La pourriture brune du cacaoyer

(1)

CIRAD ATP 96/21

SÉMINAIRE GESTION RAISONNÉE DES RÉSISTANCES DES PLANTES AUX PATHOGÈNES

(2)

LA POURRITURE BRUNE DU CACAOYER

C. LANAUD et al

4 espèces principales en cause

• - Phytophthora palmivora

- Phytophthora megakarya - Phytophthora capsici

- Phytophthora citrophthora

--> Perte de récolte par pourriture des

• cabosses

De 15 à 80 °/o de pertes selon les

'

especes

---> Aucune résistance totale observée

dans l'espèce Theobroma _cacao, mais un

degré variable de tolérance selon l~s clones

(3)

Questio·ns qui se posent

et qui conditionnent la sélection et. la gestion des résistances

- Déterminisme de ces résistances

-partielles :

• . Nombre de gènes impliqués

•

. Gènes majeurs ? ou importance de

chaque gène dans la variation

- Stabilité de l'expression de ces gènes selon le contexte génétique et environ-mental

- Existence des mêmes gènes de

résistance dans les différents. géniteurs ou dans les différents pools génétiques

- Gènes communs, ou spécifiques mis en

(4)

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Cumul possible des gènes de résistance (nb de géniteurs/ croisement/

• in.dividus à impliquer dans les

croisements)

• -->

Existence possible de liaisons

favorables ou défavorables avec d'autres caractères importants pour la sélection

--> Distribution des différents gènes de résistance dans les populations hybride~

(5)

•

DISPOSITIF MIS EN OEUVRE

Cartographie et recherche d,e QTL

*

Plusieurs descendances an.alysées :

. Trinidad

(P. palmivora F.BA x F.HA 1

(P. capsici

. Côte d'Ivoire, P. palmivora F.HA x Tr 2

. Cameroun, P. megakarya F.HA x Tr 2

. Montpellier,

(P. palmivora

(P. megakarya Hyb(F.HA) x F.BA 1

(P. capsici

*

Evaluation de la résistance par

l'ana-lyse de données :

. De récolte (0

/o de cabosses pourries)

. D'inoculations artificielles sur feuilles et cabosses (RCI, Cameroun, Trinidad, Montpellier)

*

Relations entre les différents types de

données de résistance

. Par l'approche cartographie

. Par tests au champ sur différents essais

*

Approche gènes candidats

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(6)

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QTL s FOR RESISTANCE TO PHYTOPHTHORA PALMIVORA

AND YIELD IN COCOA

...

(7)

APPROCHE "GENE CANDIDAT"

Objectifs

Trouver des marqueurs moléculaires situés sur les gènes de résistance

---> Identification de gènes de résistance sur plusieurs espèces

Tomate cf9, cf2 Tabac N Lin L6 Arabidopsis RPS2, RPMl Riz Xa21 Cladosporium fulvum ·virus TMV M. lini Pseudomonas syringae Xanthomonas oryzae

Les gènes de résistance ont une

• certaine homologie structurale ---> codes

pour des protéines ayant des régions

riches en leucine (LRR).

· Ces LRR sont impliquées dans les

interactions entre protéines

---> rôle dans le complexe récepteur-ligand.

(8)

e

-Des motifs conservés se retrouvent dans le NBS (Nucleotide Binging Site):

Kinase-la (P. loop)

Kinase 2

Kinase 3a

Ils se retrouvent en des positions similaires dans RPS2, N et L6.

---> Il est possible de définir des amorces consensus dans ces régions conservées pour amplifier des R gènes chez d'autres

'

especes.

---> Ces primers ont été utilisés pour amplifier l'ADN de cacaoyer.

---> Clonage et séquençage des produits d'amplification.

---> 12 avaient une homologie avec des Rgènes de pomme de terre et de riz.

---> Régions conservées entre N et L6 retrouvées chez le cacaoyer.

-·-> Hybridation et cartographie.

(9)

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(10)

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(12)

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C.OTED'IVOIRE • :r · Ismael KEB E Jeanne N'GORAN .• TRINIDAD Olivier SOUNIGO Jean-Marc THEVENIN CAM1EROUN S-alomon NYASS!E MONTPELLIER Denis DESPREAUX - Michel DUCAMP Marie-Henriette FLAMENT Mohamed HASSAN

Claire LAN AUD Didier PAULIN Isabelle PIERETTI