CIRAD ATP 96/21
SÉMINAIRE GESTION RAISONNÉE DES RÉSISTANCES DES PLANTES AUX PATHOGÈNES
LA POURRITURE BRUNE DU CACAOYER
C. LANAUD et al
4 espèces principales en cause
• - Phytophthora palmivora
- Phytophthora megakarya - Phytophthora capsici
- Phytophthora citrophthora
--> Perte de récolte par pourriture des
• cabosses
De 15 à 80 °/o de pertes selon les
'
especes
---> Aucune résistance totale observée
dans l'espèce Theobroma _cacao, mais un
degré variable de tolérance selon l~s clones
Questio·ns qui se posent
et qui conditionnent la sélection et. la gestion des résistances
- Déterminisme de ces résistances
-partielles :
• . Nombre de gènes impliqués
•
. Gènes majeurs ? ou importance de
chaque gène dans la variation
- Stabilité de l'expression de ces gènes selon le contexte génétique et environ-mental
- Existence des mêmes gènes de
résistance dans les différents. géniteurs ou dans les différents pools génétiques
- Gènes communs, ou spécifiques mis en
--~>
Cumul possible des gènes de résistance (nb de géniteurs/ croisement/• in.dividus à impliquer dans les
croisements)
•
-->
Existence possible de liaisonsfavorables ou défavorables avec d'autres caractères importants pour la sélection
--> Distribution des différents gènes de résistance dans les populations hybride~
•
•
DISPOSITIF MIS EN OEUVRE
Cartographie et recherche d,e QTL
*
Plusieurs descendances an.alysées :. Trinidad
(P. palmivora F.BA x F.HA 1
(P. capsici
. Côte d'Ivoire, P. palmivora F.HA x Tr 2
. Cameroun, P. megakarya F.HA x Tr 2
. Montpellier,
(P. palmivora
(P. megakarya Hyb(F.HA) x F.BA 1
(P. capsici
*
Evaluation de la résistance parl'ana-lyse de données :
. De récolte (0
/o de cabosses pourries)
. D'inoculations artificielles sur feuilles et cabosses (RCI, Cameroun, Trinidad, Montpellier)
*
Relations entre les différents types dedonnées de résistance
. Par l'approche cartographie
. Par tests au champ sur différents essais
*
Approche gènes candidats.. -,_
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12 11 cTcCR2JI 15 cTcCR1 Il==++==:Q4IIIIH
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uPA402 D=El=
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AND YIELD IN COCOA
...
APPROCHE "GENE CANDIDAT"
Objectifs
Trouver des marqueurs moléculaires situés sur les gènes de résistance
---> Identification de gènes de résistance sur plusieurs espèces
Tomate cf9, cf2 Tabac N Lin L6 Arabidopsis RPS2, RPMl Riz Xa21 Cladosporium fulvum ·virus TMV M. lini Pseudomonas syringae Xanthomonas oryzae
Les gènes de résistance ont une
• certaine homologie structurale ---> codes
pour des protéines ayant des régions
riches en leucine (LRR).
· Ces LRR sont impliquées dans les
interactions entre protéines
---> rôle dans le complexe récepteur-ligand.
e
-Des motifs conservés se retrouvent dans le NBS (Nucleotide Binging Site):
Kinase-la (P. loop)
Kinase 2
Kinase 3a
Ils se retrouvent en des positions similaires dans RPS2, N et L6.
---> Il est possible de définir des amorces consensus dans ces régions conservées pour amplifier des R gènes chez d'autres
'
especes.
---> Ces primers ont été utilisés pour amplifier l'ADN de cacaoyer.
---> Clonage et séquençage des produits d'amplification.
---> 12 avaient une homologie avec des Rgènes de pomme de terre et de riz.
---> Régions conservées entre N et L6 retrouvées chez le cacaoyer.
-·-> Hybridation et cartographie.
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Alignment Report of comp. prot cacao/L6 et N, using Cfustaf method with PAM250 residue weight table. Vendredi 13 Juin 1997 16:16 Page, 84 72 105 250 92 295 352 113 102 132 ~31
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Flax Rg L6 prot - Majority - - - Majority 480 O. sativa h8558-12 pro· sol.tub.st121 prot sca6/Al prot 191 !~1il!;li N R I P A A A 505 :ï~L. .. 180 ij~ii1!ili N H I R G R L Q V D H M G E L P T 142/f12 142/H2 prot 3 79 Jiliimli K V W G S L L H N L R L T E W K S A I E H M K N N - S Y 439 Tj~jK VI G S L L F K Q E I A V W ED TL E Q L R RTL N L
tabac Rgene N prot Flax Rg L6 prot
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Alignment Report of compar. prot cacao/gen. - copie, using Clustal method with PAM250 residue weight table. Page3
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Claire LAN AUD Didier PAULIN Isabelle PIERETTI