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Remerciements ... iii

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Academic year: 2021

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Texte intégral

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Sommaire

Remerciements ... iii

Sommaire ... vi

Résumé (en français) ... x

Résumé (en anglais) ... xii

Chapitre I : ÉTUDE BIBLIOGRAPHIQUE ... 1

1. Les protéines recombinantes dans la biotechnologie : système eucaryote et procaryote ... 2

2. Paramètres liés à la production des protéines recombinantes ...3

3. Yarrowia lipolytica... 5

3.1. Historique, taxonomie et habitat ... 5

3.2. Yarrowia lipolytica est une levure dimorphique ... 5

3.2.1. Effet des sources de carbone ... 7

3.2.2. Effet des sources d’azote ... 7

3.2.3. Effet du pH ... 7

3.2.4. Stress anoxique ... 7

3.2.5. Choc thermique ... 7

3.2.6. Effet du mode de culture ... 8

3.3. Métabolisme ... 8

3.3.1. Métabolisme du glycérol ... ………..8

3.3.2. Métabolisme du glucose ... 9

3.3.4. Catabolisme des substrats hydrophobes : β-oxydation ... 12

3.3.5. Métabolisme d’azote ... …………13

3.4. Caractéristiques génomiques et outils génétiques ... 13

3.5. Applications industrielles de Y. lipolytica ... 14

vii

4. Yarrowia lipolytica, un système levure performant pour la production des protéines recombinantes ... 15

4.1. Promoteurs ... ..16

4.1.1. Les promoteurs constitutifs ... ………….17

4.1.2. Les promoteurs hybrides ... 17

4.1.3. Les promoteurs inductibles par de l’acide oléique ... ……….18

4.2. Régulation de l’induction de gène LIP2 ...20

4.2.1. Effet des sources d’azote ... 20

(2)

4.2.2. Effet des sources de carbone ... 21 4.2.3. Effet d’oxygène ... 21 4.2.4. Induction de promoteur POX2 et LIP2 via des éléments de réponse oléate (ORE) .... 22

5. Yarrowia et la cytométrie en flux ... 23 6. Conclusion ... .27 Références ...29 Chapitre II: Deciphering how LIP2 and POX2 promoters can optimally

regulate recombinant protein production in the yeast Yarrowia

lipolytica ………..…42 Chapitre III: pH and not cell morphology modulates pLIP2 induction in the dimorphic yeast Y. lipolytica………56 Chapitre IV: Multiplexed on-line flow cytometry for high content monitoring of Y. lipolytica bioprocesses based on hydrophobic

substrat………...………..64

Chapitre V : Conclusions générales et perspectives……….……….94

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