PUBMED
Pubmed permet un accès gratuit à la base Medline (4800 périodiques indexés depuis 1966 –de 1950 à 1966 dans Old Medline - 16 millions de références) et à d‘autres bases médicales spécialisées, est un produit développé par le NCBI (National Center for
Biotechnology Information) et les éditeurs de revues biomédicales
Indexation des articles : avec le Mesh (thesaurus comprenant 15 000 termes hiérachisés) Comment chercher ?
Par la page d’accès . Saisir un terme , clic sur go .L’affichage des références apparaît Aller sur le bouton « details » pour avoir le détail de la recherche : Si le système affiche la mention [Mesh terms],il a trouvé la correspondance avec le terme du thésaurus Mesh Exemple : la recherche sur « heart attack » a été transférée vers le terme Mesh
« myocardial infarction » (mapping)
Pubmed
Octobre 2006
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F O R M A T IO N A L A R E C H E R C H E D O C U M E N T A IR E – B U S A N T E
Compléter et préciser la recherche avec la fonction preview-index
Choisir parmi plusieurs index : auteurs, titres de revues, mots clés Mesh, type, date de publication.
Exemple : choisir un « mesh term » : « emergency medicine » et valider avec l’opérateur
« AND »
Pubmed
Octobre 2006
E IR C U M E N T A E D – B U S A N T O E F A O R M A T IO N L H A R E C H E R C
21 -Choisi un index : nom d’auteur, titre de revue, mot-clef mesh, type ou
date de publication… 2-vérifier si
le terme choisi est bien indexé 3 valider
avec « preview"
après avoir
sélectionné « AND
Pour préciser une recherche :
A partir d’un résultat affiché , utiliser la fonction « limits » Parmi les critères :
Nom d’auteur Titre de revue Date de publication
Date de citation dans Pubmed Puis, les critères suivants :
Valider avec clic sur GO
Rechercher par le « Mesh database »(menu à gauche de la page d’accueil) Cet accès permet d’effectuer des recherches à partir des mots-clefs du Mesh
.Taper un mot-clé .Le système affiche la liste des mots-clefs comprenant le terme saisi . Sélectionner un terme , en cliquant dessus .
S’affiche la description du mot-clef : définition, synonymie.
Possibilité de limiter la recherche sur une option particulière avec un qualificatif subheadings
Possibilité de limiter à un type de littérature Mesh Major Topics (références d’articles dont le sujet principal est le thème choisi)
Utiliser le bouton Send to search box with AND afin que l’équation de recherche soit validée dans la boîte de dialogue .
Pubmed
Octobre 2006
3 Langue de l’article
Recherche par domaine spécialisé
Type de littérature
Tranche d’âges
F O R M A T IO N A L A R E C H E R C H E D O C U M E N T A IR E – B U S A N T E
Utiliser le bouton links , puis Pubmed pour valider une recherche sur un terme Mesh sans pondération.
Exemple : rechercher des documents concernant la rééducation de l’aphasie
Possibilité de compléter une première requête avec un autre mot clef du thésaurus , utiliser search box with AND, OR, ou NOT, selon les besoins de la recherche
Exemple : Compléter la première requête :
Recherche de documents concernant la rééducation de l’aphasie, pondérée avec la mention « major topics »par une recherche sur la rééducation de l’agraphie
Search box with AND
Une fois l’équation bien écrite dans la boîte de dialogue, envoyer sur Pubmed search to Pubmed afin que la recherche soit effectuée.
Affichage des notices
L’affichage des notices , est par défaut, summary : Nom des auteurs
Titre de l’article
Titre abrégé de la revue, (en allant avec la souris à la fin de ce titre abrégé, on récupère le titre complet du périodique ), année , mois, n° du volume, n°du fascicule et pagination
La mention du niveau de l’indexation des références :
Pubmed – indexed for Medline : la référence est complétement indexée
Pubmed – in process (référence en cours de traitement : n’est pas encore indexée avec les termes Mesh )
Pubmed –as supplied by publisher : référence très récente , vient d’être envoyée par l’éditeur, la notice bibliographique est incomplète.
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F O R M A T IO N A L A R E C H E R C H E D O C U M E N T A IR E – B U S A N T E
: Nolfe G, Cobianchi A, Mossuto-Agatiello L, Giaquinto S. Related Articles, Links
The role of P300 in the recovery of post-stroke global aphasia.
Eur J Neurol. 2006 Apr;13(4):377-84.
PMID: 16643316 [PubMed - indexed for MEDLINE
On peut modifier l’affichage ,(flèche de l’ascenseur à droite de “summary”), , choisir l’affichage citation
.
Cet affichage permet d’accéder : Au résumé de l’article
A la liste des « mesh terms » qui ont permis d’indexer l’article (les mots sujets primordiaux ont un astérique)
Au lien avec le texte intégral de l’article si l’abonnement au périodique est financé par l’établissement.
Comment retrouver les requêtes et les combiner ?
Le bouton history permet d’avoir accès à l’historique des recherches : supprimer, afficher les résultats, combiner (en cliquant sur le numéro de la recherche)
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F O R M A T IO N A L A R E C H E R C H E D O C U M E N T A IR E – B U S A N T E
Autres fonctionnalités de Pubmed Sur la partie gauche de l’écran :
Journals database : permet de rechercher les titres des périodiques dépouillés, de les feuilleter virtuellement, clic sur le bouton links, puis pubmed
permet de retrouver le titre complet et les références d’un périodique, en saisissant le titre abrégé dans la boîte de dialogue .
Single citation matcher : permet de retrouver une référence bibliographique à partir de quelques éléments de cette référence.
Clinical queries :
Ce filtre permet de cibler une recherche sur un sujet, essentiellement dans le domaine de la littérature systématique :
Search by clinical study category : permet ,en précisant l’aspect qualifiant la recherche (étiologie, diagnostic…) de récupérer des références d’essais randomisés sur le sujet.
Find systematic reviews : permet, dans le domaine de la littérature systématique, de retrouver des méta-analyses, conférences de consensus, recommandations….
Sauvegarde
Cilpboard : possibilité de sélectionner des références dans un panier (clipboard) . A partir de l’affichage des références concernant une recherche, clic sur send to – clipboard ; les références sélectionnées ont alors un numéro vert.
Email :possibilité d’envoyer les références du panier par e-mail, dans le format choisi,
avec le tri choisi (menu « sort by » : permet de trier par auteur, revue ou date)
Send to file : permet d’envoyer les références sur un logiciel de gestion de références bibliographique (style Endnote) .Demander l’affichage display medline des notices.
Veille et alerte
A partir d’une recherche, possibilité de la sauvegarder, de la compléter par de nouvelles références et d’être averti par e-mail, selon un rythme de fréquence choisi.
A partir de l’affichage de références, clic sur My NCBI
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F O R M A T IO N A L A R E C H E R C H E D O C U M E N T A IR E – B U S A N T E
Après s’être identifié par nom,
mot de passe,
Après avoir indiqué une adresse e-mail sur laquelle vous recevrez les références des nouveaux documents concernant votre recherche, le système vous reconnaît.
Lors de recherches ultérieures, après un clic sur SAVE SEARCH, identifiez-vous, le système vous reconnaît et propose une veille appropriée.
A noter : les documents proposés dans le cadre de cette veille sont très récents et ne sont pas complétement référencés, ils ont la mention :
« Pubmed – in process » ou
« Pubmed- as supplied by publisher »
Leur indexation avec les termes du thesaurus Mesh n’est pas achevée.
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Octobre 2006
E A C R E H C E R L E A N IO T A M R H D F E T N A S U B – IR O A T N E M U C O E F L R E H C E R A A H N IO T A M R O C E T IR N A S U B – E A D T N E M U C O
7Pour plus d’informations :
Pubmed : formation à l’utilisation .
Françoise DAILLAND - Bibliothèque universitaire de médecine – Paris Sud – Le Kremlin- Bicêtre
A partir de la page d’accueil de Pubmed,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed, documents d’aide à la recherche (en anglais):
help tutorials
sur la page d’accès a mesh database : quick tours
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