Niveau du poste : MCF PR Section du poste : 65
Research Field : Microbiology, System Biology, bacterial chromosome engineering, gene/metabolic networks, gene regulation, bioinformatics
Profil court : Microbiologie, Biologie des systèmes
Affectation Département : BS Affectation Laboratoire : MAP Enseignement :
Profil : Microbiologie et Biologie des systèmes
L’enseignement se fera dans le département Biosciences de l’INSA et sera centré sur l’étude des microorganismes dans une démarche intégrative abordant aussi bien les micro-organismes en tant que cellules, populations et communautés que les mécanismes d’interactions avec les autres organismes (homme, animal, plante) ou leurs rôles dans l’environnement. Les enseignements de microbiologie sont intégrés dans le programme de base des étudiants de L3 à M2 des deux parcours de formation Bioinformatique et Modélisation (BIM) et Biochimie et Biotechnologies (BB). Le ou la candidat(e) devra posséder une solide formation en microbiologie, génétique moléculaire, bioinformatique, lui permettant de s'insérer plus largement dans les activités d'enseignement du département (y compris dans la formation doctorale).
Le ou la Professeur(e) recruté(e) devra s’impliquer fortement dans les activités du Département Biosciences avec à terme la possibilité́ d'assurer la responsabilité́ de la plateforme d'enseignement en microbiologie et ingénierie génétique. Cette implication passera également par un soutien fort à la Direction du Département, en particulier sur des projets d’évolution de la pédagogie, l’évaluation par compétences et l'ouverture du cursus Biosciences à l'international.
La personne recrutée devra s'intégrer à l'équipe pédagogique existante et participer activement aux tâches collectives de la discipline. Un niveau suffisant sera exigé en langues française et anglaise pour assurer correctement les enseignements dans ces deux langues.
Département d’enseignement : Biosciences
Lieu(x) d’exercice : INSA LYON - Bâtiment Pasteur Contact : Carole Knibbe, directrice département ; 04 72 43 80 85 Email directeur dépt. : carole.knibbe@insa-lyon.fr
Descriptif département : Le département BioSciences de l’INSA Lyon forme des ingénieurs pluridisciplinaires, gestionnaires de projets, ouverts à l’international, destinés aux industries de la santé, de l’agroalimentaire et de l’environnement. Il offre deux parcours de formation: Biochimie et Biotechnologies (BB) et Bio-Informatique et Modélisation (BIM).
URL dépt. : http://biosciences.insa-lyon.fr/
Recherche :
Profil : Microbiologie et Biologie des systèmes
Le/la professeur recruté(é) s’appuiera dans un premier temps sur l’équipe «Structure de la chromatine et régulation de la pathogénie bactérienne (CRP)», localisée au sein du bâtiment Pasteur de l’INSA de Lyon, pour y développer un axe complémentaire aux études actuelles de cette équipe. L’objectif de CRP est de proposer une vision intégrative de la régulation de l’expression génique lors des interactions bactéries pathogènes-plante.
La future recrue développera un projet novateur avec une approche de biologie des systèmes visant : - soit à étudier l’interconnexion étroite entre structure du chromosome bactérien et contrôle de
l’expression génique avec notamment des problématiques d’ingénierie et d’édition du génome.
- soit à reconstruire les réseaux métaboliques et de régulation de la virulence afin d’étudier l’interconnexion entre métabolisme et virulence, et entamer une modélisation de la dynamique infectieuse du pathogène intégrant les processus de signalisation inter- et intra-organismes durant l’interaction bactérie(s)/plante.
- toute proposition structurante ciblant un renforcement de la biologie systémique des bactéries pathogènes de plante sera étudiée.
La personne recrutée devra avoir la capacité de travailler en équipe et les compétences nécessaires pour développer un projet en biologie systémique, en particulier dans des domaines liés à la régulation génétique, les réseaux métaboliques, la génomique fonctionnelle. Il ou elle pourra par la suite créer sa propre équipe ou reprendre éventuellement la direction de l’équipe CRP.
Le/la professeur(e) recruté(e) sera également amené(e) à prendre des responsabilités au sein de l’unité de recherche, notamment via l’animation de l’axe transversal «Plant-microbe pathogenesis: from gene to networks».
Lieu(x) d’exercice : INSA LYON - MAP Bâtiment Pasteur Contact : Nathalie POUSSEREAU, directrice-adjointe de MAP
Tel contact labo :(+33) 4 72 85 22 84, (33)6 83 18 42 78; email: nathalie.poussereau@univ-lyon1.fr URL labo: http://map.univ-lyon1.fr/
Descriptif labo : Le laboratoire MAP est une Unité Mixte de Recherche associant le CNRS, l'Université Claude Bernard Lyon 1, l'INSA de Lyon et notre partenaire industriel Bayer CropSciences autour d’un intérêt commun pour les mécanismes d’adaptation et de pathogénie des microorganismes (archées, bactéries, champignons et levures). La pathogénie est un cas particulier d’adaptation à un environnement spécifique, celui d'un organisme vivant: plante, insecte, homme. Au sein d'un campus fortement dédié à la biologie de l'environnement (LyonTech La Doua), notre unité développe des approches pluri-disciplinaires (biochimie, génétique, biologie moléculaire, imagerie, biophysique ainsi que diverses approches globales -génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, et modélisation mathématique), pour générer les connaissances scientifiques permettant de comprendre les mécanismes d’adaptation chez les microorganismes. L'unité comprend cinq équipes développant différentes thématiques, articulées autour de deux axes transversaux: «Plant-microbe pathogenesis: from gene to networks» et «Microbial interfaces: from structure to signaling». Le/la professeur recruté(e) s’impliquera notamment dans le premier axe.
URL labo: http://map.univ-lyon1.fr/
Mots clés (champ de recherche)
Microbiologie, Régulation Génétique, Ingénierie des génomes bactériens, Bioinformatique, Biologie systémique.
Position Level: MCF (Ass. Prof.): Prof.
Section: 65
Research Field: Microbiology, System Biology, bacterial chromosome engineering, gene/metabolic networks, gene regulation, bioinformatics
Short profile: Microbiology, Systems Biology
INSA Department: Biosciences Laboratory: MAP UMR 5240
Keywords:
Microbiology, Genetic Regulation, Engineering of bacterial genomes, Bioinformatics, Systems Biology.
Teaching duties:
Profile: Microbiology and Systems Biology
Teaching will take place at the BioSciences Department of INSA Lyon, and will be centred on the study of microorganisms in an integrative framework. This involves considering microorganisms as cells, populations as well as communities, as well as their interaction mechanisms with other organisms (man, animals, plants) or their environmental roles. The microbiology training programme is integrated in the programme of 3
rd, 4
thand 5
thyear students of both courses of the Department, Bioinformatics and Modelling (BIM) and Biochemistry and Biotechology (BB). The candidate must be strongly trained in microbiology, molecular genetics, bioinformatics, in order to insert in a broad range of teaching duties at the Department (including doctoral training).
The hired Professor will get strongly involved in the activities of the Department, with the future possibility to undertake the responsibility of the Microbiology ad Genetic engineering teaching platform. This involvement includes a strong support to the Direction of the Department, especially through projects for educational evolution, skill-assessment evaluation, and international relations of the Biosciences program.
The recruited person will have to provide part of his or her teaching in English to allow a more important opening of the department towards the international students. He/she is expected to be involved in the life of the department to allow further developments of the training offer in line with the Institution's strategy.
Teaching department: BioSciences; INSA Lyon
Contact: Carole Knibbe, department Director; Phone Number: +33 (0)4 72 43 80 85 Director Email:
carole.knibbe@insa-lyon.frDepartment Description: The BioSciences Department of INSA Lyon
trains top-level pluridisciplinary engineers, international-open project managers, targeted for health, agri-food, and environmental industries. It offers two training courses: Bioinformatics and Modelling (BIM) and Biochemistry and Biotechnology (BB).URL Dept.: https://biosciences.insa-lyon.fr/en/
Research:
Profile: Microbiology and Systems Biology
The hired Professor will first rely on the team “Chromatin Structure and Regulation of Bacterial Pathogenesis (CRP)”, located inside the Pasteur building of INSA Lyon, in order to develop a research
programme complementary to the present studies of this team. The objective of CRP is to propose an integrative vision of the regulation of gene expression in plant-pathogen interaction.
The hired Professor will develop an innovative project with a systems biology approach, aiming at:
- either studying the close interplay between the bacterial chromosome structure and the control of genetic expression, possibly including genome engineering or editing aspects.
- or rebuild metabolic and virulence regulation networks, in order to analyze the interplay between metabolism and virulence, and ultimately, develop a modelling of the infection dynamics of the pathogen, that integrates inter- and intra-organisms signaling processes during plant/pathogen interaction.
- any structuring project dedicated to strengthen the systems biology of plant pathogenic bacteria will be considered, even if not fulfilling the two previous items.
The candidate must have team management skills, as well as skills required for a systems biology project, in particular in genetic regulation, metabolic networks or functional genomics domains. The hired Professor may then create his/her own team or become team leader of CRP.
The hired Professor shall also undertake responsibilities inside the laboratory, in particular by organising the transversal axis “Plant-microbe pathogenesis: from gene to networks”.
Location: INSA LYON-MAP; URL Laboratory: https://map.insa-lyon.fr/en/
Contact: Nathalie POUSSEREAU, laboratory deputy Director
Phone:
(+33)4 72 85 22 84, (+33)6 83 18 42 78 ; mail: nathalie.poussereau@univ-lyon1.frLaboratory description:
The laboratory is a joint research unit associating the CNRS (UMR5240), Claude Bernard Lyon 1 University and INSA Lyon (University of Lyon), together with our industrial partner, around a common interest for the mechanisms of adaptation and pathogenesis of a large array of cellular microorganisms (archaea, bacteria, fungi and yeasts). Pathogenesis is a specific case of adaptation to a specific environment, that of a living organism: plant, insect, amoeba, man.
Within a campus dedicated to Environmental Biology (LyonTech La Doua), our research unit
develops multi-discplinary approaches (biochemistry, genetics, molecular biology as well as
various global approaches -genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics -, and
mathematical modeling), to generate the integrative knowledge aimed at understanding the
mechanisms of phenotypic adaptation in all such microorganisms. The unit is organised into
five research teams focused on different topics, with two transversal axes. The hired Professor
will get involved in the first axis.
INSA Lyon DRH – Pôle EC
CONSTITUTION DU DOSSIER DE CANDIDATURE
Attention : les candidatures seront reçues exclusivement de manière dématérialisée sur l’application ministérielle dédiée
GALAXIE/ ANTEE
La liste des pièces obligatoires à fournir, selon la situation du candidat ou de la candidate, est définie par les arrêtés du 13 février 2015 modifiés par l’arrêté du 23 juillet 2019 relatifs aux modalités générales des opérations de mutation, de détachement et de recrutement par concours des maîtres de
conférences et des professeurs des universités. Elle est disponible sur le portail GALAXIE.
Les documents administratifs rédigés en tout ou partie en langue étrangère sont accompagnés
d’une traduction en langue française dont le candidat atteste la conformité sur l’honneur.Toutes pièces autres que celles demandées ci-dessus ne seront pas transmises aux rapporteurs. Les lettres de recommandation ne seront donc pas prises en compte CALENDRIER :
Ouverture des candidatures : le jeudi 25 février 2021, 10 heures, heure de Paris Clôture des candidatures : le mardi 30 mars 2021, 16 heures, heure de Paris.
Tout dossier incomplet à la date limite susmentionnée sera déclaré irrecevable.
Remarques importantes avant d’envoyer votre dossier :
- N’attendez pas le dernier jour pour déposer votre dossier,
- Vérifiez ABSOLUMENT que vous avez joint TOUTES les pièces demandées en UNE VERSION NUMERIQUE
AUDITION :
Mise en situation obligatoire du·de la candidat·e :
Objectif de la mise en situation : Percevoir la capacité pédagogique et d’adaptation à un auditoire d’étudiants de niveau L1 à L3 sur un sujet en lien avec le profil enseignement du poste . Le sujet sera précisé lors de la convocation.
Durée de la mise en situation : représente environ 20% du temps total de l’audition.
Egalité de traitement des candidats(es) : Du fait que la mise en situation est intégrée à l’audition, pour des raisons d’égalité de traitement des candidats, la mise en situation de chaque candidat sera réalisée exclusivement devant les membres du COS.
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Langue : Au cours de l’audition le(la) candidat(e) devra s’exprimer en français avec 3 minutes environ en anglais (sauf exceptions justifiées par les nécessités de l’enseignement).
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Afin de réaliser un bon équilibre entre formation et recherche, le Conseil d’Administration réuni en formation Restreinte demande que les candidats MCF et PR auditionnés soient informés qu’ils doivent, lors de leur audition, consacrer un temps approximativement égal entre les volets formation incluant la mise en situation et recherche.
Exemple de répartition du temps d’audition : 10 min sur le projet de recherche, 10 min sur le projet de formation dont 5 min pour la mise en situation, 15 min de questions (les 3 minutes approximatives d’anglais sont intégrées dans l’une des parties précédentes).
COMPILING THE APPLICATION
Be careful: applications will be received exclusively electronically on the dedicated application GALAXIE/ ANTEE
The list of mandatory documents to be provided, according to the situation of the candidate, is defined by the decree of 13 February 2015 amended by the decree of 23 July 2019.
It is available on the GALAXIE portal.
Administrative documents drawn up in whole or in part in a foreign language must be provided with a French translation whose the applicant should certify compliance on the honor.
Any suppliant documents not included in the above list will not be forwarded to the reviewers.
Letters of recommendation will not be taken into consideration.
CALENDAR:
OPENING: Thursday, 25 february 2021, 10H am, Paris time CLOSING: Tuesday, 30 march 2021, 16H pm, Paris time
Any incomplete file by the above mentioned deadline will be declared inadmissible.
Important comments before sending your application:
- Do not wait until the last day to submit your application,
- You MUST absolutely check that you have attached ALL the documents requested in a digital version
AUDITION:
Purpose of the scenario:
Perceiving the applicant’s teaching ability and his/her adaptability to an audience of students at levels L1 to L3 (1st to 3rd year of an undergraduate degree) on a subject related to the role’s teaching profile. The subject will be specified in the invitation letter.
Scenario length (je dirai Scenario allotted time): represents approximately 20% of the total interview time.
Equal treatment of applicants: As the scenario is incorporated into the interview, to ensure that the applicants are treated equally, each applicant’s scenario will be conducted exclusively in front of the COS members.
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Language: During the interview, the applicant must speak in French with approximately 3 minutes in English (unless for exceptional cases justified by the teaching needs).
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