INFECTION A ESCHERCHIA COLI ENTEROHEMORRAGIQUE

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MOHAMMED V DE RABAT

FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT

DOYENS HONORAIRES :

1962 – 1969 : Professeur Abdelmalek FARAJ 1969 – 1974 : Professeur Abdellatif BERBICH 1974 – 1981 : Professeur Bachir LAZRAK 1981 – 1989 : Professeur Taieb CHKILI

1989 – 1997 : Professeur Mohamed Tahar ALAOUI 1997 – 2003 : Professeur Abdelmajid BELMAHI 2003 - 2013 : Professeur Najia HAJJAJ – HASSOUNI

ADMINISTRATION :

Doyen

Professeur Mohamed ADNAOUI

Vice-Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines

Professeur Brahim LEKEHAL

Vice-Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération

Professeur Toufiq DAKKA

Vice-Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie

Professeur Jamal TAOUFIK

Secrétaire Général

1 - ENSEIGNANTS-CHERCHEURS MEDECINS ET PHARMACIENS

PROFESSEURS :

DECEMBRE 1984

Pr. MAAOUNI Abdelaziz Médecine Interne – Clinique Royale

Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi Anesthésie -Réanimation

Pr. SETTAF Abdellatif Pathologie Chirurgicale

NOVEMBRE ET DECEMBRE 1985

Pr. BENSAID Younes Pathologie Chirurgicale

JANVIER, FEVRIER ET DECEMBRE 1987

Pr. LACHKAR Hassan Médecine Interne

Pr. YAHYAOUI Mohamed Neurologie

DECEMBRE 1989

Pr. ADNAOUI Mohamed Médecine Interne –Doyen de la FMPR

Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda Neurologie

JANVIER ET NOVEMBRE 1990

Pr. HACHIM Mohammed* Médecine-Interne

Pr. KHARBACH Aîcha Gynécologie -Obstétrique

Pr. TAZI Saoud Anas Anesthésie Réanimation

FEVRIER AVRIL JUILLET ET DECEMBRE 1991 Pr. AZZOUZI Abderrahim Anesthésie Réanimation- Doyen de FMPO

Pr. BAYAHIA Rabéa Néphrologie

Pr. BELKOUCHI Abdelkader Chirurgie Générale

Pr. BENCHEKROUN Belabbes Abdellatif Chirurgie Générale

Pr. BENSOUDA Yahia Pharmacie galénique

Pr. BERRAHO Amina Ophtalmologie

Pr. BEZAD Rachid Gynécologie Obstétrique Méd. Chef Maternité des

Orangers

Pr. CHERRAH Yahia Pharmacologie

Pr. CHOKAIRI Omar Histologie Embryologie

Pr. KHATTAB Mohamed Pédiatrie

Pr. SOULAYMANI Rachida Pharmacologie- Dir. du Centre National PV Rabat Pr. TAOUFIK Jamal Chimie thérapeutique V.D à la pharmacie+Dir. du CEDOC +

DECEMBRE 1992

Pr. AHALLAT Mohamed Chirurgie Générale Doyen de FMPT

Pr. BENSOUDA Adil Anesthésie Réanimation

Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza Gastro-Entérologie

Pr. CHRAIBI Chafiq Gynécologie Obstétrique

Pr. EL OUAHABI Abdessamad Neurochirurgie

Pr. FELLAT Rokaya Cardiologie

Pr. GHAFIR Driss* Médecine Interne

Pr. JIDDANE Mohamed Anatomie

Pr. TAGHY Ahmed Chirurgie Générale

Pr. ZOUHDI Mimoun Microbiologie

MARS 1994

Pr. BENJAAFAR Noureddine Radiothérapie

Pr. BEN RAIS Nozha Biophysique

Pr. CAOUI Malika Biophysique

Pr. CHRAIBI Abdelmjid

Endocrinologie et Maladies Métaboliques Doyen de la

FMPA

Pr. EL AMRANI Sabah Gynécologie Obstétrique

Pr. EL BARDOUNI Ahmed Traumato-Orthopédie

Pr. EL HASSANI My Rachid Radiologie

Pr. ERROUGANI Abdelkader Chirurgie Générale – Directeur du CHIS-Rabat

Pr. ESSAKALI Malika Immunologie

Pr. ETTAYEBI Fouad Chirurgie Pédiatrique

Pr. HASSAM Badredine Dermatologie

Pr. IFRINE Lahssan Chirurgie Générale

Pr. MAHFOUD Mustapha Traumatologie – Orthopédie

Pr. RHRAB Brahim Gynécologie –Obstétrique

Pr. SENOUCI Karima Dermatologie

MARS 1994

Pr. ABBAR Mohamed* Urologie Directeur Hôpital My Ismail Meknès

Pr. ABDELHAK M’barek Chirurgie – Pédiatrique

Pr. BENTAHILA Abdelali Pédiatrie

Pr. BENYAHIA Mohammed Ali Gynécologie – Obstétrique Pr. BERRADA Mohamed Saleh Traumatologie – Orthopédie Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae Ophtalmologie

Pr. LAKHDAR Amina Gynécologie Obstétrique

Pr. MOUANE Nezha Pédiatrie

MARS 1995

Pr. ABOUQUAL Redouane Réanimation Médicale

Pr. AMRAOUI Mohamed Chirurgie Générale

Pr. BARGACH Samir Gynécologie Obstétrique Pr. DRISSI KAMILI Med Nordine* Anesthésie Réanimation

Pr. EL MESNAOUI Abbes Chirurgie Générale

Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila Oto-Rhino-Laryngologie

Pr. HDA Abdelhamid* Cardiologie Inspecteur du Service de Santé des FAR Pr. IBEN ATTYA ANDALOUSSI Ahmed Urologie

Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia Ophtalmologie

Pr. SEFIANI Abdelaziz Génétique

Pr. ZEGGWAGH Amine Ali Réanimation Médicale

DECEMBRE 1996

Pr. AMIL Touriya* Radiologie

Pr. BELKACEM Rachid Chirurgie Pédiatrie

Pr. BOULANOUAR Abdelkrim Ophtalmologie

Pr. EL ALAMI EL FARICHA EL Hassan Chirurgie Générale

Pr. GAOUZI Ahmed Pédiatrie

Pr. MAHFOUDI M’barek* Radiologie

Pr. OUZEDDOUN Naima Néphrologie

Pr. ZBIR EL Mehdi* Cardiologie DirecteurHôp.Mil. d’Instruction Med V Rabat

NOVEMBRE 1997

Pr. ALAMI Mohamed Hassan Gynécologie-Obstétrique

Pr. BEN SLIMANE Lounis Urologie

Pr. BIROUK Nazha Neurologie

Pr. ERREIMI Naima Pédiatrie

Pr. FELLAT Nadia Cardiologie

Pr. KADDOURI Noureddine Chirurgie Pédiatrique

Pr. KOUTANI Abdellatif Urologie

Pr. LAHLOU Mohamed Khalid Chirurgie Générale

Pr. MAHRAOUI CHAFIQ Pédiatrie

Pr. TOUFIQ Jallal Psychiatrie Directeur Hôp.Ar-razi Salé

Pr. YOUSFI MALKI Mounia Gynécologie Obstétrique

NOVEMBRE 1998

Pr. BENOMAR ALI Neurologie Doyen de la FMP Abulcassis

Pr. BOUGTAB Abdesslam Chirurgie Générale

Pr. ER RIHANI Hassan Oncologie Médicale

Pr. BENKIRANE Majid* Hématologie

JANVIER 2000

Pr. ABID Ahmed* Pneumo-phtisiologie

Pr. AIT OUAMAR Hassan Pédiatrie

Pr. BENJELLOUN Dakhama Badr.Sououd Pédiatrie

Pr. BOURKADI Jamal-Eddine Pneumo-phtisiologie Directeur Hôp. My Youssef Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer Chirurgie Générale

Pr. ECHARRAB El Mahjoub Chirurgie Générale

Pr. EL FTOUH Mustapha Pneumo-phtisiologie

Pr. EL MOSTARCHID Brahim* Neurochirurgie

Pr. MAHMOUDI Abdelkrim* Anesthésie-Réanimation

Pr. TACHINANTE Rajae Anesthésie-Réanimation

Pr. TAZI MEZALEK Zoubida Médecine Interne

NOVEMBRE 2000

Pr. AIDI Saadia Neurologie

Pr. AJANA Fatima Zohra Gastro-Entérologie

Pr. BENAMR Said Chirurgie Générale

Pr. CHERTI Mohammed Cardiologie

Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Selma Anesthésie-Réanimation

Pr. EL HASSANI Amine Pédiatrie - Directeur Hôp.Cheikh Zaid

Pr. EL KHADER Khalid Urologie

Pr. EL MAGHRAOUI Abdellah* Rhumatologie

Pr. GHARBI Mohamed El Hassan Endocrinologie et Maladies Métaboliques

Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae Pédiatrie

Pr. ROUIMI Abdelhadi* Neurologie

DECEMBRE 2000

Pr.ZOHAIR ABDELLAH * ORL

Pr. BALKHI Hicham* Anesthésie-Réanimation

Pr. BENABDELJLIL Maria Neurologie

Pr. BENAMAR Loubna Néphrologie

Pr. BENAMOR Jouda Pneumo-phtisiologie

Pr. BENELBARHDADI Imane Gastro-Entérologie

Pr. BENNANI Rajae Cardiologie

Pr. BENOUACHANE Thami Pédiatrie

Pr. BEZZA Ahmed* Rhumatologie

Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi Anatomie

Pr. BOUMDIN El Hassane* Radiologie

Pr. CHAT Latifa Radiologie

Pr. DAALI Mustapha* Chirurgie Générale

Pr. DRISSI Sidi Mourad* Radiologie

Pr. EL HIJRI Ahmed Anesthésie-Réanimation

Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid Neuro-Chirurgie

Pr. EL MADHI Tarik Chirurgie-Pédiatrique

Pr. EL OUNANI Mohamed Chirurgie Générale

Pr. ETTAIR Said Pédiatrie - Directeur Hôp. d’EnfantsRabat

Pr. GAZZAZ Miloudi* Neuro-Chirurgie

Pr. HRORA Abdelmalek Chirurgie Générale

Pr. KABIRI EL Hassane* Chirurgie Thoracique Pr. LAMRANI Moulay Omar Traumatologie Orthopédie

Pr. LEKEHAL Brahim Chirurgie Vasculaire Périphérique

Pr. MAHASSIN Fattouma* Médecine Interne

Pr. MEDARHRI Jalil Chirurgie Générale

Pr. MIKDAME Mohammed* Hématologie Clinique

Pr. MOHSINE Raouf Chirurgie Générale

Pr. NOUINI Yassine Urologie - Directeur Hôpital Ibn Sina

Pr. SABBAH Farid Chirurgie Générale

Pr. SEFIANI Yasser Chirurgie Vasculaire Périphérique Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Soumia Pédiatrie

DECEMBRE 2002

Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane* Anatomie Pathologique

Pr. AMEUR Ahmed * Urologie

Pr. AMRI Rachida Cardiologie

Pr. AOURARH Aziz* Gastro-Entérologie

Pr. BAMOU Youssef * Biochimie-Chimie

Pr. BELMEJDOUB Ghizlene* Endocrinologie et Maladies Métaboliques

Pr. BENZEKRI Laila Dermatologie

Pr. BENZZOUBEIR Nadia Gastro-Entérologie

Pr. BERNOUSSI Zakiya Anatomie Pathologique

Pr. BICHRA Mohamed Zakariya* Psychiatrie

Pr. CHOHO Abdelkrim * Chirurgie Générale

Pr. CHKIRATE Bouchra Pédiatrie

Pr. EL ALAMI EL Fellous Sidi Zouhair Chirurgie Pédiatrique

Pr. EL HAOURI Mohamed * Dermatologie

Pr. FILALI ADIB Abdelhai Gynécologie Obstétrique

Pr. HAJJI Zakia Ophtalmologie

Pr. IKEN Ali Urologie

Pr. JAAFAR Abdeloihab* Traumatologie Orthopédie

Pr. KRIOUILE Yamina Pédiatrie

Pr. MABROUK Hfid* Traumatologie Orthopédie

Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss* Gynécologie Obstétrique

Pr. OUJILAL Abdelilah Oto-Rhino-Laryngologie

Pr. RACHID Khalid * Traumatologie Orthopédie

Pr. RAISS Mohamed Chirurgie Générale

Pr. RGUIBI IDRISSI Sidi Mustapha* Pneumo-phtisiologie

Pr. RHOU Hakima Néphrologie

Pr. SIAH Samir * Anesthésie Réanimation

Pr. THIMOU Amal Pédiatrie

JANVIER 2004

Pr. ABDELLAH El Hassan Ophtalmologie

Pr. AMRANI Mariam Anatomie Pathologique

Pr. BENBOUZID Mohammed Anas Oto-Rhino-Laryngologie

Pr. BENKIRANE Ahmed* Gastro-Entérologie

Pr. BOULAADAS Malik Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale

Pr. BOURAZZA Ahmed* Neurologie

Pr. CHAGAR Belkacem* Traumatologie Orthopédie

Pr. CHERRADI Nadia Anatomie Pathologique

Pr. EL FENNI Jamal* Radiologie

Pr. EL HANCHI ZAKI Gynécologie Obstétrique

Pr. EL KHORASSANI Mohamed Pédiatrie

Pr. EL YOUNASSI Badreddine* Cardiologie

Pr. HACHI Hafid Chirurgie Générale

Pr. JABOUIRIK Fatima Pédiatrie

Pr. KHARMAZ Mohamed Traumatologie Orthopédie

Pr. MOUGHIL Said Chirurgie Cardio-Vasculaire

Pr. OUBAAZ Abdelbarre * Ophtalmologie

Pr. TARIB Abdelilah* Pharmacie Clinique

Pr. TIJAMI Fouad Chirurgie Générale

Pr. ZARZUR Jamila Cardiologie

JANVIER 2005

Pr. ABBASSI Abdellah Chirurgie Réparatrice et Plastique Pr. AL KANDRY Sif Eddine* Chirurgie Générale

Pr. ALLALI Fadoua Rhumatologie

Pr. AMAZOUZI Abdellah Ophtalmologie

Pr. AZIZ Noureddine* Radiologie

Pr. BAHIRI Rachid Rhumatologie Directeur Hôp. Al Ayachi Salé

Pr. BARKAT Amina Pédiatrie

Pr. BENYASS Aatif Cardiologie

Pr. DOUDOUH Abderrahim* Biophysique

Pr. EL HAMZAOUI Sakina * Microbiologie

Pr. HAJJI Leila Cardiologie (mise en disponibilité

Pr. HESSISSEN Leila Pédiatrie

Pr. JIDAL Mohamed* Radiologie

Pr. LAAROUSSI Mohamed Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. LYAGOUBI Mohammed Parasitologie

Pr. RAGALA Abdelhak Gynécologie Obstétrique

Pr. SBIHI Souad Histo-Embryologie Cytogénétique

AVRIL 2006

Pr. ACHEMLAL Lahsen* Rhumatologie

Pr. AKJOUJ Said* Radiologie

Pr. BELMEKKI Abdelkader* Hématologie

Pr. BENCHEIKH Razika O.R.L

Pr. BIYI Abdelhamid* Biophysique

Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine Chirurgie - Pédiatrique

Pr. BOULAHYA Abdellatif* Chirurgie Cardio – Vasculaire. Pr. CHENGUETI ANSARI Anas Gynécologie Obstétrique

Pr. DOGHMI Nawal Cardiologie

Pr. FELLAT Ibtissam Cardiologie

Pr. FAROUDY Mamoun Anesthésie Réanimation

Pr. HARMOUCHE Hicham Médecine Interne

Pr. HANAFI Sidi Mohamed* Anesthésie Réanimation

Pr. IDRISS LAHLOU Amine* Microbiologie

Pr. JROUNDI Laila Radiologie

Pr. KARMOUNI Tariq Urologie

Pr. KILI Amina Pédiatrie

Pr. KISRA Hassan Psychiatrie

Pr. KISRA Mounir Chirurgie – Pédiatrique

Pr. LAATIRIS Abdelkader* Pharmacie Galénique

Pr. LMIMOUNI Badreddine* Parasitologie

Pr. MANSOURI Hamid* Radiothérapie

Pr. OUANASS Abderrazzak Psychiatrie

Pr. SAFI Soumaya* Endocrinologie

Pr. SEKKAT Fatima Zahra Psychiatrie

Pr. SOUALHI Mouna Pneumo – Phtisiologie

Pr. TELLAL Saida* Biochimie

Pr. ZAHRAOUI Rachida Pneumo – Phtisiologie

DECEMBRE 2006

Pr SAIR Khalid Chirurgie générale Dir. Hôp.Av.Marrakech

OCTOBRE 2007

Pr. ABIDI Khalid Réanimation médicale

Pr. ACHACHI Leila Pneumo phtisiologie

Pr. ACHOUR Abdessamad* Chirurgie générale

Pr. AIT HOUSSA Mahdi * Chirurgie cardio vasculaire

Pr. AMHAJJI Larbi * Traumatologie orthopédie

Pr. AOUFI Sarra Parasitologie

Pr. BAITE Abdelouahed * Anesthésie réanimation Directeur ERSSM

Pr. BALOUCH Lhousaine * Biochimie-chimie

Pr. BOUTIMZINE Nourdine Ophtalmologie

Pr. CHERKAOUI Naoual * Pharmacie galénique

Pr. EHIRCHIOU Abdelkader * Chirurgie générale

Pr. EL BEKKALI Youssef * Chirurgie cardio-vasculaire

Pr. EL ABSI Mohamed Chirurgie générale

Pr. EL MOUSSAOUI Rachid Anesthésie réanimation

Pr. EL OMARI Fatima Psychiatrie

Pr. GHARIB Noureddine Chirurgie plastique et réparatrice

Pr. HADADI Khalid * Radiothérapie

Pr. ICHOU Mohamed * Oncologie médicale

Pr. ISMAILI Nadia Dermatologie

Pr. KEBDANI Tayeb Radiothérapie

Pr. LALAOUI SALIM Jaafar * Anesthésie réanimation

Pr. LOUZI Lhoussain * Microbiologie

Pr. MADANI Naoufel Réanimation médicale

Pr. MAHI Mohamed * Radiologie

Pr. MARC Karima Pneumo phtisiologie

Pr. MASRAR Azlarab Hématologie biologique

Pr. MRANI Saad * Virologie

Pr. OUZZIF Ez zohra * Biochimie-chimie

Pr. RABHI Monsef * Médecine interne

Pr. RADOUANE Bouchaib* Radiologie

Pr. SEFFAR Myriame Microbiologie

Pr. SEKHSOKH Yessine * Microbiologie

Pr. SIFAT Hassan * Radiothérapie

Pr. TABERKANET Mustafa * Chirurgie vasculaire périphérique

Pr. TACHFOUTI Samira Ophtalmologie

Pr. TAJDINE Mohammed Tariq* Chirurgie générale

Pr. TANANE Mansour * Traumatologie-orthopédie

Pr. TLIGUI Houssain Parasitologie

Pr. TOUATI Zakia Cardiologie

DECEMBRE 2008

Pr TAHIRI My El Hassan* Chirurgie Générale

MARS 2009

Pr. ABOUZAHIR Ali * Médecine interne

Pr. AGADR Aomar * Pédiatrie

Pr. AIT ALI Abdelmounaim * Chirurgie Générale Pr. AIT BENHADDOU El Hachmia Neurologie

Pr. AKHADDAR Ali * Neuro-chirurgie

Pr. ALLALI Nazik Radiologie

Pr. ARKHA Yassir Neuro-chirurgie Directeur Hôp.des Spécialités

Pr. BELYAMANI Lahcen* Anesthésie Réanimation

Pr. BJIJOU Younes Anatomie

Pr. BOUHSAIN Sanae * Biochimie-chimie

Pr. BOUI Mohammed * Dermatologie

Pr. BOUNAIM Ahmed * Chirurgie Générale

Pr. BOUSSOUGA Mostapha * Traumatologie-orthopédie

Pr. CHTATA Hassan Toufik * Chirurgie Vasculaire Périphérique

Pr. DOGHMI Kamal * Hématologie clinique

Pr. EL MALKI Hadj Omar Chirurgie Générale

Pr. EL OUENNASS Mostapha* Microbiologie

Pr. ENNIBI Khalid * Médecine interne

Pr. FATHI Khalid Gynécologie obstétrique

Pr. HASSIKOU Hasna * Rhumatologie

Pr. KABBAJ Nawal Gastro-entérologie

Pr. KABIRI Meryem Pédiatrie

Pr. KARBOUBI Lamya Pédiatrie

Pr. LAMSAOURI Jamal * Chimie Thérapeutique

Pr. MARMADE Lahcen Chirurgie Cardio-vasculaire

Pr. MESKINI Toufik Pédiatrie

Pr. MESSAOUDI Nezha * Hématologie biologique

Pr. MSSROURI Rahal Chirurgie Générale

Pr. NASSAR Ittimade Radiologie

Pr. OUKERRAJ Latifa Cardiologie

Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani * Pneumo-Phtisiologie

OCTOBRE 2010

Pr. ALILOU Mustapha Anesthésie réanimation

Pr. AMEZIANE Taoufiq* Médecine Interne

Pr. BELAGUID Abdelaziz Physiologie

Pr. CHADLI Mariama* Microbiologie

Pr. CHEMSI Mohamed* Médecine Aéronautique

Pr. DAMI Abdellah* Biochimie- Chimie

Pr. DARBI Abdellatif* Radiologie

Pr. DENDANE Mohammed Anouar Chirurgie Pédiatrique

Pr. EL HAFIDI Naima Pédiatrie

Pr. EL KHARRAS Abdennasser* Radiologie

Pr. EL MAZOUZ Samir Chirurgie Plastique et Réparatrice

Pr. EL SAYEGH Hachem Urologie

Pr. ERRABIH Ikram Gastro-Entérologie

Pr. LAMALMI Najat Anatomie Pathologique

Pr. MOSADIK Ahlam Anesthésie Réanimation

Pr. MOUJAHID Mountassir* Chirurgie Générale

Pr. NAZIH Mouna* Hématologie

DECEMBRE 2010

Pr.ZNATI Kaoutar Anatomie Pathologique

MAI 2012

Pr. AMRANI Abdelouahed Chirurgie pédiatrique

Pr. ABOUELALAA Khalil * Anesthésie Réanimation

Pr. BENCHEBBA Driss * Traumatologie-orthopédie

Pr. DRISSI Mohamed * Anesthésie Réanimation

Pr. EL ALAOUI MHAMDI Mouna Chirurgie Générale Pr. EL KHATTABI Abdessadek * Médecine Interne Pr. EL OUAZZANI Hanane * Pneumophtisiologie

Pr. ER-RAJI Mounir Chirurgie Pédiatrique

Pr. JAHID Ahmed Anatomie Pathologique

Pr. MEHSSANI Jamal * Psychiatrie

Pr. RAISSOUNI Maha * Cardiologie

* Enseignants Militaires FEVRIER 2013

Pr.AHID Samir Pharmacologie

Pr.AIT EL CADI Mina Toxicologie

Pr.AMRANI HANCHI Laila Gastro-Entérologie

Pr.AMOR Mourad Anesthésie Réanimation

Pr.AWAB Almahdi Anesthésie Réanimation

Pr.BELAYACHI Jihane Réanimation Médicale

Pr.BELKHADIR Zakaria Houssain Anesthésie Réanimation

Pr.BENCHEKROUN Laila Biochimie-Chimie

Pr.BENKIRANE Souad Hématologie

Pr.BENNANA Ahmed* Informatique Pharmaceutique

Pr.BENSGHIR Mustapha * Anesthésie Réanimation

Pr.BENYAHIA Mohammed * Néphrologie

Pr.BOUATIA Mustapha Chimie Analytique et Bromatologie Pr.BOUABID Ahmed Salim* Traumatologie orthopédie

Pr BOUTARBOUCH Mahjouba Anatomie

Pr.CHAIB Ali * Cardiologie

Pr.DENDANE Tarek Réanimation Médicale

Pr.DINI Nouzha * Pédiatrie

Pr.ECH-CHERIF EL KETTANI Mohamed Ali Anesthésie Réanimation Pr.ECH-CHERIF EL KETTANI Najwa Radiologie

Pr.EL FATEMI NIZARE Neuro-chirurgie

Pr.EL GUERROUJ Hasnae Médecine Nucléaire

Pr.EL JAOUDI Rachid * Toxicologie

Pr.EL KABABRI Maria Pédiatrie

Pr.EL KHANNOUSSI Basma Anatomie Pathologique

Pr.EL KHLOUFI Samir Anatomie

Pr.EL KORAICHI Alae Anesthésie Réanimation

Pr.EN-NOUALI Hassane * Radiologie

Pr.ERRGUIG Laila Physiologie

Pr.FIKRI Meryem Radiologie

Pr.GHFIR Imade Médecine Nucléaire

Pr.IMANE Zineb Pédiatrie

Pr.IRAQI Hind Endocrinologie et maladies métaboliques

Pr.KABBAJ Hakima Microbiologie

Pr.KADIRI Mohamed * Psychiatrie

Pr.MAAMAR Mouna Fatima Zahra Médecine Interne

Pr.MEDDAH Bouchra Pharmacologie

Pr.MELHAOUI Adyl Neuro-chirurgie

Pr.MRABTI Hind Oncologie Médicale

Pr.NEJJARI Rachid Pharmacognosie

Pr.OUBEJJA Houda Chirugie Pédiatrique

Pr.OUKABLI Mohamed * Anatomie Pathologique

Pr.RAHALI Younes Pharmacie Galénique

Pr.RATBI Ilham Génétique

Pr.RAHMANI Mounia Neurologie

Pr.REDA Karim * Ophtalmologie

Pr.REGRAGUI Wafa Neurologie

Pr.RKAIN Hanan Physiologie

Pr.ROSTOM Samira Rhumatologie

Pr.ROUAS Lamiaa Anatomie Pathologique

Pr.ROUIBAA Fedoua * Gastro-Entérologie

Pr SALIHOUN Mouna Gastro-Entérologie

Pr.SAYAH Rochde Chirurgie Cardio-Vasculaire

Pr.SEDDIK Hassan * Gastro-Entérologie

Pr.ZERHOUNI Hicham Chirurgie Pédiatrique

AVRIL 2013

Pr.EL KHATIB MOHAMED KARIM * Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale

MAI 2013

Pr.BOUSLIMAN Yassir Toxicologie

MARS 2014

Pr. ACHIR Abdellah Chirurgie Thoracique

Pr.BENCHAKROUN Mohammed * Traumatologie- Orthopédie

Pr.BOUCHIKH Mohammed Chirurgie Thoracique

Pr. EL KABBAJ Driss * Néphrologie

Pr. EL MACHTANI IDRISSI Samira * Biochimie-Chimie

Pr. HARDIZI Houyam Histologie- Embryologie-Cytogénétique

Pr. HASSANI Amale * Pédiatrie

Pr. HERRAK Laila Pneumologie

Pr. JANANE Abdellah * Urologie

Pr. JEAIDI Anass * Hématologie Biologique

Pr. KOUACH Jaouad* Gynécologie-Obstétrique

Pr. LEMNOUER Abdelhay* Microbiologie

Pr. MAKRAM Sanaa * Pharmacologie

Pr. OULAHYANE Rachid* Chirurgie Pédiatrique

Pr. RHISSASSI Mohamed Jaafar CCV

Pr. SABRY Mohamed* Cardiologie

Pr. SEKKACH Youssef* Médecine Interne

Pr. TAZI MOUKHA Zakia Gynécologie-Obstétrique

AVRIL 2014

PROFESSEURS AGREGES :

DECEMBRE 2014

Pr. ABILKASSEM Rachid* Pédiatrie

Pr. AIT BOUGHIMA Fadila Médecine Légale

Pr. BEKKALI Hicham * Anesthésie-Réanimation

Pr. BENAZZOU Salma Chirurgie Maxillo-Faciale

Pr. BOUABDELLAH Mounya Biochimie-Chimie

Pr. BOUCHRIK Mourad* Parasitologie

Pr. DERRAJI Soufiane* Pharmacie Clinique

Pr. DOBLALI Taoufik* Microbiologie

Pr. EL AYOUBI EL IDRISSI Ali Anatomie

Pr. EL GHADBANE Abdedaim Hatim* Anesthésie-Réanimation

Pr. EL MARJANY Mohammed* Radiothérapie

Pr. FEJJAL Nawfal Chirurgie Réparatrice et Plastique

Pr. JAHIDI Mohamed* O.R.L

Pr. LAKHAL Zouhair* Cardiologie

Pr. OUDGHIRI NEZHA Anesthésie-Réanimation

Pr. RAMI Mohamed Chirurgie Pédiatrique

Pr. SABIR Maria Psychiatrie

Pr. SBAI IDRISSI Karim* Médecine préventive, santé publique et Hyg.

AOUT 2015

Pr. MEZIANE Meryem Dermatologie

Pr. TAHRI Latifa Rhumatologie

JANVIER 2016

Pr. BENKABBOU Amine Chirurgie Générale

Pr. EL ASRI Fouad* Ophtalmologie

Pr. ERRAMI Noureddine* O.R.L

Pr. NITASSI Sophia O.R.L

JUIN 2017

Pr. ABI Rachid* Microbiologie

Pr. ASFALOU Ilyasse* Cardiologie

Pr. BOUAYTI El Arbi* Médecine préventive, santé publique et Hyg.

Pr. BOUTAYEB Saber Oncologie Médicale

Pr. EL GHISSASSI Ibrahim Oncologie Médicale

Pr. OURAINI Saloua* O.R.L

Pr. RAZINE Rachid Médecine préventive, santé publique et Hyg.

Pr. ZRARA Abdelhamid* Immunologie

2 - ENSEIGNANTS-CHERCHEURS SCIENTIFIQUES

PROFESSEURS/Prs. HABILITES

Pr. ABOUDRAR Saadia Physiologie

Pr. ALAMI OUHABI Naima Biochimie-chimie

Pr. ALAOUI KATIM Pharmacologie

Pr. ALAOUI SLIMANI Lalla Naïma Histologie-Embryologie

Pr. ANSAR M’hammed Chimie Organique et Pharmacie Chimique

Pr .BARKIYOU Malika Histologie-Embryologie

Pr. BOUHOUCHE Ahmed Génétique Humaine

Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz Applications Pharmaceutiques Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia Biochimie-chimie

Pr. DAKKA Taoufiq Physiologie

Pr. FAOUZI Moulay El Abbes Pharmacologie

Pr. IBRAHIMI Azeddine Biologie moléculaire/Biotechnologie

Pr. KHANFRI Jamal Eddine Biologie

Pr. OULAD BOUYAHYA IDRISSI Med Chimie Organique

Pr. REDHA Ahlam Chimie

Pr. TOUATI Driss Pharmacognosie

Pr. ZAHIDI Ahmed Pharmacologie

Mise à jour le 10/10/2018 Khaled Abdellah

A ma très chère grande mère

A cette douce personne qui m’a toujours montré la meilleure des voix,

j’aurai aimé partager ce moment avec toi, j’aurai aimé te voir sourire une

dernière fois, j’aurai aimé me blottir entre tes bras une dernière fois , mais

hélas dieux on a décidé autrement , je prie le tout puissant pour

t’accueillir dans son paradis éternelle.

A ma mère lala Boumalek Fatima

Tu représentes pour moi le symbole de la bonté par excellence, la source de

tendresse et l’exemple du dévouement qui n’a pas cessé de m’encourager et

de prier pour moi.

Ta prière et ta bénédiction m’ont été d’un grand secours pour mener à

bien mes études.

Aucune dédicace ne saurait être assez éloquente pour exprimer ce que tu

mérites pour tous les sacrifices que tu n’as cessé de me donner depuis ma

naissance, durant mon enfance et même à l’âge adulte.

Tu as fait plus qu’une mère puisse faire pour que ces enfants suivent le

bon chemin dans leur vie et leurs études.

Je te dédie ce travail en témoignage de mon profond amour. Puisse Dieu,

le tout puissant, te préserver et t’accorder santé, longue vie et bonheur.

A mon père que dieux ait pitié de son âme Baaddouch mouhamed

Aucun mot ne pourra exprimer ma grande tristesse en ton absence…

Ton visage gai et souriant…

Ta tendresse infinie…

Et ton amour incomparable…

Resteront à jamais gravés dans mon cœur…

Je te remercie pour tous les beaux moments que nous avons partagé en

famille…

Je te remercie pour m’avoir appris à prendre des décisions dans la vie…

Je te remercie pour ton grand amour…

Tu me manques beaucoup papa…

J’aurai aimé que tu sois à mes côtés ce jour…

Mais le destin en a décidé autrement…

J’espère que tu es fier de moi papa…

Je t’aime…

A mes freres

Said Baaddouch ,abedali Baaddouch, mustapha Baaddouche

Aucune dédicace ne pourrait traduire ma gratitude et ma profonde

reconnaissance et mon amour. Je vous dédie ce travail comme témoignage

de mon respect et mon amour éternel.

A ma grande sœur Khadija Baaddouch et rekayia Baaddouch

Ma meilleure amie ma confidente Les mots ne pourraient guère exprimer

l’attachement, l’amour et l’affection que je porte pour toi. Mon ange

gardien et mon fidèle compagnon dans les moments les plus délicats de

cette vie. Tu as toujours cru en moi, tu as su me redonner du courage

dans les moments les plus difficiles, je t’aime ma sœur.

A ma famille ben lmouden et Boumalek

Je vous dédie ce travail modeste pour exprimer ma gratitude

A mes amis Yassine Merjan , faycal benssassi ,Hamid maydoun,Anas

Moukhlisse.khalid,hakim…etc

Grace à vous les difficultés de la vie m’ont paru facile, grâce a vous j’ai

regagné le sourire quand j’étais mal, grâce à vous j’ai su supporter toutes

A mon oncle Haj mouhamed boumalek et son marie lala keltoum

Veuillez trouver dans ce modeste travail l’expression de mon affection la

plus sincère .

A ma deuxieme mere

Madam derii Aicha et latifa habach .

Vous images et vous sourire étaient et resterez toujours devant mes yeux.

J’aurais tant souhaité vous avoir à mes côtés, mais Dieu en a voulu

autrement.

A mon amie Oumaima Elmidaoui

Ma meilleure amie, ma sœur nulle mots ne saurait exprimer ce que je

ressens, tu as toujours été là pour moi et moi pour toi, on a escaladé les

marches de la réussite pas à pas, on trébuchait, on tombait certes mais il

y avait toujours ta main tendue envers moi qui me soutenait qui me

redonnait cette joie de vivre,

Je te serai à tous jamais reconnaissant.

A mon ami et frère yassine

Depuis le premier jour j’ai su que tu seras mon compagnon d’arme, ta

sagesse, ta tendresse, et ton sens d’amitié m’ont redonné fois en ce monde,

j’espère qu’on sera les meilleurs amis pour toujours dans cette vie et la

prochaine

A Notre Maître et Président de Thèse

Monsieur Mimoun ZOUHDI

Professeur de Microbiologie

Vous nous avez fait le grand honneur d’accepter la présidence du jury de

cette thèse et nous vous remercions de la confiance que vous avez bien

voulu témoigner.

Nous avons eu de la chance de compter parmi vos étudiants et de profiter

de l’étendue de votre savoir. Nous ne saurons jamais vous exprimer notre

profonde gratitude.

Vos remarquables qualités humaines et professionnelles ont toujours

suscité notre profonde admiration.

Nous vous prions de trouver dans ce travail le témoignage de notre

reconnaissance et l’assurance de nos sentiments respectueux.

A Notre Maître et Rapporteur de Thèse

Monsieur Yassine SEKHSOKH

Professeur de Microbiologie

Nous tenons à vous déclarer nos remerciements les plus sincères pour

avoir accepté de diriger ce travail et avoir vérifié à son élaboration avec

patience et disponibilité.

Votre dévouement au travail, votre modestie et votre gentillesse imposent

le respect et représentent le modèle que nous serons toujours heureux de

suivre. Mais au-delà de tous les mots de remerciements que nous vous

adressons, nous voudrons louer en vous votre amabilité, votre courtoisie et

votre générosité. Ce fut très agréable de travailler avec vous pendant cette

période.

Puisse ce travail être à la hauteur de la confiance que vous nous avez

accordée.

A Notre Maître et Juge de Thèse

Monsieur Ahmed GAOUZI

Professeur de Pédiatrie

Nous sommes très heureux de l’honneur que vous nous faites en

acceptant de juger notre travail.

Votre présence est pour nous, l’occasion de vous exprimer notre

admiration de votre grande compétence professionnelle et de votre

généreuse sympathie.

A Notre Maître et Juge de Thèse

Madame Saida TELLAL

Professeur de Biochimie

Vous nous faites un immense plaisir en acceptant de juger notre thèse.

Qu’il nous soit permis de témoigner à travers ces quelques lignes notre

admiration à la valeur de votre compétence, votre rigueur ainsi que votre

gentillesse, votre sympathie et votre dynamisme qui demeureront pour

nous le meilleur exemple.

Que ce travail soit une occasion de vous exprimer notre gratitude, de

respect et d’admiration les plus sincères.

Abréviations

A/E : Attachement/Effacement ADN : Acide désoxyribonucléique ADN : Acide désoxyribonucléique

AEEC : Attaching and Effacing E. coli

Afssa : Agence française de sécurité sanitaire

ANSES : Agence nationale de la sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail

ARN : Acide ribonucléique

AST3 : Appareil de sécrétion de type III

CNR :Centre national de référence

EA : Éthanolamine

ECP : E. coli common pilus

EHEC : Escherichia.coli entérohémorragique ELISA : Enzyme-linked Immunosorbent Assay

EPEC : Escherichia.coli entéropathogène Gb3 : Globotriasoylcéramide

Gb4 : Globotétraosylcéramide

HCP : Hemorrhagic coli pilus

HPA : Hydroxypropionaldehyde

InVS : Institut national de Veille Sanitaire

LEE : Locus d’effacement des entérocytes

LPS : Lipopolysaccharide

MLVA : Multiple locus variable number

ORF : open reading frame

PCR : Réaction de polymerisation en chaîne (Polymerase Chain Reaction). PTT : Purpura thrombotique thrombocytopénique

RE : Réticulum endoplasmique

rRNA :Ribosomal ribonucleic acid

SHU : Syndrome Hémolytique et Urémique SNC : Systhéme nerveuxcentrale

STEC : Escherichia.coli producteur de Shiga toxines Stx : Gène codant la Shiga-toxine

TIAC : Toxi-infection alimentaire collective

Liste des figures

Figure 1: Représentation schématique de la structure d‘E. coli ... 9 Figure 2: Induction de la production des Shiga-toxines Stx1 et Stx2, adaptée de Mellies &

Lorenzen (2014) ... 11

Figure 3: Structure (A) et mode d’action des Shiga-toxines (B) , adaptée de Bryan et al.

(2015); Melton-Celsa (2014). La toxine Stx, composée d’une sous-unité A et d’un pentamère de sous-unités B, se fixe au récepteur Gb3 et est internalisée dans l’endosome. Le complexe Stx/Gb3 migre par un transport rétrograde vers l’appareil de Golgi puis le réticulum endoplasmique dans lequel le peptide A1 est libéré pour atteindre les ribosomes et engendrer un arrêt de la synthèse protéique ... 13

Figure 4: Organisation génétique du locus d‘effacement des entérocytes (Ritchie and

Waldor, 2005) ... 15

Figure 5: Représentation schématique de l‘assemblage du système de sécrétion de type III

chez les EPEC (Sekiya et al., 2001) ... 18

Figure 6: Représentation schématique du système de sécrétion de type III , exprimé par les

EHEC et C. rodentium (Pallen et al., 2005) ... 18

Figure 7: Mécanisme de pathogénicité des E. coli entéropathogènes et entérohémorragiques (Croxen and Finlay, 2010) ... 19

Figure 8: Mode de transmission des EHEC à partir du réservoir animal, adaptée de

Fairbrother et al. (2006)[116]. La transmission des EHEC par l’alimentation représente la principale source d’infection pour l’Homme. La transmission entre personnes qui peut être observée en milieu familial ainsi que le contact direct entre l’Homme et les animaux de la ferme constituent également des sources d’infection ... 30

Figure 9: Surveillance du SHU chez les enfants de moins de 15 ans en France en 2015. ... 35 Figure 10: Répartition départementale des souche de EHEC isolées en 2017 (n=250) sur le

Figure 11: Principales étapes du processus infectieux des E. coli enterohémorragiques. ... 42 Figure 12: Adhésion des EHEC aux cellules épithéliales intestinales et formation des

lésions A/E ... 43

Figure 13: Diagnostic d’une infection à EHEC ... 51 Figure 14: Principe de mise en évidence des EHEC dans les selles ... 53 Figure 15: Aspect des colonies d' Escherichia coli O157 : H7 Colonies sorbitol – sur

milieu SMAC – céfixime-tellurite ; à gauche, d' Escherichia coli sorbitol positif à droite ... 54

Figure 16: Pulsotypes d’E. coli O104:H4 [digestion enzymatique par NotI] ... 55 Figure 17: Biopsie colique d’un patient porteur d’une infection à Escherichia coli 0157 :

Liste des tableaux

Tableau I: Résumé des principales épidémies à EHEC dans le monde entre 1998-2014 ... 6 Tableau II: Principaux critères biochimiques différentiels des espèces du genre

Escherichia (d‘après Grimont, 1987) ... 8

Tableau III: Protéines sécrétées par le système de sécrétion de type III par les E.coli

O157:H7 et leurs activités (d‘après Stevens and Frankel, 2014) ... 16

Tableau IV: Milieux utilisés pour la recherche des EPEC ou EHEC et pour la recherche de

E. coli O157 par les 215 laboratoires répondants... 26

Tableau V : Pathovar entérique : résultats des experts ... 28 Tableau VI : Nombre (%) de TIAC déclarées par danger, en fonction du niveau

d’identification de l’agent et del’aliment, et nombre de TIAC retenues pour l’analyse sur la période 2006-2015 ... 32

Tableau VII: Séquences des amorces nucléotidiques permettant la détection spécifique des

I. Introduction ...2 II. Historique d’Escherichia coli entérohémorragique ...4 III. Epidémiologie ...8

1. Agent pathogène EHEC ...8 1.1 Taxonomie ...8 1.2 Morphologie ...9 1.3 Facteurs de virulence des EHEC ...9 1.3.1 Shiga-toxines ... 10 1.3.1.1 Phages stx ... 10 1.3.1.2 Structure et mode d’action des Shiga-toxines ... 12 1.3.1.3 Sous-types de Shiga-toxines ... 14 1.3.2 Locus d’effacement des entérocytes ... 15 1.4 Autres facteurs de virulence potentiels des EHEC ... 23 1.4.1 Plasmide de virulence des EHEC ... 23 1.4.2 îlots génomiques ... 25 1.5 Caractères culturaux ... 25 1.6 Caractères Biochimiques ... 27 1.7 Caractères antigéniques ... 27 2. Réservoir et modes de transmission ... 29 3. Réceptivité et et Facteurs favorisants ... 31 4. Aspects épidémiologiques ... 34 5. Répartition géographique ... 37

IV. Physiopathologie des infections à Escherichia coli entérohémorragique ... 42

2. Action des Shiga-toxines au niveau des cellules cibles ... 44 3. Rôle des Shiga-toxines dans la physiopathologie du SHU . ... 44

V. Aspects cliniques ... 47

1. Colite hémorragique ... 47 2. Syndrome hémolytique et urémique (SHU) ... 47 3. Purpura Thrombotique Thrombocytopénique (PTT) ... 48

VI. Diagnostic ... 51

1. Prélèvements ... 52 2. Culture ... 52 2.1 Isolement et caractérisation des souches EHEC de sérotype O157:H7 ... 53 2.2 Isolement et caractérisation des souches EHEC de sérotype non O157 ... 54 3. Mise en évidence des toxines et des gènes de virulence. ... 55 3.1 Effet cytopathogène ... 55 3.2 Méthodes moléculaires ... 56 3.3 Tests immunologiques ... 57 3.4 Diagnostic sérologique des infections à EHEC... 57 3.5 Mise en évidance des autres pathovars d’Escherichia coli ... 58

VII. Traitement... 60 VIII. Prévention ... 71 Conclusion ... 73 Résumés ... 75 Références ... 79

1

2

I. Introduction

Escherichia coli est un Bacille à Gram négatif, aéro-anaérobie facultatif, oxydase négative, mesurant de 2 à 4 μm de long et d’un diamètre d’environ 0,6 μm. E. coli est une bactérie normalement présente parmi la microflore digestive de l’Homme et des animaux à sang chaud. Mais certaines souches d’E. coli sont pathogènes car elles ont acquis des facteurs de virulence. Sur la base des signes cliniques observés chez les malades, les souches d’E. coli pathogènes sont regroupées en pathovars (ou pathotypes) parmi lesquels les E. coli entérohémorragiques ou EHEC (enterohemorrhagic E. coli) [1]. La virulence des EHEC est étroitement liée a la production d'une toxine appelee shigatoxine (Stx). Bien qu'associée le plus souvent a de nombreux autres facteurs de virulence, notamment ceux caractéristiques des E. coli enteropathogenes (EPEC) dont le gène eae du locus LEE (locus of enterocytes effacement), seule la mise en évidence de la toxine ou de ces gènes permet d'affirmer que l'on est en présence d'un EHEC. [2]

Les EHEC sont responsables chez l’homme de troubles variés allant d’une simple diarrhée aqueuse bénigne à une colite hémorragique pouvant évoluer vers des formes graves telles que le syndrome hémolytique et urémique (SHU) chez les jeunes enfants et le purpura thrombotique thrombocytopénique chez l’adulte. Le réservoir de ces bactéries est majoritairement le tube digestif des ruminants : la transmission à l’homme se fait principalement par la consommation d’aliments insuffisamment cuits (viande de boeuf notamment), l’eau contaminée, le contact direct avec des animaux ou avec des personnes infectées.[3]

Enfin, en raison de l'origine le plus souvent alimentaire des infections a EHEC, de leur évolution parfois fatale et de leur risque potentiellement epidemique, la detection d'EHEC, en particulier lorsqu'ils sont responsables de SHU, peut conduire a la mise en œuvre d'une enquête diligentée par l'InVS afin d'identifier la source de contamination.[4]

Notre travail consistera dans une première partie a développer l’épidémiologie d’E.coli entérohémorragique, Nous traitons dans une deuxième partie le diagnostic, traitement et prévention.

3

Historique d’Escherichia coli

entérohémorragique

4

II. Historique d’Escherichia coli entérohémorragique

La bactérie Escherichia coli a été décrite pour la première fois en 1885 après avoir été isoléedans des selles de nourrissons par l’allemand Theodor Escherich. Son nom actuel lui est ensuite donné en 1919 par Castellani et Chambers [5].

Des souches particulières d’Escherichia coli pathogènes ont été décrites pour la première fois en 1982, lors de deux épidémies survenues aux Etats-Unis (dans l’Oregon puis trois mois plus tard dans le Michigan) suite à la consommation de hamburgers contaminés et insuffisamment cuits. Les patients atteints présentant une colite hémorragique, ces souches particulières ont été dénommées Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC).[6]

En 1983 Karmali a mit en évidence dans des selles d’enfants atteints du syndrome hémolytique et urémique (SHU) des souches d’E. Coli produisant une toxine active sur les cellules Véro (cellules de rein de singe vert d’Afrique), appelée vérotoxine ou Shiga toxine .parmi ces souches on trouve l’E .coli O157 :H7. [7] [8]

En 1985, la relation entre la présence d’E. coli O157:H7 produisant des Shiga-toxines dans les selles d’enfants et les signes cliniques, i.e. les colites hémorragiques et le SHU, est établie. [8]

Ainsi, deux observations microbiologiques et cliniques clés, l’une basée sur une bactérie E. coli de sérotype rare et l’autre basée sur la production d’une cytotoxine spécifique, ont conduit à la reconnaissance d’une nouvelle classe d’agents pathogènes entériques responsable d’une maladie caractérisée par des signes intestinaux et rénaux. [9]

la toxiinfection en 1996 au Japon, provoquée par une souche STEC O157:H7 à partir de jeunes pousses de radis, qui avait causé près de 10000 malades et 12 décès.[10] Des viandes hachées en France ont été à l’origine d’infections par Escherichia coli O157:H7, en mars 2008 puis en juillet 2011.les aliments en cause contaminateurs de cette bactérie redoutable sont très divers dans le monde. l’E. Coli O104:H4 (E.coli entérohémorragique (EHEC) est une autre souche, redoutable, décelée en juin 2011, jugulée en juillet, 2011, décelée en Europe du Nord - Allemagne), puis en France.[11][12]

5

une épidémie a frappé l’Allemagne (3 816 cas de colite hémorragique, 54 décès, 845 SHU dont une centaine chez des enfants)et à une moindre échelle en France 7 étaient due à un E. coli rare, 0104 :H4, particulièrement virulent car producteur de Stx, résistant aux antibiotiques et entéroagrégant.[13][14]

En Allemagne, une épidémie de grande ampleur a été rapportée suite à la consommation de graines germées contaminées par E. coli O104 :H4. Il s’agissait d’une souche pathogène émergente considérée comme non pathogène selon la définition de l’Anses. Peu de temps après (en juin 2011), quinze cas de SHU ou de diarrhée sanglante ont été signalés en France. Des graines germées contaminées par la même souche d’E. coli O104 :H4 étaient à l’origine de la contamination.[14]

Des infections humaines causées par des souches de STEC sont signalées dans le monde entier. à la fois en tant que cas sporadiques et associés à une éclosion. La notification de Les infections par des STEC humains sont obligatoires dans la plupart des États membres de l’UE. En 2015, 5901 cas d'infection par les STEC ont été confirmés dans l'UE.[15]

6

7

8

III. Epidémiologie

1. Agent pathogène EHEC

1.1 Taxonomie

Les E. coli sont des bacilles à Gram négatif appartenant à la famille des Enterobacteriaceae. Ce sont des bactéries aérobies anaérobies facultatives, mésophiles et asporulées se développant sur des milieux pauvres, fermentant les nitrates et ne possédant pas d‘oxydase . [17]

Commensale, E. coli est l‘espèce prédominante de la flore aéroanaérobie facultative du tube digestif des mammifères à sang chaud tel que l‘Homme. Cette bactérie est l‘une des premières colonisatrices du tractus gastro-intestinal du nouveau-né. Son implantation dans les premières heures suivant l‘accouchement, notamment au niveau du côlon est maintenue durant toute la vie du sujet. D‘autres espèces appartenant au genre Escherichia ont été décrites dans la littérature.[18] Il s‘agit d‘Escherichia albertii ; E. fergusonii ; E. hermannii et E vulneris. Elles se différencient par leurs capacités métaboliques (Tableau II).

Tableau II: Principaux critères biochimiques différentiels des espèces du genre Escherichia (d‘après Grimont, 1987). [17]

(+) positif pour la majorité des souches ; +/- positif ou négatif selon les souches ; LC Lysine Décarboxylase, ODC Ornithine Décarboxylase.

9

1.2 Morphologie

Escherichia coli ou colibacille est une bactérie asporulée mesurant 2 à 4 μ de long sur 0,4 à 0,6 μ de large. C’est une bactérie fine et allongée à extrémités arrondies, mobile grâce à une ciliature péritriche. Ce germe non exigeant, sur gélose ordinaire donne des colonies lisses, brillantes et homogènes.[19]

Figure 1: Représentation schématique de la structure d‘E. coli.[19]

1.3 Facteurs de virulence des EHEC

La virulence des EHEC est associée à la présence de toxines appelées Shiga-toxines (Stx) et à la présence du gène eae, responsable des lésions d’attachement-effacement au niveau du côlon et du caecum. [20]

La liste des facteurs de virulence et des mécanismes impliqués dans le pouvoir pathogène des souches EHEC n’est pas encore complètement connue. En effet, bien que la production de Stx et la colonisation de la muqueuse colique soient nécessaires, elles ne sont pas suffisantes pour induire maladie chez l’homme. De nombreux autres facteurs de virulence potentiels ont été décrits [20] [21] [22].6

10

1.3.1 Shiga-toxines

Les Shiga-toxines (Stx) sont considérées comme le principal facteur de virulence des EHEC. Les toxines Stx sont également connues sous le nom de Vérotoxines en raison de leur cytotoxicité sur les lignées cellulaires Vero dérivant de cellules épithéliales rénales de singe africain. La pathogénicité des EHEC dépend de la production des toxines Stx qui sont responsables des effets cliniques, notamment les colites hémorragiques et le SHU. Les toxines Stx sont des exotoxines présentant une parenté avec la toxine produite par Shigella dysenteriae de type I. Elles ont été classées en deux groupes majeurs : Stx1 et Stx2. Pour chaque groupe de toxine Stx, plusieurs variants ont été identifiés.[23]

1.3.1.1 Phages stx

Les gènes stx, codant les Shiga-toxines, sont portés sur un opéron localisé sur le génome d’un phage inductible et lysogénique similaire au bactériophage λ, appelé phage stx. Les gènes codant Stx1 et Stx2 sont portés par des phages distincts ayant un processus d’induction similaire. [24]

Au stade lysogénique, le phage stx est intégré dans le chromosome bactérien sous la forme d’un prophage et l’expression des gènes stx est inhibée. Dans le chromosome bactérien, les phages stx peuvent s’insérer au niveau d’un site préférentiel unique ou d’autres sites d’intégration secondaires.[25] Dans certaines conditions, le prophage est induit (stade lytique) et les gènes portés par le phage sont exprimés. Ainsi, l’expression des gènes stx est sous le contrôle du promoteur du phage et de l’antiterminateur Q [26] [27].

L’induction des prophages stx, et donc la production de Stx, est contrôlée par des molécules signal, dont RecA, un régulateur du système SOS (Figure 2).[24]

11

Figure 2: Induction de la production des Shiga-toxines Stx1 et Stx2, adaptée de Mellies & Lorenzen (2014).[24]

Par exemple, lors d’une infection chez l’Homme, un stress oxydatif qui survient au niveau de l’intestin participe à l’activation de RecA et donc à l’induction des prophages stx [28]

Le traitement des infections humaines à EHEC par des antibiotiques ciblant la synthèse d’ADN peut avoir de graves conséquences cliniques en raison de l’effet de certains antibiotiques sur l’induction du phage stx et la production de Stx. [29]

Par ailleurs, l’adrénaline, la noradrénaline ou l’auto-inducteur 3 (AI-3), une molécule du quorum sensing produite par les bactéries du microbiot intestinal, activent RecA par un mécanisme dépendant du système Qse (qorum sensing E. coli) [30] [31]

D’autres facteurs comme la carence en fer et la présence d’éthanolamine peuvent favoriser l’expression des gènes stx1 et stx2, respectivement. [32] [24]

Le prophage stx au stade lysogénique module l’expression de certains gènes de la bactérie hôte, comme par exemple une augmentation de l’expression de gènes impliqués dans la mobilité ou l’inhibition de l’expression de l’appareil de sécrétion de type III .[33] [34]

12

Cette inhibition est due à une région régulatrice présente sur le génome du phage stx et principalement retrouvée chez les souches de sérogroupe O157 isolées de cas cliniques. Chez les souches O157, la présence d’une région codant pour l’antiterminateur transcriptionnel Q933 a été associée à une expression élevée des gènes stx [35] .

De plus, les phages stx peuvent réguler différentes étapes de l’interaction des EHEC avec l’épithélium intestinal, comme l’augmentation de l’expression de la nucléoline, un des récepteurs de l’intimine.[36]

Les phages stx représentent des éléments génétiques mobiles et sont considérés comme vecteurs des gènes stx. La transmission des phages stx peut avoir lieu au cours du transit intestinal mais aussi dans l’eau, les aliments, via les fèces ou encore les biofilms.[37] [38]

1.3.1.2 Structure et mode d’action des Shiga-toxines

Les toxines Stx sont composées d’une sous-unité A liée de façon non covalente à 5 unités B identiques formant un pentamère (protéine de type AB5) (Figure 3). La sous-unité A est composée de deux parties, A1 et A2, reliées entre elles par un pont disulfure. Le peptide A1 possède l’activité enzymatique N-glycosidase alors que les sous-unités B permettent l’interaction de la toxine avec son récepteur, le globotriaosylcéramide Gb3 présent à la surface des cellules endothéliales de l’intestin, du rein et du cerveau chez l’homme.[39]

Pour exercer son activité N-glycosidase, le peptide A1 doit être libéré dans le cytosol de la cellule cible. Bien que la protéine Stx2 ne présente que 60% d’homologie avec Stx1, les deux toxines ont un mode d’action identique.[40] [41]

13

Figure 3: Structure (A) et mode d’action des Shiga-toxines (B) , adaptée de Bryan et al. (2015); Melton-Celsa (2014). La toxine Stx, composée d’une unité A et d’un pentamère de

sous-unités B, se fixe au récepteur Gb3 et est internalisée dans l’endosome. Le complexe Stx/Gb3 migre par un transport rétrograde vers l’appareil de Golgi puis le réticulum endoplasmique dans lequel le peptide A1 est libéré pour atteindre les ribosomes et engendrer un arrêt de la

synthèse protéique.[42]

Au niveau du site de colonisation intestinal des EHEC, les toxines Stx sont relarguées lors de la lyse bactérienne et rejoignent la circulation sanguine par translocation des cellules épithéliales intestinales, dépourvues de Gb3, du pôle apical vers le pôle basal sans activité cytotoxique. Les toxines Stx atteignent les cellules endothéliales cibles du côlon, du rein et du cerveau et se fixent sur le récepteur Gb3.[43]

14

Il existe deux sites de fixation de la sous-unité B qui ont une forte affinité avec le récepteur Gb3 alors que le troisième site de fixation semble être important pour le recrutement des récepteurs à la surface des cellules. Après fixation de la toxine au récepteur Gb3, le complexe Stx/Gb3 est internalisé dans la cellule cible par un mécanisme d’endocytose puis fusionne avec l’endosome (Figure 3). Le complexe rejoint l’appareil de Golgi puis le réticulum endoplasmique (RE) par un transport rétrograde.[41]

Dans le RE, le pont disulfure entre les peptides A1 et A2 est réduit et seul le peptide A1 est libéré et quitte le RE pour atteindre l’enveloppe nucléaire puis les ribosomes cibles (Figure 3). L’activité N-glycosidase du peptide A1 retire un résidu adénine de l’ARN ribosomique 28S du ribosome 60S, ce qui entraine la dissociation du ribosome avec le facteur d’élongation 1, conduisant à l’inhibition de la synthèse protéique.[44] Il a également été montré que les toxines Stx sont capables d’induire l’apoptose de différents types cellulaires.[45]

1.3.1.3 Sous-types de Shiga-toxines

Comme indiqué ci-dessus, deux grands groupes de toxines, Stx1 et Stx2, et de nombreux variants ont été identifiés. Ils se distinguent par leur différence d’activité biologique, de réactivité immunologique, de reconnaissance de leur récepteur au niveau des cellules cibles et de leur capacité à être activés par l’élastase du mucus intestinal.[46]

En 2012, Scheutz et al. ont développé un système basé sur les séquences des toxines Stx afin de standardiser la nomenclature des différents variants.[47] Le groupe des toxines Stx1 inclut les variants Stx1a, Stx1c et Stx1d, alors que celui des toxines Stx2 est plus hétérogène et comprend les variants Stx2a, Stx2b, Stx2c, Stx2d, Stx2e, Stx2f et Stx2g. Le type de variant reflète à la fois l’origine des souches et leur pouvoir pathogène. Certains variants semblent associés à des hôtes spécifiques et pourraient influencer directement la virulence des souches.[48]

Par exemple, les variants Stx2a, Stx2c et Stx2d ont été fréquemment associés à des souches hautement pathogènes et à l’apparition du SHU, alors que les variants Stx1 et Stx2e, Stx2f et Stx2g sont plus rarement impliqués dans des cas d’infections humaines . Les différents profils des variants de Stx sont considérés comme un facteur prédictif de la sévérité des infections à EHEC.[49]

15

1.3.2 Locus d’effacement des entérocytes

Ce LEE est un îlot de pathogénicité de 35,6 kb. Il est constitué de cinq opérons polycistroniques (LEE1 à 5) codant pour 41 ORF et notamment pour une intimine, codé par le gène eae (« E. coli attaching and effacing ») et son récepteur Tir (« translocated intimin 58 receptor ») (LEE5 ; Figure 4). En plus d‘être présent dans le génome chromosomique des STEC potentiellement pathogènes, ce LEE est retrouvé chez plusieurs bactéries entéropathogènes tels que les EPEC, Citrobacter rodentium ou Escherichia albertii.[50]

Figure 4: Organisation génétique du locus d‘effacement des entérocytes (Ritchie and Waldor, 2005).[51]

Les gènes sep (« secretion of E. coli protein »), esc (« E. coli secretion »).(36) et esp (« EPEC-secreted protein ») retrouvés dans les LEE1, LEE2 et LEE3 codent pour un système de sécrétion de type III (SSTT). Le LEE1 contient le gène « LEE encoded regulator » (ler) codant pour une protéine se fixant à l‘ADN et qui est le régulateur principal de l‘expression des autres LEE. Le SSTT est impliqué dans la translocation d‘effecteurs, majoritairement codés par les gènes du LEE4, dans la cellule hôte (Tableau 3).[52]

16

Tableau III: Protéines sécrétées par le système de sécrétion de type III par les E.coli O157:H7 et leurs activités (d‘après Stevens and Frankel, 2014).[52]

17

L‘expression de chaque opéron de ce LEE est inactivée de manière constitutive par la fixation d‘une protéine H-NS (« Histone-like protein ») sur le site de fixation de l‘ARN polymérase. La fixation de la protéine Ler (LEE1) à la protéine H-NS active l‘expression des opérons. Le SSTT est assemblé (Figure 5)[53], EspA permet l‘élongation de la seringue de l‘injectisome (SSTT) jusqu‘à la membrane de la cellule eucaryote. EspB et EspD transloquent ensuite à travers cette seringue moléculaire pour former un port d‘ancrage du SSTT dans la membrane de la cellule cible qui relie la bactérie à la cellule hôte (Figure 6).[54]

18

Figure 5: Représentation schématique de l‘assemblage du système de sécrétion de type III chez les EPEC (Sekiya et al., 2001). [53]

Figure 6: Représentation schématique du système de sécrétion de type III , exprimé par les EHEC et C. rodentium (Pallen et al., 2005).[54]

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Grâce au SSTT ainsi formé, les protéines Tir sont ensuite transférées dans le cytoplasme

de la cellule cible. Elles sont insérées dans la membrane plasmique eucaryote et servent de récepteurs aux intimines exprimées à la surface de la membrane externe bactérienne et codées par le gène eae. L‘association entre ces deux protéines permet la mise ien place d‘une relation très rapprochée entre la bactérie et sa cible. Cet attachement permet le recrutement, par l‘intermédiaire des récepteurs Tir, de protéines eucaryotes qui induisent des réarrangements du cytosquelette et forment un « piédestal » d‘actine autour de la bactérie, créant ainsi une niche pour le développement du pathogène. La formation de ce piédestal crée le phénotype d‘effacement des microvillosités des cellules endothéliales du côlon à l‘origine des diarrhées aqueuses (lésion d‘attachement/effacement [A/E], Figure 7) [55]

Figure 7: Mécanisme de pathogénicité des E. coli entéropathogènes et entérohémorragiques (Croxen and Finlay, 2010).[55]

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La colonisation du tube digestif est une étape majeure de la physiopathologie des EHEC. Les EHEC mettent notamment en place des lésions A/E analogues à celles décrites chez les EPEC (Figure 7). Néanmoins, contrairement aux EPEC qui colonisent l‘intestin grêle, les lésions A/E des STEC se concentrent au niveau de l‘épithélium folliculaire des plaques de Peyer.[56] Différents variants du gène eae existent.[57] Il semblerait que ces variants soient impliqués dans le tropisme cellulaire. En effet, les souches d‘EPEC sont capables de coloniser et d‘établir des lésions A/E au niveau de l‘intestin grêle, tandis que les EHEC sont retrouvés au niveau de l‘iléon terminal et du côlon, notamment à proximité des plaques de Peyer. Or il a été démontré qu‘une souche EHEC O157:H7 inactivée pour le gène eae-gamma et trans-complémentée pour le gène eae-alpha, communément retrouvé chez les EPEC, était capable de coloniser le côlon et l‘intestin grêle de porcs gnotobiotiques, à l‘instar des souches EPEC.[58]

D‘autres facteurs d‘adhésion potentiels ont été décrits chez les STEC. Le génome de la souche SAKAI O157:H7 contient au moins 16 groupes de gènes codant pour des adhésines fimbriaires. Ces gènes sont également retrouvés chez des souches non-O157, même si certains ne semblent pas être totalement fonctionnels. Cependant, l‘hypothèse de transcomplémentation des différents loci exprimant ces adhésines potentielles a été émise.[59] Parmi ces autres facteurs d‘adhésion, nous pouvons citer le gène saa (« STEC autoagglutinating adhesin ») codant pour une adhésine non fimbriaire auto-agglutinante. Ce gène a notamment été retrouvé chez des souches d‘EHEC eae négatives et isolées de cas humains.[60]

L‘adhésine EfaI est impliquée dans l‘adhésion in vitro de STEC à des cellules cibles [61, 62] Ce gène efaI présente 99,9% d‘homologie avec le gène lifA (pour « lymphocyte inhibitory factor A ») codant pour une lymphotoxine présente chez les souches EPEC.[62 ,63]

La protéine ToxB, impliquée dans l‘adhésion des souches EHEC O157:H7 sur des cellules Caco-2 in vitro favorise la sécrétion des protéines par le SSTT.[64 ,65] Cette protéine présente des homologies avec la toxine B de Clostridium difficile.[66,67]

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Le facteur d‘adhésion Lpf (pour « long polar fimbriae ») semble être impliqué dans l‘adhésion des souches O157:H7.[68,69] Ces Lpf sont néanmoins présents chez de nombreuses souches d‘E. coli, notamment pathogènes, et ne semblent donc pas être spécifiques des EHEC.[70] Des gènes chromosomiques [71] et des îlots génomiques.[72] codant potentiellement pour d‘autres adhésines fimbriaires ont également été mis en évidence (sfa, stp et stc, OI-1 et OI- 47) mais leur rôle dans la pathogénie des EHEC reste à déterminer. Les « bundle-forming pilus » jouent un rôle dans l‘adhésion des EHEC aux cellules cibles.[55]

Une protéine de la membrane externe bactérienne, Iha (pour « IrgA homologue adhesin»), proche de la protéine IrgA (« Iron-regulated gene homologue A ») de Vibrio cholerae, a été identifiée. Iha confère aux bactéries un phénotype d‘adhésion diffuse sur des cellules HeLa en culture.[73] Les autres facteurs d’adhésion des EHEC non codés par le LEE : Chez les EHEC, de nombreuses adhésines fimbriaires et non fimbriaires contribuent à l’adhésion, à l’établissement et à la persistance de l’infection.[74] Différentes adhésines fimbriaires ont été décrites:

+ Le fimbriae Lpf (Long polar fimbriae) contribue à l’adhésion des EHEC aux cellules épithéliales intestinales, au niveau des cellules M ,[75] mais aussi aux protéines de la matrice extracellulaire comme la fibronectine, la laminine et le collagène de type IV.[76] Comme l’intimine, ce fimbriae semble influencer le tropisme cellulaire pour l’épithélium associé aux plaques de Peyer. [75 ,77]

+ Le pilus ECP (E. coli common pilus) et les fimbriae F9, ELF (E. coli laminin-binding-fimbriae) et Sfp (Sorbitol-fermenting fimbriae protein) permettent l’adhésion des EHEC aux cellules épithéliales in vitro.[74,78] De plus, le pilus ECP et les fimbriae F9 et ELF sont également capables d’interagir avec des protéines de la matrice extracellulaire. Il a également été montré que le pilus ECP et le fimbriae Sfp étaient exprimés dans des conditions limitées en oxygène, conditions retrouvées dans le tube digestif.[74,79]

+ Le pilus de type IV HCP pour « hemorrhagic coli pilus » est impliqué dans l’adhésion des EHEC à de nombreux types cellulaires ainsi que dans l’invasion des cellules épithéliales, l’hémagglutination des érythrocytes, la formation de biofilm et la réponse pro-inflammatoire. Ces propriétés suggèrent que ce pilus contribue non seulement à la virulence, la survie et la transmission des EHEC mais aussi l’inflammation causée par les EHEC.[80,81]