homologues avec ou sans champignons AM et souches taggées : suivi de l’infection.

En cours :

En perspective :

Bibliographie citée :

Cruz, C. et al (2004). Mycorrhiza, 14: 177-184. Parniske, M. (2008). Nature Reviews, 6: 763-775.

Polhill, R.M. et al (1981). Advances in Legume Systematics. Eds. Polhill, R.M. & Raven, P.H.. Royal Botanic Garden, Kew, UK. Wojciechowski, M.F. et al (2004). American Journal of Botany, 91: 1846-1862.

Objectifs spécifiques

Feuilles

Racines

Racines

Contexte

Caractérisation moléculaire ADNr 28S

En conclusion, notre étude montre que si le caroubier est associé à des Glomeromycètes diversifiés et héberge des bactéries endophytes nodulantes ou induisant des

boursouflures racinaires, il reste à préciser le lien entre ces deux types de symbioses dans des conditions

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